Multidomain proteins are often thought to fold as collections of independently stable domains, a modularity that underpins many assumptions in structural biology and design. Here, we challenge this view by examining the folding behavior of full-length Staphylococcal protein A (SpA), a 516-residue multidomain protein containing five immunoglobulin (Ig)-binding domains. Although each of the five Ig-binding domains of SpA folds stably in isolation (as it is already known experimentally and also confidently predicted by AI models), here, we show that the full-length construct and the individual Ig
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of autoclavable hydrogels has been driven by the need for materials that can withstand the rigors of sterilization without compromising their properties or functionality. Many conventional hydrogels cannot withstand autoclave treatment owing to the breakdown of their composition or structure under the high-temperature and high-pressure environment of autoclaving. Here, the effect of autoclaving on the physical, mechanical, and biological properties of bovine serum albumin methacryloyl (BSAMA) cryogels at three protein concentrations (3, 5, and 10%) was extensively studied. We f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Halloysite clay nanotubes (HNTs) show promising applications as hemostatic materials and tissue-repairing materials owing to their unique tubular structure and physicochemical properties. When HNTs enter the body, the protein corona formed on HNTs affects the properties and behavior of the nanoparticles. Here, bovine plasma protein was used as a model protein to study the protein corona on HNTs (PC@HNTs), using chitosan-coated HNTs as a control. The formation of a stable protein corona layer on HNTs was confirmed by particle size, surface potential, and morphology, while circular dichroism ana
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Steroidogenesis depends on the delivery of free cholesterol to the inner mitochondrial membrane by StAR (steroidogenic acute regulatory protein). Mutations in the StAR gene leads to proteins with limited cholesterol-binding capacity. This gives rise to the accumulation of cytoplasmic cholesterol, a deficit in steroid hormone production and to the medical condition of lipoid congenital adrenal hyperplasia. A detailed understanding of the mechanism of the specific binding of free cholesterol by StAR would be a critical asset in understanding the molecular origin of this disease. Previous studies
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease is characterized by the loss of dopaminergic neurons in the nigrostriatal pathway accompanied by the presence of intracellular cytoplasmic inclusions, termed Lewy bodies. Fibrillized alpha-synuclein forms the major component of Lewy bodies. We reported a specific interaction between rat alpha-synuclein and tat binding protein 1, a subunit of PA700, the regulatory complex of the 26S proteasome. It has been demonstrated that PA700 prevents the aggregation of misfolded, nonubiquinated substrates. In this study, we examine the effect of PA700 on the aggregation of wild-type and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A monoclonal antibody, AC7, directed against the RGD-binding site of the GPIIIa subunit of the platelet fibrinogen receptor, interacts with activated platelet. The H3 region (H3, RQMIRGYFDV sequence) of the complementarity-determining region 3 heavy chain of AC7 inhibits platelet aggregation and fibrinogen binding to platelet. H3 contains the arginine, glycine and aspartate residues, but in an unusual order. The solution structure of the decapeptide has been studied by proton NMR. The NMR data suggested a helical equilibrium. To test whether the helical structure of H3 was biologically relevan
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nerve growth factor (NGF) interacts with a cell surface receptor on responsive neurons to initiate a series of cellular events leading to neuronal survival and/or differentiation. The first step in this process is the binding of NGF to a low affinity and/or a high affinity receptor. In the present report, we have studied the conformation and stability of recombinant receptor extracellular domain (RED) from the human low affinity receptor and the structural basis of its interaction with NGF. Circular dichroism (CD) studies indicate that the RED is primarily random coil in nature with little reg
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
By chemical and enzymatic probing, we have analyzed the secondary structure of rodent BC1 RNA, a small brain-specific non-messenger RNA. BC1 RNA is specifically transported into dendrites of neuronal cells, where it is proposed to play a role in regulation of translation near synapses. In this study we demonstrate that the 5' domain of BC1 RNA, derived from tRNA(Ala), does not fold into the predicted canonical tRNA cloverleaf structure. We present evidence that by changing bases within the tRNA(Ala) domain during the course of evolution, an extended stem-loop structure has been created in BC1
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AlphaFold2 protein structure predictions are widely available for structural biology uses. These predictions, especially for eukaryotic proteins, frequently contain extensive regions predicted below the pLDDT 70 level, the rule-of-thumb cutoff for high confidence. This work identifies major modes of behavior within low-pLDDT regions through a survey of human proteome predictions provided by the AlphaFold Protein Structure Database. The near-predictive mode resembles folded protein and can be a nearly accurate prediction. Barbed wire is extremely unproteinlike, being recognized by wide looping
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The calcium-binding protein S100A9 is recognized as an important component of the brain neuroinflammatory response to the onset and development of neurodegenerative disease. S100A9 is intrinsically amyloidogenic and in vivo co-aggregates with amyloid-β peptide and α-synuclein in Alzheimer's and Parkinson's diseases, respectively. It is widely accepted that calcium dyshomeostasis plays an important role in the onset and development of these diseases, and studies have shown that elevated levels of calcium limit the potential for S100A9 to adopt a fibrillar structure. The exact mechanism by which
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Japanese encephalitis (JE) is inflammation and swelling of the brain caused by the JE virus (JEV), a mosquito-borne member of the Flavivirus family. There are around 68,000 JE cases worldwide each year, many of which result in permanent brain damage and death. There is no specific treatment for JE. Here we present the crystal structure of the JEV capsid protein, a potential drug target, at 1.98 Å, and compare it to other flavivirus capsid proteins. The JEV capsid has a helical secondary structure (α helixes 1-4) and a similar protein fold to the dengue virus (DENV), the West Nile virus (WNV),
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the effects of Echinococcus granulosus sensu stricto (E. granulosus s.s.) reproduction-associated protein EGr_09888 on the development of E. granulosus s.s. protoscoleces (PSCs) in vitro. SWISS-MODEL, Netphos3.1, and PyMOL bioinformatics analysis software, along with subcellular localization prediction, were used to analyze the structure, phosphorylation sites, epitopes, and distribution of the EGr_09888 protein. The recombinant plasmid pET30a-EGr_09888 was constructed for protein expression and purification, and New Zealand white rabbits were immunized with the recombinant prot
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The low density lipoprotein receptor-related protein 1 (LRP1) is a member of the low density lipoprotein receptor family and plays important roles in a number of physiological and pathological processes. Expression of LRP1 requires the receptor-associated protein (RAP), a molecular chaperone that binds LRP1 and other low density lipoprotein receptor family members in the endoplasmic reticulum and traffics with them to the Golgi where the acidic environment causes its dissociation. Exogenously added RAP is a potent LRP1 antagonist and binds to LRP1 on the cell surface, preventing ligands from b
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study aimed to compare the composition structure, interfacial, and antioxidant activities of flaxseed protein isolates (FPIs) in different flaxseed varieties. The results showed that apparently intact protein bodies (PBs) were manifested as densely staining cytoplasmic inclusions with distinct boundaries and varying diameter ranges among different flaxseed varieties. Through alkali extraction with isoelectric precipitation, FPIs exhibited a relatively small and irregular lamellar strip structure with varying sizes and shapes packed with spherical particles in studied flaxseed varie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TcaR and IcaR are a weak and a strong negative regulator of transcription of the ica locus, respectively, and their presence prevents the poly-N-acetylglucosamine production and biofilm formation in Staphylococcus epidermidis. Although TcaR was shown to interact with the ica promoter, the precise binding region and the mechanism of interaction remained unclear. Here we present the 3D structure of TcaR in its apo form and in complex with salicylate as well as several aminoglycoside and beta-lactam antibiotics. A comparison of the native and complex TcaR structures indicates that the mechanism o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Insertion of 3 to 4 mutations, based on in silico modelling, in a diverse set of natural miniproteins generates potent androgen receptor (AR) binders and a clear insight into the structure-activity relationship of such coactivator mimics concerning helix length.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fibronectin is an extracellular matrix glycoprotein involved in cell adhesion and migration events in a range of important physiological processes. Aberrant adhesion of cells to the matrix may contribute to the breakdown of normal tissue function associated with various diseases. The adhesive properties of fibronectin may be mediated by its interaction with collagen, the most abundant extracellular matrix protein. The collagen-binding activity of fibronectin has been localized to a 42 kDa proteolytic fragment on the basis of this fragment's affinity for denatured collagen (gelatin)
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vancomycin and daptomycin are commonly used glycopeptide antibiotics to cure Gram-positive staphylococcal infections. The clinical isolates of mutant Staphylococcus aureus strains, Methicillin-Resistant (MRSA) and Vancomycin-Resistant (VRSA), have developed resistance against these antibiotics. A recently discovered Serine/threonine phosphatase (Stp1) is an Mn+2 containing protein at the active site with a flap sub-domain that participates in the phospho-signaling system of bacterial cell wall formation. The flap sub-domain probably regulates substrates recruitment and release with an extra Mn
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Granulins (GRNs) are a family of small (∼6 kDa) proteins generated by the proteolytic processing of their precursor, progranulin (PGRN), in many cell types. Both PGRN and GRNs are implicated in a plethora of biological functions, often in opposing roles to each other. Lately, GRNs have generated significant attention due to their implicated roles in neurodegenerative disorders. Despite their physiological and pathological significance, the structure-function relationships of GRNs are poorly defined. GRNs contain 12 conserved cysteines forming six intramolecular disulfide bonds, making them rat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lactate dehydrogenase from Plasmodium knowlesi (Pk-LDH) has been suggested as a potential therapeutic target for the development of drugs against malaria disease. This paper reported the screening of compounds which have potentials to be developed as drugs specific for malaria caused by P. knowlesi via in silico screening. Due to the unavailability of Pk-LDH crystal structure, a protein model was built based on the crystal structure of the closest similar protein, lactate dehydrogenase from Plasmodium falciparum (Pf-LDH) with 91% sequence identity between the two enzymes. The model was develop
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования