RATIONALE: Castration-resistant prostate cancer (CRPC) poses significant therapeutic challenges due to its aggressive nature and limited effective treatments. Although PARP inhibitor olaparib has been approved for metastatic CRPC patients bearing BRCA1/2 mutations, its application is confined to this specific patient subpopulation. The induction of "BRCAness" feature in CRPC patients without BRCA1/2 mutations becomes a significant challenge.
METHODS: A transcriptomic analysis to identify potential "BRCAness" regulator was performed on 921 prostate cancer (PCa) patients from 6 public datasets
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DDX11 is a DNA helicase involved in critical cellular functions, including DNA replication/repair/recombination as well as sister chromatid cohesion establishment. Bi-allelic mutations of DDX11 lead to Warsaw breakage syndrome (WABS), a rare genome instability disorder marked by significant prenatal and postnatal growth restriction, microcephaly, intellectual disability, and sensorineural hearing loss. The molecular mechanisms underlying WABS remain largely unclear. In this study, we uncover a novel role of DDX11 in regulating the macroautophagic/autophagic pathway. Specifically, we demonstrat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replication protein A (RPA), a heterotrimer with subunits of molecular masses 70, 32, and 14 kDa, is a single-stranded-DNA-binding factor involved in DNA replication, repair, and recombination. There have been only three reported cases of anti-RPA in systemic lupus erythematosus (SLE) and Sjögren syndrome (SjS). This study sought to clarify the clinical significance of autoantibodies against RPA. Sera from 1,119 patients enrolled during the period 2000 to 2005 were screened by immunoprecipitation (IP) of 35S-labeled K562 cell extract. Antigen-capture ELISA with anti-RPA32 mAb, immunofluorescen
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Schistosomiasis is one of the world's most prevalent zoonotic diseases and a serious worldwide public health problem. Since the tegument (TG) of Schistosoma japonicum is in direct contact with the host and induces a host immune response against infection, the identification of immune response target molecules in the schistosome TG is crucial for screening diagnostic antigens for this disease.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: In this study, an immunoproteomics approach used TG proteins as screening antigens to identify potential diagnostic molecules of S. japonicum. Ten spots corres
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Translesion synthesis (TLS) is the major pathway by which mammalian cells replicate across DNA lesions. Upon DNA damage, ubiquitination of proliferating cell nuclear antigen (PCNA) induces bypass of the lesion by directing the replication machinery into the TLS pathway. Yet, how this modification is recognized and interpreted in the cell remains unclear. Here we describe the identification of two ubiquitin (Ub)-binding domains (UBM and UBZ), which are evolutionarily conserved in all Y-family TLS polymerases (pols). These domains are required for binding of poleta and poliota to ubiquitin, thei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
XPA, XPC-hHR23B, RPA, and TFIIH all are the damage recognition proteins essential for the early stage of nucleotide excision repair. Nonetheless, it is not clear how these proteins work together at the damaged DNA site. To get insight into the molecular mechanism of damage recognition, we carried out a comprehensive analysis on the interaction between damage recognition proteins and their assembly on damaged DNA. XPC physically interacted with XPA, but failed to stabilize the XPA-damaged DNA complex. Instead, XPC-hHR23B was effectively displaced from the damaged DNA by the combined action of R
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The interstrand cross-link repair gene SNM1 of Saccharomyces cerevisiae was examined for regulation in response to DNA-damaging agents. Induction of SNM1-lacZ fusions was detected in response to nitrogen mustard, cis-platinum (II) diamine dichloride, UV light, and 8-methoxypsoralen + UVA, but not after heat-shock treatment or incubation with 2-dimethylaminoethylchloride, methylmethane sulfonate or 4-nitroquinoline-N-oxide. The promoter of SNM1 contains a 15 bp motif, which shows homology to the DRE2 box of the RAD2 promoter. Similar motifs have been found in promoter regions of other damage-in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: During a latent tuberculosis infection, there exists a dynamic equilibrium between the host and the 'dormant' bacterium wherein they mutually influence each other. An understanding of the host genetic response to 'dormant' tubercle bacilli during infection is necessary for developing targeted strategies against them.
RESULTS: A previously established infection model based on Vitamin C-induced Mtb dormancy was utilized in the present study to identify host responses to 'dormant' Mycobacterium tuberculosis (Mtb) infection by analyzing host transcriptomic data generated from Mtb-infe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sonodynamic therapy (SDT) is a promising noninvasive cancer treatment, but the performance of semiconductor sonosensitizers is often limited by rapid electron-hole recombination and insufficient reactive oxygen species (ROS) generation. Herein, ZnO-Au nanocomposites were developed by anchoring Au nanoparticles onto ZnO nanosheets through photoinduced deposition, with an actual Au loading of 4.83 wt%. This metal‑semiconductor heterostructure markedly improved charge separation, reduced interfacial charge‑transfer resistance. EPR measurements in cell‑free conditions confirmed enhanced ultrasound
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer, ranking as the tenth most common cancer globally, lacks genomic characterization in Bangladeshi patients. This study is an exploratory analysis of the genomic landscape of bladder cancer in this population by conducting whole-exome sequencing (WES) on tumor (median coverage = 65X) and matched blood (median coverage = 68X) samples from four patients at the National Institute of Cancer Research and Hospital in Dhaka, using the Illumina HiSeq platform. Somatic mutations were identified using GATK Mutect2 and analyzed with bioinformatics tools to explore potential genetic alteratio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly(ADP-ribose) polymerase inhibitors (PARPis) have revolutionized the treatment of homologous recombination-deficient (HRD) cancers, particularly those with BRCA1/2 mutations. However, their clinical utility is mainly restricted to HRD tumors and also hindered by innate or acquired drug resistance. Consequently, expanding the efficacy of PARPis to HR-proficient tumors represents a major unmet need in cancer therapy. Emerging evidence indicates that receptor tyrosine kinases (RTKs) play critical roles in regulating DNA damage response pathways and HR repair, providing a strong mechanistic rat
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Hepatocellular carcinoma (HCC) is a highly heterogeneous malignancy that necessitates the identification of robust biomarkers across diverse populations to enhance diagnostic and prognostic precision. This study aimed to identify clinically relevant biomarkers and potential therapeutic targets through integrative transcriptomic and computational analyses.
METHODS: A comparative transcriptomic analysis was performed on 724 HCC samples obtained from four independent cohorts (United States, South Korea, France, and Taiwan). Differential expression and survival analyses, including K
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly(ADP-ribose) polymerase inhibitors (PARPi) have reshaped therapy for advanced prostate cancer, yet durable benefit remains concentrated in BRCA1/2-altered tumors, especially BRCA2, and most responders eventually relapse. Here, we frame PARPi response and resistance through a unifying model in which DNA damage response (DDR) rewiring (e.g., homologous recombination repair (HRR) restoration, fork protection, checkpoint tolerance, and altered drug handling) converges with treatment-induced dormancy and quiescent therapy-tolerant residual states that sustain minimal residual disease (MRD) unde
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: PARP inhibitors (PARPis) are new targeted agents that exploit homologous recombination DNA repair deficiencies (HRDs), which are present in 50% of high-grade serous carcinoma (HGSC) cases. Currently, olaparib is approved as maintenance therapy for BRCA1/2-mutated HGSC, and niraparib is approved for platinum-sensitive recurrent disease. However, research is currently expanding their potential as front-line agents or in combination with carboplatin, a standard HGSC chemotherapeutic.
METHODS: Immortalized ovarian cancer (iOvCa) cell lines, developed from HGSC patient ascites, were tr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mesorhizobium ciceri, a nitrogen-fixing symbiont of chickpea (Cicer arietinum), remains genetically challenging to manipulate using conventional homologous recombination approaches, which are labor-intensive and often leave undesirable selection markers. In this protocol, we describe a streamlined genome-editing strategy using a broad-host-range Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)-associated protein 9 (Cas9) system adapted for M. ciceri. We demonstrate the efficacy of this method by targeting nodC, which encodes the N-acetylglucosaminyltransferase required for ch
СтатьяVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC) remains a leading cause of cancer-related mortality in men. Although poly(ADP-ribose) polymerase inhibitors (PARP inhibitor) are approved for mCRPC patients with homologous recombination repair (HRR) deficiencies, clinical trials combining Olaparib with PD-1/PD-L1 inhibitors have shown limited efficacy in unselected populations. To investigate the immunomodulatory effects of PARP inhibitor in an unbiased manner, we performed bulk RNA sequencing on HRR-proficient MycCaP cells treated with the PARP inhibitor (Olaparib) versus vehicle contro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Poly (ADP-ribose) polymerase (PARP) enzymes are crucial for the repair of DNA single-strand breaks and have become key therapeutic targets in homologous recombination-deficient cancers, including prostate cancer. To enable non-invasive monitoring of PARP-1 expression, several PARP-1-targeting positron emission tomography (PET) tracers have been developed. Here, we aimed to preclinically investigate [carbonyl-11C]DPQ as an alternative PARP-1 PET tracer as it features a strongly distinct chemotype compared to the frontrunners [18F]FluorThanatrace and [18F]PARPi.
RESULTS: [carbonyl-1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Precise genome editing is a critical focus in gene therapy, and the CRISPR-Cas9 system has become a powerful and versatile tool for this purpose. However, a significant limitation of the CRISPR-Cas9 system is its low homologous recombination rate, which can impede the restoration of normal gene function. To address some of these challenges, advanced gene-editing technologies, such as base editors and prime editors have been developed. Here, we explored whether Cas9-specific single-stranded DNA (ssDNA) aptamers could enhance the PE2 system's functionality.
METHODS: Systematic evo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Treatment strategies to improve outcomes in patients with metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC) are evolving. Of particular interest are therapies that target DNA damage responses in tumor cells by inhibiting poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) activity. Several PARP inhibitors have recently received regulatory approval for the treatment of patients with mCRPC, of which olaparib was the first for prostate cancer. Olaparib received approval as a monotherapy following the PROfound study (NCT02987543) and in combination with abiraterone following the PROpel study (NCT03732820) fo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This phase 1 study aimed to determine the maximum tolerated dose (MTD) and evaluate the safety and preliminary efficacy of rucaparib (RUB), a poly(adenosine diphosphate ribose) polymerase (PARP) inhibitor, combined with liposomal irinotecan (nal-IRI) and 5-fluorouracil (5-FU) in metastatic gastrointestinal (GI) cancers. RUB targets DNA repair pathways, showing efficacy in tumors with homologous recombination deficiency, such as BRCA mutations. Preclinical data suggest synergy with irinotecan, but overlapping toxicities pose challenges.
METHODS: Eighteen patients with metastatic GI
СтатьяКлиническое исследование I фазыПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.