The domestic pig has been widely used as an important large animal model. Precise and efficient genetic modification in pig provides a great promise in biomedical research. Recently, clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)/CRISPR-associated (Cas) system has been successfully used to produce many gene-targeted animals. However, these animals have been generated by co-injection of Cas9 mRNA and single-guide RNA (sgRNA) into one-cell stage embryos, which mostly resulted in mosaicism of the modification. One or two rounds of further breeding should be performed to obtain
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The c.1222C>T (p.Arg408Trp) phenylalanine hydroxylase (PAH) variant is the most frequent cause of phenylketonuria (PKU), an autosomal recessive disorder characterized by accumulation of blood phenylalanine (Phe) to neurotoxic levels. Here we devised a therapeutic base editing strategy to correct the variant, using prime-edited hepatocyte cell lines engineered with the c.1222C>T variant to screen a variety of adenine base editors and guide RNAs in vitro, followed by assessment in c.1222C>T humanized mice in vivo. We found that upon delivery of a selected adenine base editor mRNA/guide RNA combi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SAM and SH3 domain-containing 1 (SASH1), a member of the SLy protein family, is a tumor suppressor gene that has been studied for its association with various cancers. SASH1 is highly expressed in the mammalian central nervous system, particularly in glial cells, and is expressed in the central nervous system during zebrafish embryo development. However, SASH1's role in brain development has rarely been investigated. In this study, Morpholino oligonucleotides (MO) were used to down-regulate sash1a expression in zebrafish to observe morphological changes in the brain. Three transgenic zebrafish
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clinical success of CRISPR therapies hinges on the safety and efficacy of Cas proteins. The Cas9 from Francisella novicida (FnCas9) is highly precise, with a negligible affinity for mismatched substrates, but its low cellular targeting efficiency limits therapeutic use. Here, we rationally engineer the protein to develop enhanced FnCas9 (enFnCas9) variants and broaden their accessibility across human genomic sites by ~3.5-fold. The enFnCas9 proteins with single mismatch specificity expanded the target range of FnCas9-based CRISPR diagnostics to detect the pathogenic DNA signatures. They ou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR/Cas9 is an adaptive immune system where bacteria and archaea have evolved to resist the invading viruses and plasmid DNA by creating site-specific double-strand breaks in DNA. This study tested this gene editing system in inhibiting human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection by targeting the viral long terminal repeat and the gene coding sequences. Strong inhibition of HIV-1 infection by Cas9/gRNA was observed, which resulted not only from insertions and deletions (indels) that were introduced into viral DNA due to Cas9 cleavage, but also from the marked decrease in the level
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Engineered virus-like particles (eVLPs) are promising vehicles for transient delivery of gene editing agents. While extensive particle engineering has yielded efficient eVLPs, it remains underexplored whether engineering the cells used to produce eVLPs could further improve eVLP properties. We report an unbiased genome-wide screening approach to systematically investigate how genetic perturbations in producer cells influence eVLP production. This approach generates eVLPs loaded with guide RNAs that identify the genetic perturbation in the cell that produced a particular particle; the abundance
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is an urgent need for inexpensive new technologies that enable fast, reliable, and scalable detection of viruses. Here, we repurpose the type III CRISPR-Cas system for sensitive and sequence-specific detection of SARS-CoV-2. RNA recognition by the type III CRISPR complex triggers Cas10-mediated polymerase activity, which simultaneously generates pyrophosphates, protons, and cyclic oligonucleotides. We show that all three Cas10-polymerase products are detectable using colorimetric or fluorometric readouts. We design ten guide RNAs that target conserved regions of SARS-CoV-2 genomes. Multi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pediatric cholestatic liver diseases (Ped-CLD) comprise many ultrarare disorders with a genetic basis. Pharmacologic therapy for severe cases of Ped-CLD has not been established. Species differences in bile acid (BA) metabolism between humans and rodents contribute to the lack of phenocopy of patients with Ped-CLD in rodents and hinder the development of therapeutic strategies. We aimed to establish an efficient in vivo system to understand BA-related pathogenesis, such as Ped-CLD.
