BACKGROUND AND OBJECTIVE: The salivary transcriptome may present as a readily available and non-invasive source of potential biomarkers. The … d 2 distinct bands at 23S (3800 bp) and 16S (1500 bp) characteristic of bacterial rRNA. Preliminary microarray analysis was performed for 4 samples (P2, P6, H5 and H9). The percentage of genes present in each of the 4 samples was not consistent with about 1.8%-18.7% of genes being detected. Quantitative real-time polymerase chain reaction confirmed that the total RNA …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Exposure to radiation provokes cellular responses, which are likely regulated by gene expression networks. MicroRNAs are small non- … ofiles were evaluated by microarrays and followed by quantitative RT-PCR analysis.
RESULTS: A cDNA microarray analysis found 2183 transcripts being up-regulated and 2917 transcripts down-regulated (P ≤ 0.05, ≥2.0 fold change) in the lung tissues after irradiation. Likewise, a miRNAs microarray analysis indicated 15 miRNA species being up-regulated and 8 down-regulat …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Clostridium perfringens (C. perfringens) is a pathobiont of the intestinal microbiota that can cause severe systemic and enteric diseases. C. perfringens colonizes a variety of hosts and environmental niches, which is the theorized reason for its large genome, low guanine-cytosine content, and small stable core genome. Over 20 putative virulence factors have been described, but only six are included in the used typing scheme. Epidemiological analysis is limited, and to the authors' knowledge, this is the first study for Austria. Furthermore, C. perfringens frequently harbors diff
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Follicular lymphoma (FL) is the second most common lymphoma type. However, the molecular mechanisms underlying its pathogenesis remain poorly understood. This study aimed to identify and validate potential FL biomarkers using a combination of microarray analysis, machine learning, and experimental validation.
METHODS: Differential expression analysis was performed to identify differentially expressed genes (DEGs) between FL patients and matched controls using microarray datasets. Multiple machine learning algorithms were used to identify the hub genes for FL. The predictive perf…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: This study aims to predict the pro-angiogenic functions of monocytic-type myeloid-derived suppressor cells (M-MDSCs) derive … through several bioinformatics tools. Finally, quantitative PCR was used to confirm the results of microarray analysis.
RESULTS: M-MDSCs from mice infected with E. granulosus could promote the formation of tubes from HUVECs in vitro. Moreover, vascular endothelial growth factor (VEGF) showed significantly high expression, whereas soluble fms-like tyrosine kinase-1 …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Everolimus (EVE) is a drug widely used in several renal transplant protocols. Although characterized by a relatively low nephrot … oth HPSE- and AKT-silenced cell lines. AKT is a protein having a central role in EMT. Additionally, microarray analysis identified other 2 genes significantly up-regulated in 100 nM EVE-treated cells (p < 0.005 and FDR < 5%): transforming growth factor beta-2 (TGFβ2) and epidermal growth factor receptor (EGFR). Real-time PCR analysis validated microarray.
CONCLUSION …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Recurrent aphthous ulcer (RAU) is a common oral disease with unclear mechanism. This study aimed to explore the serum signatures of RAU patients via proteomic and transcriptomic analysis.
METHODS: This study was based on clinical observation. Part of serum was used for clinical tests, while the rest was processed for isobaric tags for relative and absolute quantitation (ITRAQ) labeling coupled with two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry (2D LC-MS/MS) combined with microRNA (miRNA) microarrays. Bioinformatic analysis was then used to obtain significant signa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to determine the effect of orexin B (OXB) on the global expression pattern and the relationships among differentially expressed genes (DE-genes) in the transcriptome of myometrial explants during the early implantation period in the pig (day 15 of pregnancy). The changes in the transcriptome profile of the porcine myometrium were investigated using the Porcine (V2) Two-colour Gene Expression Microarray, 4 × 44. An analysis of the data from the microarray experiment revealed that 1540 DE-genes were affected by OXB, of which 1135 exhibited fold changes (FC) greater than 1.2 (P <
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the mechanism of glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchor deficiency in Burkitt lymphoma cell lines.
METHODS: We identified a large GPI anchor protein deficient population in three different Burkitt lymphoma cell lines through proaerolysin treatment of the cells and flow cytometry analysis using a proaerolysin variant (FLAER). The mechanism of GPI anchor protein deficiency was studied by DNA gene sequencing, a cell-free assay to investigate the GPI anchor biosynthetic pathway, microarray analysis, and quantitative real-time polymerase chain reaction.
RESULTS: Burki…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report on a child with Filippi syndrome who shows syndactyly of fingers and toes, severe pre- and post-natal growth retardation, postnatal microcephaly, epilepsy, and severe mental retardation with speech impairment. Standard cytogenetics, CGH microarray, and molecular analysis of the GJA1 (Cx43) gene coding region were normal. We review the literature and provide additional information delineating the genetic and neurological aspects of the syndrome.
Клинический случайСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We undertook a prospective study to quantitate Burkholderia pseudomallei in blood, urine, respiratory secretions, and pus [corrected] obtained from 414 patients with melioidosis. The median was count 1.1, 1.5 x 10(4), 1.1 x 10(5), and 1.1 x 10(7) CFU/mL in these sample types, respectively. This provides important insights into the likely feasibility of future studies such as expression microarray analysis using clinical material.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA sequencing is a recently developed approach for transcriptome profiling with several advantages over gene expression profiling using DNA microarrays. Here we describe a RNA-sequencing protocol optimized for low-input analysis of total RNA from CD138+ purified plasma cells from myeloma patients which is applicable in clinical routine.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Improved insight into the molecular and genetic profile of different types of epithelial ovarian cancer (EOC) is required for understanding the carcinogenesis of EOC and may potentially be exploited by future targeted therapies. The aim of the present study was to identify a unique microRNA (miRNA) patterns and key miRNAs, which may assist in predicting progression and prognosis in high‑grade serous carcinoma (HGSC) and clear cell carcinoma (CCC). To identify unique miRNA patterns associated with HGSC and CCC, a miRNA microarray was performed using Chinese tumor bank specimens of patients with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene expression profiles in the cortex of adult Long-Evans rats as a function of a stressful social loss and victory in inter-male fighting encounters were examined. This social dominance and subordination model has been postulated to simulate early changes in the onset of depression in the losers. Microarrays were fabricated containing 45mer oligonucleotides spotted in quadruplicate and representing 1178 brain-associated genes. Dynamic range, discrimination power, accuracy and reproducibility were determined with standard mRNA "spiking" studies. Gene expression profiles in dominant and subord
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Data regarding the molecular epidemiology, clonal diversity, and resistance mechanisms of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) … ation of antimicrobial resistance, virulence, and biofilm-associated genes were performed using DNA microarray analysis, assigning isolates to clonal complexes (CCs). The diagnostic performance of lateral flow assays (LFAs) for penicillin-binding protein 2a (PBP2a) and Panton-Valentine leukocidin (PVL) detection was evaluated against microarray results. Ten distinct …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: IgG4-related disease (IgG4-RD) is a new clinical entity of unknown etiology characterized by elevated serum IgG4 and tissue infi … IgG4-RD before and after steroid therapy and from healthy controls. Total RNA was extracted and DNA microarray analysis was performed in two IgG4-RD patients to screen for genes showing changes in expression. Candidate genes were validated by real-time RT-PCR in 27 patients with IgG4-RD and 13 healthy controls.
RESULTS: DNA microarray analysis identified 21 genes th …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mutations in MECP2 encoding methyl-CpG-binding protein 2 (MeCP2) cause the X-linked neurodevelopmental disorder Rett syndrome. R … transcripts surpassed the highly significant threshold (P < 0.005, fold change > 1.2) in expression microarray analysis from triplicate cultures. The top 10% of genes with the highest levels of MeCP2 binding were identified in two independent ChIP-seq experiments. Together this integrated, genome-wide screen for MeCP2 target genes provided an overlapping list of 19 h …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Dupuytren's disease (DD) is characterized by fibroblastic proliferation of the palmar fascia, often leading to flexion contracture in the hand. Although there is a strong genetic component the genome-wide expression of novel genes is not known. The purpose of this study was to use DNA microarray technology to identify upregulated genes in DD.
METHODS: Human tissue samples were harvested from 3 patient sources: DD cord tissue (n = 20), normal-appearing adjacent control fascia (n = 15), and palmar fascia from patients having carpal tunnel release (n = 15). DNA microarray analysis was p…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein microarrays have been successfully used for detection of allergen-specific IgE in patient sera. Here, we demonstrate proof-of-concept of a solid-phase technique coupling the high-throughput potential of protein microarrays with the biologically relevant readout provided by IgE reporter cells, creating a novel allergic sensitization detection system. Three proteins (κ-casein, timothy grass pollen extract, polyclonal anti-human IgE) were printed onto three different polymer-coated surfaces (aldehyde-, epoxy- and NHS ester-coated). ToF-SIMs analysis was performed to assess printed protein
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To study the correlation between M2 tumor-associated macrophages (TAMs) and invasion patterns in cervical squamous cell carcinoma (SCC) tissues.
METHODS: In the present observational study, two commercial SCC tissue microarrays were evaluated by immunohistochemical analysis between January 1, 2016, and December 31, 2016. CD163-positive cells in a cervical SCC tissue microarray were identified. Tissue samples were stratified into groups based on a pushing border pattern (PBP), a diffuse infiltration pattern (DIP), or non-tumorous tissues included as a control group; M2 TAM numbers a
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования