BACKGROUND: Hepatitis C virus (HCV) resistance-associated variants (RAVs) have been shown to adversely affect treatment response of direct-acting antivirals. Identifying pre-existing RAVs and transmission networks among HIV/HCV genotype 1 (G1)-infected patients from Poland will assist in shaping surveillance strategies for HCV.
METHODS: NS3 and NS5A sequences were obtained from samples of 112 direct-acting antiviral-naive G1 patients (45 G1a and 67 G1b), of which 74 were chronically infected and 38 were diagnosed with acute hepatitis C (AHC). RAVs were identified using geno2pheno, and 98 conc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: MicroRNA (miRNA) processing genes play important roles in the craniofacial development. The aim of this study was to explore the associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) of miRNA processing genes with the risk of non-syndromic orofacial clefts (NSOC).
METHODS: We genotyped 12 potentially functional SNPs from seven miRNA processing genes (GEMIN3, DROSHA, DGCR8, GEMIN4, PIWIL1, XPO5, and DICER) in a case-control study of 602 NSOC cases and 605 controls.
RESULTS: Two SNPs were associated with the susceptibility of CL/P: rs10719 in DROSHA led to an increased risk of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spliceosome is a large ribonucleoprotein complex that removes introns from pre-mRNA transcripts. Mutations in EFTUD2, encoding a component of the major spliceosome, have recently been identified as the cause of mandibulofacial dysostosis, Guion-Almeida type (MFDGA), characterized by mandibulofacial dysostosis, microcephaly, external ear malformations and intellectual disability. Mutations in several other genes involved in spliceosomal function or linked aspects of mRNA processing have also recently been identified in human disorders with specific craniofacial malformations: SF3B4 in Nager
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory syncytial virus (RSV) is the etiological agent of acute respiratory diseases, such as bronchiolitis and pneumonia. The exacerbated production of proinflammatory cytokines and chemokines in the airways in response to RSV is an important pillar in the development of these pathologies. As such, a keen understanding of the mechanisms that modulate the inflammatory response during RSV infection is of pivotal importance to developing effective treatment. The NF-kappaB transcription factor is a major regulator of proinflammatory cytokine and chemokine genes. However, RSV-mediated activati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RAD3 gene of Saccharomyces cerevisiae is required for excision repair of ultraviolet-damaged DNA and is essential for cell viability. The RAD3-encoded protein shares a high degree of homology with the human ERCC2(XPD) gene product. Mutations in XPD, besides causing the cancer-prone syndrome xeroderma pigmentosum, can also result in Cockayne's syndrome and trichothiodystrophy. To investigate the role of RAD3 in viability, we examined here the effect of a recessive, temperature-sensitive (ts) conditional lethal mutation of the gene on transcription by RNA polymerase II. Upon transfer to the
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Autosomal recessive inherited ataxia with oculomotor apraxia type 2 (AOA2), caused by SETX gene mutations, is characterized by early-onset, progressive cerebellar ataxia, peripheral neuropathy, oculomotor apraxia and elevated serum α-fetoprotein (AFP). This study aimed to expand and summarize the clinical and genetic characteristics of SETX variants related to AOA2.
METHODS: The biochemical parameters, electromyogram and radiological findings of the patient were evaluated. Whole-exome sequencing (WES) was performed on the patient using next-generation sequencing (NGS), the variant
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long-term infection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) represents a challenge to virus dispersion and the control of coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. The reason why some people have prolonged infection and how the virus persists for so long are still not fully understood. Recent studies suggested that the accumulation of intra-host single nucleotide variants (iSNVs) over the course of the infection might play an important role in persistence as well as emergence of mutations of concern. For this reason, we aimed to investigate the intra-host evolution
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), a highly pathogenic virus, is responsible for a respiratory disease termed coronavirus disease 2019 (COVID-19). SARS-CoV-2 genome encodes various structural and non-structural proteins, which are necessary for viral entry and replication. Among these proteins, papain-like protease (PLpro), 3C-like protease (3CLpro), RNAdependent RNA polymerase (RdRp), helicase, serine protease, and spike protein are potential targets of herbal remedies and phytocompounds for inhibition of viral infection and replication. Th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rabbit haemorrhagic disease virus Lagovirus europaeus/GI.1d variant (GI.1d/RHDV) was identified in 1990 in France, and until the emergence of the new genotype GI.2, it was the main variant circulating in the country. The early stages of RHDV infection have been described in a few studies of rabbits experimentally infected with earlier strains, but no information was given on the minimum infective dose. We report the genomic and phenotypic characterisation of a GI.1d/RHDV strain collected in 2000 in France (GI.1d/00-21).
RESULTS: We performed in vivo assays in rabbits to study viru
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA) is a neuromuscular disorder caused by homozygous mutation or deletion of the survival motor neuron 1 (SMN1) gene. A second copy, SMN2, is similar to SMN1 but produces ∼10% SMN protein because of a single-point mutation that causes splicing defects. Chronic low levels of SMN cause accumulation of co-transcriptional R-loops and DNA damage leading to genomic instability and neurodegeneration in SMA. Severity of SMA disease correlates inversely with SMN levels. SMN2 is a promising target to produce higher levels of SMN by enhancing its expression. Mechanisms that regu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Infections of Reoviridae consisting of a double-stranded RNA (dsRNA) genome are a possible cause of biliary atresia (BA). The aim of the present study is to clarify the pathophysiological function of dsRNA viruses in the pathogenesis of BA. The expression of dsRNA pattern-recognizing receptors, Toll-like receptor 3 (TLR3), retinoic acid inducible gene I (RIG-I), melanoma differentiation-associated gene-5 (MDA-5), and dsRNA-activated protein kinase R (PKR) was constitutively detected in cultured human biliary epithelial cells (BECs). Stimulation with polyinosinic-polycytidylic acid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: DEAD-box ATPase 24 (DDX24) plays crucial roles in the development and progression of cancers, including oral squamous cell carcinoma (OSCC). However, its regulatory mechanism and functional role remain unclear. This study aims to investigate the regulatory mechanism of DDX24 in OSCC.
DESIGN: DDX24 expression and its clinical significance in OSCC and normal tissues were analyzed through bioinformatics analysis. Small interfering RNA (siRNA) was utilized to knockdown (KD) DDX24 expression in CAL27 cells, and assessed biological functions using CCK8, wound healing assays and transwell
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The flavivirus virion consists of an envelope outer layer, formed by envelope (E) and membrane (M) proteins on a lipid bilayer, and an internal core, formed by capsid (C) protein and genomic RNA. The molecular mechanism of flavivirus assembly is not well understood. Here, we show that Zika virus (ZIKV) NS2A protein recruits genomic RNA, the structural protein prM/E complex, and the NS2B/NS3 protease complex to the virion assembly site and orchestrates virus morphogenesis. Coimmunoprecipitation analysis showed that ZIKV NS2A binds to prM, E, NS2B, and NS3 (but not C, NS4B, or NS5) in a viral RN
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although plasmacytoid dendritic cells (pDCs) represent a rare immune cell type, they are the most important source of type I interferons (IFNs) upon viral infection. Phagocytosed RNA viruses and RNA virus-infected cells are detected by pDCs with the endosomal pattern recognition receptor (PRR) toll-like receptor 7 (TLR7). We showed that replication of the yellow fever live vaccine YF-17D in human pDCs and pDC-like cell lines stimulated type I IFN production through RIG-I (retinoic acid-inducible gene I), a member of the RIG-I-like receptor (RLR) family of cytosolic PRRs. Thus, human pDCs sense
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recognition of viral nucleic acids leads to type I and type III IFN gene expression and activation of host antiviral responses. At present, type III IFN genes are the least well-characterized IFN types. Here, we demonstrate that the p38 MAPK signaling pathway is involved in regulating IFN-λ1 gene expression in response to various types of RNA molecules in human moDCs. Inhibition of p38 MAPK strongly reduced IFN gene expression, and overexpression of p38α MAPK enhanced IFN-λ1 gene expression in RNA-stimulated moDCs. The regulation of IFN gene expression by p38 MAPK signaling was independent of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long noncoding RNAs (lncRNAs) regulate the progression of type 2 diabetes mellitus complicated with obstructive sleep apnoea (T2DM-OSA). However, the role of the lncRNA nuclear paraspeckle assembly transcript 1 (NEAT1) in T2DM-OSA remains unknown. This study aimed to reveal the function of NEAT1 in T2DM-OSA and the underlying mechanism. KKAy mice were exposed to intermittent hypoxia (IH) or intermittent normoxia to generate a T2DM-OSA mouse model. HMEC-1 cells were treated with high glucose (HG) and IH to construct a T2DM-OSA cell model. RNA expression was detected by qRT-PCR. The protein expr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IL-7 is a key factor in T cell immunity and common variants at IL7R, encoding its receptor, are associated with autoimmune disease susceptibility. IL7R mRNA is induced in stimulated monocytes, yet a function for IL7R in monocyte biology remains unexplored. Here we characterize genetic regulation of IL7R at the protein level in healthy individuals, and find that monocyte surface and soluble IL7R (sIL7R) are markedly induced by lipopolysaccharide. In monocytes, both surface IL7R and sIL7R expression strongly associate with allelic carriage of rs6897932, a disease-associated IL7R polymorphism. Mo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella have developed a sophisticated machinery to evade immune clearance and promote survival in the infected cells. Previous studies were mostly focused on either bacteria itself or host cells, the interaction mechanism of host-pathogen awaits further exploration. In the present study, we show that Salmonella can exploit mammalian cell non-classical microRNA processing machinery to further process bacterial small non-coding RNAs into microRNA-like fragments. Sal-1, one such fragment with the highest copy number in the infected cells, is derived from Salmonella 5'-leader of the ribosomal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Molecular diagnosis is difficult to achieve in disease groups with a highly heterogeneous genetic background, such as cerebellar ataxia (CA). In many patients, candidate gene sequencing or focused resequencing arrays do not allow investigators to reach a genetic conclusion.
OBJECTIVES: To assess the efficacy of exome-targeted capture sequencing to detect mutations in genes broadly linked to CA in a large cohort of undiagnosed patients and to investigate their prevalence.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: Three hundred nineteen index patients with CA and without a history of domi
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PROBLEM: Expression patterns and regulation of cytosolic pattern recognition receptors (PRR) NOD-1, NOD-2, RIG-1, and MDA5 have not been elucidated in the human female reproductive tract (FRT).
METHOD OF STUDY: Primary epithelial cells (EC) isolated from Fallopian tube (FT), endometrium (EM), cervix (Cx), and ectocervix (Ecx) were treated with estradiol, poly(I:C), Neisseria gonorrhea (GC), and HIV-1. PRR mRNA expressions were analyzed by Real-time RT-PCR. Conditioned media were analyzed for IL-8 by ELISA.
RESULTS: EC from all FRT compartments constitutively expressed NOD1, NOD2, RIG-1, and
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.