Putrescine has long been considered the initiating substrate for aspartate semialdehyde-dependent bacterial spermidine biosynthesis. However, two recent studies identified a variant pathway in which agmatine serves as the preferred substrate. This variation appears to be common, but the mechanistic basis for substrate preference was unknown. Here, we investigate the aspartate semialdehyde-dependent dehydrogenases from Bacteroides fragilis and Clostridium leptum using steady-state and transient-state kinetic assays, mass spectrometry, thermal shift protein stability assays, X-ray crystallograph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human α-L-iduronidase (IDUA) is a member of glycoside hydrolase family and is involved in the catabolism of glycosaminoglycans (GAGs), heparan sulfate (HS) and dermatan sulfate (DS). Mutations in this enzyme are responsible for mucopolysaccharidosis I (MPS I), an inherited lysosomal storage disorder. Despite great interest in determining and studying this enzyme structure, the lack of a high identity to templates and other technical issues have challenged both bioinformaticians and crystallographers, until the recent publication of an IDUA crystal structure (PDB: 4JXP). In the present work, fo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malaria, caused by the parasite Plasmodium falciparum, remains a significant global health threat, with multidrug resistance posing a major challenge to treatment. The P-glycoprotein homolog P. falciparum Multidrug Resistance Protein 1 (PfMDR1) is a key determinant of resistance to first-line antimalarials like mefloquine (MFQ) and chloroquine. ACT-451840, a clinical phase I drug, has been developed as an antimalarial candidate, but its mechanism of action and interaction with drug resistance markers remain to be fully understood. Here, we present the cryo-electron microscopy structure of PfMD
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prenylation is a common biological reaction in all domains of life wherein prenyl diphosphate donors transfer prenyl groups onto small molecules as well as large proteins. The enzymes that catalyze these reactions are structurally distinct from ubiquitous terpene cyclases that, instead, assemble terpenes via intramolecular rearrangements of a single substrate. Herein, we report the structure and molecular details of a new family of prenyltransferases from marine algae that repurposes the terpene cyclase structural fold for the N-prenylation of glutamic acid during the biosynthesis of the poten
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The latent infection is unique characteristic of Mycobacterium tuberculosis to overcome human immune response for its survival. The M. tb develops adaptation to extreme stress conditions to increase the viability, thus easily acquires drug resistance than any other bacteria and maintains a long-term infection status without any symptoms. Rv0569 is a conserved hypothetical protein that overexpresses under dormant state induced by hypoxia, starvation, and medication. To study function and structure in detail, we determined the solution structure of Rv0569 by NMR. NOE and RDC restraints were used
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic fibrosis is an autosomal recessive condition caused by mutations in the CFTR gene, which encodes the CFTR protein. Currently, CF is a life-limiting illness that has a limited cure. The present study aimed to identify top leads against CFTR protein with F508del in comparison with Lumacaftor. In this study, a homology model of the NBD domain of CFTR protein was developed using the available NBD domain crystal structure. The protein model was refined through apo dynamics. Energy-optimized pharmacophore mapping was carried out to identify essential features for CFTR, resulting in a model wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii is identified as an obligate intracellular apicomplexan parasite that infects warm blooded animals and humans worldwide. SAG5 protein includes SAG5A, -5B, -5C, -5D, and -5E five subtypes. SAG5A, -5B, -5C, and -5D are expressed on the surface of Toxoplasma gondii. In this study, we used online T-Coffee tool to analyze SAG5 proteins sequence alignment. SMART software was used to predict secondary structures of SAG5A, -5B, -5C, and -5D. The 3D models of SAG5 proteins were constructed and analyzed with SWISS-MODEL server and VMD software. Results indicated that SAG5A, -5B, -5C, a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zhonghua shi yan he lin chuang bing du xue za zhi = Zhonghua shiyan he linchuang bingduxue zazhi = Chinese journal of experimental and clinical virology2005chi
BACKGROUND: To express the prM-E protein in Sf9 cells, and lay a basis for further study on the function of the viral proteins and development of specific diagnostic reagents.
METHODS: The recombinant prM-E protein of tick-borne encephalitis virus was expressed in insect cell Sf9 by RT-PCR amplification of prM-E gene, construction of donor plasmid of Bac-to-Bac baculovirus expression system, homologous recombination of donor plasmid with bacmid DNA at the site of Tn7 and transfection of insect cell Sf9.
