BRCA1-linked cancers contain abundant ~10 kb 'Group 1' tandem duplications (TDs). Group 1 TDs form at a Tus/Ter replication-fork barrier in DNA-end resection-defective mouse embryonic stem (mES) cells lacking Brca1 exon 11. To elucidate how BRCA1 suppresses Group 1 TDs, we analyzed Brca1 coiled-coil (CC)-domain mutants-separation-of-function alleles impaired for homologous recombination (HR) through loss of PALB2-binding and RAD51-loading functions but competent for DNA-end resection. Notably, Brca1 CC mutants retain the ability to suppress Group 1 TDs in the Tus/Ter system and in a mouse mode…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Engineering polyploid industrial microorganisms is hindered by their intrinsic capacity to repair induced mutations, limiting the efficiency of genome editing and directed evolution. Using the ethanologenic bacterium Zymomonas mobilis- a polyploid alphaproteobacterium that exhibits exceptionally efficient microhomology-mediated end joining (MMEJ)- we demonstrate that RecN is essential for MMEJ and homologous recombination (HR) in vivo. Strikingly, a specialized mutant RecN-K35A, with strongly impaired ATP hydrolysis, specifically blocks MMEJ while leaving HR fully intact. The physiological imp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During high-concentration ethanol fermentation, Saccharomyces cerevisiae often faces multiple stresses, such as high osmotic pressure, ethanol toxicity, and nutrient limitation. These factors collectively limited the production of ethanol. To identify novel targets related to fermentation performance, we employed SHPERM- bCGHR strategy (a marker free allele replacement strategy based on comparative genomics and homologous recombination). We replaced the endogenous PHO4 of the high-producing strain MF01 with the PHO4 allele from MC15, thereby constructing a novel engineered strain MF01-PHO4. Un…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quinofumelin, a quinoline-based fungicide, demonstrated potent antifungal activity against Fusarium graminearum, the pathogen responsible for Fusarium head blight (FHB) in wheat. Previously, we elucidated that quinofumelin targets dihydroorotate dehydrogenase (DHODH), an indispensable enzyme in the de novo pyrimidine biosynthesis pathway. To explore its resistance mechanism, five FgDHODHII site-directed mutants with distinct genotypes were generated using the homologous recombination strategy. Sensitivity assays identified varying resistance levels: FgDHODHII-A94V remained sensitive to quinofu…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mixed yolk sac tumors (YST) with carcinoma or carcinosarcoma (Ca/CS) of the uterus and ovary represent exceptionally rare and aggressive mal … fic evolution. Therapeutically, we identified a high frequency of actionable alterations, including homologous recombination repair (HRR) gene mutations (4/9), HER2 amplification or low expression (7/9), and biomarkers for immunotherapy (positive PD-L1 in 3/9, TMB > 10 mutations > 10 /Mb in 2/9). Consistent with these findings, two patients derived profound clinical benef …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bordetella bronchiseptica is a highly contagious veterinary bacterial respiratory pathogen with a broad host range that can cause a variety … he diversity among the fimbrial subunit genes located within the fimX locus was likely generated by homologous recombination.
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recombinant herpesvirus vectors have emerged as highly potent platforms for next-generation vaccine development, distinguished by their genomic capacity and their unique ability to elicit durable, long-lasting immunity through persistent latent infections. In this review, we trace the evolutionary trajectory of herpesvirus vector engineering-transitioning from traditional homologous recombination to advanced bacterial artificial chromosome (BAC) systems and precise, scarless CRISPR/Cas9 gene editing. We comprehensively evaluate the rational design of classical animal herpesvirus vectors, inclu…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Pacific Biosciences (PacBio) HiFi long-read sequencing enables robust characterization of complex genomic regions, repetitive el … pport functional annotation, mutational signature analysis, tumor purity and ploidy estimation, and homologous recombination deficiency (HRD) assessment. Utilizing nf-core's modular design and containerized execution, nf-core/pacsomatic provides a stable framework for the reproducible discovery of biological insights.
AVAILABILITY: nf-core/pacsomatic is available under t …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cytoplasmic accumulation of damaged DNA to activate the STING pathway has emerged as a promising strategy to enhance tumor immunogenicit … , Sd@Lip enhances DNA damage by simultaneously disrupting both nonhomologous end joining (NHEJ) and homologous recombination (HR) repair pathways, leading to cytoplasmic DNA accumulation that activates STING signaling, induces proinflammatory cytokine release and enhances infiltration of immune effector cells. This immunogenic cascade promotes the recruitment of natural k …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The connection between genetic mutations linked to delamanid resistance and phenotypic resistance remains unclear. We assessed the phenotypic effects of delamanid-resistant mutations in the Mycobacterium tuberculosis H37Rv strain through gene disruption using homologous recombination and complementation tests. Delamanid resistance was assessed by determining the minimum inhibitory concentration (MIC) via the 7H9 microdilution method. Sanger sequencing identified mutations, and conservation of the mutated residues was predicted through multiple sequence alignments of orthologs. A total of 116 i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) plays a key role in DNA damage repair and has become a critical target for tumor therapy. In recent years, several PARP inhibitors, such as Olaparib and Niraparib, have achieved clinical success in breast cancer susceptibility genes (BRCA) mutant tumors by exploiting the synthetic lethality of homologous recombination-deficient cancers. However, problems have emerged in clinical application, such as hematologic toxicity, which may be related to the lack of subtype selectivity of PARP-1/-2. Selective inhibitors of PARP-1 that can overcome toxicity have emerged…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated alterations in DNA damage repair (DDR) genes in cholangiocarcinoma (CCA) influencing cellular vulnerability to DDR i … d KKU-023 cells exhibited the highest PARPi sensitivity. Co-treatment with ATMi induced a synthetic homologous recombination deficiency (HRD) state in BRCA-proficient CCA cells, thereby sensitizing them to PARPi. This drug combination suppressed CCA cell growth via G2/M phase arrest, downregulated cyclin A and B1 expression, and enhanced apoptosis. Mechanistically, this s …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly (ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) is a key enzyme in the base excision repair pathway, crucial for maintaining genomic stability by re … ese results underscore the potential of targeting PARP-1 as a therapeutic strategy for cancers with homologous recombination deficiencies, including prostate, breast, and ovarian cancer, particularly in patients with DNA repair deficiencies.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Some Trichoderma strains have been widely used in agriculture due to their biological control functions against plant pathogens. However, on … videnced by combined analyses of transcriptome and proteome, proteins interaction network, and gene homologous recombination. Overexpression of cystathionine γ-lyase significantly up-regulated expression levels of six pathway proteins and enzyme activities of secreted proteins associated with biocontrol. It also increased contents of cysteine and hydrogen sulfide in enric …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A key event in meiosis is the conversion of a small subset of double strand breaks into interhomolog crossovers. In this study, we demonstra … in the absence of SPO-11 during spermatogenesis. These COSA-1-marked sites are also independent of homologous recombination, and Topoisomerases I and II. We find that the synaptonemal complex, which holds homologs in proximity, differently modulates COSA-1 enrichment to chromosomes in the absence of SPO-11 in males and hermaphrodites. Together, these findings suggest tha …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single circulating tumor cell (sCTC) analysis enables the determination of predominant CTC phenotypes and genotypes. We previously demonstra … nd 12, while CNA dynamics of sCTCs suggested a potential selection of distinct CNAs specific to the homologous recombination pathway. sCTCs revealed persistent CNAs in the CDK4 and emerging ones in the ALK oncogene. Notably, primary tumors revealed considerable fractions of shared genomic aberrations.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii is a globally prevalent parasite capable of establishing lifelong infections, which can have severe consequences in immunocompromised individuals and developing fetuses. GRAs are essential secretory effectors that facilitate nutrient acquisition, modulate host immune responses, and support intracellular survival. In this study, we characterized four putative GRAs (GRA85-88) that co-localize with GRA12 in both tachyzoite and bradyzoite stages. Using CRISPR-Cas9-mediated homologous recombination, we successfully generated knockout strains in both type I RH and type II Pru backg…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SOLACE2 (ACTRN12618000686202) investigates whether 12-weeks of olaparib, or cyclophosphamide-olaparib priming, improves subsequent durvaluma … aparib-durvalumab) and 35.1% (20.4-50.3; olaparib monotherapy). PFS is significantly longer for the homologous recombination deficient (N = 71) as compared to the proficient (HRP) (N = 29) subgroups (Hazard Ratio (HR) 0.55, 0.35-0.87). CUP-CC+ subgroup (N = 58) has a significantly longer PFS (HR 0.31, 0.19-0.49) than CUP-CC- (N = 46). Future studies should investigate whe …
СтатьяКлиническое исследование II фазыРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arsenic is a pollutant that can cross the placenta; however, research on the effects of arsenic exposure during pregnancy on the fertility o … a reduction in oocyte quantity. Arsenic exposure impedes synapsis formation in MPI and compromises homologous recombination-mediated repair of double-strand breaks, resulting in fewer crossovers. This disruption activates the pachytene-checkpoint, hindering the progression of the MPI and resulting in the elimination of defective oocytes through p-Chk2 activation. Our stu …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly (ADP-ribose) polymerase inhibitors have been increasingly used in ovarian cancer treatment. However, the real-world safety data of these drugs in Japanese patients are limited. This retrospective study included 181 patients with ovarian cancer who received olaparib or niraparib at two independent hospitals in Japan between May 2018 and December 2022. Clinical information and blood sampling data were collected. Regarding patient backgrounds, the olaparib group had higher proportions of patients with serous carcinoma, BRCA positivity, homologous recombination deficiency, and those receiving…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования