Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder in which oxidative stress plays a critical role in pathogenesis. As key reactive species governing oxidative stress, the dynamic interplay between glutathione (GSH) and hydrogen peroxide (H2O2) is tightly coupled to redox homeostasis. To enable simultaneous tracking of these two crucial species, we developed a dual-responsive fluorescent probe, TCS, for the discriminative visualization of GSH and H2O2. TCS features a methylsulfonyl group that is selectively reduced by GSH, triggering green fluorescence at 500 nm, and a borona
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To address the limitations of existing approaches─targeted next-generation sequencing (NGS) and simplex droplet digital PCR (ddPCR) assays─for circulating tumor DNA (ctDNA) detection in uveal melanoma (UM), we developed and validated mutation-agnostic multiplex drop-off ddPCR assays at the targeted loci as a novel strategy. Two multiplex drop-off ddPCR assays covering hotspot mutations in GNAQ p.Q209, GNA11 p.Q209, p.R183, SF3B1 p.R625, PLCB4 p.D630, and CYSLTR2 p.L129Q were developed. Analytical sensitivity and specificity were determined. Clinical validation was performed using DNA from tumo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aptamers, as high-affinity and high-specificity functional nucleic acids obtained through in vitro selection, face significant limitations in clinical applications due to their susceptibility to nuclease-mediated degradation in the bloodstream. To address this challenge, this study introduces a stem-engineered aptamer strategy, which focuses on the rational engineering and chemical modification of the aptamer's stem region within its stem-loop configuration. Specifically, modifications such as locked nucleic acids (LNA), 2'-O-methyl (2'-OMe), and 3'-inverted deoxythymidine (idT) bases were inc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liquid chromatography coupled to high-resolution mass spectrometry (LC-HRMS) is a widely used analytical technique for characterizing the chemical composition of organic samples. Due to its high sensitivity and ability to detect thousands of chemical features in a single run, untargeted LC-HRMS experiments generate highly complex and data-rich datasets that typically require advanced computational methods, including machine learning, for meaningful interpretation. While traditional machine learning approaches have been applied to LC-HRMS data, their performance remains limited for complex task
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inducing cell surface receptor clustering to mediate downstream signaling and reverse drug resistance has become a core cancer therapeutic strategy. However, controllable in situ formation of receptor superclusters remains a key bottleneck. To address these issues, a programmable DNA self-assembly strategy was established by integrating three units of rolling circle amplification (RCA) vector unit, two long DNA strands loaded with aptamer recognition units and the hairpin assembly unit. Fluorescence imaging analysis demonstrated that targeting binding to protein tyrosine kinase 7 (PTK7) can tr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemiluminescent nanoprobes have attracted increasing attention in bioimaging owing to their excitation-free emission and high signal-to-background ratio. However, most reported self-sustaining chemiluminescent nanosystems rely on strong photosensitizers to generate large amounts of reactive oxygen species to initiate the emission process. Although this strategy may result in deep tissue penetration, the excessive ROS accumulation could raise potential phototoxicity concerns. In this work, we designed a bioimaging probe in which the ROS generation, ROS trapping, and near-infrared (760 nm) chem
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have for the first time applied the recently developed Brenner formalism-based two-zone moment analysis (TZMA) method for chromatographic band broadening to a unit cell containing randomly packed fully porous spheres instead of containing only perfectly ordered packings, as in previous literature reports. In total, 4 random packings have been simulated. Each containing 100 fully porous spheres, they can be considered a good proxy for the short-range randomness appearing in randomly packed chromatography beds. Compared to the minimal plate height hmin in real packed columns, the hmin produce
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The advantages of top-down proteomics (TDP) in the characterization of proteoforms, resulting from genetic variations, alternative splicing, and post-translational modifications (PTMs), have been well documented. However, TDP applications on limited samples have been less explored, and no direct comparison with the bottom-up proteomics (BUP) approach for the same scarce amounts of samples has been conducted to date. In this work, we processed ∼100-1000 HeLa cells using bottom-up and top-down workflows and subjected sample volumes equivalent to ∼25 and up to ∼250 HeLa cells to liquid chromatogr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Both protein O-GlcNAcylation and N-glycosylation are extremely important in human cells and regulate many cellular events. While O-GlcNAcylation is known to act as a stress sensor, its changes in human cells with N-glycosylation perturbations remain to be explored. In this study, we comprehensively and site-specifically studied common and cell-type-specific responses of protein O-GlcNAcylation under N-glycosylation inhibition in three types of human cells (HEK293T, HepG2, and Jurkat cells) by integrating metabolic labeling, bio-orthogonal chemistry, and multiplexed proteomics. In total, more t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein secretion is crucial in maintaining immune homeostasis, yet the molecular interactions governing this process remain incompletely understood. While transcriptional and post-transcriptional regulation of protein expression is well characterized, the subcellular interactions between secreted proteins and trafficking machinery are less explored. To address this, we systematically mapped protein-protein interactions (PPIs) involved in the secretion of interleukin-2 (IL-2) from human T cells using proximity-based labeling coupled with mass spectrometry. Our analysis revealed significant enr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypothalamic norepinephrine (NE) dysregulation drives hypertensive pathogenesis, yet lacks precise in vivo quantitative monitoring tools. We engineered CyQs probes integrating near-infrared (NIR) intensity and fluorescence lifetime imaging (FLIM) for spatiotemporal NE tracking. CyQ-2 employs a hemicyanine scaffold conjugated to an S-phenyl carbonate moiety, enabling 16-fold fluorescence turn-on, 0.21 μM detection limit, and 0.8 ns lifetime extension upon NE-specific activation via nucleophilic cyclization. CyQ-2 mapped endogenous NE dynamics in PC12 cells and the K+-evoked neurotransmitter rel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Raman imaging provides label-free and molecule-specific spatial profiling of biological samples and has been widely applied in cellular analysis and pathological research. However, the intrinsically weak Raman scattering signal imposes a fundamental trade-off between spatial resolution and imaging speed, limiting its use in high-throughput applications. Computational reconstruction, particularly super-resolution, offers a promising strategy for improving Raman imaging quality from sparsely sampled data. Existing reconstruction methods often struggle to preserve intrinsic spatial-spectral coupl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibody transistor biosensors show promise for early Alzheimer's disease (AD) diagnosis due to their single molecule detection capability. However, the random attachment of a payload to antigen-binding fragments (Fab) during biosensor preparation can disrupt target recognition, leading to poor consistency and repeatability. Here, we present a rapid and simple antibody-oriented immobilization method through a dopamine self-polymerization (DASP) process. Experimental and molecular dynamics simulation validation confirms the performance and mechanism of antibody orientation modification, attribu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
On-bead single-pot solid-phase enhanced sample preparation, SP3, also known as protein aggregation capture (PAC), is a robust, high-throughput, and widely utilized approach for proteomic sample preparation. Recent studies have highlighted PAC/SP3 as an ideal platform for chemoproteomics, allowing chemical labeling while minimizing sample loss and improving recovery of derivatized peptides. In this work, we establish an on-bead PAC/SP3 protein-level amine and carboxyl derivatization approach to facilitate C-terminal focused proteomics. We demonstrate that on-bead protein derivatization of carbo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Remote blood sampling offers multiple advantages over traditional clinic-based blood sampling studies, including greater patient inclusion, more frequent sampling, and broader geographical reach. Combining remote blood sampling with transcriptomic analysis opens potential in translational applications for capturing acute and dynamic immune responses to various exposures. In this study, we establish the feasibility of homeRNA, a capillary blood collection and RNAlater-based stabilization kit, for use in downstream total RNA-sequencing applications via capturing a lipopolysaccharide (LPS)-induce
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein aggregation is a central feature of many neurodegenerative diseases, yet methods to characterize aggregate size in complex biological samples remain limited. Here, we show that fluorescence intensity from individual single-molecule array (Simoa) microwells encodes size-dependent information beyond conventional digital quantification. Using defined synthetic tau assemblies, we establish that increasing aggregate size produces higher microwell brightness. Applying this technique to human brain homogenate reveals a shift toward larger tau aggregates in Alzheimer's disease compared to age-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herein, we describe the identification of protein biomarkers in the cerebrospinal fluid (CSF) of Alzheimer's disease (AD) patients that enable the differentiation of Responders from Non-Responders to lymphatic-venous anastomosis (LVA). Discovery of these potential biomarkers was achieved by deep proteomic analysis on the pre-LVA cerebrospinal fluid in a cohort of 90 patients. A combination of two CSF processing modalities and two computational platforms allowed us to secure the largest CSF proteome ever reported (6711 proteins identified with 4506 proteins quantified at a false-discovery rate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Laser ablation inductively coupled plasma time-of-flight mass spectrometry (LA-ICP-TOFMS) enables the quantitative imaging of metal-based therapeutics with cellular resolution. Despite its analytical power, systematic screening of metal-containing anticancer agents remains limited by the substantial time, cost, and labor required for cell handling, staining, and analysis. Here, we present a barcoding strategy that allows us to pool multiple experiments together and analyze them simultaneously. Our labeling approach combines wheat germ agglutinin (WGA) with lanthanide-labeled anti-WGA barcodes,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Limited proteolysis coupled to mass spectrometry (LiP-MS) probes protein conformational dynamics, but interpretation of LiP-MS data is complicated by heterogeneous proteolytic cleavage patterns and missing data. Recent advances in data-independent acquisition (DIA) and machine learning-based search engines promise improved sensitivity and reproducibility, yet their performance in LiP-MS workflows remains underexplored. We systematically evaluated selected library-free DIA workflows using a rapamycin-treated human cell lysate and a yeast heat shock data set, benchmarking DIA-NN and Spectronaut
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spatiotemporal progression of amyloid pathology in Alzheimer's disease (AD) follows a characteristic pattern, spreading from the cortex to the hippocampus brain regions. However, analytical methods for comparative profiling of amyloid plaque composition between these two regions are limited. Herein, we developed a small molecule guided method to selectively label, enrich, profile and compare amyloid interactome in cortical and hippocampal regions of AD brain tissue. We embarked on rational design of probes to transform Congo Red derivatives from amyloid chromophore to singlet fluorescent s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования