BACKGROUND: Mycobacterium tuberculosis infects one-fourth of the global population, and current challenges such as latent infections, multidrug-resistant strains, and the limited efficacy of the BCG vaccine emphasize the urgent need for next-generation vaccines. This study aimed to introduce novel vaccine candidates, immunoreactive epitopes, and a novel multi-epitope vaccine (MEV).
METHODS: New immunogenic targets were identified based on different characteristics, including subcellular localization, antigenicity, non-similarity to the host proteome, sequence conservation, prevalence, and B-c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The use of omics data, including gene expression profiles, has recently gained increasing attention in drug discovery. Omics-based drug searches and designs are often based on the correlations between chemically induced and disease-induced gene expression profiles; however, the cell specificity has not been considered. In this study, we designed a novel computational method for drug search and design using cell-specific correlations between drugs and diseases. A data completion technique allowed the characterization of cell-specific gene expression patterns in diseased cells. This proposed met
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric cancer is aggressive with poor prognosis due to high invasion and metastasis rates, a hallmark of cancer. The Snail family (SNAI1 and SNAI2) drives EMT, enabling epithelial cells to gain migratory and invasive traits.
METHODS: We used "limma" package to identify genes with differential expression between high and low levels of SNAI1/SNAI2 in TCGA stomach adenocarcinoma dataset, intersecting these with cancer invasion and metastasis genes obtained from 5 databases. Using Cox regression analysis, we developed a risk score model and created a nomogram incorporating clinical d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aimed to identify transcript isoforms of protein-coding genes with potential relevance to the malignant transformation of gut mucosa.
METHODS: Colon cancer cell lines (HCT116, DLD1, SW620) and immortalized cells derived from healthy gut epithelium (HCEC-1CT) were cultured as spheroids and subjected to RNA sequencing to profile both canonical and non-canonical transcripts. The resulting data were compared with prior bioinformatics study findings that analyzed RNA-seq datasets from 473 patient-derived tumor and 417 non-tumor colon tissue samples.
RESULTS: Among 375 trans…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ischemic stroke may impair glymphatic clearance, but whether this is associated with post-stroke brain functional reorganization in humans remains unclear. METHODS: We prospectively enrolled 48 capsular stroke (CS) patients, 28 pontine stroke (PS) patients, and 50 healthy controls. All participants underwent MRI examinations at baseline (< 7 days) and 90 days post-stroke. Cerebrovascular reactivity (CVR) and the diffusion tensor imaging along the perivascular space (DTI-ALPS) index were measured to assess functional reorganization and glymphatic function. Regions with significant i
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Inflammatory bowel disease (IBD) is a group of chronic inflammatory disorders, including ulcerative colitis (UC) and Crohn's disease, affecting the gastrointestinal tract and is associated with high morbidity and mortality. Accumulating evidence indicates that IBD not only impacts the gastrointestinal tract but also affects multiple extraintestinal organs, which may manifest prior to the diagnosis of IBD. Among these extraintestinal manifestations associated with IBD, primary sclerosing cholangitis (PSC) stands out as a prominent example. PSC is recognized as a progressive cholesta
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder that primarily affects memory, thinking, and behavior, leading to dementia, a severe cognitive decline. While no cure currently exists, recent advancements in preventive drug trials and therapeutic management have increased interest in developing clinical algorithms for early detection and biomarker identification. Electroencephalography (EEG) is noninvasive, cost-effective, and has high temporal resolution, making it a promising tool for automated AD detection. However, conventional machine learning approaches often fall sho
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Patients with Human Immunodeficiency Virus (HIV)have an atypical imaging pattern of lymphoma. There is paucity of literature on differences in tumor volume or burden of disease amongst HIV positive patients compared with HIV negative patients and how this correlates with clinicopathological parameters of aggressiveness and prognosis.
METHODS: This was a retrospective cross-sectional study of patients with non-Hodgkin lymphoma which were categorized into HIV positive and HIV negative. The tumor burden, disease sites, international prognostic score and Ki-67 index were recorded. Con
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Brain functional connectivity alterations have been observed in cardiovascular diseases (CVDs), but the causality between brain resting-state functional connectivity networks and CVDs remains undetermined. We aimed to investigate the bidirectional causality between brain network connectivity and CVDs using Mendelian randomization (MR) analysis.
METHODS: Using genome-wide association study (GWAS) data from the UK Biobank (n = 34,691), we conducted bidirectional two-sample MR analyses between 191 resting-state functional MRI phenotypes and four major CVDs: hypertension, atrial fibril
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Post-mastectomy PTSD is a serious mental health issue, but it has not been studied enough, particularly in low-resource settings like Bangladesh. This study aimed to predict PTSD among breast cancer survivors using machine learning (ML) models and identify significant predictors through the Boruta algorithm, a feature selection tool, offering scalable solutions for early detection and intervention.
METHODS: A cross-sectional study of 138 post-mastectomy breast cancer patients was conducted across 3 hospitals in Bangladesh. Data on sociodemographic, health history, social experienc
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deep vein thrombosis (DVT) is a clinically significant condition characterized by the formation of thrombi in deep venous structures, leading to high morbidity and potential mortality. Identifying reliable biomarkers for DVT risk prediction remains challenging due to the intricate genetic and molecular mechanisms underlying the disease. This study aims to investigate the best biomarker for DVT. Our study utilized genome-wide association studies (GWAS) findings coupled with a functional annotation scoring system to identify and prioritize genetic markers with strong associations to DVT. Further
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For more than 5 years, several countries in Latin America have been developing and updating compound databases of natural products (NPs) isolated and characterized by their countries. In parallel, multiple research groups have been collaborating and assembling a unified Latin American Natural Product Database (LANaPDB), an open-access compound collection representative of Latin America that stands out as a geographical region distinct from its vastness and richness of NP resources. Herein, we report a significant update of LANaPDB, which gathers NPs from eight countries. Major updates to the d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The efficiency of Androgen Receptor (AR) pathway inhibitors for prostate cancer (PCa) is on decline due to resistance mechanisms including the occurrence of gain-of-function mutations on human androgen receptor (AR). Hence, understanding and predicting such mutations is crucial for developing effective PCa treatment strategies. Leveraging accu- mulated data on clinically relevant AR mutants with recent advances in deep modeling techniques, this study aims to unveil and quantify critical AR mutation-drug relation- ships. By incorporating molecular descriptors for drugs and mutated genes sequenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advancements in cloud-based machine learning (ML) now allow for the rapid and remote identification of neural-biomarkers associated with common neuro-developmental disorders from neuroimaging datasets. Due to the sensitive nature of these datasets, secure deep learning (DL) algorithms are essential. Although, fully homomorphic encryption (FHE)-based methods have been proposed to maintain data confidentiality and privacy, however, existing FHE deep convolutional neural network (CNN) models still face some issues such as low accuracy, high encryption/decryption latency, energy inefficienc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary angle-closure glaucoma (PACG), an irreversible blinding disease characterized by retinal ganglion cell damage and optic nerve atrophy, exerts significant effects on brain functional networks. Using resting-state functional magnetic resonance imaging (rs-fMRI) data from 34 PACG patients and 34 matched healthy controls (HCs), we extracted four types of connectivity features-voxel-wise static functional connectivity (FC), dynamic functional connectivity (dFC), effective connectivity (EC), and dynamic effective connectivity (dEC)-via the AAL90 (Automated Anatomical Labeling 90) atlas follo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Power-to-power cross-frequency coupling (CFC) is a novel method to index the dynamic spatio-temporal interactions between brain rhythms, including high frequency oscillations (HFOs). This research evaluates this promising method's capacity for seizure detection with intracranial EEG. Seizures can be conceptualized as composites of different electrographic patterns including (1) spike, (2) ripple-on-spike, and (3) ripple-on-oscillation. This study also performs a basic CFC analysis of each of these components which has potential to further the understanding of epileptogenic processes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The important role that the neurotrophin tyrosine kinase receptor - TrkB has in the pathogenesis of several neurodegenerative conditions such are Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Huntington's disease, has been well described. This shouldn't be a surprise, since in the physiological conditions, once activated by brain-derived neurotrophic factor (BDNF) and neurotrophin-4/5 (NT-4/5), the TrkB receptor promotes neuronal survival, differentiation and synaptic function. Considering that the natural ligands for TrkB receptor are large proteins, it is a challenge to discover small molecule c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Different aspects of cognitive functions are affected in patients with Alzheimer's disease. To date, little is known about the associations between features from brain-imaging and individual Alzheimer's disease (AD)-related cognitive functional changes. In addition, how these associations differ among different imaging modalities is unclear. Here, we trained and investigated 3D convolutional neural network (CNN) models that predicted sub-scores of the 13-item Alzheimer's Disease Assessment Scale-Cognitive Subscale (ADAS-Cog13) based on MRI and FDG-PET brain-imaging data. Analysis of the traine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio vulnificus, a gram-negative pathogenic bacterium, transmitted via undercooked seafood or contaminated seawater, causes septicemia and wound infections. In this study, we analyzed 15 clinical and 11 environmental isolates. In total, 20 sequence types (STs), including eight novel STs, were identified. Antibiotic resistance gene analysis commonly detected the cyclic AMP receptor protein (CRP) in both the clinical and environmental isolates. Interestingly, clinical and environmental isolates were non-susceptible to third-generation cephalosporins, such as ceftazidime and cefotaxime, complic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Variable surface antigens (VSAs) encoded by var and vir genes in Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax, respectively, are known to be involved in malaria pathogenesis and host immune escape through antigenic variations. Knowledge of the genetic diversity of these antigens is essential for malaria control and effective vaccine development. In this study, we analysed the genetic diversity and evolutionary patterns of two fragments (DBL2X and DBL3X) of VAR2CSA gene and four vir genes (vir 4, vir 12, vir 21 and vir 27) from different endemic regions, including Southeast Asia and sub-Saharan A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования