The sequence of the genome of the RA27/3 vaccine strain of rubella virus (RUB) was determined. In the process, several discrepancies between the previously reported genomic sequences of two wild RUB strains (Therien and M33) were resolved. The genomes of all three strains contain 9762 nucleotides (nts), exclusive of the 3' poly A tract. In all three strains, the genome contains (5' to 3'), a 40 nt 5' untranslated region (UTR), an open reading frame (ORF) of 6348 nts that encodes nonstructural proteins, a 123 nt UTR between the two genomic ORFs, a 3189 nt ORF that encodes the structural protein
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Subjects afflicted with atopic dermatitis are particularly predisposed to such viral superinfections as verruca, herpes (eczema herpeticum) and vaccinia (eczema vaccinatum). Knowledge of superinfection by the molluscum contagiosum virus is more recent and the authors describe one case. The orf virus (responsible for ovine ecthyma contagiosum), however, has never been described as responsible for the profuse superinfection of an atopic eczema. The authors observed one case of this in a child, atypical as result of his age (16 months), the cervical localization and the aspect, which was a telang
Клинический случайАннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The B169L protein (pB169L) of African swine fever virus (ASFV) is a structural protein with an unidentified function during the virus replication. The sequences of the B169L gene and the downstream B438L gene are separated by short intergenic regions. However, the regulatory mode of the gene transcription remains unknown. Here, we identified two distinct promoter regions and two transcription start sites (TSSs) located upstream of the open reading frame (ORF) of B438L. Using the promoter reporter system, we demonstrated that the cis activity of the ORF proximal promoter exhibited significantly
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ambiviruses are fungal-infecting circular RNA viruses that uniquely combine viroid-like and viral features, yet the function of their conserved ORF-B protein and their effects on hosts remain unknown, hindered by the lack of a reverse genetics system. Here, we constructed the first infectious cDNA clone of an ambivirus, Fusarium graminearum ambivirus 1 (FgAV1), using a head-to-tail dimer placed downstream of a fungal promoter. FgAV1 was horizontally transmitted via hyphal anastomosis to virus-free Fusarium graminearum strains. Notably, a reverse-oriented dimer construct was also infectious and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The family Mamonoviridae, assigned in 2023, consists of three strains of medusavirus that infect acanthamoeba. A closely related species, clandestinovirus, which infects vermamoeba, was reported in 2021. Here, we report a newly identified clandestinovirus-like virus, named ushikuvirus, isolated from a freshwater pond in Japan. The ushikuvirus genome was at least 666,605 bp and contained 784 genes. Annotation revealed that a substantial proportion (58%) of open reading frames (ORFs) are ORFans, and 25% of ORFs are similar to those of other viruses in the phylum Nucleocytoviricota. Among ORFs sh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Myxomatosis is a recurrent problem on rabbit farms throughout Europe despite the success of vaccines. To identify gene variations of field and vaccine strains that may be responsible for changes in virulence, immunomodulation, and immunoprotection, the genomes of 6 myxoma virus (MYXV) strains were sequenced: German field isolates Munich-1, FLI-H, 2604, and 3207; vaccine strain MAV; and challenge strain ZA. The analyzed genomes ranged from 147.6 kb (strain MAV) to 161.8 kb (strain 3207). All sequences were affected by several mutations, covering 24 to 93 open reading frames (ORFs) a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis E virus (HEV), a single-stranded, positive-sense RNA virus, is responsible for acute hepatitis E epidemics in many developing countries, and the virus is also endemic in some industrialized countries. Hepatitis E is a recognized zoonotic disease, and several animal species, including pigs, are potential reservoirs for HEV. The genome of HEV contains three open reading frames (ORFs). ORF1 encodes the nonstructural proteins, ORF2 encodes the capsid protein, and ORF3 encodes a small multifunctional protein. The ORF2 and ORF3 proteins are translated from a single, bicistronic mRNA. The c
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis E virus (HEV), a fecal-orally transmitted foodborne viral pathogen, causes acute hepatitis in humans and is responsible for hepatitis E outbreaks worldwide. Since the identification of HEV as a zoonotic agent, this virus has been isolated from a variety of hosts with an ever-expanding host range. HEV-open reading frame (ORF) 3, the smallest ORF in HEV genomes, initially had been perceived as an unremarkable HEV accessory protein. However, as novel HEV-ORF3 function has been discovered that is related to the existence of a putative third virion structural form, referred to as "quasi-e
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transcriptome of fowl adenovirus has not been comprehensively revealed. Here, we attempted to analyze the fowl adenovirus 4 (FAdV-4) transcriptome by deep sequencing. RNA samples were extracted from chicken LMH cells at 12, 18 or 26 h post-FAdV-4 infection, and subjected to Illumina strand-specific RNA-seq or nanopore full-length PCR-cDNA sequencing. After removing the reads of host cells, the data of FAdV-4 nanopore full-length cDNAs (transcripts) were corrected with reads from the Illumina RNA-seq, mapped to the viral genome and then used to predict viral open reading frames (ORFs). Othe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acinetobacter baumannii is an opportunistic pathogen that easily resists currently available antibiotics. Phages are considered alternative therapeutic agents to conventional antibiotics for the treatment of multidrug-resistant bacteria. We isolated an Acinetobacter virus Abgy202141 from underground sewage in a residential area of Guiyang City in China. Transmission electron microscopy (TEM) analysis showed that Acinetobacter virus Abgy202141 has an icosahedral head attached to a tail. This phage infects A. baumannii strain GY-4, and was found to have a short latent period of 5 min and with a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The program(s) of gene expression operating during murine gammaherpesvirus 68 (gammaHV68) latency is undefined, as is the relationship between gammaHV68 latency and latency of primate gammaherpesviruses. We used a nested reverse transcriptase PCR strategy (sensitive to approximately one copy of gammaHV68 genome for each genomic region tested) to screen for the presence of viral transcripts in latently infected mice. Based on the positions of known latency-associated genes in other gammaherpesviruses, we screened for the presence of transcripts corresponding to 11 open reading frames (ORFs) in
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Camelpox virus (CMPV) and variola virus (VAR) are orthopoxviruses (OPVs) that share several biological features and cause high mortality and morbidity in their single host species. The sequence of a virulent CMPV strain was determined; it is 202182 bp long, with inverted terminal repeats (ITRs) of 6045 bp and has 206 predicted open reading frames (ORFs). As for other poxviruses, the genes are tightly packed with little non-coding sequence. Most genes within 25 kb of each terminus are transcribed outwards towards the terminus, whereas genes within the centre of the genome are transcribed from e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Contagious Ecthyma (CE) is a highly contagious viral disease of sheep and goats with worldwide distribution. The present study aimed to provide a clinical description of contagious ecthyma in four sheep flocks and screen the possible genetic variation in the B2L gene of the detected isolates. Oral lesions were collected and inoculated into chorioallantoic membrane (CAM) of 11 days embryonated chicken eggs. Polymerase chain reaction and direct sequencing of the B2L gene was conducted. Infected sheep exhibited anorexia with a development of nodular lesions evolving in proliferative thick scabs a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tick-borne encephalitis (TBE) virus is an important human pathogen belonging to the genus Flavivirus within the family Flaviviridae. The genome of the TBE virus is a single-stranded RNA (ssRNA) molecule of positive polarity encoding all the viral proteins within a single open reading frame (ORF). TBE virus shares common physical and genetic characteristic of the flavivirus genus. Two subtypes of the TBE virus have been described: (1) European, endemic in many parts of Europe and transmitted by Ixodes ricinus ticks, and (2) Far Eastern (Russian spring summer encephalitis (RSSE) virus), endemic
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chinese hamster ovary (CHO) cells manifesting striking cytopathogenic changes in culture were investigated to determine the causative agent. Electron microscopic analyses revealed viral particles of about 40 nm in diameter, displaying typical calicivirus morphology. To date, this virus, designated isolate 2117, exclusively replicates in CHO cells, achieving only moderate titres. After cloning, the coding region of 7928 nucleotides, the 3' non-coding region and the poly(A) tail were sequenced. The genome consists of three open reading frames (ORFs), with the first and second ORF having the same
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most human enterovirus 71 (HEV71) strains infect only primates and are unable to cause clinically apparent infection in mice. Here we describe a mouse-adapted HEV71 strain that belongs to sub-genogroup B5 with increased virulence in newborn BALB/c mice. The mouse-virulent strain was initially selected by serial passage of a HEV71 clinical isolate (HEV71-B5) in Chinese hamster ovary (CHO) cells (CHO-B5), followed by serial passage in newborn mice. Virus from the fifth mouse passage was cultured twice on Vero cells and designated as MP-B5. MP-B5 induces severe disease of high mortality in newbor
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Current influenza A vaccines fall short, leaving both humans and animals vulnerable. To address this issue, we have developed attenuated modified live virus (MLV) vaccines against influenza using genome rearrangement techniques targeting the internal gene segments of FLUAV. The rearranged M2 (RAM) strategy involves cloning the M2 ORF downstream of the PB1 ORF in segment 2 and incorporating multiple early stop codons within the M2 ORF in segment 7. Additionally, the IgA-inducing protein (IGIP) coding region was inserted into the HA segment to further attenuate the virus and enhance
ПрепринтСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aglaonema bacilliform virus (ABV), a member of the genus Badnavirus in the family Caulimoviridae, is associated with leaf deformation and chlorosis in Aglaonema modestum. The complete genome sequence of a Minnesota isolate of ABV was determined. The ABV genome is 7,178 bp in length and similar in size and organization to those of the members of the genus Badnavirus, containing three open reading frames (ORFs) with the potential to encode three proteins of 14.92, 13.33 and 207.95 kDa, respectively. The last ORF (ORF3) encodes a putative polyprotein with conserved domains, including zinc finger,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Varicella-zoster virus (VZV), a double-stranded DNA virus, causes varicella, establishes lifelong latency in ganglionic neurons, and reactivates later in life to cause herpes zoster, commonly associated with chronic pain. The VZV genome is densely packed and produces multitudes of overlapping transcripts deriving from both strands. While 71 distinct open reading frames (ORFs) have thus far been experimentally defined, the full coding potential of VZV remains unknown. Here, we integrated multiple short-read RNA sequencing approaches with long-read direct RNA sequencing on RNA isolated from VZV-
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The putative DNA encapsidation genes encoded by open reading frames (ORFs) 25, 26, 30, 34, 43, 45/42 and 54 were cloned from Varicella-zoster virus (VZV) strain Ellen. Sequencing revealed that the Ellen ORFs were highly conserved at the amino acid level when compared to those of 19 previously published VZV isolates. Additionally, RT-PCR provided the first evidence that ORF45/42 was expressed as a spliced transcript in VZV-infected cells. All seven ORFs were expressed in vitro and full length products were identified using a C-terminal V5 epitope tag. The in vitro products of the putative VZV t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования