PURPOSE: Acute lower respiratory infection (ALRI) remains a global public health problem among children. Distinguishing the etiology of ALRI is challenging and rapid pathogen identification is critical for optimizing the diagnosis and treatment of infectious diseases. Multiplex polymerase chain reaction (PCR) is sensitive, simple, and rapid. Our objective was to evaluate the diagnostic yield and prognostic significance of the FilmArray test for identification of pathogens in pediatric patients with ALRI at a tertiary care center.
METHODS: A prospective observational cross-sectional study invo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: In Zimbabwe, cervical cancer is screened through cytology and visual inspection with acetic acid and cervicography (VIAC). … f this study was to detect HR-HPV genotypes (HPV 16, 18, 31, 33, 35, 45, 51, 52, 56, and 58), using multiplex polymerase chain reaction (PCR), in stored cervicovaginal swabs from both HIV-positive and HIV-negative women reporting for routine cervical cancer screening.
METHODOLOGY: Stored cervicovaginal swabs from sexually active women who underwent VIAC at the Parirenyatwa Referral …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nasopharyngeal bacterial colonization is a pre-requisite for developing bacterial mucosal and invasive disease. Pneumococcal conjugate vaccine (PCV) immunization of children reduces their risk of colonization by vaccine-serotypes, which could affect the biome of the nasopharynx in relation to colonization by other bacteria. This study evaluated the association of PCV immunization on the prevalence density of nasopharyngeal colonization by common, potentially pathogenic bacteria.
METHODS: A multiplex qPCR assay was used to evaluate bacterial nasopharyngeal colonization by 7-valent
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Described is a novel real-time multiplex reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) assay suitable for intraoperative detection of micrometastasis (MM) in sentinel nodes (SNs) dissected from patients with clinical N0 (cN0) gastric carcinoma.
METHODS: One hundred three patients with gastric cancer, who were preoperatively diagnosed with cN0 and clinical T1 or T2, were enrolled. The patients underwent SN mapping followed by standard radical gastrectomy with lymph node dissection. In addition to all SNs, non-SNs (NSNs) within the SN lymphatic basin and NSN from a different
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The classification of B-lineage acute lymphoblastic leukemia (ALL) by specific chromosomal translocations has prognostic implications for risk-directed therapy. Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) assay is a useful tool for detecting fusion transcripts from common chromosomal translocations of ALL cells.
METHODS: Multiplex RT-PCR and nested-PCR assays were used to detect ALL-type BCR-ABL1 transcripts of the t(9;22), TCF-PBX1 transcripts of t(1;19), the MLL-AF4 transcripts of t(4;11), and 2 variants of ETV6-RUNX1 of the cryptic t(12;21) in 148 leukemic samples
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HSV-1, HSV-2, CMV, EBV, which are the members of the herpes virus family colonize and establish latent infection in human. Although EBV is a well known virus most involved in recurrent bouts of acute tonsillitis, the role and possibility of HSV-1, HSV-2, and CMV for establishing infection in tonsils are not clear. The purpose of this study is to verify whether the tonsils might harbor the HSV-1, HSV-2, and CMV, in addition to EBV, in chronically hyperplastic nasopharyngeal lymphoid tissue. To accomplish the purpose, we developed a new Multiplex Polymerase Chain Reaction (M-PCR) assay using a s…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A multiplex polymerase chain reaction (PCR)-liquid hybridization assay detecting a minimum 10 fg of cytomegaloviral (CMV) DNA has been developed. This assay successfully detected viral nucleic acids in 25/26 (96.2%) routinely embedded allograft liver biopsies with CMV hepatitis. No CMV DNA was detected in 15 native and 12 donor liver tissues sampled at the time of liver transplantation. These results indicate that archived formalin-fixed, paraffin-embedded liver tissues obtained from patients with significant liver disease can be successfully analyzed for CMV by PCR, retrospectively. Failure t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Blood cultures are the cornerstone of diagnosis for detecting the presence of bacteria or fungi in the blood, with an average detection time of 48 hours and failure to detect a pathogen occurring in approximately 50% of patients with sepsis. Rapid diagnosis would facilitate earlier treatment and/or an earlier switch to narrow-spectrum antibiotics.
OBJECTIVE: The aim of this study is to develop and implement a multiplex droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) assay as a routine diagnostic tool in the detection and identification of pathogens from whole blood and/or blood
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Calf diarrhea is a major economic burden to the bovine industry. Since multiple infectious agents can be involved in calf diarrhea, and the detection of each of the causative agents by traditional methods is laborious and expensive, a panel of 2 multiplex real-time polymerase chain reaction (PCR) assays was developed for rapid and simultaneous detection of the 5 major bovine enteric pathogens (i.e., Bovine coronavirus [BCoV; formally known as Betacoronavirus 1], group A Bovine rotavirus [BRV], Salmonella spp., Escherichia coli K99(+), and Cryptosporidium parvum). The estimated detection limit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Large outbreaks of hand, foot, and mouth disease have been reported in the Asia Pacific region over the last few years and resulted in significant fatalities. The 2 main etiologic agents are Enterovirus 71 (EV71) and Coxsackievirus A16 (CA16). Both viruses are closely related genetically and show similar clinical symptoms. However, EV71 are associated with neurologic complications and can lead to fatalities. In this study, we developed a multiplex real-time hybridization probe reverse transcriptase polymerase chain reaction to detect and differentiate EV71 from CA16 using the LightCycler (Roch
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To develop multiplex reverse translation-polymerase chain reaction (RT-PCR) method for detection of dengue virus type 1-4.
METHODS: Based on the genomes sequence analysis of dengue virus type 1-4, four-pair of primers were designed. The specificity of the primers was primarily tested by searching the GenBank DNA sequence database. The optimal reaction conditions of the multiplex RT-PCR were then established. The specificity of RT-PCR was tested using the homologous yellow fever virus and Japanese encephalitis virus. 30 serum samples of dengue virus from suspected sufferers in the p
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We developed a multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay that simultaneously detects three types of flea-associated microorganisms. Targets for the assay were sequences encoding portions of the gltA, a 17-kDa antigen, and pla genes of Bartonella spp. Strong et al., Rickettsia spp. da Rocha-Lima, and Yersinia pestis Yersin, respectively. A total of 260 flea samples containing bloodmeal remnants were analyzed from fleas collected from abandoned prairie dog (Cynomys ludovicianus) burrows at the site of an active plague epizootic in Jefferson County, CO. Results indicated that 34 (13.1%) fle…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The multiplexed digital polymerase chain reaction (PCR) is widely used in molecular diagnosis owing to its high sensitivity and throughput for multiple target detection compared with the single-plexed digital PCR; however, current multiplexed digital PCR technologies lack efficient coding strategies that do not compromise the sensitivity and signal-to-noise (S/N) ratio. Hence, we propose a fluorescent-encoded bead-based multiplexed droplet digital PCR method for ultra-high coding capacity, along with the creative design of universal sequences (primer and fluorescent TaqMan probe) for ultra-sen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Meningitis is one of the most dangerous infection affecting children. The need for rapid and accurate diagnosis is mandatory for improving the outcome.
AIM OF THE WORK: to evaluate the role of multiplex polymerase chain reaction (PCR), cerebrospinal fluid (CSF)-C-reactive protein (CRP) and serum procalcitonin (PCT) in diagnosis of meningitis and to detect its accuracy.
PATIENTS AND METHODS: A cross-sectional study was carried out in University Children hospital, Faculty of Medicine, between November 2019 and September 2020. The study was approved by the Ethics Review Board of Fac…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although infectious diarrhea is one of the most common complications in human immunodeficiency virus (HIV)-infected patients, robust diagnostic methods for determining potential pathogens are still limited in the clinic. Norovirus, a type of calicivirus, has been shown to be the most common cause of gastroenteritis. Here, we used multiplex polymerase chain reaction as a diagnostic tool to verify Norovirus as the diarrhea-related pathogen in HIV-infected patients with unknown etiological information. Stool specimens obtained from 81 HIV-infected patients with diarrhea were analyzed by BioFire F…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bartonella henselae (Rhizobiales: Bartonellacae), the agent of cat-scratch disease, is an emerging bacterial pathogen which can be transmitted via infective faecal material of Ctenocephalides felis Bouché (Siphonaptera: Pulicidae). Worldwide, B. henselae has been identified in 1-53% of felines and 2.9-17.4% of fleas. Although culture is the routine method for detection, the procedure is time-consuming and is rarely used for isolation directly from flea vectors. The current study reports the development of a quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) to detect and quantify B. hense
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutation detection in the neurofibromatosis type 2 (NF2) gene is challenging because when combining mutation detection methods such as single-strand conformational polymorphism and heteroduplex analysis, denaturing gradient gel electrophoresis, and direct sequencing of aberrant polymerase chain reaction (PCR) fragments only 30 to 60% of the constitutional mutations are detected. Because large deletions and complete chromosome rearrangements are also described methods such as microarray-comparative genomic hybridization and fluorescence in situ hybridization are also used. The one type of mutat
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Blood parasites cause serious drawbacks in the livestock industry. The detection methods rely on microscopic examination and polymerase chain reaction (PCR), which requires an expert person, labor, time, and cost.
AIM: In this study, a multiplex PCR has been developed for hemoparasites consisting of Piroplasma (Babesia spp. and Theileria spp.), Anaplasma spp., and Trypanosoma evansi detections.
METHODS: Blood parasite infections in cattle were investigated using three different methods: microscopic examination, single PCR, and multiplex PCR. The Anaplasma 16s rRNA gene, Babesia 1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT.—: Quantification and detection of the t(9;22) (BCR-ABL1) translocation in chronic myelogenous leukemia and B-lymphoblastic leukemia are important for directing treatment protocols and monitoring disease relapse. However, quantification using traditional reverse transcriptase quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) is dependent on a calibration curve and is prone to laboratory-to-laboratory variation. Droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) is a novel method that allows for highly sensitive absolute quantification of transcript copy number. As such, ddPCR is a good c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In Sub-Saharan Africa, including Mozambique, acute bacterial meningitis (ABM) represents a main cause of childhood mortality. The burden of ABM is seriously underestimated because of the poor performance of culture sampling, the primary method of ABM surveillance in the region. Low quality cerebrospinal fluid (CSF) samples and frequent consumption of antibiotics prior to sample collection lead to a high rate of false-negative results. To our knowledge, this study is the first to determine the frequency of ABM in Mozambique using real-time polymerase chain reaction (qPCR) and to com
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования