BACKGROUND: Although histologically benign, invasive pituitary adenomas exhibit malignant-like biological behavior, characterized by local invasiveness and high proliferative activity. Clinical management remains challenging due to the absence of effective targeted therapies, difficulties with surgical resection, and high risks of postoperative residual disease and recurrence. Precise therapeutic targets are urgently needed.
METHODS: To investigate molecular mechanisms underlying pituitary adenoma invasion and identify potential therapeutic targets, we collected 216 whole transcriptome sequen
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung neuroendocrine tumours (NETs, also known as carcinoids) are rapidly rising in incidence worldwide but have unknown aetiology and limited therapeutic options beyond surgery. The current WHO classification, based on mitotic count and presence or absence of necrosis, divides lung NETs into grade-1 typical, and grade-2 atypical tumours. This dichotomous classification however does not account for recently described molecular entities nor is it sufficient for clinical management.
METHODS: Here we conducted integrative multi-omic analyses on over 300 lung NETs including whole-genom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundWD Repeat Domain 76 (WDR76) plays a potential role in cellular regulation; however, its comprehensive landscape across human malignancies and its specific biological function in hepatocellular carcinoma (HCC) remain largely unexplored.MethodsWe conducted a systematic pan-cancer analysis utilizing multi-omics data from The Cancer Genome Atlas (TCGA), Genotype-Tissue Expression (GTEx), and Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) atabases to evaluate WDR76 expression, subcellular localization, and its correlation with clinicopathologic features, genomic instability, and immune infiltration
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Considerable interest has recently grown toward the role Schwann cells (SCs) play in controlling the growth of several tumors. TCGA human melanoma database was interrogated focusing on 30 genes preferentially expressed in SCs and not present in melanoma (here referred to as SC-signature). The KM-plotter platform was exploited to address the relation of SC-signature to survival in melanoma patients and in other tumors as specificity controls. In addition, PCA in the GEPIA2 portal was used to address whether the SC-signature discriminates melanomas vs. healthy controls. Finally, the expression o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) have been associated with thyroid dysfunction, but their relationship with papillary thyroid carcinoma (PTC) and relevant molecular processes remains unclear. We integrated bioinformatics analyses, a hospital-based case-control study, and in vitro experiments to investigate associations between PFAS exposure and PTC and to explore potentially relevant post-transcriptional RNA regulatory processes. Transcriptomic data, PFAS-associated genes, and m7G-associated genes were integrated to identify candidate genes. Among 24 overlapping candidates, 21 remain
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: TNFRSF12A is abnormally expressed in various malignancies, especially in stomach adenocarcinoma (STAD), which is related to tumor invasiveness and prognosis of patients. This study examined the expression pattern of TNFRSF12A in STAD and predicted immunotherapy response.
METHODS: Data were derived from The Cancer Gene Atlas (TCGA), Gene Expression Omnibus (GEO), and Gene Expression Profiling Interactive Analysis (GEPIA) to analyze the expression pattern of TNFRSF12A in pan-cancer and STAD, as well as its correlation with clinical features. Biological pathways involved in TNFRSF12A
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Claudin 18.2 (CLDN18.2), a tight junction protein isoform, is an emerging therapeutic target in oncology. CLDN18 is well-characterized in gastric cancer, but its pan-cancer expression profiles and isoform distributions are poorly documented. In the present study, we analyzed CLDN18 expression in patients with solid tumors enrolled in the MONSTAR-SCREEN-2 study using immunohistochemistry (IHC, n = 349) and whole-transcriptome sequencing (WTS, n = 2191). A splice junction analysis algorithm characterized isoform distribution patterns in WTS data and evaluated temporal changes using paired pre- a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colon adenocarcinoma (COAD) has a limited response to immunotherapy due to its immunologically “cold” tumor microenvironment (TME). Efferocytosis is an important process that regulates the TME, but its mechanism and clinical significance in COAD are unclear. METHODS: We integrated histopathological images, transcriptomic profiles, and clinical data from 387 COAD patients. Image features were extracted using ResNet50 and CellProfiler, followed by construction of a multimodal machine learning model to evaluate prognostic risk. We further combined bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diffuse large B cell lymphomas (DLBCLs) are a heterogeneous group of malignancies that can arise in lymph nodes or extranodal locations, including immune-privileged sites. Here, we applied highly multiplexed spatial transcriptomics and proteomics together with genomic profiling to characterize the immune microenvironment architecture of 78 DLBCL tumors. We define seven distinct cellular niches, each characterized by unique cellular compositions, spatial organizations and patterns of intercellular communication associated with niche-specific phenotypes of both T cells and tumor B cells. Among t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer-associated fibroblasts (CAFs) are key regulators of the tumor microenvironment, yet their spatial organization and immunomodulatory functions in H. pylori-associated gastric cancer (GC) remain incompletely understood.
METHODS: We profiled formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tumors from 71 GC patients using spatial transcriptomics and integrated single-cell RNA-seq from three independent cohorts (China, USA, and Singapore). CAF-immune cell colocalization was quantified by neighborhood enrichment and aggregation index score. Ligand-receptor inference and trajectory analys
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gut microbiota has been implicated in various diseases, exerting systemic effects on the host by activating or inhibiting gene expression. However, the precise role of gut microbiota and its downstream targets in hepatocellular carcinoma (HCC) progression remains poorly understood. To address this gap, we developed a computational method, termed the microbial-associated signature (MAS) score, to characterize gut microbiota-induced transcriptional alterations across 33 cancer types and 29 normal tissues. MAS scores exhibited cancer type-specific associations with genomic alterations and immune
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human Papillomavirus-associated cancer remains a global health issue despite the availability of prophylactic vaccination. Two single-chain recombinant antibodies specific for the high-risk HPV16-E6 and E7 oncoproteins were previously developed as intrabodies in HPV16-positive cells. The anti-E6 I7NUC and anti-E7 43M2SD intrabodies demonstrated antiproliferative efficacy in vitro and in mouse tumor models by interfering with p53 and pRb tumor suppressors. This study aimed to explore the mechanism behind this antitumor activity. METHODS: HPV16-positive SiHa cells were electroporated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The immune microenvironment is critical in gastric cancer (GC), yet epithelial-specific genes linked to immune infiltration remain poorly defined. We integrated single-cell RNA-seq (GSE112302) and TCGA-STAD data to identify epithelial-related differentially expressed genes (DEGs). MAGEA3 and MAGEA6 were selected to classify immune subtypes. Immune infiltration was analyzed using ESTIMATE, CIBERSORT, ssGSEA, and Xcell. WGCNA and survival analysis identified prognostic immune-related genes. MAGEA3/6-high tumors showed low immune infiltration, defining an immune-cold subtype, while MAGEA3/6-low t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Pancreatic adenocarcinoma (PAAD) is one of the most lethal cancers worldwide, with more than 95% of PAAD patients not surviving beyond 5 years. Due to its rapid progression, in most cases there is no time for treatment by the time the disease is diagnosed, and metastases have developed in many organs. Therefore, there is currently a need to discover prognostic markers. Anillin actin-binding protein (ANLN) is an actin-binding protein involved in cell division. Its increased expression has been reported in many types of cancer, suggesting that it may be strongly involved in the p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: CD40 is a T-cell co-stimulatory receptor targeted by next-generation immunotherapies. We conducted a pan-cancer transcriptome analysis of CD40, its ligand, and related immune markers to evaluate co-expression patterns and clinical outcomes.
METHODS: We analyzed transcriptome data for CD40, its ligand, and other common checkpoints and co-stimulators (PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA-4, LAG-3, ICOS, CD27, CD28, OX40, and GITR). RNA expression was classified as high (75-100th percentile), moderate (25-74th), or low (0-24th) against a reference population of 735 previously tested solid tumors
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is a prevalent form of cancer globally. This disease is characterized by its complex genetic underpinnings, involving the intricate regulation of multiple genes. Genetic factors influence cellular processes such as growth, differentiation, and apoptosis of oral mucosal cells, thereby promoting or inhibiting tumor formation and progression. Furthermore, environmental factors-including smoking, alcohol consumption, and human papillomavirus (HPV) infection-can significantly increase the risk of developing OSCC. These external influences can impact the disease i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brain metastases (BMs) are frequent and devastating complications of systemic malignancies, necessitating accurate diagnosis and origin identification for effective treatment strategies. Invasive biopsies are currently required for definitive diagnosis, highlighting the need for less invasive diagnostic approaches and robust biomarkers. Circulating microRNAs (miRNAs) have demonstrated potential as sensitive and specific diagnostic biomarkers in various cancers. Thus, our objective was to identify and compare miRNA profiles in BM tissue, cerebrospinal fluid (CSF), and plasma, with a specific fo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BRCA) is one of the most common neoplastic diseases among the female population. There were 43,780 BRCA-related deaths, with a mortality rate of 15% in the United States in 2022. Therefore, it is necessary to screen and validate potential diagnostic and prognostic biomarkers related to BRCA through bioinformatics technology. The GSE42568 and GSE5364 datasets were obtained from the Gene Expression Omnibus database, and the Cancer Genome Atlas BRCA dataset was sourced from the Xena functional genomics platform. Differentially expressed genes were identified across these 3 BRCA dat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anaplastic thyroid cancer (ATC) is an aggressive and rare disease. Rapid metastasis and limited treatments call for additional therapeutic options, including drug repurposing. The early spreading of ATC highlights the importance of rapid therapy success assessment, which could be achieved by measurement of extracellular vesicle (EV)-associated cell-free RNA in liquid biopsy samples. Recent studies have discovered the potential of the receptor tyrosine kinase inhibitor vandetanib for ATC treatment in vitro and in vivo. Given the rarity of ATC patients receiving off-label vandetanib treatment, a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Androglobin (ADGB) is a phylogenetically ancient multi-domain protein with an embedded globin domain, which binds heme and may therefore interact with gaseous molecules. Other globins like neuroglobin, cytoglobin and myoglobin have shown tumor-suppressor or oncogenic roles in a tissue-dependent way, and also ADGB has been suggested as being oncogenic in prostate and brain cancer models. However, ADGB expression in human tumor entities in vivo has not been investigated systematically so far. Here we mined transcriptome data from various cancer types and reveal that ADGB is typically downregulat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования