Dysregulation of RNA binding proteins (RBPs) is a hallmark in cancerous cells. In acute myeloid leukaemia (AML) RBPs are key regulators of tumour proliferation. While classical RBPs have defined RNA binding domains, RNA recognition and function in AML by non-canonical RBPs (ncRBPs) remain unclear. Given the inherent complexity of targeting AML broadly, our goal was to uncover potential ncRBP candidates critical for AML survival using a CRISPR/Cas-based screening. We identified the glycolytic enzyme glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) as a pro-proliferative factor in AML cells. Bas
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endogenous mitochondrial genes encode critical oxidative phosphorylation components and their mutation results in a set of disorders known collectively as mitochondrial encephalomyopathies. There is intensive interest in modulating mitochondrial function as organelle dysfunction has been associated with numerous disease states. Proteins encoded by the mitochondrial genome cannot be genetically manipulated by current techniques. Here we report the development of a mitochondrial-targeted RNA expression system (mtTRES) utilizing distinct non-coding leader sequences (NCLs) and enabling in vivo exp
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Igf2 and H19 are reciprocally imprinted genes that are closely linked and coexpressed in tissues of mesodermal and endodermal origin. Here we report that coexpression of these genes is also found in specific fetal tissues of neuroectodermal origin, that is in the ventral midline region of both the hindbrain and spinal cord. For cells of neuroectodermal origin, complete absence of Igf2 and H19 transcription was previously described. Analysis of allele-specific expression of both Igf2 and H19 in the ventral midline region of the hindbrain shows that H19 is expressed monoallelically, with the pat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute kidney injury (AKI) is a major complication of lupus nephritis and kidney transplantation, inevitably causing ischemia-reperfusion (I/R) injury. We previously confirmed that high-dose voclosporin induces drug nephropathy through aberrant peroxisome accumulation. The latter induces increased renal indole-3-aceticT acid (IAA) production due to the decreased expression of the IAA-degrading enzyme indolethylamine N-methyltransferase (INMT). Conversely, INMT overexpression prevents this nephropathy, suggesting that high-dose voclosporin could enable a novel therapeutic approach. This prompted
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer-associated fibroblasts (CAFs) are key regulators of the tumor microenvironment, yet their spatial organization and immunomodulatory functions in H. pylori-associated gastric cancer (GC) remain incompletely understood.
METHODS: We profiled formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tumors from 71 GC patients using spatial transcriptomics and integrated single-cell RNA-seq from three independent cohorts (China, USA, and Singapore). CAF-immune cell colocalization was quantified by neighborhood enrichment and aggregation index score. Ligand-receptor inference and trajectory analys
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Protein homeostasis is critical to the survival of multiple myeloma cells. Although this is targeted with proteasome inhibitors, mRNA translation inhibition has not entered trials. Recent work illustrates broad sensitivity of multiple myeloma cells to the translation inhibitor omacetaxine. We hypothesized that understanding how multiple myeloma becomes resistant will lead to the development of drug combinations to prevent or delay relapse. We generated omacetaxine resistance in H929 and MM1S multiple myeloma cell lines and compared them with parental lines. Resistant lines displaye
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV-1 viral core transport to the nucleus, an early infection event, triggers the redistribution of cleavage and polyadenylation specificity factors (CPSF) 5 and CPSF6 to nuclear speckles, forming puncta-like structures. CPSF5 and CPSF6 regulate alternative polyadenylation (APA), which governs approximately 70% of gene expression. APA alters the lengths of mRNA 3'-untranslated regions (3'-UTRs), which contain regulatory signals influencing RNA stability, localization, and function. We investigated whether HIV-1 infection-induced changes in CPSF5 and CPSF6 subcellular localization are accompani
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lysyl oxidase-like 2 (LOXL2) is an extracellular copper-dependent enzyme that plays a central role in fibrosis by catalyzing the crosslinking and deposition of collagen. Therapeutic LOXL2 inhibition has been shown to suppress liver fibrosis progression and promote its reversal. This study investigates the efficacy and underlying mechanisms of human umbilical cord-derived exosomes (MSC-ex) in LOXL2 inhibition of liver fibrosis. MSC-ex, nonselective LOX inhibitor β-aminopropionitrile (BAPN), or PBS were administered into carbon tetrachloride (CCl4)-induced fibrotic livers. Serum LOXL2 and collag
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To evaluate potential effects of gastric inflammation on Helicobacter pylori diversification and evolution within the stomach, we experimentally infected Mongolian gerbils with an H. pylori strain in which Cag type IV secretion system (T4SS) activity is controlled by a TetR/tetO system. Gerbils infected with H. pylori under conditions in which Cag T4SS activity was derepressed had significantly higher levels of gastric inflammation than gerbils infected under conditions with repressed Cag T4SS activity. Mutations in the 5' untranslated region (UTR) of katA (encoding catalase) were detected in
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vascular rarefaction due to impaired angiogenesis is associated with contractile dysfunction and the transition from compensation to decompensation and heart failure. The regulatory mechanism controlling vascular rarefaction during the transition remains elusive. Increased expression of a nuclear RNA-binding protein CUGBP Elav-like family member 1 (CELF1) in the adult heart is associated with the transition from compensated hypertrophy to decompensated heart failure. Elevated CELF1 level resulted in degradation of the major cardiac gap junction protein, connexin 43, in dilated cardiomyopathy (
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS/HYPOTHESIS: The Diabetes Virus Detection (DiViD) study is the first study to laparoscopically collect pancreatic tissue and purified pancreatic islets together with duodenal mucosa, serum, peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and stools from six live adult patients (age 24-35 years) with newly diagnosed type 1 diabetes. The presence of enterovirus (EV) in the pancreatic islets of these patients has previously been reported.
METHODS: In the present study we used reverse transcription quantitative real-time PCR (RT-qPCR) and sequencing to characterise EV genomes present in different
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the value of miR-222 in hypertrophic scars (HS). Specific mechanisms were used to measure the level of miR-222, while MTT assay, flow cytometry, western blot and qRT-PCR were employed to detect the relative proteins after fibroblasts were transfected with the miR-222 mimic/inhibitor. The direct target of miR-222 was determined by Dual-Luciferase Reporter assay. Furthermore, qRT-PCR and western blot were employed to detect the matrix metalloproteinase 1 (MMP1) RNA/protein after fibroblasts were transfected with the miR-222 mimic/inhibitor. These results revealed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial infections and the rise of antibiotic resistance, especially multidrug resistance, have generated a clear need for discovery of novel therapeutics. We demonstrated that a small-molecule drug, PKZ18, targets the T-box mechanism and inhibits bacterial growth. The T-box is a structurally conserved riboswitch-like gene regulator in the 5' untranslated region (UTR) of numerous essential genes of Gram-positive bacteria. T-boxes are stabilized by cognate, unacylated tRNA ligands, allowing the formation of an antiterminator hairpin in the mRNA that enables transcription of the gene. In the a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bone nonunion caused by bacterial infection accounts for bone fractures, bone trauma and bone transplantation surgeries. Severe consequences include delayed unions and amputation and result in functional limitations, work disability, and poor quality of life. However, the mechanism of bone nonunion remains unknown. In this study, we aimed to screen the miRNA biomarkers of bacterial bone infection and investigated whether miRNAs regulate the osteoblasts and thus contribute to bone nonunion. We established a miRNA-mRNA network based on high-throughput RNA sequencing to compare the model rabbits
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fragile X Syndrome (FXS), the most common form of inherited mental retardation, is caused by a trinucleotide repeat expansion (CGG) in the 5'-untranslated region of the Fragile X Mental Retardation 1 (FMR1) gene located at Xq27.3. Patients with fragile X -related mental retardation, carry the full mutation CGG-repeat expansions (>200 CGG repeats), which are generally accompanied by hypermethylation of the promoter region, with the consequent transcriptional silencing of the FMR1 gene and absence of the encoded FMR1 protein (FMRP). Expansion of the CGG triplet number above the normal range (n=5
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tubulointerstitial fibrosis (TIF) is crucial in the development of renal fibrosis in diabetic nephropathy(DN). Previous data shows that SIRT1 plays an important role on fibrosis, but the effect on TIF in DN and underlying mechanisms remains uncertain. In this study, we evaluated the vital role of SIRT1 and identified SIRT1 as a downstream target gene of microRNA-34a-5p (miR-34a-5p) in TIF of DN. The result revealed that expression of miR-34a-5p, fibronectin(FN),collagen type I (COL1) and transforming growth factor β1 (TGF-β1) were up-regulated accompanied by the corresponding down-regulation o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV) infection of pregnant women can cause a wide range of congenital abnormalities, including microcephaly, in the infant, a condition now collectively known as congenital ZIKV syndrome. A vaccine to prevent or significantly attenuate viremia in pregnant women who are residents of or travelers to epidemic or endemic regions is needed to avert congenital ZIKV syndrome, and might also help to suppress epidemic transmission. Here we report on a live-attenuated vaccine candidate that contains a 10-nucleotide deletion in the 3' untranslated region of the ZIKV genome (10-del ZIKV). The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Otosclerosis is a relatively common heterogenous condition, characterized by abnormal bone remodelling in the otic capsule leading to fixation of the stapedial footplate and an associated conductive hearing loss. Although familial linkage and candidate gene association studies have been performed in recent years, little progress has been made in identifying disease-causing genes. Here, we used whole-exome sequencing in four families exhibiting dominantly inherited otosclerosis to identify 23 candidate variants (reduced to 9 after segregation analysis) for further investigation in a secondary c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Posttranscriptional machinery regulates inflammation and is associated with autoimmunity as well as tumorigenesis in collaboration with transcription factors. We previously identified the tumor suppressor gene transformed follicular lymphoma (TFL) on 6q25 in a patient with follicular lymphoma, which transformed into diffuse large B cell lymphoma. TFL families have a common RNase domain that governs macrophage-mediated inflammation. In human peripheral blood, TFL is dominantly expressed at the glycine- and tryptophan-rich cytoplasmic processing bodies of T lymphocytes, and it is persistently up
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the past decade, there has been an upsurge in the number of newly described insect-specific flaviviruses isolated pan-globally. We recently described the isolation of a novel flavivirus (tentatively designated 'Nhumirim virus'; NHUV) that represents an example of a unique subset of apparently insect-specific viruses that phylogenetically affiliate with dual-host mosquito-borne flaviviruses despite appearing to be limited to replication in mosquito cells. We characterized the in vitro growth potential and 3' untranslated region (UTR) sequence homology with alternative flaviviruses, and evalu
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.