Aflatoxin B1 (AFB1) can cause hepatocellular carcinoma (HCC) through a mutagenic mode of action but can also lead to global changes in gene expression; however, the AFB1 network of molecular pathways involved in HCC is not known. Here, we used toxicogenomic data from human liver cells exposed to AFB1 to infer the network of AFB1-responsive molecular pathways involved in HCC. The following computational tools: STRING, MCODE, cytoHubba, iRegulon, kinase enrichment tool KEA3, and DAVID were used to identify protein-protein interaction network, hub genes, transcription factors (TFs), upstream kina
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diminazene aceturate (DIZE), an antiparasitic, is an ACE2 activator, and studies show that activators of this enzyme may be beneficial for COVID-19, disease caused by SARS-CoV-2. Thus, the objective was to evaluate the in silico and in vitro affinity of diminazene aceturate against molecular targets of SARS-CoV-2. 3D structures from DIZE and the proteases from SARS-CoV-2, obtained through the Protein Data Bank and Drug Database (Drubank), and processed in computer programs like AutodockTools, LigPlot, Pymol for molecular docking and visualization and GROMACS was used to perform molecular dynam
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular transport through nanofluidic structures exhibits properties that are unique at the nanoscale. The high surface-to-volume ratio of nanometer-sized confined spaces renders particle interactions with the surface of central importance. The electrical double layer (EDL) at the solid-liquid interface of charged surfaces generates an enrichment of counterions and the exclusion of co-ions that lead to a change in their diffusivity. In addition, the diffusive transport is altered by steric and hydrodynamic interactions between fluid molecules and the boundaries. An extensive body of literatu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitroxyl (HNO) is a species that has been proposed recently to play different roles in nitrosative stress processes. HNO decomposition in aqueous solution leading to N2O is a fast reaction that competes with many biochemical reactions in which HNO may be involved. Since molecular determinants of this reaction are still not fully understood, we present in this work an exhaustive analysis of the mechanism in terms of electronic-structure calculations as well as state of the art hybrid quantum mechanics/molecular mechanics molecular dynamics simulations. We characterized the reaction mechanism an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The natural products rhizopodin and bistramide belong to an elite class of highly potent actin binding agents. They show powerful antiproliferative activities against a range of tumor cell lines, with IC50 values in the low-nanomolar range. At the molecular level they disrupt the actin cytoskeleton by binding specifically to a few critical sites of G-actin, resulting in actin filament stabilization. The important biological properties of rhizopodin and bistramide, coupled with their unique and intriguing molecular architectures, render them attractive compounds for further development. However
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Qigui Tongfeng tablet (QLTFT) is a traditional Chinese medicine with good effect for treating gout. Here, network pharmacology method and molecular similarity analysis were utilized to study the effective substance basis and molecular mechanism of the QLTFT on the gout. The similarity to the medicinal compounds is reflected in the Tanimoto coefficient that gives the structural similarity of two compounds. Operationally, similar modifiers were described as pairs of concepts with a similarity score of 0. 500. The results of the molecular similarity analysis suggested that the flavonoids in QLTFT
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bromodomains (BRDs) are a diverse family of evolutionarily conserved protein-interaction modules. Among various members of the bromodomain and extra terminal domain family, BRD4 is found to be an important target for many diseases such as cancer, acute myeloid leukemia, multiple myeloma, Burkitt's lymphoma, etc. Therefore, in this study an attempt has been made to screen compounds from NCI Diversity, Drug Bank and Toslab Databases targeting the Kac binding site of BRD4 using molecular docking, molecular dynamics simulations, MM-PB/GBSA binding free energy calculations and steered molecular dyn
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: The aim of this study was to evaluate the impact of chemotherapy with molecular-targeting agents on liver metastases from colorectal cancer.
PATIENTS AND METHODS: Six patients with synchronous colorectal liver metastases who underwent hepatectomy after chemotherapy with S-1 and oxaliplatin (SOX) between January 2010 and December 2011 at the Department of Surgery, Kashiwa Hospital, the Jikei University School of Medicine were enrolled. Two patients received only SOX as chemotherapy, while the others received SOX in combination with one of the three molecular-targeting agents, bevacizumab,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) is a widely used plasticizer present in numerous consumer and medical products and has been associated with adverse effects in multiple organ systems, including the kidney. Chronic kidney disease (CKD) is an increasing global health burden, yet the molecular targets potentially linking DEHP exposure to CKD remain incompletely understood. This study integrated epidemiological analysis, network toxicology, Mendelian randomization (MR), molecular docking, and molecular dynamics simulations to investigate potential molecular targets associated with DEHP exposure a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cysteine proteases are recognized as relevant therapeutic targets in both parasitic diseases and cancer due to their essential biological functions. Among these enzymes, cruzain from Trypanosoma cruzi is an important molecular target for the treatment of Chagas disease. Likewise, human cathepsin L (hCatL) is a potential target for anticancer drug development. Both enzymes share conserved catalytic features, particularly the cysteine-histidine catalytic dyad, which enables interaction with nitrile-based reversible covalent inhibitors. Here, six nitrile-derived inhibitors (Neq1171.1, Neq1172.1,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated and evaluated the antihypertensive effects and mechanisms of Ophioglossum vulgatum(OV) through a combination of computational simulations and in vivo experiments.Initially, an in silico analysis using network pharmacology was employed to identify target proteins, followed by molecular docking and molecular dynamics simulations. Network pharmacology data indicated that OV may influence several pathways involved in blood pressure regulation. Molecular docking revealed the effective targets of OV, showing that some of its major active compounds could potentially bind direc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Subsurface oxygen in oxide-derived copper catalysts significantly influences CO2 activation. However, its effect on the molecular charging process, the key to forming the CO2δ- intermediate, remains poorly understood. We employ many-body perturbation theory to investigate the impact of the structural factors induced by the subsurface oxygen on the charged activation of CO2. By computing the molecular single-particle state energy of the electron-accepting orbital on the Cu (111) surface, we examined how this molecular quasi-particle (QP) energy changes with the varying vicinity of adsorption an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Direct electrical stimulation has been used for decades as a gold standard clinical tool to map cognitive function in neurosurgery patients1-8. However, the molecular impact of electrical stimulation in the human brain is unknown. Here, using state-of-the-art transcriptomic and epigenomic sequencing techniques, we define the molecular changes in bulk tissue and at the single-cell level in the human cerebral cortex following direct electrical stimulation of the anterior temporal lobe in patients undergoing neurosurgery. Direct electrical stimulation surprisingly had a robust and consistent impa
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Four hundred Phytochemical (bio-active) compounds having predictive activity for treating Sickle Cell Anemia were screened, using PASS online computational resource. Twenty-six compounds out of the four hundred compounds which showed high probability for treating sickle were further screened for pharmacokinetics profiles (ADMET properties) using SwissAdmet, AdmetSAR 2 and Pro-tox II online resources. Only thirteen compounds that displayed good ADMET properties from the twenty-six were further used for DFT calculations and molecular docking against carbonmonoxy sickle hemoglobin (PDB ID: 5E6E).
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, the binding behavior of β-sitosterol with lysozyme (LZM) was elucidated by surface plasmon resonance (SPR), computational molecular docking and molecular dynamics simulation studies. Chicken egg white lysozyme (CEWLZM) served as a model protein. Tri-N-acetylchitotriose (NAG3) was used in the redocking experiments to generate precise binding location of the protein. β-sitosterol displayed a slightly better binding energy (-6.68±0.04 kcal/mol) compared to NAG3. Further molecular dynamics simulations and MMPBSA analysis revealed that residues Glu35, Gln57-Asn59, Trp62, Ile98, Ala10
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper describes the in vitro inhibition potential of bisoxadiazole-substituted sulfonamide derivatives (6a-t) against bovine carbonic anhydrase (bCA) after they were designed through computational analyses and evaluated the predicted interaction via molecular docking. First, in silico ADMET predictions and physicochemical property analysis of the compounds provided insights into solubility and permeability, then density functional theory (DFT) calculations were performed to analyse their ionization energies, nucleophilicity, in vitro electron affinity, dipole moments and molecular interac
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Within the realm of pharmacological strategies for cardiovascular diseases (CVD) like hypertension, stroke, and heart failure, targeting the angiotensin-converting enzyme I (ACE-I) stands out as a significant treatment approach. This study employs QSAR modeling using Monte Carlo optimization techniques to investigate a range of compounds known for their ACE-I inhibiting properties. The modeling process involved leveraging local molecular graph invariants and SMILES notation as descriptors to develop conformation-independent QSAR models. The dataset was segmented into distinct sets for training
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent evidence highlights the role of low-grade synovial inflammation in the progression of osteoarthritis (OA). Inflamed synovium of OA joints detected by imaging modalities are associated with subsequent progression of OA. In this sense, detecting and quantifying synovitis of OA by imaging modalities may be valuable in predicting OA progressors as well as in improving our understanding of OA progression. Of the several imaging modalities, molecular imaging such as positron emission tomography (PET) and single-photon emission computed tomography (SPECT) has an advantage of visualizing the ce
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Esculetin is a well-known coumarin derivative found abundantly in nature possessing an extensive array of pharmacological and therapeutic properties. Consequently, to comprehend its molecular recognition mechanism, our objective is to conduct a complete investigation of its interactions with the nucleic acid, specifically ct-DNA, and t-RNA, using spectroscopic and computational techniques. The intrinsic fluorescence of esculetin is quenched when it interacts with ct-DNA and t-RNA, and this occurs through a static quenching mechanism. The thermodynamic parameters demonstrated that the interacti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plamepsin II has been identified as a therapeutic target in the Plasmodium falciparum's life cycle and may lead to a drastic reduction in deaths caused by malaria worldwide. Africa flora is rich in medicinal qualities and possesses both simple and complex bioactive phytochemicals. This study utilized computational approaches like molecular docking, molecular dynamics simulation, quantum chemical calculations and ADMET to evaluate the plasmepsin II inhibitory properties of phytochemicals isolated from African antimalarial plants. Molecular docking was carried out to estimate the binding affinit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования