Two-step polymerase chain reaction (nested PCR) method was examined for the diagnosis of scrub typhus. Primers were derived from the type-specific antigen (TSA) gene DNA sequences of Rickettsia tsutsugamushi, Gilliam strain. These primers served to produce rickettsia-specific products in the amplification of template DNA prepared from all serovariants, Gilliam, Karp, Kato, Kawasaki, Kuroki and Shimokoshi strains, and the fragments of product after digestion with several kinds of restriction endonuclease showed the respective patterns to strain in acrylamide or agarose gel electrophoresis. The …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arbitrarily primed polymerase chain reaction (AP-PCR) was used to characterize Legionella pneumophila serogroup 1. Cells from a single colony could be subtyped by AP-PCR within a few hours. The discrimination between strains of L. pneumophila serogroup 1 by AP-PCR was equivalent to that by monoclonal antibody analysis and ribotyping. Four strains representing the monoclonal antibody pattern most frequently associated with outbreaks all yielded unique amplicon patterns by AP-PCR.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We tested for measles, mumps, and rubella viruses in multiple sclerosis by polymerase chain reaction (PCR). Using RNA extracted from 19 multiple sclerosis and 8 control brain specimens, nested PCR was performed after reverse transcription (RT) of the RNA to cDNA using primer pairs directed against two regions in the genomes of measles and mumps viruses and one region in the rubella virus genome. Despite enhanced sensitivity of nested RT PCR, measles, mumps, and rubella viral genomic sequences were not found in any brain specimen.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A combination of immunomagnetic separation (IMS) and a polymerase chain reaction (PCR) procedure was used for direct isolation and identification of Shigella dysenteriae type 1 and Shigella flexneri from feces. Immunomagnetic particles were coated with monoclonal antibody MASFB, which is specific for a common epitope of the O polysaccharides of S. dysenteriae type 1 and S. flexneri. Bacteria bound to the beads were boiled in water, and target DNA was amplified with a primer pair specific for a gene coded on the invasion-associated locus (ial) of the large virulence plasmid of all four Shigella…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Southern hybridisation demonstrates deleted mitochondrial DNAs (mtDNAs) in muscle but not in blood in a subgroup of patients with mitochondrial myopathy. The polymerase chain reaction (PCR) was used to search for low levels of rearranged mitochondrial DNAs in blood in 24 patients with mitochondrial myopathy, and 15 asymptomatic relatives, all of whom have no detectable abnormality on restriction enzyme analysis of blood mitochondrial DNA. In eight patients and two of their relatives, PCR products were obtained consistent with deletions of mitochondrial DNA. The presence or absence of a deletio…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Samples from patients with genital condyloma acuminata or with cervical condylomas and/or dysplasia and from women without cytological/clinical evidence of cervical affection were examined by dot blot DNA hybridization or the polymerase chain reaction (PCR). The PCR was much more sensitive than dot blot, more than doubling the human papilloma virus (HPV) findings. HPV DNA, mainly HPV 6/11, was detected in 18 of 19 biopsies of condyloma acuminata, whereas HPV 16 was most frequently detected in the 21 cervices (76%) with condyloma and/or dysplasia. HPV 16 was detected in eight of 103 cervical sm…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T(3;14)(q27;q32) is frequently detected in B-cell non-Hodgkin's lymphomas, especially the diffuse large cell type and the follicular type. T … e BCL6 gene. We established a method to detect these chimaeric transcripts by reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) using the consensus sequence of the J region and the sequence of exon 3 of the BCL6 gene as primers. Using the semi-nested RT-PCR method and a cell line carrying t(3;14)(q27;q32), we detected one lymphoma cell among 10,000 background cells. …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Frozen tissue is considered the gold standard if DNA is to be extracted for polymerase chain reaction (PCR) analysis. In molecular studies from paraffin-embedded material, only positive results are usually taken into account. Our goal was to evaluate both the sensitivity and the specificity of PCR techniques for immunoglobulin heavy chain (IgH) gene rearrangement according to various lengths and types of fixative before paraffin embedding. One set of studies compared IgH rearrangement in a case of mantle cell lymphoma tissue that had been fixed in 14 different ways before paraffin embedding an…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The multiplexed digital polymerase chain reaction (PCR) is widely used in molecular diagnosis owing to its high sensitivity and throughput for multiple target detection compared with the single-plexed digital PCR; however, current multiplexed digital PCR technologies lack efficient coding strategies that do not compromise the sensitivity and signal-to-noise (S/N) ratio. Hence, we propose a fluorescent-encoded bead-based multiplexed droplet digital PCR method for ultra-high coding capacity, along with the creative design of universal sequences (primer and fluorescent TaqMan probe) for ultra-sen…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Typhoid fever is caused by the bacteria Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhi (S. Typhi) and remains a significant health pr … prevalent Salmonella spp. in Kenya (S. Typhi, S. Typhimurium and S. Enteritidis) using conventional polymerase chain reaction (PCR). The staA primers and viaB primers were found to be specific only for the different strains of S. Typhi, producing PCR products of 585 bp and 540 bp, respectively. The sopE primers was demonstrated to be specific for all Salmonella spp. produc …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prior studies illustrate the presence and clinical importance of detecting Aspergillus species in the airways of patients with chronic respiratory disease. Despite this, a low fungal biomass and the presence of PCR inhibitors limits the usefulness of quantitative PCR (qPCR) for accurate absolute quantification of Aspergillus in specimens from the human airway. Droplet digital PCR (ddPCR) however, presents an alternative methodology allowing higher sensitivity and accuracy of such quantification but remains to be evaluated in head-to-head fashion using specimens from the human airwa
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sporothrix globosa is an important clinical pathogen in the Sporothrix complex, which is causing sporotrichosis. S. globosa is distributed worldwide, especially in Asia. The transmission medium of S. globosa is mainly contaminated soil or decaying vegetation, and the infection usually caused by transcutaneous trauma, through which the fungal conidia or yeast cells enter the host. Although the clinical manifestations of sporotrichosis caused by S. globosa is always benign, there have been several outbreaks worldwide. In this study, we established a novel real-time polymerase chain reaction (PCR…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydophila pneumoniae is an intracellular pathogen responsible for respiratory tract infections. The isolation of the microorganism from clinical specimens is essential for a diagnosis. However, the identification of C. pneumoniae by cell cultures is very difficult besides strongly depending on the sample conditions. The study aimed to investigate, in adult patients with pharyngotonsillitis, the frequency of Chlamydophila pneumoniae detection by cell cultures and three conventional PCRs (a conventional PCR targeting the 16S rRNA gene and two nested PCRs, targeting the 16S rRNA gene and the
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial meningitis poses enormous healthcare challenges due to a high mortality, morbidity and sequelae. Neisseria (N.) meningitidis, Haemophilus (H.) influenzae, Streptococcus (S.) pneumoniae and S. agalactiae remain among the most prevalent infectious agents that cause bacterial meningitis in children. The objective of this study was the simultaneous detection of these pathogens in suspected cerebrospinal fluid (CSF) by using multiplex polymerase chain reaction (mPCR) and compare PCR results with standard diagnostics currently used in clinical practice. CSF specimens were obtained from 515…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It has been previously reported that adenovirus 36 (Ad36) infection is associated with obesity in humans and other animals. However, there is no clinically available standard protocol to detect Ad36 DNA. In this study, we developed a method for quantitative and rapid detection of Ad36 DNA. Using a TaqMan probe quantitative polymerase chain reaction (qPCR), we identified that the E3 and E4orf1 regions specifically detect Ad36 DNA, because these regions did not show cross reactivity with other types of adenoviruses. The limit of detection was 379 copy/ml and 384 copy/ml for E3 and E4orf1 regions…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We hypothesized that local infection plays a critical role in the pathogenesis of medication-related osteonecrosis of the jaw (MRONJ). Recent developments in molecular methods have revolutionized new approaches for the rapid detection of microorganisms including those difficult to culture. The aim of our study is to identify the bacterial profiles in MRONJ by microbiological culture and polymerase chain reactions (PCR). A retrospective analysis was performed on MRONJ patients from 2008 to 2014. The bacterial profile from MRONJ bone samples was determined using microbiological culture and PCR. …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Culture-negative septic arthritis occurs frequently in children. The supplemental use of polymerase chain reaction (PCR) techniques improves the detection of bacteria in the joint fluid. This study evaluates the clinical utility of PCR at a tertiary pediatric medical center.
METHODS: Children with septic arthritis were studied prospectively from 2012 to 2014. Culture results and clinical infection parameters were recorded. PCR was performed whenever sufficient fluid was available from the joint aspiration. A statistical comparison was made for the rates of identification of the …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nasopharyngeal swabs from 424 children were used to compare the performances of the new multiplex real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) RIDA®GENE Flu & RSV kit and monospecific RT-PCR assays in detecting respiratory syncytial and influenza viruses. The easy-to-use kit was highly sensitive and specific and is recommended for routine practice.
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Laboratory detection of Brucella is based largely on bacterial isolation and phenotypic characterization. These methods are lengthy and labor-intensive and have been associated with a heightened risk of laboratory-acquired infection. Antibody based indirect detection methods also suffer from limitations in proper diagnosis of the organism. To overcome these problems, nucleic acid amplification has been explored for rapid detection and confirmation of the presence of Brucella spp. PCR-based diagnostics is useful for screening large populations of livestock to identify infected individuals and c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to the increasing numbers of dogs imported from or visiting Mediterranean countries, canine leishmaniasis has become an important infectious disease in countries where natural transmission typically does not occur. Although conjunctival swabs have recently been described as a useful diagnostic tool in endemic areas, their usefulness in non-endemic areas is unknown. The aim of this study was to evaluate the sensitivity and specificity of a conjunctival swab polymerase chain reaction (PCR) in dogs in a non-endemic area. Dogs (n=74) that were presented for suspected canine leishmaniasis or fo…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.