On page 1594, researchers unveil the workings of YopJ, one of a group of nefarious proteins that Yersinia bacteria--including Y. pestis, the bacterium that is infamous for causing the bubonic plague--deploy. Early in the disease, Yersinia bacteria inject YopJ into macrophage cells of the immune system, where, the researchers have now found, YopJ acts like scissors, cleaving the macrophage proteins that would normally send an SOS to other immune cells for help. Leaving the macrophage stranded clears the way for other Yersinia proteins to destroy the cell.
КомментарийНовостьПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in XPD helicase, required for nucleotide excision repair (NER) as part of the transcription/repair complex TFIIH, cause three distinct phenotypes: cancer-prone xeroderma pigmentosum (XP), or aging disorders Cockayne syndrome (CS), and trichothiodystrophy (TTD). To clarify molecular differences underlying these diseases, we determined crystal structures of the XPD catalytic core from Sulfolobus acidocaldarius and measured mutant enzyme activities. Substrate-binding grooves separate adjacent Rad51/RecA-like helicase domains (HD1, HD2) and an arch formed by 4FeS and Arch domains. XP mut
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A physico-chemical and structural characterization of three 1,4-beta-D-glucan cellobiohydrolases (EC. 3.2.1.91), isolated from a culture filtrate of the white-rot fungus Phanerochaete chrysosporium, reveals that the cellulolytic enzyme secretion pattern and thus the general degradation strategy for P. chrysosporium is similar to that of Trichoderma reesei. Partial sequence data show that two of the isolated enzymes, i.e., CBHI, pI 3.82 and CBH62, pI 4.85, are homologous with CBHI and EGI from T. reesei; while, the third, i.e., CBH50, pI 4.87, is homologous to T. reesei CBHII. Limited proteolys
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural and biochemical studies of the orf12 gene product (ORF12) from the clavulanic acid (CA) biosynthesis gene cluster are described. Sequence and crystallographic analyses reveal two domains: a C-terminal penicillin-binding protein (PBP)/β-lactamase-type fold with highest structural similarity to the class A β-lactamases fused to an N-terminal domain with a fold similar to steroid isomerases and polyketide cyclases. The C-terminal domain of ORF12 did not show β-lactamase or PBP activity for the substrates tested, but did show low-level esterase activity towards 3'-O-acetyl cephalosporin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As a novel therapeutic approach in complement-mediated pathologies, we recently developed a human C3 derivative capable of obliterating functional complement by a catalytic, non-inhibitory mechanism. In this derivative, the C-terminal region of hC3 was substituted by a 275 amino acid sequence derived from the corresponding sequence of cobra venom factor (CVF), a complement-activating C3b homologue from snake venom. In this study, we replaced shorter C-terminal sequences of hC3 by corresponding CVF sequences to further reduce potential immunogenicity and to identify domains essential for the fo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 (SARM1) is an enzyme that cleaves nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) and plays a role in disrupting neural circuits through axon degeneration and cell death. SARM1 is activated by changes in the nicotinamide mononucleotide (NMN)/NAD+ ratio and by various post-translational modifications, but its complete regulatory mechanism remains poorly understood. Here, we report that tripartite motif-containing protein 32 (TRIM32) activates SARM1 through specific ubiquitination triggered by anticancer drug treatment. TRIM32 promotes the attachment of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peptidoglycan hydrolases are promising alternatives for combating pathogens due to their specificity and potent bacteriolytic activity. In this study, a novel M23 peptidase from Streptococcus thermophilus NCTC10353, designated StM23, was discovered and characterized. It exhibited antibacterial activity against Listeria monocytogenes and other Gram-positive bacteria with meso-DAP-type peptidoglycan, including Bacillus subtilis and Bacillus cereus. To enhance StM23's efficacy and specificity, a chimeric enzyme, StM23_CWT, was engineered by fusing its catalytic domain with a cell wall-targeting d…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Set1 is the catalytic subunit of SET1C or COMPASS, which methylates histone H3K4 and serves as a scaffold for the association of seven tightly bound polypeptides. We have employed yeast two-hybrid screenings to determine the interactome of Set1 and each subunit, providing a unique resource for exploring known and novel roles of the complex. Our screenings identified a multitude of potential interactors involved in chromatin regulation, DNA replication, meiotic breaks, and Ty transposition, processes previously associated with SET1C. Consistent with Set1 being an RNA-binding protein, the screen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The carbonic anhydrase isoform IX (hCAIX) is one of the main players in extracellular tumor pH regulation, and it is known to be overexpressed in breast cancer and other common tumors. hCA IX supports the growth and survival of tumor cells, and its expression is correlated with metastasis and resistance to therapies, making it an interesting biomarker for diagnosis and therapy. The aim of this work deals with the development of an MRI imaging probe able to target the extracellular non-catalytic proteoglycan-like (PG) domain of CAIX. For this purpose, a specific nanoprobe, LIP_PepC, was designe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver fibrosis is characterised by the activation of hepatic stellate cells (HSCs) and matrix deposition. Accumulating evidence has revealed that the oncogenic protein tyrosine phosphatase Src homology 2 domain-containing phosphatase 2 (SHP2) acts as a therapeutic target of fibrosis. Although several SHP2 inhibitors have reached early clinical trials, there are currently no FDA-approved drugs that target SHP2. In this study, we aimed to identify novel SHP2 inhibitors from an in-house natural product library to treat liver fibrosis. Out of the screened 800 compounds, a furanogermacrane sesquite
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aminoacyl-tRNA synthetases (ARSs) are essential enzymes with a critical role in protein synthesis: charging tRNA molecules with cognate amino acids. Heterozygosity for variants in five genes (AARS1, GARS1, HARS1, WARS1, and YARS1) encoding cytoplasmic, dimeric ARSs have been associated with autosomal dominant neurological phenotypes, including axonal Charcot-Marie-Tooth disease (CMT). Missense variants in the catalytic domain of YARS1 were previously linked to dominant intermediate CMT type C (DI-CMTC). Here, we report a patient with a missense variant of unknown significance predicted to modi…
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nontoxic, anthrax protective antigen/lethal factor N-terminal domain (PA/LFN ) complex is an effective platform for translocating protei … asic functions of mPA. Moreover, mPA-scFv fusions enable cell-specific delivery of diphtheria toxin catalytic domain and Ras/Rap1-specific endopeptidase to pancreatic cancer cells. Importantly, mPA-scFv fusion-based treatments display potent cell-specific toxicity in vitro, opening fundamentally new routes toward engineered immunotoxins and providing a potential s …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Growing evidence suggests that plasmin is involved in a number of physiological processes in addition to its key role in fibrin cleavage. Pl … bind to plasmin's kringle domain(s) and sulfated glycosaminoglycan mimetics that bind to plasmin's catalytic domain. Plasmin inhibitors have also been explored for resolving other disease states including cell metastasis, cell proliferation, angiogenesis, and embryo implantation. This review highlights functional and structural aspects of plasmin inhibitors with …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To establish a novel, sensitive and high-throughput gelatinolytic assay to define new inhibitors and compare domain deletion mutants of gelatinase B/matrix metalloproteinase (MMP)-9.
METHODS: Fluorogenic Dye-quenched (DQ)™-gelatin was used as a substrate and biochemical parameters (substrate and enzyme concentrations, DMSO solvent concentrations) were optimized to establish a high-throughput assay system. Various small-sized libraries (ChemDiv, InterBioScreen and ChemBridge) of heterocyclic, drug-like substances were tested and compared with prototypic inhibitors.
RESULTS: First, we des
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AXHs (arabinoxylan arabinofuranohydrolases) are alpha-L-arabinofuranosidases that specifically hydrolyse the glycosidic bond between arabinofuranosyl substituents and xylopyranosyl backbone residues of arabinoxylan. Bacillus subtilis was recently shown to produce an AXH that cleaves arabinose units from O-2- or O-3-mono-substituted xylose residues: BsAXH-m2,3 (B. subtilis AXH-m2,3). Crystallographic analysis reveals a two-domain structure for this enzyme: a catalytic domain displaying a five-bladed beta-propeller fold characteristic of GH (glycoside hydrolase) family 43 and a CBM (carbohydrate…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lethal factor (LF) toxin that is produced by Bacillus anthracis plays an important role in the pathogenesis of anthrax. LF has mononucle … e delivery of LF to the cytosol, as all mouse macrophages are killed by polypeptides containing the catalytic domain of Diphtheria toxin fused to the domain of LF required for cytosolic transport. Furthermore, the susceptibility phenotype is dominant to resistance, suggesting that resistance is caused by an absence of or polymorphism in a molecule that acts jointl …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The C5a peptidase from Streptococcus pyogenes (ScpA) is a highly specific enzyme with potential therapeutic value. ScpA is a good model for studying determinants of specificity in the multidomain immunomodulatory enzymes (IMEs), which comprise a large family of bacterial surface proteases. The surface exposed region of ScpA has 5 main domains which includes 3 C-terminal Fn3-like domains (Fn1, Fn2 and Fn3) (Kagawa et al. 2009). Progressive deletion of the Fn3-like domains from the C-ter resulted in loss of enzyme activity and showed an important role for the Fn2 domain in enzyme function. Funct
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genes encoding the pyruvate dehydrogenase (PDH) complex (pdhA, pdhB, pdhC and pdhD) from Mycoplasma hyopneumoniae have been cloned and s … t in pdhC. The lipoyl domain is believed to act as a "swinging arm" that spans the gaps between the catalytic domains of each of the subunits. Portions of the N-terminal regions of pdhA and pdhD were expressed as 6xHis-tag fusion proteins in Escherichia coli and purified by nickel affinity chromatography. The purified proteins were used to raise antibodies in rabb …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peptidoglycan (PG) serves as an essential target for antimicrobial development. An overlooked reservoir of antimicrobials lies in the form of PG-hydrolyzing enzymes naturally produced for polymicrobial competition, particularly those associated with the type VI secretion system (T6SS). Here, we report that a T6SS effector TseP, from Aeromonas dhakensis, represents a family of effectors with dual amidase-lysozyme activities. In vitro PG-digestion coupled with LC-MS analysis revealed the N-domain's amidase activity, which is neutralized by either catalytic mutations or the presence of the immuni
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phytate, which is one of the dominant organic phosphorus compounds in nature, is very stable in soils. Although a substantial amount of phyt … haracterization of recombinant full-length PhyS and its domains demonstrated that Domain II was the catalytic domain responsible for phytate hydrolysis. The full-length PhyS displayed a K(m) of 83 microM with a kcat of 175.9 min(-1) and the Domain II displayed a K(m) of 474 microM with a kcat of 10.6 min(-1). These results confirm that the phyS gene encodes a func …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.