BACKGROUND: This study aims to determine the relationship between expression levels of ALDH2 and SOD2 genes and clinical parameters such as alcohol drinking, tobacco smoking, primary site of HNSCC, and human papilloma virus (HPV) state.
METHODS: Gene expression data were obtained from gene expression omnibus (GEO accession number: GSE65858). Clinical data (N = 270) including survival result, gender, age, TNM stage, primary site of HNSCC, HPV status, alcohol drinking, and tobacco smoking habit were analyzed according to gene expression pattern.
RESULTS: ALDH2 gene was expressed in low levels
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA), the most frequent human congenital motor neuron degenerative disease, is caused by loss-of-function mutations in the highly conserved survival motor neuron gene SMN1. Mutations in SMN could affect several molecular processes, among which aberrant pre-mRNA splicing caused by defective snRNP biogenesis is hypothesized as a major cause of SMA. To date little is known about the interactions of SMN with other splicing factor genes and how SMN affects splicing in vivo. The nematode Caenorhabditis elegans carries a single ortholog of SMN, smn-1, and has been used as a m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant glutathione transferases (GSTs) are induced by diverse biotic and abiotic stimuli, and are important for protecting plants against oxidative damage. We have studied the primary transcriptional stress response of the entire Arabidopsis GST family to seven stresses, including both biotic and abiotic stimuli, with a focus on early changes in gene expression. Our results indicate that individual GST genes are highly specific in their induction patterns. Furthermore, we have been able to link individual GSTs to particular stress stimuli. Using RNAi, we successfully co-silenced a group of four
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The region Xp11.23 is a gene-rich, light giemsa-staining segment on the short arm of the X chromosome. In this study, we have characterized the transcriptional regulatory elements in this interval for two adjacent genes: SUV39H1, a regulator of chromatin organization, and the Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP). The WASP gene exhibits two alternate promoters, both of which demonstrate transcription factor binding elements specific to blood cell lineages. Reporter gene expression analyses indicate that both WASP promoters show high levels of expression in different hematopoietic cell lines.
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replication-defective retroviral vectors were created that contained chimeric genes composed of either the albumin (ALB) or the alpha-fetoprotein (AFP) transcriptional regulatory sequences linked to the coding domain of the thymidine kinase gene from Varicella zoster virus (VZV TK). These viruses were used to infect the human hepatoblastoma cell line, HepG2. Subsequent to infection, the infected cells were single-cell cloned. The level of expression of VZV TK from the chimeric genes correlated with the level of endogenous expression of ALB or AFP in most clones, indicating that the transcripti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 5-hydroxytryptamine type 2 receptor gene is transcriptionally induced by 5-HT-mediated activation of the 5-HT2 receptor in rat myometrial smooth muscle cells. We recently cloned the promoter of the rat 5-HT2 receptor gene and showed that a 1.4-kilobase promoter construct transfected into myometrial smooth muscle cells displays both constitutive and serotonin-dependent promoter activity. We have examined a series of deletional mutants of this promoter for their transcriptional activity. Deletions from base pair (bp) -1314 to bp -184 (with respect to the major transcriptional start (site) re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how genetic variation shapes gene regulation in the developing human brain remains a central challenge in neuroscience, particularly in transient cell types and developmental stages where data are limited. We present Seal, an interpretable artificial intelligence (AI) transfer learning framework for genome-based modeling of gene expression and variant effects with spatiotemporal resolution across 26 regions, 30 cell types and 7 developmental stages. Seal predictions provide mechanistic interpretation by linking variants to transcriptional regulators in a spatiotemporal context. A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The helix-loop-helix transcription factor ID3 is a critical regulator of tissue development and homeostasis. Aberrations in ID3 are strongly associated with numerous human disease processes including Burkitt's lymphoma. We previously identified that a single-nucleotide polymorphism (SNP) in ID3 at rs11574 is associated with increased vascular disease burden in three independent cohorts; however, the mechanisms by which this SNP alters ID3 function and impacts vascular cells are unknown. Here, we show that the minor allele of rs11574 specifically disrupts ID3's ability to bind the E-protein E12
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Variants at the CD2AP locus, which encodes a branched-actin regulator, are associated with late-onset Alzheimer's disease (AD), and CD2AP-deficient mice show increased blood-brain barrier (BBB) permeability. CD2AP is enriched in endothelial cells, but its function there is poorly understood. In endothelium, branched actin networks maintain cell-cell junctions and are also required for immune cells to cross through individual endothelial cells (transcellular transendothelial migration, TEM). We previously showed that the Arp2/3 activators N-WASP and WAVE2 contribute to these processes, but the
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast cancer (BRCA) is a common malignant tumor that seriously threatens women's health. Studies have shown that histone modifications (HMs) play a vital role in the occurrence and development of BRCA. This study aims to explore the distribution patterns of HMs in the mammary epithelial cell line (HMEC) and breast cancer cell line (MCF-7), and their potential associations with gene expression, patient prognosis, and drug efficacy.
METHODS: First, the distribution of histone modification (HM) signals in HMEC and MCF-7 cell lines was analyzed. Multiple algorithms were then used to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sensitization of spinal nociceptive circuits plays a crucial role in neuropathic pain. This sensitization depends on new gene expression that is primarily regulated via transcriptional and translational control mechanisms. The relative roles of these mechanisms in regulating gene expression in the clinically relevant chronic phase of neuropathic pain are not well understood. Here, we show that, in mice, changes in gene expression in the spinal cord during the chronic phase of neuropathic pain are substantially regulated at the translational level. Downregulating spinal translation at the chron
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute Myeloid Leukemia (AML) is a heterogeneous hematologic malignancy driven by genetic and epigenetic alterations, where super-enhancers (SEs) play key oncogenic roles, representing promising therapeutic targets in AML. Through H3K27ac ChIP-seq profiling of 7 AML cell lines and 13 primary samples, we identified USP20 as the deubiquitinase that most frequently associated with super-enhancers. Public database analysis confirmed USP20 overexpression in AML and its correlation with adverse prognosis. Genetic knockdown of USP20 via shRNA significantly induced apoptosis and suppressed proliferatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A truncated derivative of Fibroblast growth factor receptor-1 (FGFR1) (tnFGFR1) independently transforms haematopoietic stem cells leading to a stem cell-like leukaemia/lymphoma syndrome (SCLL). In mouse models, these transformed cells show extensive genetic reprogramming that is distinct from cells transformed with full-length chimeric FGFR1 kinases. We now show that the truncated derivative is insensitive to kinase inhibitors, and its increased expression is related to resistance to kinase inhibitors. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) analysis shows that tnFGFR1 can occupy the promoters o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quorum sensing enables bacteria to coordinate gene expression in response to population density through the detection of small-molecule signals. In gram-negative bacteria, LuxR-type transcription factors bind acyl-homoserine lactones to regulate collective behaviors, yet how ligand sensitivity is tuned to shape transcriptional outcomes remains poorly defined. In Pseudomonas aeruginosa, the quorum-sensing receptor RhlR responds to N-butyryl-L-homoserine lactone (C4HSL) and controls late-stage quorum-sensing behaviors, including phenazine biosynthesis. Here, we use a chemical-genetic and structu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Food allergy is a growing global health concern, with increasing prevalence and significant impacts on patients quality of life. Epithelial barrier dysfunction, particularly through the skin-gut axis, has emerged as a critical factor in food allergy pathogenesis. However, the precise mechanisms linking epithelial barrier disruption to immune dysregulation remain poorly understood. This study investigates the effects of tape-stripping-induced epithelial barrier damage on the exacerbation of ovalbumin (OVA)-induced food allergy in a murine model, with a focus on histopathological, im
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Osteoarthritis (OA) is a prevalent degenerative joint disease with a complex molecular basis. This study aims to identify key molecules involved in OA pathogenesis, focusing on the role of acetylation-related gene expression. Methods: Public microarray datasets GSE82107 and GSE169077 were integrated to construct a differential expression landscape between OA patients and healthy controls. Acetylation-linked differentially expressed genes (acetylation-DEGs, ARDEGs) were extracted by intersecting DEGs with a curated set of acetyltransferases, deacetylases and acetylation substrates.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcohol use disorder (AUD) is a leading cause of morbidity and mortality worldwide, characterized by cycles of heightened craving and excessive, uncontrolled consumption of alcohol despite progressive decline in physical and mental health. Voluntary alcohol consumption is influenced by a variety of environmental and genetic factors, including circadian clock genes, whose effects are modulated in a sex-specific manner. The sex-specific role of clock genes in alcohol drinking was identified through selective ablation of Bmal1 and Per2 from neurons of the mouse striatum; however, the contribution
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plants adapt to recurrent drought through transcriptional memory, yet the upstream regulators remain largely unknown. This study integrated expression genome-wide association study (eGWAS) across 115 Arabidopsis thaliana ecotypes with differential methylome profiling to identify these regulators. Focusing on the memory genes LKR, HIS1-3, and DREB1A, eGWAS identified signaling and epigenetic loci involved in ABA/JA responses and DNA methylation. Methylome profiling by whole-genome bisulfite sequencing of ecotypes contrasting in drought tolerance, and in the superinduction of memory genes reveal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cinnamyl alcohol dehydrogenase (CAD) is a key enzyme in lignin biosynthesis, but its role in grapevine cold tolerance is not well understood. Here we identified 23 VvCAD members from the 'Pinot Noir' genome and focused on VvCAD15-like, a Group II member whose expression was induced by cold. Transient overexpression of this gene in grape calli and plantlets increased lignin content, antioxidant enzyme activities (CAT, POD, SOD), and proline level, while decreased MDA, H₂O₂, and membrane permeability. It also upregulated VvCBF1/3 and VvICE1a. Transcriptome data implied potential links between Vv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования