Polyketides form a structurally diverse and pharmaceutically important class of secondary metabolites. Both diversity and biological activity are largely facilitated by post-polyketide synthase tailoring including methylation, oxidation, reduction, glycosylation, and dimerization. Cytochrome P450 enzymes (CYPs), flavin-dependent monooxygenases (FMOs), and laccases are known to catalyze phenol coupling in the biosynthesis of polyketide dimers. Polyketide homodimers resulting from enzyme catalysis are often formed in a highly regio- and stereoselective manner, in contrast to analogous nonenzymat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The enzymes 6-methylsalicylic acid (6-MSA) synthases (6-MSASs) are involved in the building of an aryl moiety in many bioactive secondary metabolites produced by fungi and bacteria. Using the bacterial 6-MSAS ChlB1 in the biosynthesis of spirotetronate antibiotic chlorothricin (CHL) as a model, functional analysis of its dehydratase (DH) and ketoreductase (KR) domains by site-specific mutagenesis revealed that selective ketoreduction is not essential for polyketide chain extension. Promiscuity of the ketoacylsynthase domain in beta functionality recognition allows for engineering ChlB1 to an o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A logical discovery method based on metabologenomic targeting was designed to search for new β-branched conjugated polyketides. PCR screening of a bacterial DNA library (1,638 strains) targeting the key enzyme hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HCS) homolog-encoding gene as a genomic hallmark identified 67 hit strains. Phylogenetic analysis of HCS homolog-encoding gene amplicons prioritized strains potentially producing new β-branched conjugated polyketides. Vibronic fine structures in ultraviolet spectra as a metabolomic hallmark clearly identified β-branched conjugated polyketides in bacter
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyketide synthase-positive Escherichia coli (pks+ E. coli) has attracted significant attention following the discovery that its genotoxic metabolite, colibactin, imprints distinct mutational signatures in intestinal epithelial cells that are detectable in ∼12% of colorectal cancer (CRC) cases. Although these signatures are present in established tumors, growing evidence suggests that colibactin acts early in tumorigenesis, positioning pks+ E. coli as a potential contributor to CRC initiation. Mechanistic studies show that colibactin genotoxicity is highly context dependent and requires direc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Covering: up to August 2024Macrolides, the core skeletons of numerous marketed drugs and bioactive natural products, have garnered considerable scientific interest owing to their structural diversity and broad spectrum of pharmaceutical activities. The formation of intramolecular ester bonds is a critical biocatalytic step in constructing macrolide skeletons. Here, we summarised enzymatic ester bond formation strategies in fungal polyketide (PK)-type, nonribosomal peptide (NRP)-type, and PK-NRP hybrid-type macrolides. In PK-type macrolides, ester bond formation is commonly catalysed by a trans
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The medically important immunosuppressant FK506 is a structurally complex macrolactone biosynthesized by a combined polyketide synthase and a nonribosomal peptide synthetase enzyme complex. Its acyltransferase domain 4 (AT4) selects an unusual extender unit, resulting in an allyl moiety on carbon 21 of the macrolactone backbone. Based on the AT4 domain, chemobiosynthetic processes have been developed that enable the introduction of diverse moieties at the carbon 21 position. However, the novel moieties that were introduced into the polyketide backbone are chemically inert. Reported here is a n
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyketides represent an important class of biologically active and structurally diverse compounds found in nature. They are biosynthesized from acyl CoA precursors by polyketide synthases (PKSs). The use of combinatorial biosynthesis to form hybrid PKSs is considered to be an excellent approach for the development of novel polyketides. Here, 10 new 16-membered macrolide compounds were isolated from the broth of the genetically engineered strain Streptomyces avermitilis TM24, in which the PKS gene aveA3 was seamlessly replaced by the milbemycin PKS gene milA3. Their structures were elucidated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type III polyketide synthases (PKS IIIs) contribute to the synthesis of many economically important natural products, most of which are currently produced by direct extraction from plants or through chemical synthesis. Olivetolic acid (OLA) is a plant secondary metabolite sourced from PKS III catalysis, which along with its prenylated derivatives has various pharmacological activities. To demonstrate the potential for microbial cell factories to circumvent limitations of plant extraction or chemical synthesis for OLA, here we utilize a synthetic approach to engineer Escherichia coli for the pr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pepstatins are potent inhibitors of aspartic proteases, featuring two statine residues crucial for target binding. However, the biosynthesis of pepstatins, especially their statine substructure, remains elusive. Here, we discover and characterize an unconventional gene cluster responsible for pepstatin biosynthesis, comprising discrete nonribosomal peptide synthetase and polyketide synthase genes, highlighting its trans-acting and iterative nature. Central to this pathway is PepI, an F420H2-dependent oxidoreductase. The biochemical characterization of PepI reveals its role in the tandem reduct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptolydigin is a tetramic acid antibiotic produced by Streptomyces lydicus NRRL 2433 and involving a hybrid polyketide synthase (PKS)-nonribosomal peptide synthetase (NRPS) system in its biosynthesis. The streptolydigin amino-acid precursor, 3-methylaspartate, has been proposed to be condensed to the polyketide portion of the molecule by a NRPS composed by three enzymes (SlgN1, SlgN2 and SlgL). On the other hand, biosynthesis of the polyketide moiety involves the participation of cytochrome P450 SlgO2 for the correct cyclization of the characteristic bicyclic ketal. Independent disruption o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brown algae contain phlorotannins with recognized biological and ecological functions, but the responses of phenolic metabolism to different light environments remain incompletely understood. In this study, Sargassum muticum was cultivated for 15 days under different photoperiods (12L:12D, 16L:8D, and 20L:4D) and light qualities (white, blue, and red light). Growth, photosynthetic performance, oxidative stress indicators, and phlorotannin content were examined, together with transcriptomic and untargeted metabolomic responses. Extended photoperiods were associated with increased growth and a t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycosylated macrolactones (macrolides) often display broad and potent biological activities and are targets for drug development and discovery. The modular genetic organization of macrolide polyketide synthases (PKSs) and various polyketide tailoring enzymes has inspired the combinatorial biosynthesis of new-to-nature macrolides. However, most engineered PKS and macrolide biosynthetic pathways are ineffective and produce reduced or negligible product titers. Directed evolution could improve the activity of engineered PKSs and associated pathways but critically requires a high-throughput scree
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycolactones are a family of polyketide synthase products made by the human pathogen Mycobacterium ulcerans that were recently identified as novel inhibitors of the host membrane translocation complex (Sec61). Here, we provide protocols for the purification of mycolactones from bacterial cultures, and for their quantitative assessment in biological samples.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing incidence of Candida albicans infections and resistance to current antifungal therapies has led to the search for new and more effective antifungal compounds. Actinobacterial species from the Streptomyces genus are recognized as some of the major producers of antimicrobial compounds. Therefore, the aims of this study were: (1) the identification of Streptomyces strains isolated from Mexican tropical acidic soils, (2) the evaluation of their antifungal activity on C. albicans, and (3) the exploration of the presence of polyketide synthase genes in their genome and antifungal seco
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ketosynthase (KS) domains of modular type I polyketide synthases (PKSs) typically catalyze the Claisen condensation of acyl and malonyl units to form linear chains. In stark contrast, the KS of the rhizoxin PKS branching module mediates a Michael addition, which sets the basis for a pharmacophoric δ-lactone moiety. The precise role of the KS was evaluated by site-directed mutagenesis, chemical probes, and biotransformations. Biochemical and kinetic analyses helped to dissect branching and lactonization reactions and unequivocally assign the entire sequence to the KS. Probing the range of accep
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isolation and structure elucidation of six new divergolides reveal unusual ansamycin diversification reactions including formation of the unusual isobutenyl side chain from a branched polyketide synthase extender unit, azepinone ring closure, macrolide ring contraction and formation of a seco variant by a neighboring group-assisted decarboxylation.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome mining of the marine-derived Streptomyces sp. S42 uncovered a type II polyketide synthetase (T2 PKS) biosynthetic gene cluster (BGC) harboring a gene for 3-ketoacyl-ACP synthase III (KAS III), a hallmark of non-acetate starter unit incorporation, suggesting that the BGC may produce previously unidentified aromatic polyketides. Heterologous expression and promoter engineering of this prioritized BGC in host Streptomyces albus J1074 activated the biosynthetic pathway, leading to the isolation of eight new polycyclic aromatic derivatives, verrucones A-H (1-8). Comprehensive structural eluc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Largimycins are a recently discovered group of hybrid nonribosomal peptide-polyketide compounds belonging to the leinamycin family of natural products. They are produced in Streptomyces argillaceus by the lrg biosynthetic gene cluster, which includes three cytochrome P450 encoding genes. By characterizing the compounds accumulated by mutants lacking these three genes, we have determined their essential roles in largimycin biosynthesis. Specifically, LrgC2 is involved in converting an olefinic exomethylene group into an oxo (ketone) group at position C-9, while LrgC1 is responsible for forming
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avermectins (AVMs), a family of 16-membered macrocyclic macrolides produced by Streptomyces avermitilis, have been the most successful microbial natural antiparasitic agents in recent decades. Doramectin, an AVM derivative produced by S. avermitilis bkd- mutants through cyclohexanecarboxylic acid (CHC) feeding, was commercialized as a veterinary antiparasitic drug by Pfizer Inc. Our previous results show that the production of avermectin and actinorhodin was affected by several other polyketide biosynthetic gene clusters in S. avermitilis and Streptomyces coelicolor, respectively. Thus, here,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel Pseudomonas species was isolated from the rhizosphere of Zea mays in Hungary. Phylogenetic analysis based on concatenated 16S rRNA, rpoD, and rpoB sequences placed the isolate within the Fluorescens superclade, while a proteome-based phylogenetic analysis elucidated the accurate phylogenetic position, a distinct lineage between the Corrugata and Jessenii clades. Whole-genome sequencing of the type strain SZMC 28357T (GenBank accession: JAVLSB000000000) revealed a 5.9 Mb genome with a G + C content of 61%. Comparative genomic analyses (ANI and dDDH) further confirmed that SZMC 28357T re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования