Emerging data have shown that microRNAs (miRNAs) have important functions in the processes of cardiac hypertrophy and heart failure that occur during the postnatal period. Cardiac overexpression of miR-195 results in pathological cardiac growth and heart failure in transgenic mice. In the present study, we analyzed the roles of miR-195 in cardiomyocyte hypertrophy and found that miR-195 was greatly upregulated during isoprenaline-induced cardiomyocyte hypertrophy. By using mRNA microarray and molecular approach, we identified a novel putative target of miR-195 called high-mobility group A1 (HM
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
FinO-domain proteins are a widespread family of bacterial RNA-binding proteins with regulatory functions. Their target spectrum ranges from a single RNA pair, in the case of plasmid-encoded FinO, to global RNA regulons, as with enterobacterial ProQ. To assess whether the FinO domain itself is intrinsically selective or promiscuous, we determine in vivo targets of Neisseria meningitidis, which consists of solely a FinO domain. UV-CLIP-seq identifies associations with 16 small non-coding sRNAs and 166 mRNAs. Meningococcal ProQ predominantly binds to highly structured regions and generally acts t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningitidis is a human commensal that can also cause life-threatening meningitis and septicemia. Despite growing evidence for RNA-based regulation in meningococci, their transcriptome structure and output of regulatory small RNAs (sRNAs) are incompletely understood. Using dRNA-seq, we have mapped at single-nucleotide resolution the primary transcriptome of N. meningitidis strain 8013. Annotation of 1625 transcriptional start sites defines transcription units for most protein-coding genes but also reveals a paucity of classical σ70-type promoters, suggesting the existence of activato
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic variants in untranslated regions (UTRs) can alter post-transcriptional regulation, yet functional interpretation remains difficult because regulatory mechanisms differ between 5'UTR and 3'UTR contexts and are not fully captured by generic noncoding-variant scores. We developed UTR-FNex, an interpretable machine-learning framework for prioritizing candidate functional variants in both UTR regions. We first constructed MetaUTR, a harmonized resource of approximately 200,000 UTR variant loci, and derived model-development sets containing 14,627 3'UTR and 3533 5'UTR variants after confiden
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melatonin is a hormone primarily secreted by the pineal gland, best known for regulating circadian rhythms. It also plays a critical role in ovarian physiology by modulating granulosa cell (GC) function during follicular development, although the underlying molecular mechanisms remain incompletely understood. Recent advances in ribosome sequencing (Ribo-seq) have revealed that many small open reading frames (sORFs), previously overlooked in conventional annotations, actually encode functional micropeptides. However, whether melatonin exerts its ovarian effects through such micropeptides has re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 5' untranslated region (5'UTR) regulates protein output through upstream open reading frames (uORFs) and Kozak context, yet most deleteriousness scores rely heavily on evolutionary conservation of its nucleotide positions. Using 5ULTRA, a machine-learning classifier trained on 5'UTR regulatory biology, we annotated rare and low-frequency 5'UTR variants in 408,423 UK Biobank participants. We tested gene-level associations for all 59 quantitative blood-count and serum biochemistry traits. We identified 58 genome-wide significant gene-phenotype associations and CADD 38, including 24 shared, 3
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori (H. pylori) infection is a major risk factor for gastric cancer (GC), but the molecular mechanisms driving H. pylori-induced gastric carcinogenesis remain incompletely understood. This study investigates the role of the AEG-1 3'-untranslated region (3'UTR) as a competitive endogenous RNA (ceRNA) in this process. A ceRNA network was constructed via whole-transcriptome sequencing of H. pylori-associated GC. Gain- and loss-of-function experiments were performed to assess the impact of the AEG-1 3'UTR on epithelial-mesenchymal transition (EMT) in infected GC cells. The regulato
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite growing catalogs of genetic variation linked to human traits and diseases, the functional impact of most genetic variants remains poorly understood. Alternative splicing, particularly in the human brain, represents a key layer of post-transcriptional regulation that may mediate genetic effects on gene expression and protein diversity. In this study, we systematically map allele-specific alternative splicing (ASAS) events in postmortem brain tissues from the Mount Sinai Brain Bank cohort, identifying hundreds of genetically regulated splicing events across four brain regions. Using a co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autism spectrum disorder (ASD) is a neurodevelopmental condition characterized by genetic heterogeneity. Post-transcriptional regulation-particularly alternative polyadenylation (APA)-plays a critical role in the pathogenesis of ASD. APA controls mRNA stability, translational efficiency, and subcellular localization through modulating the length of the 3' untranslated region of mRNA. APA profiling can uncover functionally relevant post-transcriptional alterations often missed by conventional gene expression analyses. However, current ASD analyses still largely rely on differential gene express
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Palindromic rheumatism (PR) is an infrequent form of periodic arthritis. Based on the similarity of the pathogenesis of PR to autoinflammatory syndromes, we previously found that the dominant-active splice variant of the inflammasome adaptor protein, apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD (ASC), which lacks exon 2 (Δexon2), is expressed in Japanese patients with PR.
OBJECTIVE: Elucidation of the mechanism of Δexon2 ASC production and the effect of IL-1β on splicing.
METHODS: The genomic DNA of Japanese patients with PR was sequenced. The effect of the observed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Erectile dysfunction (ED) is one of the common complications of type 2 diabetes mellitus (T2DM), feathered by a complex vascular and endothelial pathogenesis and limited therapeutic options. Endothelin receptor type A (ETA), a key receptor for endothelin, mediates chronic and persistent contractile effects in the penile corpus cavernosum (CC), and is a potential target for ED treatment. Dysregulated microRNAs (miRNAs) have been implicated in the pathophysiology of ED, playing critical regulatory roles and suitable for drug development. This study investigates the role of dysregulated miRNAs in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bee venom serves as an essential defensive weapon for bees and also finds application as a medicinal drug. MicroRNAs (miRNAs) serve as critical regulators and have been demonstrated to perform a variety of biological functions. However, the presence of miRNAs in bee venom needs to be confirmed. Therefore, we conducted small RNA sequencing and identified 158 known miRNAs, 15 conserved miRNAs and 4 novel miRNAs. It is noteworthy that ame-miR-1-3p, the most abundant among them, accounted for over a quarter of all miRNA reads. To validate the function of ame-miR-1-3p, we screened 28 candidate targ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exosomal microRNAs (miRNAs) in circulation were recognized as potential biomarkers for the diagnosis of multiple diseases. However, its potential as a diagnostic hallmark for tuberculosis (TB) has yet to be explored. Here, we comprehensively analyze miRNA profiles in exosomes derived from the plasma of active TB patients and healthy persons to evaluate its efficacy in TB diagnosis. Small-RNA transcriptomic profiling analysis identified a total of 14 differentially expressed miRNAs (DEmiRNAs), among which the diagnostic potential of exosomal miR-766-3p, miR-376c-3p, miR-1283, and miR-125a-5p wa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RAS, the most frequently mutated oncogene that drives tumorigenesis by promoting cell proliferation, survival, and motility, has been perceived as undruggable for the past three decades. However, intense research in the past has mainly focused on KRAS mutations, and targeted therapy for NRAS mutations remains an unmet medical need. NRAS mutation is frequently observed in several cancer types, including melanoma (15-20%), leukemia (10%), and occasionally other cancer types. Here, we report using miRNA-708, which targets the distinct 3' untranslated region (3'UTR) of NRAS, to develop miRNA-based
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
How fetal brain development is regulated at the molecular level is not well understood. Due to ethical challenges associated with research on the human fetus, large animals particularly pigs are increasingly used to study development and disorders of fetal brain. The pig fetal brain grows rapidly during the last ∼ 50 days before birth which is around day 60 (d60) of pig gestation. But what regulates the onset of accelerated growth of the brain is unknown. The current study tests the hypothesis that epigenetic alteration around d60 is involved in the onset of rapid growth of fetal brain of pig.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atypical porcine pestivirus (APPV), an RNA virus member of the Flaviviridae family, has been associated with congenital tremor in newborn piglets. Previously reported quantitative polymerase chain reaction (qPCR)-based assays were unable to detect APPV in novel cases of congenital tremor originated from multiple farms from U.S. Midwest (MW). These assays targeted the viral polyprotein coding genes, which were shown to display substantial variation, with sequence identity ranging from 58.2% to 70.7% among 15 global APPV strains. In contrast, the 5'-untranslated region (5' UTR) was found to have
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cadmium (Cd), which is considered an endocrine disruptor, has been linked to the onset of breast cancer (BC). Our recent study demonstrated that Cd-induced BC progression has a strong correlation with miR-374c-5p dysregulation. The aim of our work was to investigate other potential miRNAs involved in Cd-induced BC cell proliferation and metastasis. In our study, the miRNA profiles of Cd-treated T-47D cells (10 μM, 72 h) were analyzed by miRNA-seq, and our results confirmed that miR-3614-5p was the top downregulated miRNA. Moreover, miR-3614-5p mimic transfection significantly decreased the pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vitamin D receptor (VDR) plays a vital protective role in oral and colonic epithelial cells. Albeit we know that VDR expression is reduced in the mucosal epithelial layers of autoimmune diseases, the mechanism by which VDR is decreased remains elusive.
METHODS: VDR and zinc finger protein 36 (ZFP36) levels in human samples and cell lines were detected by real-time PCR, western blot and immunostaining. Luciferase report assay was used to test cis-elements in VDR gene promoter, real-time PCR was applied to measure mRNA decay and western blot was performed to evaluate protein degrada
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteolysis at the tendon-bone interface can impair pullout strength during tendon-bone healing and lead to surgery failure, but the effects of clinical treatments are not satisfactory. Mesenchymal stem cell (MSC)-derived exosomes have been used as potent and feasible natural nanocarriers for drug delivery and have been proven to enhance tendon-bone healing strength, indicating that MSC-derived exosomes could be a promising therapeutic strategy. In this study, we explored Scleraxis (Scx) dynamically expressed in PDGFRα(+) bone marrow-derived mesenchymal stem cells (BMMSCs) during natural tendon
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have previously reported on the deregulation of cellular microRNAs involved in hematopoiesis and inflammation in human T-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-I)-transformed cells. In this study, we demonstrate that miR-150 and miR-223 specifically target the signal transducer and activator of transcription 1 (STAT1) 3' untranslated region, reducing STAT1 expression and dampening STAT1-dependent signaling in human T cells. The effects of miR-150 and miR-223 on endogenous STAT1 were confirmed using inducible cell lines. Our studies also showed that miR-150 expression is upregulated by interle
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.