To know the interaction of amphiphilic drugs nortriptyline hydrochloride (NOT) and promazine hydrochloride (PMZ) with serum albumins (i.e., human serum albumin (HSA) and bovine serum albumin (BSA)), techniques of UV-visible, fluorescence, and circular dichroism (CD) spectroscopies are used. The binding affinity is more in case of PMZ with both the serum albumins. The quenching rate constant (k(q)) values suggest a static quenching process for all the drug-serum albumin interactions. The UV-visible results show that the change in protein conformation of PMZ-serum albumin interactions are more p…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two overlapping cDNA clones corresponding to the 5' region of the Lassa virus S genome RNA were isolated and their nucleotide sequences determined. Similar to Pichinde and lymphocytic choriomeningitis viruses (LCMV), Lassa virus has an ambisense S RNA. The precursor to the viral glycoproteins (GPC) is encoded in viral RNA sequence originating at position 56 and terminating at position 1529 from the 5' terminus of the S RNA. A short, noncoding, intergenic region capable of forming a hairpin structure separates the termination codons of the nucleoprotein (N) and GPC genes. Hydropathic analysis o
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein-protein interactions (PPIs) are fundamental to nearly all cellular processes; however, elucidating the principles governing protein association into complexes remains a significant challenge. Previous studies have shown that protein-protein interfaces can be partitioned into distinct regions-core, rim, and support-that differ in hydration and residue composition. Here, we present a detailed analysis of interactions occurring within each of these interface regions. Extending beyond simple residue proximity or atomic contacts, our analysis, facilitated by our open-source software MICLOT,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Macromolecular complexes are cells' functional units, and their correct and efficient assembly is critical to life's processes. Complex assembly was classically described as the encounter of fully synthesized, mature protein subunits, yet an amalgam of current studies shows that cotranslational assembly is prevalent, in which nascent proteins vectorially form interfaces with their partners during translation. In this review, we examine the advances in this emerging field. We discuss the thermodynamic and kinetic principles underlying different modes of assembly and highlight how the specific s
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Protein Data Bank (PDB) contains more than 235,000 three-dimensional biostructures and is growing at a rate of nearly 10% per year. The PDB is essential to gain knowledge on how proteins and ligands interact and how these interactions are correlated with the quantitative activity of each ligand/target pair. Unfortunately, the lack of a tool that can classify structures as apo or holo, that is by no means straightforward, and differentiate between covalent and non-covalent ligand-protein complexes makes it difficult to obtain the structures that belong to each set. To address this issue, we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-translational modifications (PTMs) within the first 17 amino acids (Nt17) of exon 1 of the Huntingtin protein (Httex1) play important roles in modulating its cellular properties and functions in health and disease. In particular, phosphorylation of threonine and serine residues (T3, S13, and/or S16) has been shown to inhibit Htt aggregation in vitro and inclusion formation in cellular and animal models of Huntington's disease (HD). In this paper, we describe a new and simple methodology for producing milligram quantities of highly pure wild-type or mutant Httex1 proteins that are site-spe
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current limitations in de novo protein structure prediction and design suggest an incomplete understanding of the interactions that govern protein folding. Here we demonstrate that previously unappreciated hydrogen bonds occur within proteins between the amide proton and carbonyl oxygen of the same residue. Quantum calculations, infrared spectroscopy, and nuclear magnetic resonance spectroscopy show that these interactions share hallmark features of canonical hydrogen bonds. Biophysical analyses demonstrate that selective attenuation or enhancement of these C5 hydrogen bonds affects the stabil
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For many decades, protein function was associated with a rigid three-dimensional structure. However, in recent years, interest has grown rapidly in proteins that successfully perform their functions despite being intrinsically disordered. Unfortunately, to date, insufficient structural information has been collected on this novel protein family to analyze its structure-function correlations. To obtain the required structural information on intrinsically disordered beta-casein (b-CN), we used broadband dielectric spectroscopy, which has long been used to study structured proteins. Dielectric me
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We introduce 2D Q-BEST NMR as a quantitative approach for determining protein concentrations and relative state populations from a set of three 1H-15N correlation spectra. The BEST methodology ensures short overall experimental times and highest sensitivity. The method was validated using ubiquitin as a model system, where a precision of approximately 15-20% was achieved at the level of individual cross-peaks. This precision can be further improved by averaging corrected intensities of well-resolved resonances corresponding to the same protein state. The approach was subsequently applied to th
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glucosylceramide (GlcCer) is a common glycosphingolipid that accumulates in cells in response to Gaucher disease, diabetes, and skin disorders in humans and is also found in plants. In animals, GlcCer is catabolized by glucosylcerebrosidase 1 and 2 (GBA1 and GBA2). GBA1 is a lysosomal enzyme in glycoside hydrolase (GH) family GH30, while GBA2 is a membrane-associated cytoplasmic protein in family GH116. Currently, there are no experimental structures of eukaryotic GH116 homologues. Although the bacterial TxGH116 β-glucosidase structure was determined by X-ray crystallography, TxGH116 does not
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The membrane fusion process, mediated by the entry fusion complex (EFC) of the monkeypox virus (MPXV), is crucial for host cell invasion. Apolipoprotein B mRNA Editing Catalytic Polypeptide-like 3 (APOBEC3)-driven mutation bias is a key factor in MPXV's adaptive evolution during its global spread. However, how these mutations affect the structure and function of EFC proteins remains poorly understood. To address this, we performed genomic mutation analysis on globally circulating MPXV clades Ib and IIb, combined with protein monomer, binary, and quaternary complex structure modeling based on A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human NBD domain which is centrally located in the NOD2 protein displays an essential role in oligomerization and initiates the immune response via CARD-RIPK2 interaction. The mutations associated with the NBD domain have been largely implicated in inflammatory disorders such as Blau syndrome and sarcoidosis. This study aims to determine the structural and phenotypic effect of a lethal mutation that occurs in the NBD domain which has an axiomatic impact on protein dysfunction. Initially, the most deleterious missense mutations were screened through various in silico analysis. Out of 33 var
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Serratia marcescens, a Gram-negative nosocomial pathogen secretes a 50 kDa multi-domain zinc metalloprotease called serratiopeptidase. Broad substrate specificity of serratiopeptidase makes it suitable for detergent and food processing industries The protein shows potent anti-inflammatory, anti-edemic, analgesic, antibiofilm activity and sold as an individual or fixed-dose enteric-coated tablets combined with other drugs. Although controversial, serratiopeptidase as drug is used in the treatment of chronic sinusitis, carpal tunnel syndrome, sprains, torn ligaments, and postoperativ
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein misfolding is a common theme in neurodegenerative disorders including Huntington's disease (HD). The HD-causing mutant huntingtin protein (mHTT) has an expanded polyglutamine (polyQ) stretch that may adopt multiple conformations, and the most toxic of these is the one recognized by antibody 3B5H10. Here we show that the 3B5H10-recognized mHTT species has a slower degradation rate due to its resistance to selective autophagy in human cells and brains, revealing mechanisms of its higher toxicity.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An early and continual event in Alzheimer's disease (AD) is upregulation of the immune response concomitant with accumulation of aggregated amyloid-β peptide (Aβ). The mechanisms by which Aβ can trigger an immune response involve stimulation of cell surface receptors and intracellular pathways, as well as internalization of Aβ into the cell cytosol. The HEK293T cell line has been a valuable model system for exploring a variety of biological processes, including internalization of protein aggregates such as Aβ. There have been some questions regarding the role of Aβ conformation in the HEK293T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In plasma, the zymogens factor XII (FXII) and prekallikrein reciprocally convert each other to the proteases FXIIa and plasma kallikrein (PKa). PKa cleaves high-molecular-weight kininogen (HK) to release bradykinin, which contributes to regulation of blood vessel tone and permeability. Plasma FXII is normally in a "closed" conformation that limits activation by PKa. When FXII binds to a surface during contact activation it assumes an "open" conformation that increases the rate of activation by PKa. Mutations in FXII that disrupt the closed conformation have been identified in patients with con
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The causative factors underlying conformational conversion of cellular prion protein (PrPC) into its infectious counterpart (PrPSc) during prion infection remain undetermined, in part because of a lack of monoclonal antibodies (mAbs) that can distinguish these conformational isoforms. Here we show that the anti-PrP mAb PRC7 recognizes an epitope that is shielded from detection when glycans are attached to Asn-196. We observed that whereas PrPC is predisposed to full glycosylation and is therefore refractory to PRC7 detection, prion infection leads to diminished PrPSc glycosylation at Asn-196,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histone deacetylases (HDACs) regulate myriad cellular processes by catalyzing the hydrolysis of acetyl-l-lysine residues in histone and nonhistone proteins. The Zn2+-dependent class IIb enzyme HDAC6 regulates microtubule function by deacetylating α-tubulin, which suppresses microtubule dynamics and leads to cell cycle arrest and apoptosis. Accordingly, HDAC6 is a target for the development of selective inhibitors that might be useful in new therapeutic approaches for the treatment of cancer, neurodegenerative diseases, and other disorders. Here, we present high-resolution structures of catalyt
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxsackievirus A16 belongs to the family Picornaviridae, and is a major agent of hand-foot-and-mouth disease that infects mostly children, and to date no vaccines or antiviral therapies are available. 2A protease of enterovirus is a nonstructural protein and possesses both self-cleavage activity and the ability to cleave the eukaryotic translation initiation factor 4G. Here we present the crystal structure of coxsackievirus A16 2A protease, which interestingly forms hexamers in crystal as well as in solution. This structure shows an open conformation, with its active site accessible, ready for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования