BACKGROUND: Type 1 diabetes (T1D) clusters within families, yet shared genetic susceptibility does not fully explain discordance among relatives. We investigated whether single CpG methylation differences recur independently across multiplex T1D families and whether methylation at these loci segregates with T1D status or relates to HLA class II risk haplotype dosage.
METHODS: Seventeen participants from three multiplex Arab families, including nine with T1D, underwent targeted bisulfite sequencing. Data from two sequencing runs were combined. Each pedigree was analysed independently. Unadjust…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beauvericin (BEA) is an emerging mycotoxin with various reported toxic effects. Since BEA is considered non-genotoxic, epigenetic mechanisms may contribute to its toxicity. This study investigated the effects of BEA on global DNA methylation (5-mC) and hydroxymethylation (5-hmC), the expression of genes involved in these processes, and the modulatory potential of curcumin (CUR). After 24 h of BEA exposure, the IC50 values were 15.93 μM in HepG2 cells and 16.57 μM in HCT116 cells, decreasing to 0.98 μM and 0.30 μM after 48 h. Co-treatment with 5 μM CUR significantly restored cell viability. BEA…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The cost-effectiveness of methylation-guided surveillance after Helicobacter pylori eradication remains uncertain.
RESEARCH DESIGN AND METHODS: From a healthcare system perspective, a cohort model compared annual, biennial, and RIMS1 methylation-guided surveillance over 30 years in Japanese patients aged 50 years with open-type gastric atrophy. Differences in stage at diagnosis were calibrated from annual-surveillance data. Costs and quality-adjusted life-years (QALYs) were discounted at 3.0% annually. Sensitivity analyses examined uncertainty; an exploratory analysis used Korean …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osimertinib, a third-generation EGFR-TKI, is effective for non-small cell lung cancer (NSCLC), but drug resistance significantly worsens patient outcomes. Epigenetic regulation, particularly methylation, is crucial in tumor progression and resistance development. Changes in polygenic methylation patterns are linked to osimertinib resistance in NSCLC, affecting drug target mutations, transporter functions, and signaling pathways. However, the mechanisms by which epigenetic regulation impacts NSCLC and drug resistance are not fully understood. This review summarizes the role of polygenic methyla…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanoma, a malignant skin tumor, has an increasing incidence rate annually and affects the skin, eyes and mucous membranes. Despite advancements in early diagnosis and treatment improving survival rates, invasion and metastasis of melanoma remain major challenges. In-depth research into the pathogenesis of melanoma and novel therapies is essential to enhance patient outcomes. N6-methyladenosine (m6A) methylation, a key RNA modification, regulates gene expression and cellular functions, influencing cell proliferation, differentiation, apoptosis and signal transduction. It is implicated in vari…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple-negative breast cancer (TNBC) exhibits iron homeostasis that supports tumor growth and proliferation, yet the regulatory mechanisms controlling iron flux remain poorly defined. Here, we identify a ferritinophagic cargo receptor NCOA4 as a novel substrate of the lysine methyltransferase SUV39H2, uncovering a previously unrecognized mechanism that regulates ferritinophagy and ferroptosis. SUV39H2 directly binds and mono-methylates NCOA4 at lysine 356, a modification that reduces NCOA4 stability. Mechanistically, K356 methylation enhances NCOA4 interaction with the E3 ligase HERC2, promoti…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sexual size dimorphism (SSD) refers to the differences in body size between males and females. Epigenetic mechanisms, such as DNA methylation, can shape phenotypes; however, their role in SSD remains unclear. Here, we used Cynoglossus semilaevis, a species with larger females (female-biased SSD), as a model to investigate the role of methylation in the emergence and regulation of SSD. Methylomes and transcriptomes were constructed in four tissues (brain, liver, muscle, and gonad) from three key life stages: juveniles (3 months post-fertilization), male mature stage (1 year post-fertilization; …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Chinese Hamster Ovary (CHO) cells are widely used for the production of recombinant therapeutics due to their ability to carry out human-like post-translational modifications. Media adaptation represents a key step in large-scale production to ensure optimal safety and cost efficiency. As DNA methylation is a central epigenetic mechanism underlying adaptive modulation of gene expression, we report here, for the first time, the use of high-coverage whole-genome bisulfite sequencing to generate single-base-resolution maps of CHO cells at different phases of growth in a fed-batch cu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3) activation is crucial in intestinal inflammation and tumorigenesis. However, its metabolic regulation is not well understood. Herein, we identified a macrophage-dependent methionine-S-adenosylmethionine (SAM)-protein arginine methyltransferase 1 (PRMT1)-lactate dehydrogenase A (LDHA)-lactate axis that controls intestinal inflammation through STAT3 regulation. Specifically, SAM promoted STAT3 Y705 phosphorylation and upregulated anti-inflammatory interleukin-10 expression in macrophages. Additionally, genetic ablation of PRMT1 in myeloi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Early detection of colorectal cancer remains critical for reducing disease-specific mortality, yet current noninvasive screening approaches have limitations in sensitivity (Sens), patient adherence, and scalability. We developed and clinically evaluated a non-next-generation sequencing (non-NGS) liquid biopsy assay for colorectal cancer detection based on methylation profiling of circulating cell-free DNA (cfDNA). The assay focuses on 40 CpG regions selected via bioinformatics analysis of public methylome datasets and uses a ten-eleven translocation methylcytosine dioxygenase 2-apo…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Neurotensin receptor 1 (NTSR1) is a high-affinity receptor for neurotensin. Its abnormal expression correlates with cancer develo … munofluorescence. Dot-blot and methylated RNA immunoprecipitation-qPCR were employed to examine m6A methylation levels. The interaction between IGF2 mRNA binding protein (IGF2BP3) and NTSR1 was verified by RNA immunoprecipitation and dual luciferase experiments. Immunohistochemistry was applied to analyze protein expression in mouse tumor tissues.
MEASUREMEN …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation alterations play a crucial role in rectal cancer development. This study identifies and characterizes DNA methylation-driven genes in the TCGA-READ cohort, constructs a prognostic model, and validates its robustness and biological relevance in independent external cohorts. METHODS: Using TCGA-READ (n = 160) as the discovery cohort, we identified 490 methylation-driven genes via MethylMix analysis. A LASSO-derived prognostic model was constructed integrating expression of CCNI2, LINC00899, and ST6GALNAC1. Model performance was assessed by Kaplan–Meier analysis, time-…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein arginine methyltransferase 1 (PRMT1) serves as a crucial regulator of post-translational modifications of proteins. While PRMT1 has been implicated in the progression of various cancers, its specific role in chronic lymphocytic leukemia (CLL) remains to be fully elucidated. This study aimed to investigate the oncogenic function of PRMT1 and assess the therapeutic efficacy of a selective PRMT1 inhibitor, C7280948, in CLL. Elevated expression of PRMT1 was observed in CLL cells and was associated with unfavorable prognosis. Additionally, in vitro and in vivo experiments demonstrated that
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurate detection of MET amplification is essential for guiding targeted therapy in lung adenocarcinoma (LUAD). Conventional methods such as FISH are limited by tissue availability, and ctDNA-based liquid biopsy shows limited sensitivity for amplification detection. DNA methylation profiling offers a promising alternative.
OBJECTIVES: To identify MET amplification-associated DNA methylation features and develop a diagnostic model for MET amplification detection in LUAD.
DESIGN: A retrospective cohort study.
METHODS: Targeted DNA methylation sequencing (Illumina TruSeq Methyl Ca…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Butyrate is one of the three main short-chain fatty acids, and it provides energy, controls the state of the intestinal microbiota and mediates the immune response. Sodium butyrate supplementation improves poultry production and changes the intestinal microbiota dynamically. These changes may affect the liver directly and indirectly through pathways in the gut-liver axis, the bidirectional relationship between the liver and intestines. The study analysed gene expression and methylation in the broiler liver after in-ovo stimulation by sodium butyrate.
MATERIAL AND METHODS: Incuba…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: DNA methylation is an important epigenetic feature associated with genetic regulation, gene expression, and phenotypic variation. However, the genetic architecture, regulatory organization, and trait relevance of the porcine skeletal muscle methylome remain poorly characterized.
OBJECTIVES: This study aimed to characterize the genetic regulation of DNA methylation in porcine skeletal muscle and identify genetically supported relationships among genotype, methylation, gene expression, and complex traits.
METHODS: We integrated 185 whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) dataset…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pituitary neuroendocrine tumours (PitNETs) range from slow-growing to highly aggressive tumours; however, traditional prognostic markers often fail to predict clinical outcomes reliably. DNA methylation has recently emerged as a promising biomarker for assessing tumour behaviour. This systematic review evaluates its predictive value in PitNETs. To systematically assess the clinical applicability of DNA methylation profiles in predicting behaviour of PitNETs. Systematic review. A comprehensive search was conducted in Medline, Embase, Web of Science, and Cochrane CENTRAL on December 13, 2024, wi…
Систематический обзорСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bipolar disorder (BD) is a major mood disorder influenced by both genetic and environmental factors. While DNA methylation from peripheral tissues can reflect both genetic and environmental influences and reveal insights into disease biology, it remains understudied in BD. DNA methylation signatures may complement polygenic scores (PGS) and hold potential as biomarkers. Here, we conducted the largest epigenome-wide association study (EWAS) of BD to date and evaluated the predictive value of polymethylation scores (PMS) in classifying case-control status.
METHODS: DNA methylation f…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Heart failure (HF) is a syndrome of heterogeneous aetiology and multiple exposomal causes. The role of DNA methylation (DNAm) changes in symptomatic HF and its phenotypes is unclear. This work addresses global and regional DNAm patterns and epigenetic ageing in HF.
METHODS: Patients with HF were included from the MyoVasc Study, an investigator-initiated prospective cohort study. Individuals without HF were included from a population-based Gutenberg Health Study. DNAm was measured using the Illumina Infinium MethylationEPIC assay. Epigenetic ageing was calculated using GrimAge and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Asthma is a clinically heterogeneous airway disorder characterized by complex interactions between environmental exposures, immune activation, and molecular regulatory programs, whose underlying mechanisms are not fully elucidated by known genetic loci. DNA methylation serves as a mechanistic interface bridging genetic predisposition and environmental influences; however, most epigenetic studies remain confined to isolated CpG sites, lacking robust biological interpretability.
METHODS: We developed a cross-tissue, multi-cohort, and mechanistically interpretable epigenetic framewor…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.