Peroxiredoxins (Prxs) are a newly defined family of anti-oxidant proteins that have been implicated, via their anti-oxidant activity, in a number of cellular functions, including cell proliferation and differentiation, protection of other proteins from oxidative damage, and intracellular signaling. We isolated genomic DNA sequences of the Prx I genes from the mouse, and characterized their molecular genetic features. Prx I was found to form a small gene family with two and three members; one functional and two pseudogenes. The Prx I-1 gene has splice donor/acceptor site sequences and five or s…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent studies on the genomic organization of the human Ig VH locus have revealed the presence of an important proportion of VH pseudogenes and a high degree of interspersion among VH gene-family members. The mechanisms of selection of VH genes expressed by differentiating B cells remain to be elucidated. We have made use of RNA-RNA in situ hybridization to probe the repertoire of VH gene-families assembled in peripheral B cells of normal adults. Cells were in vitro activated with mitogens and then hybridized to [35S]-labeled anti-sense RNA probes specific for C mu and C gamma genes, and for t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent progress in exploring the Y-chromosome gene content in humans, mice and cats have suggested that "autosome-to-Y" transpos … chromosome 17 (BTA17) and subsequently amplified. Approximately 130 active ZNF280BY loci (and ~240 pseudogenes) and ~130 pseudogenized ZNF280AY copies are present over the majority of the male-specific region (MSY). Phylogenetic analysis indicated that both gene families fit with the "birth-and-death" model of evolution. The active ZNF280BY loci share high s …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The family of olfactory receptors (ORs) subserves the sense of smell and includes both functional alleles and pseudogenes, the latter identified by mutations resulting in frame shift or premature truncation. During neuronal differentiation, nonfunctional ORs are expressed initially but then are switched out, and/or the olfactory sensory neurons (OSNs) expressing them die. We carried out a transcriptomic analysis of FACS-isolated cells from ΔSox2-eGFP, Neurog1-eGFP BAC and ΔOMP-eGFP strains of uninjured and olfactory bulbectomized transgenic mice that correspond to distinct stages in the progre…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcripts of NANOG and OCT4 have been recently identified in human t(4;11) leukemia and in a model system expressing both t(4;11) fusion proteins. Moreover, downstream target genes of NANOG/OCT4/SOX2 were shown to be transcriptionally activated. However, the NANOG1 gene belongs to a gene family, including a gene tandem duplication (named NANOG2 or NANOGP1) and several pseudogenes (NANOGP2-P11). Thus, it was unclear which of the NANOG family members were transcribed in t(4;11) leukemia cells. 5'-RACE experiments revealed novel 5'-exons of NANOG1 and NANOG2, which could give rise to the expres…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Shigella bacteria cause bacillary dysentery, which remains a significant threat to public health. The genus status and species classific … chromosomes share most of their genes with that of E.coli K12 strain MG1655, but each has over 200 pseudogenes, 300 approximately 700 copies of insertion sequence (IS) elements, and numerous deletions, insertions, translocations and inversions. There is extensive diversity of putative virulence genes, mostly acquired via bacteriophage-mediated lateral gene t …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diatoms are pivotal in global oxygen, carbon dioxide, and silica cycling, contributing significantly to photosynthesis and serving as fundamental components in aquatic ecosystems. Recent advancements in genomic sequencing have shed light on their evolutionary dynamics, revealing evolutionary complex genomes influenced by symbiotic relationships and horizontal gene transfer events. By analyzing publicly available sequences for 120 plastomes and 70 mitogenomes, this paper aims to elucidate the evolutionary dynamics of diatoms across diverse lineages. Gene losses and pseudogenes were more frequen…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudoalteromonas viridis strain BBR56 was isolated from seawater at Dutungan Island, South Sulawesi, Indonesia. Bacterial DNA was isolated … me size was 5.5 Mb and included chromosome 1 (4.2 Mbp) and chromosome 2 (1.3 Mbp), which encoded 61 pseudogenes, 4 noncoding RNAs, 113 tRNAs, 31 rRNAs, 4,505 coding DNA sequences, 4 clustered regularly interspaced short palindromic repeats, 4,444 coding genes, and a GC content of 49.5%. The sequence of the whole genome of P. viridis BBR56 was uploaded to GenB …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Olfaction is a crucial capability for most vertebrates and is realized through olfactory receptors in the nasal cavity. The enormous diversi … n an anuran, B. bufo presented the smallest number of pseudogene sequences ever identified, with no pseudogenes in either the beta or epsilon groups. Although H. boettgeri shares many morphological adaptations for an aquatic lifestyle with Xenopus, and presented a similar number of genes related to the detection of water-soluble odorants, it had comparatively …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 193 base pair repeat polymorphism in the human poly(ADP-ribose) polymerase (PADPRP) pseudogene found on chromosome 13 has been associated with lung cancer, endemic Burkitt lymphoma, B-cell lymphoma, breast cancer and colorectal carcinoma. We investigated the frequency of the PADPRP genetic polymorphism in a hospital-based case-control study of lung cancer for 54 cases and 47 controls. There was a statistically significant difference in allelic frequency between Caucasians and African Americans (p<0.001). For African Americans, the odds ratio for lung cancer and the 'B' allele was 2.38 (95% C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Variants in six pre-mRNA processing factors cause autosomal dominant Retinitis Pigmentosa (adRP). The RP9 gene encodes a seventh splicing factor, and in 2002, we published RP9 variants c.410A>T; p.(H137L) and c.509A>G; p.(D170G) as likely causes of adRP in a large multigenerational RP9-linked family and a single case, respectively. It has since been suggested these variants might be artefacts due to simultaneous amplification of the RP9P pseudogene, and no further pathogenic variants have been reported. We therefore rescreened two members of the RP9-linked family by genome sequencing. Examinat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium lepromatosis is an uncultured human pathogen associated with diffuse lepromatous leprosy and a reactional state known as Lucio's phenomenon. By using deep sequencing with and without DNA enrichment, we obtained the near-complete genome sequence of M. lepromatosis present in a skin biopsy from a Mexican patient, and compared it with that of Mycobacterium leprae, which has undergone extensive reductive evolution. The genomes display extensive synteny and are similar in size (∼3.27 Mb). Protein-coding genes share 93% nucleotide sequence identity, whereas pseudogenes are only 82% ide…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The importance of a genetic polymorphism (A/B allele) of poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) pseudogene on chromosome 13q34-qter, and PARP enzyme activities in the development of human breast cancer were evaluated in a cancer case-control study. A total of 309 Caucasian women (> or = 50 years old) were evaluated for the PARP genotype, 70 of whom had histologically confirmed breast cancer, 128 women with benign breast diseases as study controls, and 111 reference controls. Age was significantly associated with case-control status (p < 0.0001), but family history of breast cancer, age at menarche
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Preeclampsia (PE) manifests as a pregnancy-specific complication arising from compromised placentation characterized by inadequate trophoblast invasion. A growing body of evidence underscores the pivotal involvement of pseudogenes, a subset of long noncoding RNAs, in the pathological processes of PE. This study presents a novel finding, demonstrating a significant downregulation of the pseudogene PDIA3P1 in PE placental tissues compared to normal tissues. In vitro functional assays revealed that suppressing PDIA3P1 hindered trophoblast proliferation, invasion, and migration, concurrently upreg…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Whole exome sequencing (WES) has emerged as the preferred method for diagnosing a range of Mendelian disorders. Nonetheless, the applicability of WES in genetic diagnosis of 21-hydroxylase deficiency (21-OHD) remains uncertain due to the intricacies involved in molecular analysis of the CYP21A2 gene.
METHODS: In this case series, authors report the outcomes of couples or families who underwent WES followed by focused sequential strategy (FSS) targeting CYP21A2 gene hotspot mutations and targeted sequencing of genes associated with Congenital Adrenal Hyperplasia (CAH).
RESULTS: Th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein-coding genes mapping to high-identity segmental duplications (SDs) have been difficult to annotate and characterize and are the sour … dels, including 150 that absent or different from current T2T-CHM13 gene annotation and 236 (35.1%) pseudogenes as protein-coding where we find evidence of transcription, an open reading frame, and chromatin-accessible promoters. We find that 24.2% of SD genes show evidence of constraint for both copy number and amino acid mutation. The majority of these cons …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Germline variants in the DNA mismatch repair (MMR) gene PMS2 cause 1-14% of all Lynch Syndrome cancers. Correct variant analysis of PMS2 is complex due to the presence of multiple pseudogenes and the occurrence of gene conversion. The analysis complexity increases in highly fragmented DNA from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue. Here we describe a reliable approach to detect true PMS2 variants in fragmented DNA. A custom NGS panel designed for FFPE tissue was used targeting four MMR genes, POLE and POLD1. Amplicon design for PMS2 was based on the position of paralogous sequence var…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We used next-generation sequencing to identify immunoglobulin heavy chain (IGH) genetic variation in two closely related hypertensive rat li … ong these, SHR-A3 and SHR-B2 differ from one another at the amino acid level in 96 segments. Twelve pseudogenes in the rat reference genome sequence had changes displacing the stop codon and creating probable functional genes in either or both SHR-A3 and SHR-B2. A further five alleles that encoded functional rat reference genome sequence genes or open reading …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitellogenins (Vtg) are the major yolk proteins in most oviparous organisms. They are encoded by a small number of genes--between one and four depending on the species. Characterization of the Vtg region in the genome of the rainbow trout reveals unusual features, however, in that this locus contains twenty complete genes and ten pseudogenes per haploid genome. The Vtg genes differ from each other by insertion, deletion and rearrangement events, although, at the sequence level, they show a high degree of similarity. Fluorescent in situ hybridization (FISH), pulsed-field gel electrophoresis (PF…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory T cells contribute to the pathogenesis of autoimmune diseases such as systemic lupus erythematosus (SLE). Analysis of the T-cell transcriptomics data of two independent SLE patient cohorts by three machine learning models revealed the pseudogene UHRF1P as a novel SLE biomarker. The pseudogene-encoded UHRF1P protein was overexpressed in peripheral blood T cells of SLE patients. The UHRF1P protein lacks the amino-terminus of its parental UHRF1 protein, resulting in missing the proteasome-binding ubiquitin-like (Ubl) domain of UHRF1. T-cell-specific UHRF1P transgenic mice manifested
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования