BACKGROUND: The diagnosis of Pneumocystis pneumonia (PCP) in immunocompromised patients is still challenging today due to the absence of an in vitro culture system and the low diagnostic accuracy of microscopic examinations. Herein, we performed a meta-analysis to evaluate the accuracy of real-time polymerase chain reaction (PCR) in the diagnosis of PCP.
METHODS: We searched Web of Knowledge and Medline from 1990 to May 2010 for studies reporting diagnostic accuracy data regarding the use of real-time PCR in the diagnosis of PCP in immunocompromised patients.
RESULTS: Ten individual studies …
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To assess the value of routine polymerase chain reaction (PCR) analysis on intraocular fluid from patients presenting with a first episode of suspected active infectious posterior uveitis in a population with a high prevalence of human immunodeficiency virus infection.
DESIGN: Retrospective, interventional case series. Participants. 159 consecutive patients presenting at a tertiary care hospital over a five-year period.
METHODS: PCR analysis was performed for cytomegalovirus, varicella zoster virus, herpes simplex virus types 1 and 2, Toxoplasma gondii, and Mycobacterium tuberculo…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of antimicrobial resistance of Neisseria gonorrhoeae arising from wide dissemination of resistant clones is a major global health problem. In this study, a total of 235 isolates of N. gonorrhoeae isolated from patients of Bangrak Hospital were tested for their antibiotic susceptibilities to penicillin, norfloxacin, ofloxacin, ciprofloxacin, spectinomycin, and ceftriaxone. Mutation (Ser-91) in the quinolone resistance determining regions of gyrA and random amplification of the polymorphic DNA polymerase chain reaction (RAPD-PCR) were examined from 145 isolates. Among these, 55 i…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recently, there has been an increase in the incidence of cutaneous leishmaniasis (CL), which represents an important health prob … ive, and practical. Amongst the new tests described are those including nucleic acid amplification (polymerase chain reaction, PCR) and immunohistochemistry (IHC).
METHODS: In this study, we evaluated the sensitivity of a PCR based on small subunit (SSU) ribosomal DNA, in comparison with IHC using Leishmania spp. antibodies, in biopsies embedded in paraffin.
RESULT: The …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Helicobacter pylori has been associated with the development of peptic ulcers and gastric cancer. Although the oral cavity may be a source of transmission, it is unknown whether it acts as a permanent reservoir for this bacterium, particularly in the presence of periodontal disease. The purpose of this study was to evaluate the prevalence of H. pylori by polymerase chain reaction (PCR) in the subgingival biofilm and saliva of subjects with periodontitis.
METHODS: Samples were obtained from 56 periodontally healthy subjects and 169 subjects with chronic periodontitis. DNA was extra…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Granulomatous amoebic encephalitis (GAE) is a usually fatal disease caused by the free-living amoebae Balamuthia mandrillaris and Acanthamoeba spp. The intent of this study was to determine if the polymerase chain reaction (PCR) could be used retrospectively to detect amoeba mitochondrial 16S rRNA gene DNA in confirmed archival tissue sections from GAE cases stored in our laboratories for 1 to 34 years. The DNA was extracted from deparaffinized sections, and appropriate primer sets for each of the two amoebae were used for amoeba DNA detection. Indirect immunofluorescent (IIF) staining of tiss…
Duplicate PublicationСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to demonstrate the DNA of Paracoccidioides brasiliensis in human serum samples of patients with paracoccidioidomycosis using the polymerase chain reaction (PCR). The diagnosis of paracoccidioidomycosis (PCM) was defined by microscopic observation of the fungus on direct exam or histopathology, culture, and serological positivity. DNA from serum of 33 patients with PCM was extracted and submitted to nested-PCR using primers from the gp 43 gene. Only one sample was positive on nested-PCR. We conclude that the prevalence of fungemia in patients with different clinical fo…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To compare a TaqMan-based real-time polymerase chain reaction (PCR) with conventional PCR, culture, and wet-mount microscopy for the diagnosis of trichomoniasis in women.
METHODS: Vaginal swabs from 119 women were tested for Trichomonas vaginalis by wet mount and culture. Paired vaginal lavage and urine specimens were tested by conventional and real-time PCR.
RESULTS: Using an expanded "gold standard", defined as a positive culture result using vaginal swabs and/or a positive PCR test using TVK3/7 primers, the overall prevalence of T vaginalis in the study population was 65.5% (78…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since Saikku's investigations in 1988 a direct relation between atherosclerosis and infection with Chlamydia pneumoniae has been suspected. The aim of the present study was to examine histologically normal and atherosclerotic femoral arteries of autopsy cases and to correlate histological findings with the presence of Chlamydia pneumoniae which was tested with nested polymerase chain reaction. The study included all of the femoral arteries (of which 16 male, 15 female, aged between 50 and 88 years) obtained by autopsy from the cases occurring between July 1, 1999 and August 31, 1999 in the Med…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Enteroviral infections of the central nervous system (CNS) are often difficult to diagnose, even if consistent conventional laboratory methodologies are used.
OBJECTIVES: To clarify the efficiency of two polymerase chain reaction (PCR) methods for the sensitive detection of enteroviruses and for the identification of enteroviral genotypes based on phylogenetic analysis of the amplified genome sequences, and to facilitate the diagnosis of enteroviral infection in CNS.
STUDY DESIGN: Cerebrospinal fluid (CSF), throat swab, rectal swab, and/or serum samples were collected from 171 pa…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The aetiology of cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) remains unknown despite numerous investigations. In recent years, retroviruses and human herpesviruses have been implicated to play a causal part in CTCL.
OBJECTIVE: The aim of this study was to elucidate the possible aetiopathogenetic role of human herpesviruses (HHV) in mycosis fungoides (MF).
METHODS: Polymerase chain reaction was used to study formalin-fixed, paraffin-embedded lesional skin biopsies from 92 subjects with MF to evidence possible presence of Epstein-Barr virus (EBV) and HHV-6.
RESULTS: Biopsy specimens from nin…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe a sensitive, reliable and reproducible method, based on three multiplex PCR assays, for the rapid detection of seven common alpha-thalassaemia deletions and one alpha-globin gene triplication. The new assay detects the alpha0 deletions - -SEA, - (alpha)20.5, - -MED, - -FIL and - -THAI in the first multiplex PCR, the second multiplex detects the -alpha3.7 deletion and alphaalphaalphaanti3.7 variant, the third multiplex detects the -alpha4.2 deletion. This simple multiplex method should greatly facilitate the genetic screening and molecular diagnosis of these determinants in populati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The multiple sclerosis seems to be the junction between genetics alteration and an unknown environmental factor, that they would … his samples, we extracted the DNA of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), and we analyzed by polymerase chain reaction (PCR) to detect the appearance of herpes simplex virus, varicella zoster virus, Epstein-Barr virus, cytomegalovirus, human herpesvirus 6 (HHV-6), human herpesvirus 7 and human herpesvirus 8.
RESULTS: a) we only found significative difference (p = 0 …
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The presence of Onchocerca volvulus DNA in experimentally infected flies can now be detected by use of the PCR, so that, for example, one infected Simulium damnosum can be detected in a pool of 100 uninfected flies or one S. ochraceum can be detected in pools of 20-40. As this PCR technique is specific for O. volvulus, the results are not confounded by the presence of other, unimportant, Onchocerca species, and the technique could replace time-consuming, manual dissection of flies. In 1996 and 1997, pools of 16-21 Simulium ochraceum were tested by the PCR technique. These flies had been collec
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Trichomonas vaginalis is the most common STD worldwide and the infection has been linked with an increased risk of HIV transmission. We present a detailed comparison between conventional collection and testing methods and the polymerase chain reaction (PCR) tampon test for T vaginalis.
METHODS: Women were tested for the presence of T vaginalis by PCR analysis of a tampon specimen and by conventional methods which included one or more of the following: culture and microscopy from a high vaginal swab (HVS) or endocervical swab (ECS), and microscopy of a Papanicolaou (Pap) smear.
RE…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Demonstration of identical allelic loss on chromosome 11q13 in synchronous in situ (DCIS) and invasive ductal (IDC) breast carcinoma has pro … f interest were specifically isolated by tissue microdissection. The extracted DNA was amplified by polymerase chain reaction (PCR) and analyzed with two polymorphic markers for chromosome 11q13 (INT2 and PYGM). LOH at 11q13 was identified in ILC and LCIS in approximately one third of informative cases. LCIS in association with ILC showed a loss in 50% of cases, whereas pu …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An indirect Treponema pallidum-IgG enzyme-linked immunosorbent assay (Tp-IgG-ELISA) was used for the estimation of intrathecal synthesis of specific IgG antibodies in patients with syphilis. Detection of T. pallidum DNA in cerebrospinal fluid (CSF) samples of syphilitic patients was performed by amplification of treponemal DNA, using the polymerase chain reaction (PCR). Both methods were compared as to their suitability for diagnosis of neurosyphilis in 37 patients with syphilis. Intrathecal synthesis of T. pallidum-specific IgG and PCR was negative in 16 patients with treated syphilis or untr…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Legionella pneumonia can be difficult to diagnose. Existing laboratory tests for detecting Legionella species lack sensitivity or provide only a retrospective diagnosis. We used the polymerase chain reaction (PCR) with primers that amplify a 104-base pair segment of the coding region of the 5S tRNA gene to detect Legionella DNA in urine and serum samples from patients with pneumonia. Stored urine and serum samples from patients enrolled in two prospective studies of pneumonia were tested. Legionella DNA was detected in urine and/or serum samples from 18 (64%) of 28 patients with legionella pne…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymerase chain reaction (PCR) of Epstein-Barr virus (EBV) EBNA-2 type A (PCR-A) along with dot blot hybridization using EBV DNA Bam-W and EBNA-2 type A and B fragment as the probes (DBH-W, -A, and -B) was performed in the nasopharyngeal biopsies. The positive rates of PCR-A, DBH-W, -A and -B were 83.9%, 80.6%, 74.2% and 0.0% in 31 cases of nasopharyngeal, respectively, and 12.0%, 40.0%, 92.0% and 0.0% in 25 cases of chronic nasopharyngitis (NP), respectively. There were significant differences between NPC and NP or non-NPC (P < = 0.0001) detected by PCR-A. The results indicated that positive…
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify a 149 base-pair region of the cytomegalovirus (CMV) genome and a 551 base-pair region of the HIV-1 proviral long terminal repeat (LTR) present in DNA extracted from post-mortem tissue. Multiple tissues (n = 116) obtained from 16 patients which were subjected to PCR were also subjected to cell culture and histopathological analyses. One hundred and seven samples (92%) contained CMV DNA and 66/116 (57%) contained HIV proviral DNA at a level of > or = 10 genomes. Both viruses were detected in 60/116 (51.7%) of samples, with co-infection most…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.