Antimicrobial resistance (AMR) in Staphylococcus aureus (S. aureus) poses a serious global health threat, undermining treatment outcomes and necessitating the development of innovative therapeutic strategies. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is a major contributor to this burden, with increasing prevalence in hospitals, contaminated food, and environmental sources. The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic further intensified S. aureus resistance due to widespread antibiotic misuse. Biofilm formation, which facilitates the horizontal transfer of resistance genes such a
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plastic debris provides colonizable surfaces for microbial biofilms, the plastisphere, which is now recognized as a hotspot for antimicrobial resistance (AMR) amplification and dissemination. This PRISMA 2020-compliant synthesis covers 53 studies. Random-effects meta-analysis of 30 conjugation datasets showed enhanced horizontal gene transfer: pooled log response ratio (lnRR) = 1.93 (95% CI: 1.63-2.23), 6.9-fold (95% CI: 5.1-9.3-fold); heterogeneity was high (I2 = 85.0%; τ2 = 0.573; Q = 187.6, df = 29) and the 95% prediction interval spanned 1.5-31.3-fold. Polyvinyl chloride (PVC) biofilms sho
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the occurrence of antibiotic-resistant bacteria (ARB) and associated antibiotic resistance genes (ARGs) in remote marine environments is crucial for accessing treats of ARG pollution on a border ecological scale. While most studies focused on anthropogenically disturbed settings, the Challenger Deep, as the deepest ocean habitat, offers a unique opportunity to investigate minimally disturbed resistomes. We revived 123 bacterial isolates from the Challenger Deep sediment, assessed their antibiotic susceptibility, and identified their taxonomy via 16S rRNA gene sequencing. Among th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Constructed wetlands (CWs) are widely used for advanced treatment of wastewater treatment plant effluents and their nitrogen (N) removal performance is often inhibited by antibiotics. Biofilms on CW substrates play a fundamental role in pollutant biodegradation, microbial community stability and antibiotic resistance gene (ARG) dissemination. This study investigated the effects of substrate filling ratios (90% and 60%) in modular moving bed constructed wetlands (MMB-CWs) on operational performance, biofilm properties and antibiotic resistance risks. The MMB-CW with higher substrate filling rat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metagenomics offers a culture-independent framework for comprehensively characterizing microbial communities by directly extracting and sequencing DNA from environmental samples. In this study, we employed high-throughput metagenomic sequencing to explore microbial communities inhabiting fungal-rich environments, emphasizing taxonomic composition, functional potential, and antibiotic resistance gene (ARG) dynamics.
METHODS: Six samples from two distinct groups (HFJ and QFJ) were subjected to Illumina-based shotgun sequencing, followed by rigorous quality control, taxonomic classif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Erysipelothrix rhusiopathiae is an important zoonotic pathogen in poultry, yet little is known about its antimicrobial resistance (AMR) dynamics in avian hosts. With growing concerns about subtherapeutic antimicrobial use in animal agriculture, poultry-origin isolates represent a potential but under-characterized reservoir of resistance genes. Methods: We phenotypically tested 38 E. rhusiopathiae strains isolated from geese, ducks, and turkeys in Hungary (2024) using broth microdilution against 18 antimicrobial agents, following Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) guidel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many vector-borne pathogens consist of multiple strains that circulate in both the vertebrate host and the arthropod vector. Characterization of the community of pathogen strains in the arthropod vector is therefore important for understanding the epidemiology of mixed vector-borne infections. Borrelia afzelii and B. garinii are two species of tick-borne bacteria that cause Lyme disease in humans. These two sympatric pathogens use the same tick, Ixodes ricinus, but are adapted to different classes of vertebrate hosts. Both Borrelia species consist of multiple strains that are classified using
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aromatic amino acid decarboxylases (AADCs) are found in various organisms and play distinct physiological roles. AADCs from higher eukaryotes have been well studied because they are involved in the synthesis of biologically important molecules such as neurotransmitters and alkaloids. In contrast, bacterial AADCs have received less attention because of their simplicity in physiology and in target substrate (tyrosine). In the present study, we found that Pseudomonas putida KT2440 possesses an AADC homologue (PP_2552) that is more closely related to eukaryotic enzymes than to bacterial enzymes, a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptomycetes are common soil inhabitants, yet few described species are plant pathogens. While the pathogenicity mechanisms remain unclear, previous work identified a gene, nec1, which encodes a putative pathogenicity or virulence factor. nec1 and a neighboring transposase pseudogene, ORFtnp, are conserved among unrelated plant pathogens and absent from nonpathogens. The atypical GC content of nec1 suggests that it was acquired through horizontal transfer events. Our investigation of the genetic organization of regions adjacent to the 3' end of nec1 in Streptomyces scabies 84.34 identified a
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Carbapenem-resistant hypervirulent Klebsiella pneumoniae (CR-hvKP) strains present a significant global public health threat due to their high mortality rates. This study investigated the genomic characteristics of seven ST11-K1 CR-hvKP isolates harboring highly homologous KPC-2-encoding multidrug-resistance plasmids. The strains were isolated from a Chinese tertiary hospital between 2017 and 2020. Whole-genome sequencing and bioinformatic analysis revealed various antibiotic resistance genes (ARGs) and virulence determinants. The blaKPC-2-bearing plasmids that contain multiple ant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The rising prevalence of Extended-spectrum β-lactamase-producing (ESBL) Escherichia coli poses a significant threat to human and animal health.
METHODS: To address this, we conducted a longitudinal two-year One Health study to assess ESBL E. coli occurrence and distribution across dairy farms, surrounding environments, and urban wastewater in a peri-urban region of Western Canada.
RESULTS: A total of 546 presumptive ESBL E. coli were recovered, with the highest occurrence in wastewater influent (75.9%) and calf feces (73.6%), and lowest in soil (6.3%) and surface water (18.8%). S
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Carbapenems are among the last-line antibiotics for treating severe Gram-negative infections. Comamonas spp. are increasingly recognized for their clinical pathogenicity; however, carbapenem-resistant isolates have rarely been documented.
METHODS: Species identification was confirmed by MALDI-TOF MS and whole-genome sequencing. Antimicrobial susceptibility testing (AST) was determined via Vitek 2 Compact. Genomic features and genetic environments of resistance genes were analyzed using comparative genomics, with iTOL, Easyfig, and BRIG for visualization.
RESULTS: In this study, w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global dissemination of antimicrobial-resistant (AMR) bacteria along the pork supply chain is a critical concern, as pigs are significant reservoirs for multidrug-resistant (MDR) Escherichia coli, a WHO-listed priority pathogen. This study investigated the genomic characteristics of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing E. coli across the pork production chain in Central Thailand, specifically focusing on the emergence of the last-resort tigecycline resistance gene, tet(X4). ESBL-producing E. coli isolates from a slaughterhouse pig cecum (n = 14) and retail market pork (n = 26) in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of multidrug-resistant (MDR) Escherichia coli in poultry represents a critical One Health concern, particularly in developing countries. This study employed a comparative genomic approach to investigate the genomic characteristics, antimicrobial resistance (AMR) profiles, virulence determinants, of poultry-derived MDR E. coli isolates from Bangladesh. Whole-genome sequencing of three representative MDR isolates, identified with 83 globally diverse poultry, human, and environmental E. coli genomes. Pangenome analysis identified the characteristic open pangenome of E. coli, with co
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Coagulase-negative staphylococci belonging to S. haemolyticus, S. hominis subsp. hominis, S. simulans, and S. warneri are often described as etiological factors of infections. Staphylococci are a phylogenetically coherent group; nevertheless, there are differences among the species which may be important to clinicians.
METHODS: We investigated selected virulence factors and antibiotic resistance that were phenotypically demonstrated, the presence and expression of genes encoding the virulence factors, and the type of the SCCmec cassette.
RESULTS: The differences between the teste
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Non-tuberculous mycobacteria (NTM) are a diverse group of environmental bacteria that are increasingly associated with human infections and difficult to treat. Plasmids, which might carry resistance and virulence factors, remain largely unexplored in NTM.
METHODS: We used publicly available complete genome sequence data of 328 NTM isolates belonging to 125 species to study gene content, genomic diversity, and clusters of 196 annotated NTM plasmids. Furthermore, we analyzed 3755 draft genome assemblies from over 200 NTM species and 5415 short-read sequence datasets from six clinica
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Currently, bacterial classification at the species level relies on the 95-96% average nucleotide identity (ANI) value that is known to be equivalent to a 70% digital DNA-DNA hybridization (dDDH) value. However, during the routine identification of bacteria in the uteri of camels with a history of conception failure, we found that four out of the seven strains (2298A, 2569A, 2652, 2571B, 1103A, 2571A, and 335C) could not be assigned to any valid Corynebacterium species. Furthermore, a 70% dDDH value did not correspond to a 95-96% ANI value in strain 2569A. Thus, we aimed to classify these strai
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Long-term macrolide therapy has been shown to provide benefit to those with a range of chronic respiratory conditions. However, concerns remain about the impact of macrolide exposure on the carriage and abundance of antibiotic resistance genes within the oropharynx. The potential for onward transmission of resistance from macrolide recipients to their close contacts also is poorly understood.
RESEARCH QUESTION: Does long-term macrolide use impact carriage of resistance within the oropharyngeal microbiota in people with chronic respiratory conditions and risk of onward transmission
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An IgA1 protease is produced by the human pathogens Neisseria gonorrhoeae and N. meningitidis but not by related non-pathogenic, commensal, Neisseria species. In this study, the chromosomal iga locus was characterized in the N. gonorrhoeae strain MS11 and compared to corresponding loci in N. meningitidis and commensal Neisseria species. In N. gonorrhoeae, the genes trpB and ksgA were found immediately downstream of iga. In addition to comL and comA, a homolog of the Escherichia coli YFII gene was identified upstream of iga. Each gene in the iga region (YFII and comL, comA and iga, and trpB and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: blaKPC-carrying Enterobacterales have post great challenges to global healthcare systems. In this study, we reported the evolution and spread of blaKPC between Serratia marcescens and Klebsiella pneumoniae.
METHODS: Four S. marcescens and one K. pneumoniae strains were isolated from the sputum samples of the patient. Antimicrobial susceptibility tests and whole genome sequencing were performed to investigate the phenotype & genotype of strains. Conjugation assays, cloning experiment and kinetic parameters measuring were performed to explore the spread and antimicrobial resistance
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.