RESULTS: Recombinant subviral particles, about 30 nm in diameter, consisting of prM-E wer
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The actin cytoskeleton controls the overall structure of cells and is highly polarized in chemotaxing cells, with F-actin assembled predominantly in the anterior leading edge and to a lesser degree in the cell's posterior. Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP) has emerged as a central player in controlling actin polymerization. We have investigated WASP function and its regulation in chemotaxing Dictyostelium cells and demonstrated the specific and essential role of WASP in organizing polarized F-actin assembly in chemotaxing cells. Cells expressing very low levels of WASP show reduced F-act
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RING domains act in a variety of essential cellular processes but have no general function ascribed to them. Here, we observe that purified arenaviral protein Z, constituted almost entirely by its RING domain, self-assembles in vitro into spherical structures that resemble functional bodies formed by Z in infected cells. By using a variety of biophysical methods we provide a thermodynamic and kinetic framework for the RING-dependent self-assembly of Z. Assembly appears coupled to substantial conformational reorganization and changes in zinc coordination of site II of the RING. Thus, the rate-l
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytoplasmic dynein light chain 1 (DYNLL1) is a component of large protein complex, which is implicated in cargo transport processes, and is known to interact with many cellular and viral proteins through its short consensus motif (K/R)XTQT. Still, it remains to be explored that bacterial proteins also exhibit similar recognition sequences to make them vulnerable to host defense mechanism. We employed multiple docking protocols including AUTODOCK, PatchDock, ZDOCK, DOCK/PIERR and CLUSPRO to explore the DYNLL1 and Pilin interaction followed by molecular dynamics simulation assays. Subsequent str
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TcaR and IcaR are a weak and a strong negative regulator of transcription of the ica locus, respectively, and their presence prevents the poly-N-acetylglucosamine production and biofilm formation in Staphylococcus epidermidis. Although TcaR was shown to interact with the ica promoter, the precise binding region and the mechanism of interaction remained unclear. Here we present the 3D structure of TcaR in its apo form and in complex with salicylate as well as several aminoglycoside and beta-lactam antibiotics. A comparison of the native and complex TcaR structures indicates that the mechanism o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fibronectin is an extracellular matrix glycoprotein involved in cell adhesion and migration events in a range of important physiological processes. Aberrant adhesion of cells to the matrix may contribute to the breakdown of normal tissue function associated with various diseases. The adhesive properties of fibronectin may be mediated by its interaction with collagen, the most abundant extracellular matrix protein. The collagen-binding activity of fibronectin has been localized to a 42 kDa proteolytic fragment on the basis of this fragment's affinity for denatured collagen (gelatin)
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Proteomic techniques are useful to analyse the periodontal proteome in gingival crevicular fluid (GCF) and saliva. However, few investigations have assessed and compared the GCF and salivary proteomes. Therefore, this research aims to analyse the proteome structure and compare protein expression in these fluids between individuals with periodontal health and those with periodontitis.
METHODS: GCF and saliva were collected from 44 periodontally healthy subjects and 41 with periodontitis (stages III-IV). Samples were analysed using sequential window acquisition of all theoretical
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, Hespintor, a protein with unknown function, was screened and obtained from the hepatoblastoma cell line, HepG2, using suppression subtractive hybridization (SSH). Sequence analysis demonstrated that the protein is a novel secreting member of the Kazal-type serine protease inhibitor (serpin) family, and possesses the basic structure of serpin, which is highly homologous to esophageal cancer-related gene 2 (ECRG2). To further elucidate its biological functions, the Hespintor protein was expressed and purified. The coding sequence of the Hespintor Kazal domain was cloned into the p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herein, the design, synthesis, and evaluation of small molecules, drug-like G protein-coupled receptor kinase 5 (GRK5) inhibitors are reported. GRK5 has become an important drug development target against heart failure and cancer. GRK6, a close homolog of GRK5, is considered as a possible therapeutic target for multiple myeloma. A series of drug-like GRK5 inhibitors that form noncovalent interactions in the GRK5 active site are designed. In the design of these molecules, pyrroloindoline basic scaffold of sunitinib, an FDA-approved drug, is utilized and various N-heterocyclic carboxamides in th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibroblast growth factors (FGFs) encode a large family of growth factor proteins that activate several intracellular signaling pathways to control diverse physiological functions. The human genome encodes 22 FGFs that share a high sequence and structural homology with those of other vertebrates. FGFs orchestrate diverse biological functions by regulating cellular differentiation, proliferation, and migration. Dysregulated FGF signaling may contribute to several pathological conditions, including cancer. Notably, FGFs exhibit wide functional diversity among different vertebrates spatiotemporall
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mammalian chitinases belong to the glycosyl hydrolase 18 family based on structural homology and the family includes a large number of bacterial and eukaryotic chitinases. Among the mammalian chitinases, chitotriosidase (CHIT1) and acidic mammalian chitinase (AMCase) are capable of hydrolyzing the β-(1, 4)-linkage between the adjacent N-acetyl glucosamine residues of chitin. CHIT1 is one of the most abundantly secreted proteins, being mainly produced by activated macrophages and epithelial cells. CHIT1 plays a pivotal role in the context of infectious disease including malaria and fungi infect
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scorpion venoms are a particularly rich source of neurotoxic proteins/peptides that interact in a highly specific fashion with discrete subtypes of ion channels in excitable and non-excitable cells. Here we have employed a recently developed technique to effect molecular cloning and structural characterization of a novel putative potassium channel-blocking toxin from the same sample of venom from the North African scorpion, Androctonus amoreuxi. The deduced precursor open-reading frame is composed of 59 amino acid residues that consists of a signal peptide of approximately 22 amino acid residu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rat tail tendon (RTT) collagen has been reacted with a homologous series of chromium(III) complexes viz., (H2O)(4)Cr(OH)(2)Cr(H2O)(4+)(4) 1 (dimer), Cr(3)(OH)(4)(H2O)(5+)(9) 2 (trimer), and Cr(4)(OH)(4)(O2)(H2O)(4+)(12) 3 (tetramer), and the structural alterations brought about by these complexes have been investigated through atomic force microscopy (AFM) and circular dichroism (CD) studies. Examination of Cr(III)-treated tendons using AFM revealed changes in the D-periodicity of collagen, which may arise due to differences in the topological distribution of various Cr(III) complexes. Evidenc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования