The impact of early-stage tumors on gene expression in adjacent tissues remains uncertain, despite the known influence of the tumor microenvironment on tumor progression. Here, we systematically analyze early-stage lung adenocarcinoma (LUAD) and surrounding tissues across multiple distinct regions, from the tumor core to distant tissues. DNA methylation profiling in a 12-patient cohort reveals two distinct patterns of methylation changes. Steep changes occurring at the tumor boundary and shallow changes showing a gradual shift over increasing distance to the tumor. Approximately 17,000 CpG sit…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hexanucleotide (G4C2) repeat expansion in the promoter region of C9orf72 is the most frequent genetic cause of frontotemporal dementia (FTD) and amyotrophic lateral sclerosis (ALS). In this study, we conducted a genome-wide DNA methylation (DNAm) analysis using EPIC version 2 (EPICv2) arrays on an FTD cohort comprising 27 carriers and 250 non-carriers of the pathogenic C9orf72 repeat expansion from the Amsterdam Dementia Cohort. We identified differentially methylated CpGs probes associated with the pathogenic C9orf72 expansion and used these findings to create a DNAm least absolute shrink…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Posttraumatic stress disorder (PTSD) is associated with early onset of neurological conditions, but the mechanism by which PTSD relates to d … iduals (primarily Veterans) and in the brain tissue from 100 decedents. Three (out of 19) CLDN5 DNA methylation (DNAm) probes, cg00804504, cg17411190, and cg21872764, were significantly associated with trauma exposure or PTSD severity after multiple testing correction in blood. The latter two probes also showed association with PTSD diagnosis in ventromedial …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Malignancy evaluation of thyroid nodules is an important and challenging issue in clinical practice. In this study, we intended to explore novel biomarkers for the differential diagnosis of malignant and benign thyroid nodules. METHODS: We performed whole-genome DNA methylation profiling by MethylationEPIC BeadChip and expression profiling by RNA-Sequencing, to identify differentially methylated and expressed genes in fresh-frozen tissues from early-stage papillary thyroid cancer (PTC) and benign thyroid nodule (BTN) patients. The results were validated first in two GEO datasets, and …
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-altitude environments, characterized by hypoxia, low temperatures, and intense ultraviolet radiation, pose significant challenges to human physiology and health. DNA methylation, as a key epigenetic regulatory mechanism, plays a central role in human adaptation to high-altitude environments and in disease pathogenesis. Current research indicates that high-altitude native populations (such as Tibetans and Andeans) modulate the methylation of hypoxia-responsive genes like EPAS1 and EGLN1 to enhance oxygen transport efficiency and energy metabolism patterns, while simultaneously suppressing …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malignant pleural effusion (MPE) is a thoracic complication disease characterized by tumors, predominantly resulting from advanced lung cancer. This study aimed to investigate the efficacy of SHOX2 and RASSF1A methylation as a supplementary diagnostic tool for lung cancer-induced MPE with uncertain pathological diagnoses.
MATERIALS AND METHODS: Methylation-specific polymerase chain reaction (MS-PCR) was used to assess SHOX2 and RASSF1A methylation levels in 98 pleural effusion samples. The cut-off values for SHOX2 and RASSF1A methylation levels for the detection of MPE were determ…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The etiology of obsessive-compulsive disorder (OCD) is multifactorial and remains incompletely understood. While both the Tryptophan hydroxylase 2 (TPH2) gene and the family environment have been implicated in OCD, few studies have examined their combined effects. This study aimed to investigate the association between TPH2 DNA methylation and family functioning and parenting styles in patients with OCD.
METHOD: A total of 58 individuals with OCD and 89 age- and gender- matched healthy controls were recruited. DNA methylation levels at 12 CpG sites in the promoter region of TPH2 we…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly (ADP-ribose) polymerase 1 (PARP1) promotes vascular intimal hyperplasia (IH) while contributing to N6-methyladenosine (m6A) methylation regulatory processes. The present study focuses on whether the PARP1 inhibitor PJ34 can improve vascular IH by regulating m6A methylation modification. Mice with femoral artery wire injury-induced IH and platelet-derived growth factor-BB (PDGF-BB)-challenged mouse vascular smooth muscle cells (VSMCs) were utilized in the study. PJ34 treatment significantly alleviated neointimal formation, suppressed VSMC proliferation and phenotypic switching, and reduced…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Little is known regarding the relationship between methylation levels and Frontotemporal Dementia (FTD).
OBJECTIVE: The objective of the present study was to assess the relationship between blood MAPT methylation levels and clinical expression in FTD.
METHODS: This cross-sectional observational study was conducted including 54 Italian patients with different phenotypes: 22 behavioral variant FTD (bvFTD), 10 semantic variant (svPPA), 22 non-fluent variant (nfv) Primary Progressive Aphasia (PPA).
RESULTS: Results reveal a negative correlation between MAPT methylation levels dete…
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Repetitive neonatal painful procedures experienced in the neonatal intensive care unit (NICU) are known to alter the development of the nociceptive system and have long-lasting consequences. Recent evidence indicates that NICU stay affects the methylation of the opioid receptor mu 1 encoding gene (Mor-1). Additionally, a preclinical model of neonatal procedural pain established lower adult post-operative MOR-1 levels in the spinal cord. Thus, we hypothesized that neonatal procedural pain increases the DNA methylation status of Mor-1 in the spinal cord and dorsal root ganglia (DRGs)…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Women with depression are less likely to breastfeed and experience more breastfeeding challenges. Potential biological mechanisms that link maternal depression with poor breastfeeding outcomes have not been investigated. This study examined associations between lifetime history of depression (LHD), prenatal oxytocin receptor gene (OXTR) DNA methylation, and breastfeeding outcomes.
RESULTS: Longitudinal observational data from the Norwegian Mother, Father and Child Cohort Study (MoBa) were analysed (N = 3607). LHD was self-reported during pregnancy (week 15). Blood samples were col…
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung adenocarcinoma (LUAD) is the most common histological subtype of lung cancer. The distinctive genetic and epigenetic modifications in tumors and paired non-malignant samples, such as adjacent peri-tumor and tumor-distant normal lung tissues, have not been adequately studied.
METHODS: We recruited 57 patients with resectable stage I-III LUAD and collected matched samples of the primary tumor, peri-tumoral tissues, and tumor-distant normal lung tissue. We performed bisulfite sequencing using a custom methylation panel to profile DNA methylation levels and obtained somatic varia…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcohol use disorder (AUD) contributes significantly to the global burden of disease. The susceptibility for AUD is mediated through an interaction of genetic risk factors and environmental influences. These gene × environment (G × E) interactions manifest as epigenetic regulations of gene expression, among other things. Previous research suggests an association between Ganglioside Induced Differentiation Associated Protein 1 (GDAP1) DNA methylation and AUD. Here, we investigate the epigenetic dysregulation of GDAP1 in AUD through comparing DNA methylation in whole blood and saliva, as well as…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Maternal childhood maltreatment (CM) has been associated with subsequent difficult infant temperament. Further, maternal CM and maladaptive infant outcomes have each been linked, separately, to increased methylation in umbilical cord blood of CpG sites in genes related to the stress response and inflammatory markers. Researchers have not yet examined the nature of the interactions of these factors or whether DNA methylation (DNAm) mediates or moderates the association of maternal CM with infant temperament.
OBJECTIVE: We tested whether DNAm mediates or moderates the association be…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early cancer detection through minimally invasive methods is key for improving patient outcomes. We aimed to assess the performance of a novel blood-based test leveraging DNA methylation patterns for simultaneous detection of lung (LC), breast (BrC), colorectal (CRC), and prostate (PCa) cancer. Using The Cancer Genome Atlas (TCGA) methylation data, we identified shared hypermethylated gene promoters (ADCY4, MIR129-2, NID2, and MAGI2) among those four cancers. Validation was performed using online datasets, an in-house tissue set (N = 179), and plasma samples (N = 485) using droplet digital PCR…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is a need for more precise biomarkers and understanding on the development of aggressive prostate cancer. In this study, we analyzed DNA methylation in 64 prostate cancer tissue samples, using tissue from radical prostatectomy patients (n = 16) with up to 16 years of clinical follow-up. We used several samples from each patient including both normal and cancer tissue to study DNA methylation patterns in relation to aggressiveness measured by follow-up data of biochemical recurrence and metastasis status as clinical endpoints. We identified differentially methylated CpGs associated with r…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oral and oropharyngeal cancers, caused by persistent human papillomavirus (HPV), have recently increased. Diagnostic methods often fail to assess precancerous lesion risk, delaying oral cancer diagnosis. New molecular biomarkers, particularly DNA methylation, are sought to better stratify patients' risk. The PreCursor-M+ (Fujirebio, Tokyo, Japan), which analyze hypermethylation of the two onco-suppressor FAM19A4 and miR124-2 in cervical samples from high-risk HPV-positive women, was used to assess the methylation level of 111 oral samples distinguished in oral squamous cell carcinomas (OSCC), …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Multiple studies have reported an inverse association between self-reported smoking during pregnancy and offspring type 1 diabetes (T1D) risk. We investigated the association between DNA methylation (DNAm) smoke exposure scores, parental self-reported smoking, and islet autoimmunity (IA) and T1D risk in children at high risk of T1D.
RESEARCH DESIGN AND METHODS: We used longitudinal data from the Diabetes Autoimmunity Study in the Young cohort, including 205 IA case and 206 control participants (87 and 88 were T1D case and control participants, respectively), matched by age, race/et…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: European flat oysters (Ostrea edulis) are sequential hermaphrodites that alternate sex in response to environmental change. Epigenetics, including DNA methylation, are often involved in sex reversal through influencing gene transcription. Knowledge on the epigenetic mechanisms underlying sex reversal in hermaphrodite bivalves is limited to gonadal tissue and previous studies have only compared DNA methylomes of males and females. Therefore, the aim of this study is to assess whether sex-specific DNA methylation can be identified in somatic gill tissue of the flat oyster.
RESULTS: …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Currently, research on the association of prenatal phthalate exposure with leptin, as well as the mediating role of DNA methylation, is insufficient. A birth cohort in China was conducted, followed by pregnancy to early childhood. During the follow-up period, measurements were conducted for 160 mother-child pairs, including maternal urinary phthalate concentrations in three trimesters, DNA methylation in cord blood, and leptin levels in children's plasma. The present study found that maternal urinary levels of specific phthalate metabolites, particularly MiBP (adjusted percent change [95% CI];…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования