BACKGROUND: Central nervous system (CNS) tumours occur when abnormal cells form in the tissues of the brain and/or spinal cord. Conventional testing for CNS tumour classification involves histopathological evaluation and molecular markers. More recently, DNA methylation-based classifier tests are being used as an adjunct tool in addition to conventional tests to help with CNS tumour classification. We conducted a health technology assessment of DNA methylation-based classifier tests for CNS tumours, which included an evaluation of effectiveness, cost-effectiveness, and budget impact of publicl…
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiac dysfunction is a leading cause of death each year, putting heavy burdens on the global healthcare system. To improve our understanding of cardiac disease, novel perspectives for exploring their pathogenesis mechanisms are needed, which contributes to finding novel diagnoses and therapy targets for cardiac disease. To be noteworthy, researchers have paid great attention to understanding the pathogenesis of cardiac diseases from the perspective of methyltransferase-like 3 (METTL3, the catalytic core)-mediated RNA N6-methyladenosine modification and targeting METTL3 for therapy. Therefore
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although methanogenic archaea are among the oldest microorganisms capable of mercury methylation, their contribution to methylmercury (MeHg) production has only recently gained attention. Studies with laboratory-cultivated methanogens elucidate the transformation of inorganic mercury (Hg) into MeHg, thereby uncovering underlying microbial methylation mechanisms. However, this field faces challenges such as significant Hg loss and unstable culture systems, which impede accurate assessment of these processes. This study aims to develop a reliable low-Hg-loss cultivation protocol for Hg methylati…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer (CC) remains a significant public health issue in low- and middle-income countries (LMICs), especially in Western sub-Saharan Africa and Nigeria. While global CC incidence and mortality have declined, these regions continue to face high rates due to inadequate screening and the high prevalence of HIV, which increases CC risk by promoting persistent HPV infections. This study aimed to identify DNA methylation (DNAm) biomarkers for cervical intraepithelial neoplasia (CIN) and CC in HIV-positive Nigerian women and to assess their potential for clinical risk prediction. From 2018 t…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: B cells contribute to systemic lupus erythematosus (SLE) pathogenesis through autoantibody production. DNA hypomethylation in B cells is a hallmark of SLE and may be associated with altered expression of key epigenetic regulators. This study investigated the mRNA expression of DNMT1 and UHRF1, which maintain DNA methylation, and TET2 and TET3, which mediate demethylation, in B cells from SLE patients.
METHODS: Participants included individuals with active SLE, inactive SLE, and healthy controls. Purified B cells were stimulated in vitro with anti-human IgM. Gene expr…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-traumatic stress disorder (PTSD) exhibits extensive clinical and biological variability, making treatment challenging. The Consortium to Alleviate PTSD (CAP)-ketamine trial, the largest randomized study of ketamine for PTSD, found no overall benefit of ketamine over placebo, underscoring the necessity to identify responsive subgroups. Using pre-treatment blood DNA methylation profiles and clinical measures from the CAP-ketamine trial, we applied machine learning to predict treatment response. A model based on 1,208 methylation sites achieved higher predictive accuracy than models using cl…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Early diagnosis of ovarian cancer, using cost-effective and non-invasive methods remains an unmet medical need, largely due to unspecific symptoms of the disease.
OBJECTIVE: Our goal was to identify differentially methylated CpG loci between cervical swabs obtained from patients diagnosed with benign ovarian disease and with malignant pelvic mass.
METHODOLOGY: Using Infinium EPICv2 array, we interrogated methylation profiles of 77 cervical swabs. The study cohort was then divided into a training and testing set to develop a diagnostic signature. We applied several strategies to…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urothelial carcinomas (UCs) are the fourth most common male malignancies. However, currently implemented detection methods for UC are usuall … on set, which is highly consistent with its performance in the training set. Moreover, PCDHGB7 hypermethylation showed promising potential in identifying sessile UC tumors or cases that might be missed in clinical detection and outperformed standard urine cytology in detecting bladder cancer (82.1% vs. 34.5%), ureter cancer (78.1% vs. 34.4%), and renal pelvis …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increasing evidence supports the role of the placenta in neurodevelopment and in the onset of neuropsychiatric disorders. Recently, mQTL and iQTL maps have proven useful in understanding relationships between SNPs and GWAS that are not captured by eQTL. In this context, we propose that part of the genetic predisposition to complex neuropsychiatric disorders acts through placental DNA methylation. We construct a public placental cis-mQTL database including 214,830 CpG sites calculated in 368 fetal placenta DNA samples from the INMA project, and run cell type-, gestational age- and sex-imQTL mod…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pleural mesothelioma (PM) is a rare and aggressive cancer that often requires multiple diagnostic procedures before a definitive diagnosis can be made. To improve diagnostic accuracy, we developed a DNA methylation-based biomarker assay capable of distinguishing PM from healthy pleura and other pleural pathologies. Using Infinium EPIC array data, we identified 744 hypermethylated CpG sites in PM as candidate biomarkers. These were validated in silico using external datasets, yielding a high mean AUC of 0.935. Clinical validation was performed using IMPRESS, a novel bisulfite-free methylation d…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation signatures ("episignatures") can be used as biomarkers of genetic aberrations, clinical phenotypes, and environmental exposures in rare diseases. Episignatures are utilized in molecular diagnostics and can clarify variants of uncertain significance. A growing number of disease genes, including epilepsy genes, exhibit robust and reproducible episignatures. However, whether SCN1A, the most prominent epilepsy gene, has one or more episignatures has not yet been determined. We generated genome-wide DNA methylation data and performed episignature analysis on 64 individuals with Drav…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previously, we defined CHI3L1 and PI3 as genes related with asthma and severity by analysis of differential gene expression. In this study, we investigated the role of DNA methylation in their regulation, and their relationship with protein levels and clinical parameters. Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and sera were collected from healthy controls (HCs), nonallergic asthmatic (NA), and allergic asthmatic (AA) patients. RNA and DNA were extracted from PBMCs using the trizol method. Gene expression was assessed by qRT-PCR, and DNA methylation of CpG sites near the promoters was analy…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Spinal meningiomas (SMs) are less frequently diagnosed than intracranial meningiomas. While recent advancements in tumor biology have identified key driver genes in SMs through targeted sequencing, few studies have yet to characterize the genomic profiles of these tumors together with their methylation signatures. In this study, we present our institutional experience of a combined genomic and epigenetic analysis of 8 thoracic SMs.
METHODS: We performed targeted genomic sequencing and DNA methylation profiling on 8 primary SMs. We further collected relevant clinical information and…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The incidence of thyroid cancer (TC) has significantly increased, highlighting the need for effective and objective approaches for the early diagnosis of TC. This study aimed to explore RASGEF1C methylation as a biomarker for papillary thyroid cancer (PTC).
METHODS: Formalin-fixed paraffin-embedded samples from a total of 363 PTC and 409 benign thyroid nodules from multiple centers were analyzed. RASGEF1C methylation profiles were examined via MALDI-TOFF mass spectrometry. Statistical analysis was performed via logistic regression adjusted for covariates, nonparametric tests, and …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: People living with HIV (PLWH) have an increased risk for lifetime trauma and mental health difficulties. However, no studies have evaluated stress-related genes in relation to early-life adversity, lifetime trauma, or post-traumatic stress disorder (PTSD) in PLWH.
METHODS: Using bisulfite pyrosequencing, we evaluated DNA methylation (DNAm) in intron 7 of FKBP5, a glucocorticoid feedback regulator, and in the promoter of SLC6A4, the serotonin transporter gene, in whole blood of a random sample of 70 PLWH recruited from an HIV program, and 51 individuals 2 years later (n = 48 at both time …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phenotypic diversity in bacteria often results from adaptation to changing environmental conditions, exemplified by variable colony morphoty … ion and confirmed that the Cep QS system is important for the emergence of variants. Given that DNA methylation is a key epigenetic factor regulating virulence factors in Burkholderia cenocepacia, we hypothesized that adenosine DNA methylation also governs phase variation in B. ambifaria HSJ1. By deleting the genes encoding putative adenosine DNA methyltransf …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Birth weight is a complex multifactorial trait relevant to health states and disease risks in later life. The placenta is essential for proper fetal growth and facilitates gas, nutrient, and waste exchange between the mother and developing fetus. How changes in placental DNA methylation affect fetal birth weight remains to be fully elucidated. In this study, we used whole-genome bisulfite sequencing and RNA sequencing to reveal a global map of DNA methylation and gene expression changes between the placentas of highest birth weight and lowest birth weight piglets in the same litters. The trans…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The role of protein arginine methyltransferases (PRMTs) in benign and malignant liver diseases has garnered considerable attention. PRMTs play a key function in regulating protein methylation modification in diseases such as alcoholic fatty liver disease, metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease, viral hepatitis, and hepatocellular carcinoma. This review explores the mechanisms of action of PRMTs in these diseases, with a focus on their effects on cell signaling, transcriptional regulation, cell proliferation, and metabolism. We also discuss potential therapeutic strategies tar…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alterations in lipid metabolism and DNA methylation are 2 hallmarks of aging. Connecting metabolomic, epigenomic, and aging outcomes help unravel the complex mechanisms underlying aging. We aimed to assess whether DNA methylation clocks mediate the association of circulating metabolites with incident atherosclerotic cardiovascular disease (ASCVD) and frailty.
METHODS: The China Kadoorie Biobank is a prospective cohort study with a baseline survey from 2004 to 2008 and a follow-up period until December 31, 2018. We used the Infinium Methylation EPIC BeadChip to measure the methylat…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To investigate the association between epigenetic age acceleration and glaucoma progression.
DESIGN: Retrospective cohort study.
PARTICIPANTS: 100 primary open-angle glaucoma (POAG) patients with fast progression and 100 POAG patients with slow progression.
METHODS: Subjects were classified as fast or slow progressors based on rates of change in standard automated perimetry (SAP) mean deviation (MD) and retinal nerve fiber layer (RNFL) thickness. Epigenetic age was calculated using the Horvath, Hannum, PhenoAge, and GrimAge clocks from DNA methylation profiles obtained from blood s…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования