In the present study, interferon (IFN) regulatory factor (IRF) 9 gene (irf9) was identified and characterized in common carp Cyprinus carpio. The predicted protein sequence of Irf9 contains a DNA binding domain (DBD) that possess five tryptophans, an IRF association domain (IAD) and two nuclear localisation signals (NLS). Alignment of Irf9 of C. carpio with the corresponding Irf9 proteins of other species showed that the DBD is more highly conserved than the IAD. The putative Irf9 protein sequence of C. carpio shares higher identities with teleosts (53.8-82.3%) and lower identities with mammal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Hepatitis delta virus (HDV) is responsible for the most severe form of acute and chronic viral hepatitis. We previously proposed that the Deltavirus genus is composed of eight major clades. However, few sequences were available to confirm this classification. Moreover, little is known about the structural and functional consequences of HDV variability. One practical consequence is the failure of most quantification assays to properly detect or quantify plasmatic HDV RNA. Between 2001 and 2014, 2,152 HDV strains were prospectively collected and genotyped in our reference laboratory
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A chymotrypsinlike serine proteinase of Coccidioides immitis with an estimated molecular size of 34 kDa has been shown by immunoelectron microscopy to be associated with the walls of the parasitic cells of this human respiratory pathogen. The proteinase has been suggested to play a role in spherule development. We report the isolation of a 1.2-kb cDNA from an expression library of C. immitis constructed in the lambda ZAP II phage vector. The cDNA is suggested to encode the 34-kDa protein. We demonstrate identity between segments of the deduced amino acid sequence of the open reading frame of t
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberous sclerosis complex (TSC) is an autosomal dominant genetic disorder characterized by the development of benign tumors and lesions in multiple organ systems. The syndrome arises from heterozygous mutations in either TSC1 or TSC2. In this study, we identified a family with a TSC1 c.363 + 668G > C mutation exhibiting diverse clinical phenotypes. The proband and affected family members exhibited multifocal nodular pneumocyte hyperplasia (MMPH), renal hamartomas, bone marrow hyperplasia, and pulmonary lymphangioleiomyomatosis (LAM), with genetic co-segregation analysis confirming the associa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the antibiotic resistome, mobilome, virulome, and phylogenomic lineages of Enterococcus spp. obtained from a wastewater treatment plant and its associated waters using whole-genome sequencing (WGS) and bioinformatics tools. The whole genomes of Enterococcus isolates including Enterococcus faecalis (n = 4), Enterococcus faecium (n = 5), Enterococcus hirae (n = 2), and Enterococcus durans (n = 1) with similar resistance patterns from different sampling sites and time points were sequenced on an Illumina MiSeq machine. Multilocus sequence typing (MLST) analysis revealed two E. fae
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A bacterial strain (BGf-2) with anti-Beauveria bassiana activity was obtained from the feces of Blattella germanica (L.) and identified as Pseudomonas aeruginosa based on biochemical tests and 16S rRNA sequence analysis. An antifungal protein (A0A0H2ZK06) was purified with Sephadex G-100 column and DEAE-sepharose Fast Flowanion exchange from sterile BGf-2 fermentation liquid. Based on MALDI-TOF MS analysis and protein model building, A0A0H2ZK06 showed homology with Pyrrolidone carboxyl peptidases (pcps). Fermentation liquid and antifungal proteins not only reduced the B. bassiana conidial germ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A chymotrypsin inhibitor from the venom of Ophiophagus hannah was isolated by a combination of ion-exchange chromatography and reverse phase HPLC. Amino acid sequence analysis revealed that this protein consists of 58 amino acids, six of these being cysteine residues and is highly homologous to Kunitz-type protease inhibitors. ESI-mass spectrum showed that the protein had a mass of 6493, which is in agreement with that predicted from its primary structure. In contrast to P1 Leu, Met, Phe, Trp, and Tyr appearing in other chymotrypsin inhibitors, a P1 Asn in the novel inhibitor may cause a weak
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the DSPP gene have been identified in nonsyndromic hereditary dentin defects, but the genotype-phenotype correlations are not fully understood. Recently, it has been demonstrated that the mutations of DSPP affecting the IPV leader sequence result in mutant DSPP retention in rough endoplasmic reticulum (ER). In this study, we identified a Korean family with dentinogenesis imperfecta type III. To identify the disease causing mutation in this family, we performed mutational analysis based on candidate gene sequencing. Exons and exon-intron boundaries of DSPP gene were sequenced, and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tarantula Chilobrachys jingzhao is one of the most venomous spiders with a specialized organ, venom gland, which synthesizes and secretes the complex and abundant toxin proteins. The components of the venom have been extensively studied. As far as the molecular mechanism of toxin secretion and metabolism is concerned, we still knew a little. To obtain a comprehensive view of function of its venom gland we constructed a non-normalized cDNA library of the venom gland and generated 788 expressed sequence tags (ESTs). All ESTs were assembled into 356 non-redundancy sequences including 85 clust
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio mimicus, a human pathogen that causes gastroenteritis, produces an enterotoxic hemolysin as a virulence factor. The hemolysin is secreted extracellularly as an inactive protoxin and converted to a mature toxin through removal of the N-terminal propeptide, which comprises 151 amino acid residues. In this study, a novel protease having the trypsin-like substrate specificity was purified from the bacterial culture supernatant. The N-terminal amino acid sequence of the purified protein was identical with putative trypsin VMD27150 of V. mimicus strain VM573. The purified protease was found t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumour necrosis factor alpha (TNF-α) is a pivotal cytokine in vertebrate immunity. Considering the increasing scientific interest for TNF-α in piscine biology, the paper detailed the characteristics of a novel tnf-α gene from a high-value mariculture species, Trachinotus blochii. The tbtnf-α complementary DNA (cDNA) of 1385 bp encoded an open reading frame of 762 bp, 3' untranslated region (3' UTR) of 484 bp and 5' UTR of 139 bp. The deduced Tbtnf-α1 showed the highest sequence identity to that of Seriola dumerili (∼83%). The comparative phylogenetics identified the protein as the TNF-α paralo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-RNA interactions tend to be mediated by RNA-binding proteins (RBPs) and are involved in every step of gene regulation. Faithfully mapping RBP-mediated intra- and intermolecular RNA-RNA interactions is a prerequisite for simultaneously inferring noncoding RNA structures and targets. We present a recently developed RIC-seq (RNA in situ conformation sequencing) technology for global profiling of RBP-mediated in situ RNA-RNA interactions. Our approach fixes RBP-mediated RNA-RNA interactions in living cells with formaldehyde for subsequent permeabilization, micrococcal nuclease fragmentation, p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rubinstein-Taybi syndrome (RSTS) is an autosomal dominant genetic disease characterized by growth retardation, psychomotor retardation, and distinctive facial features. It is primarily caused by mutations in CREBBP or EP300. In this study, we aimed to describe the clinical manifestations and genetic analyses of two cases with RSTS. Clinical analysis was performed on two cases with RSTS. Molecular diagnoses were made via whole exome sequencing, and potential pathogenic variants were filtered and selected. PCR followed by Sanger sequencing was used to verify candidate variants in the family memb
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The accurate characterization of triplet repeats, especially the overrepresented CAG repeats, is increasingly relevant for several reasons. First, germline expansion of CAG repeats above a gene-specific threshold causes multiple neurodegenerative disorders; for instance, Huntington's disease (HD) is triggered by >36 CAG repeats in the huntingtin (HTT) gene. Second, extreme expansions up to 800 CAG repeats have been found in specific cell types affected by the disease. Third, synonymous single nucleotide variants within the CAG repeat stretch influence the age of disease onset. Thus, new sequen
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia-telangiectasia (A-T) is an infrequent autosomal recessive multisystem disorder characterized by progressive cerebellar ataxia, oculo-cutaneous telangiectasia, a tendency to malignancies and variable immunodeficiency. Here we described a 5-year-old girl with atypical A-T symptoms. And 2 different ATM variants c.5939_5948del in exon 40 and c.2639-384A > G in intron 17 were detected by whole exome sequencing (WES) combined with RNA sequencing (RNA-seq). The variant spectrum of ATM was expanded. RNA-seq makes up for deficiencies of WES. We proposed a new approach, a dual-omics that combines
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1) is an autosomal dominant disorder characterized by the occurrence of parathyroid, pancreatic and pituitary tumors, and is due to mutations in the coding region of the MEN1 gene, which encodes menin. We investigated a family with identical twins that had MEN1, with different MEN1 tumors. DNA sequence analysis of the MEN1 coding region had not identified any abnormalities and we hypothesized that deletions and mutations involving the untranslated regions may be involved. Informed consent and venous blood samples were obtained from five family members. S
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphoserine aminotransferase (PSAT) is a pyridoxal-5'phosphate (PLP)-dependent enzyme that catalyzes the second reversible step in the phosphoserine biosynthetic pathway producing serine. The crystal structure of E. histolytica PSAT (EhPSAT) complexed with PLP was elucidated at 3.0 Å resolution and the structures of its mutants, EhPSAT_Δ45 and EhPSAT_Δ4, at 1.8 and 2.4 Å resolution respectively. Deletion of 45 N-terminal residues (EhPSAT_Δ45) resulted in an inactive protein, the structure showed a dimeric arrangement drastically different from that of the wild-type protein, with the two mono
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Matrix-enhanced secondary ion mass spectrometry (ME-SIMS) has overcome one of the biggest disadvantages of SIMS analysis by providing the ability to detect intact biomolecules at high spatial resolution. By increasing ionization efficiency and minimizing primary ion beam-induced fragmentation of analytes, ME-SIMS has proven useful for detection of numerous biorelevant species, now including peptides. We report here the first demonstration of tandem ME-SIMS for de novo sequencing of endogenous neuropeptides from tissue in situ (i.e., rat pituitary gland). The peptide ions were isolated for tand
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe the development of a new secretory production system for the enhanced production of a single-chain variable fragment (scFv) against the anthrax toxin in Corynebacterium glutamicum. For efficient secretory production of the antibody fragment, the following components were examined: (1) signal peptides, (2) codon usage of antibody fragment, (3) promoters, (4) 5' untranslated region (5' UTR) sequence, and (5) transcriptional terminator. Among all the systems examined, the use of a codon-optimized gene sequence, a Sec-dependent PorB signal peptide, and a fully synthetic H36 promoter, a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vibrio cholerae serogroup O1 has two major serotypes, Ogawa and Inaba, which may alternate among cholera epidemics. The rfbT gene is responsible for the conversion between the two serotypes. In this study, we surveyed the sequence variance of rfbT in the Ogawa and Inaba strains in China over a 48-year (1961-2008) period in which serotype shifts occurred among epidemic years.
RESULTS: Various mutation events including single nucleotide, short fragment insertions/deletions and transposases insertions, were found in the rfbT gene of the Inaba strains. Ectopically introducing an intac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.