METHODS: We generated mice that express spCas9 specifically in the liver (L-Cas9Tg/Tg [liver-specifi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Currently, there is a lack of effective treatment for Parkinson's disease (PD). In PD patients, aberrant methylation of SNCA (α-synuclein gene) has been reported and may be a potential therapeutic target. In this study, we established an epigenetic regulation platform based on an exosomal CRISPR intervention system. With the assist of focused ultrasound (FUS) opening the blood-brain barrier, engineered exosomes carrying RVG (rabies viral glycoprotein) targeting peptide, sgRNA (single guide RNA), and dCas9-DNMT3A (named RVG-CRISPRi-Exo) were efficiently delivered into the brain lesions and indu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas are prokaryotic adaptive immunity defense systems that provide protection through RNA-guided recruited nucleases effectors.Despite the vast diversity in which CRISPR-Cas systems naturally exist, the single effectors from Class 2 were the most studied as genetic engineering tools. Later, the endogenous reprogramming of type I CRISPR-Cas systems showed promising results in diverse bacteria. However, the features and functions of the subtype I-F1 from Shewanella spp. members remain poorly characterized. Here, we report the analysis of the genetic context and activity of a type I-F1 CRI
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic mutations cause hereditary deafness, in which mutations in the POU4 transcription factor 3 gene (POU4F3) lead to autosomal dominant non-syndromic deafness 15 (DFNA15), for which no effective clinical treatment currently exists. Gene editing holds promise for precisely repairing mutated nucleotides, thus offering a potential cure for hereditary hearing loss. Here, we establish a Pou4f3WT/Q113* mutant mouse model mimicking DFNA15. We develop and screen adenine base editors (ABEs) targeting the Pou4f3Q113* allele by fusing diverse adenine deaminases to Cas9 we discovered before. SchABE8e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clinical translation of gene therapy has been challenging in part because of the limitations of current delivery approaches. Herein, we report an efficient nonviral genome editor delivery approach using extracellular vesicles (EVs) carrying single-guide RNA (sgRNA): CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein (RNP) complexes for in vivo gene therapy. By leveraging a high-throughput microfluidic droplet-based electroporation system (μDES), we achieved a 10-fold enhancement in loading efficiency and more than 1000-fold increase in processing throughput for loading RNP complexes into EVs compared with conv
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To construct a mouse model of Glanzmann's thrombasthenia (GT) with ITGA2B c.2659 C>T (p.Q887X) nonsense mutation by CRISPR/Cas9 technology, and then further explore the expression and function of glycoprotein αIIbβ3 on the surface of platelet membrane.
METHODS: The donor oligonucleotide and gRNA vector were designed and synthesized according to the ITGA2B gene sequence. The gRNA and Cas9 mRNA were injected into fertilized eggs with donor oligonucleotide and then sent back to the oviduct of surrogate mouse. Positive F0 mice were confirmed by PCR genotyping and sequence analysis afte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR/Cas9-based gene knockout in animal cells, particularly in teleosts, has proven to be very efficient with regards to mutation rates, but the precise insertion of exogenous DNA or gene knock-in via the homology-directed repair (HDR) pathway has seldom been achieved outside of the model organisms. Here, we succeeded in integrating with high efficiency an exogenous alligator cathelicidin gene into a targeted non-coding region of channel catfish (Ictalurus punctatus) chromosome 1 using two different donor templates (synthesized linear dsDNA and cloned plasmid DNA constructs). We also tested
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and CRISPR-associated (Cas) genes provide adaptive immunity against invasion of foreign nucleic acids in archaea and bacteria. The system functions in three distinct stages: adaptation, biogenesis, and interference. CRISPR-Cas systems are currently classified into at least five different types, each with a signature protein among which Type III systems exhibit a dual DNA/RNA interference activity. Structures of a few Type III surveillance complexes have been determined: they are composed of several different subunits and exhibi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Over 70 mutations in the transforming growth factor beta-induced (TGFBI) gene are associated with corneal dystrophies that impair vision. The R555W hotspot mutation is a major cause of granular corneal dystrophy type 1 (GCD1). Here, we evaluated the technical feasibility of CRISPR/Cas9-mediated editing of the R555W mutation in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) obtained from a patient with GCD1. Three single guide RNAs (sgRNA1-3) and matched single-stranded oligodeoxynucleotide donors (ssODN1-3) were designed and co-transfected into PBMCs. Transfected cells were enriched by flow cytome
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prime editing (PE) is a powerful method for introducing point mutations into the genomes of living organisms. PE utilizes a Cas9 nickase fused to an engineered Moloney Murine Leukemia Virus reverse transcriptase (MLV-RT), paired with an extended guide RNA known as pegRNA, which contains a primer binding site (PBS) and a reverse transcriptase template (RTT) complementary to the non-target strand DNA. Recently described inverse prime editing (iPE) also employs reverse transcriptase and pegRNAs; however, it utilizes an RNA template complementary to the target strand, resulting in the polymerizat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide screens are a powerful technique to dissect the complex network of genes regulating diverse cellular phenotypes. The recent adaptation of the CRISPR-Cas9 system for genome engineering has revolutionized functional genomic screening. Here, we present protocols used to introduce Cas9 into human lymphoma cell lines, produce high-titer lentivirus of a genome-wide sgRNA library, transduce and culture cells during the screen, select cells with a specified phenotype, isolate genomic DNA, and prepare a custom library for next-generation sequencing. These protocols were tailored for loss-of
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A missense mutation of collagen type VIII alpha 2 chain (COL8A2) gene leads to early-onset Fuchs' endothelial corneal dystrophy (FECD), which progressively impairs vision through the loss of corneal endothelial cells. We demonstrate that CRISPR/Cas9-based postnatal gene editing achieves structural and functional rescue in a mouse model of FECD. A single intraocular injection of an adenovirus encoding both the Cas9 gene and guide RNA (Ad-Cas9-Col8a2gRNA) efficiently knocked down mutant COL8A2 expression in corneal endothelial cells, prevented endothelial cell loss, and rescued corneal endotheli
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas9 has led to great advances in gene editing for a broad spectrum of applications. To further the utility of Cas9 there have been efforts to achieve temporal control over its nuclease activity. While different approaches have focused on regulation of CRISPR interference or editing in mammalian cells, none of the reported methods enable control of the nuclease activity in bacteria. Here, we develop RNA linkers to combine theophylline- and 3-methylxanthine (3MX)-binding aptamers with the sgRNA, enabling small molecule-dependent editing in Escherichia coli. These activatable guide RNAs e
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования