Mutations in the RNA-binding protein FUS have been shown to cause the neurodegenerative disease amyotrophic lateral sclerosis (ALS). We investigate whether mutant FUS protein in ALS patient-derived fibroblasts affects normal FUS functions in the nucleus. We investigated fibroblasts from two ALS patients possessing different FUS mutations and a normal control. Fibroblasts from these patients have their nuclear FUS protein trapped in SDS-resistant aggregates. Genome-wide analysis reveals an inappropriate accumulation of Ser-2 phosphorylation on RNA polymerase II (RNA Pol II) near the transcripti…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neural stem cell (NSC) state and fate depend on spatially and temporally synchronized transcriptional and epigenetic regulation of the expre … ssion of the neurotrophic signaling factor BDNF in association with promoter H3K9 demethylation and RNA polymerase II recruitment. Unexpectedly, KDM4A/C were essential for selective H3K36 demethylation and loss of RNA polymerase II recruitment in transcribed regions of the astrocyte-characteristic gene GFAP, thereby in parallel repressing astrocytic differentiation …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loss-of-function mutations in methyl-CpG binding protein 2 (MECP2) cause Rett syndrome. While we know that MeCP2 binds to methylated cytosines on DNA, the full breadth of the molecular mechanisms by which MeCP2 regulates gene expression remains incompletely understood. Here, using a genetic modifier screen, we identify the super elongation complex, a P-TEFb-containing elongation factor that releases promoter-proximally paused RNA polymerase II, as a genetic interactor of MECP2. MeCP2 physically interacts with SEC subunits and directly binds AFF4, the scaffold of the SEC, via the transcriptiona…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA polymerase II mediates the transcription of all protein-coding genes in eukaryotic cells, a process that is fundamental to life. Genomic mutations altering this enzyme have not previously been linked to any pathology in humans, which is a testament to its indispensable role in cell biology. On the basis of a combination of next-generation genomic analyses of 775 meningiomas, we report that recurrent somatic p.Gln403Lys or p.Leu438_His439del mutations in POLR2A, which encodes the catalytic subunit of RNA polymerase II (ref. 1), hijack this essential enzyme and drive neoplasia. POLR2A mutant…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dendritic cells (DCs) produce type I interferons (IFNs) in greater amounts than other cells, but the mechanisms remain elusive. Here we stud … ction in DCs also required IRF8. Chromatin immunoprecipitation analysis showed that IRF7, IRF8, and RNA polymerase II were recruited to the IFN promoters upon stimulation. Moreover, sustained RNA polymerase II recruitment to the promoters critically depended on IRF8. Together, these data indicate that IRF8 magnifies the second phase of IFN transcription in DCs by p …
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oropouche fever, a mosquito- or midge-borne emerging zoonotic disease endemic to South and Central America, manifests as a dengue-like acute … otein is essential for its expression. Furthermore, expressing OROV NSs protein independently of an RNA polymerase II promoter is crucial to prevent restricted gene expression, potentially caused by NSs inhibiting cellular RNA polymerase II, as observed in closely related bunyavirus NSs proteins. These protein expression strategies offer insights into the molecular …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) constitutes a formidable global health challenge. Lenvatinib, a multi-targeted tyrosine kinase inhibitor (TKI … nvatinib, whereas its knockdown restores drug responsiveness. Mechanistically, RPRD1A competes with RNA polymerase II-associated protein 2 (RPAP2) for binding to RNA polymerase II (RNA Pol II), thereby derepressing integrin subunit alpha 5 (ITGA5) transcription via a c-JUN-dependent pathway. Upregulated ITGA5 subsequently activates focal adhesion kinase (FAK) signa …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
When bacterial lipopolysaccharide, a B-cell mitogen, was injected intraperitoneally into mice, the rate of deoxyribonucleic acid synthesis and the number of antibody-secreting cells in the spleen increased simultaneously, reaching a maximum in 3 days. The rate of ribonucleic acid synthesis also increased during this period, and this was found to be due to activation of alpha-amanitin-sensitive transcription in lymphoid cells of the spleen. The factors stimulating ribonucleic acid polymerase II in the spleens of normal mice and those treated with lipopolysaccharide were compared, and an additio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
All eukaryotes possess three DNA-dependent RNA polymerases, Pols I-III, while land plants possess two additional polymerases, Pol IV and Pol V. Derived through duplication of Pol II subunits, Pol IV produces 24-nt short interfering RNAs that interact with Pol V transcripts to target de novo DNA methylation and silence transcription of transposons. Members of the grass family encode additional duplicated subunits of Pol IV and V, raising questions regarding the function of each paralog. In this study, we identify a null allele of the putative Pol IV second subunit, NRPD2, and demonstrate that N
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During somatic hypermutation (SHM), activation-induced deaminase (AID) mutates deoxycytidine on single-stranded DNA (ssDNA) generated by the transcription machinery, but the detailed mechanism remains unclear. Here we report a higher abundance of RNA polymerase II (Pol II) at the immunoglobulin heavy-chain variable (Igh-V) region compared with the constant region and partially transcribed Igh RNAs, suggesting a slower Pol II progression at Igh-V that could result in some early/premature transcription termination after prolonged pausing/stalling of Pol II. Knocking down RNA-exosome complexes, w…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylguanosine capping, a post-transcriptional modification of the 5' terminus of RNA polymerase II transcripts, influences RNA function, stability, and protein synthesis. Previously, we identified the cap modification in specific transfer RNA (tRNA) precursors (pre-tRNAs) transcribed by RNA polymerase III in Saccharomyces cerevisiae, and demonstrated that pre-tRNA capping prevents 5' exonucleolytic degradation of pre-tRNAs. Herein, we comprehensively mapped pre-tRNA capping and found that nearly all pre-tRNAs undergo cap modification. This analysis enabled precise determination of transcript…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inhibitors of cyclin-dependent kinases (Cdks) have been reported to have activities in chronic lymphocytic leukemia cells by inhibiting Cdk7 … gnostic indicators and treatment history. This was associated with inhibition of phosphorylation of RNA polymerase II and inhibition of RNA synthesis. Consistent with the intrinsic turnover rates of their transcripts and proteins, antiapoptotic proteins, such as Mcl-1 and X-linked inhibitor of apoptosis protein (XIAP), were rapidly reduced on exposure to SNS-032, w …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in multiple RNA/DNA binding proteins cause Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS). Included among these are the three members of the FET family (FUS, EWSR1 and TAF15) and the structurally similar MATR3. Here, we characterized the interactomes of these four proteins, revealing that they largely have unique interactors, but share in common an association with U1 snRNP. The latter observation led us to analyze the interactome of the U1 snRNP machinery. Surprisingly, this analysis revealed the interactome contains ~220 components, and of these, >200 are shared with the RNA polymerase II (RN…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The mRNA transcription is a multistep process involving distinct sets of proteins associated with RNA polymerase II (RNAPII) through various stages. Recent studies have highlighted the role of RNAPII-associated proteins in facilitating the assembly of functional complexes in a crowded nuclear milieu. RNAPII dynamics and gene expression regulation have been primarily studied in model eukaryotes like yeasts and mammals and remain largely unchartered in protozoan parasites like Toxoplasma gondii, where considerable gene expression changes accompany stage differentiations. Here we repo…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genes specifying long non-coding RNAs (lncRNAs) occupy a large fraction of the genomes of complex organisms. The term 'lncRNAs' encompasses RNA polymerase I (Pol I), Pol II and Pol III transcribed RNAs, and RNAs from processed introns. The various functions of lncRNAs and their many isoforms and interleaved relationships with other genes make lncRNA classification and annotation difficult. Most lncRNAs evolve more rapidly than protein-coding sequences, are cell type specific and regulate many aspects of cell differentiation and development and other physiological processes. Many lncRNAs associ
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Defects in the XPD gene can result in several clinical phenotypes, including xeroderma pigmentosum (XP), trichothiodystrophy, and, less freq … of plasmids harboring methylation or oxidative damage as well as by UV photoproducts. Inhibition of RNA polymerase II transcription by four different inhibitors dramatically reduced the number of UV-induced breaks. Furthermore, the breaks were dependent on the nucleotide excision repair (NER) machinery. These data are consistent with our hypothesis that the NER mac …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcription elongation, especially RNA polymerase II (Pol II) pause-release, is less studied than transcription initiation in regulating gene expression during meiosis. It is also unclear how transcription elongation interplays with transcription initiation. Here, we show that depletion of NKAPL, a testis-specific protein distantly related to RNA splicing factors, causes male infertility in mice by blocking the meiotic exit and downregulating haploid genes. NKAPL binds to promoter-associated nascent transcripts and co-localizes with DNA-RNA hybrid R-loop structures at GAA-rich loci to enhanc…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type-I interferons (IFN-I) and IFN-stimulated genes (ISGs) are central to antiviral defense, while dysregulation can drive autoimmunity. IFNB1 expression is controlled by a highly ordered multiprotein complex composed of IRF3/7, NFκB, and ATF2/c-Jun (AP-1) that recruit coactivators and chromatin-remodeling proteins to expose the IFNB1 promoter for the RNA polymerase II (RNA Pol II) transcriptional machinery. Here, we identified the paraspeckle protein non-POU domain-containing octamer-binding protein (NONO) as a critical facilitator of innate immune activation. Loss of NONO enhanced replicatio…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dystrophin gene (DMD) is the largest gene in the human genome, mapping on the Xp21 chromosome locus. It spans 2.2Mb and accounts for app … hat the full transcription of the DMD gene requires about 16h, we have investigated the activity of RNA Polymerase II along the entire DMD locus within the context of specific chromatin modifications using a variety of chromatin-based techniques. Our results unveil a surprisingly powerful processivity of the RNA polymerase II along the entire 2.2Mb of the DMD locus …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rift Valley fever virus (RVFV) is responsible for large and recurrent outbreaks of acute febrile illness among humans and domesticated animals in Africa. It belongs to the family Bunyaviridae, genus Phlebovirus, and its negative-stranded RNA genome consists of three segments. Here, we report the establishment and characterization of two different systems to rescue the RVFV wild-type strain ZH548. The first system is based on the BHK-21 cell clone BSR-T7/5, which stably expresses T7 RNA polymerase (T7 pol). Rescue of wild-type RVFV was achieved with three T7 pol-driven cDNA plasmids representin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования