Malaria is caused by apicomplexan parasites of the genus Plasmodium, with all malaria symptoms and pathology caused by parasite stages that develop within, or transit between, host erythrocytes. The ability of Plasmodium cells to parasitise erythrocytes depends on distinctive intracellular compartments associated with invasion, as well as the development of unique cellular niches within the infected host cell. However, our understanding of the biology of the malaria parasite is limited by the fact that a large proportion of the parasite's proteome has no known cellular location or function. To
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxsackievirus A6 (CVA6) has emerged as a predominant global pathogen of hand, foot and mouth disease, yet its evolutionary and molecular characteristics remain poorly understood. This study integrated 10 year molecular surveillance data from central China (2013-2024) with global CVA6 sequences to analyse high-entropy codons in the VP1 capsid protein and their co-evolution patterns. Phylogenetic and Bayesian evolutionary analyses indicated that CVA6 strains in China primarily clustered into sub-genotype D3, with an estimated global VP1 substitution rate of 3.62×10⁻³ substitutions/site/year. Sh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue virus (DENV) transmission has risen across China in recent years, but genomic data from inland regions remain scarce. We screened 9 clinical samples collected in Ningxia in 2019 and 2023, obtaining 5 near-complete DENV-1 genomes, and performed phylogenetic reconstruction and molecular clock analyses using a global dataset of 452 DENV-1 sequences to infer spatiotemporal origins; epitope divergence relative to vaccine strains and human monoclonal antibodies was also assessed. The 2019 Ningxia strains clustered within DENV-1 genotype I, clade E, and were closely related to viruses from Heb
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus B (EVB) is the most prevalent species of human enteroviruses, responsible for a wide range of diseases, including hand, foot, and mouth disease, viral meningitis, myocarditis, and neonatal sepsis, imposing a significant disease burden primarily on children. Coxsackievirus B (CVB1-6) and various echovirus (E) serotypes are the major serotypes of EVB. Since no antiviral drug or vaccine is available, it is important to strengthen monitoring, risk assessment, and early warning of genomic variations for EVB. CVB1, CVB3, E6, and E30 were selected as representative EVB serotypes for this
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elucidating the evolution and epidemiology of Mycobacterium tuberculosis requires comprehensive characterization of its genomic diversity; however, short-read sequencing fails to resolve part of this variation. Here, we assembled 216 complete genomes from clinical isolates in the Valencia Region, Spain, using long-read sequencing. This dataset, mostly encompassing Lineage 4, provides a refined map of M. tuberculosis genetic diversity across evolutionary scales. Complete genomes uncover a median of 312 (-1 to 792) additional SNPs per pairwise comparison, revealing an estimated evolutionary rate
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The biosynthesis of polyprenyl/dolichyl phosphate, an essential lipid carrier in protein glycosylation, occurs across all domains of life. Eukaryotic heteromeric enzymes involved in polyprenyl chain elongation consist of a highly conserved catalytic cis-prenyltransferase subunit (CPT-CS) and a less conserved CPT-accessory subunit (CPT-AS). Here, we present the first experimental evidence that dolichol biosynthesis in Paramecium tetraurelia is mediated by a heteromeric CPT complex. Using a multidisciplinary experimental approach, we identified two highly homologous catalytic CPT subunits, CPT1a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA silencing is one of the major defence activities against viral pathogens in plants. Silencing signals are initiated by Dicer-like proteins (DCLs) to generate viral-derived small RNAs (sRNAs). Viral sRNAs are then loaded into Argonaute proteins to form an RNA-induced silencing complex to guide cleavage of target RNAs based on sequence homology. While the model regarding RNA silencing-mediated defence against viral pathogens is largely established based on extensive studies using the model plant Arabidopsis thaliana, there are diverse sets of silencing components in other plants, especially
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2, the virus responsible for COVID-19, has undergone significant genetic evolution since its emergence in 2019. This study examines the genomic diversity of SARS-CoV-2 in Brazil after the worst phase of the pandemic, the wider adoption of routine vaccination, and the abolishment of other non-pharmacological preventive measures from July 2022 to July 2024 using 55,951 sequences retrieved from the GISAID database. The analysis focuses on the correlation between confirmed COVID-19 cases, sequencing efforts across Brazilian states, and the distribution and evolution of viral lineages. Our
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Horseshoe bats are natural hosts of zoonotic viruses, yet the genetic basis of their antiviral immunity is poorly understood. Here we generated two new chromosomal-level genome assemblies for horseshoe bat species (Rhinolophus) and three close relatives, and show that, during their diversification, horseshoe bats underwent extensive chromosomal rearrangements and gene expansions linked to segmental duplications. These expansions have generated new adaptive variations in type I interferons and the interferon-stimulated gene ANXA2R, which potentially enhance antiviral states, as suggested by our
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reassortment among influenza A viruses (IAV) facilitates evolution and has been associated with interspecies transmission and pandemics. We introduce a novel tool called TreeSort that accurately identifies recent and ancestral reassortment events on datasets with thousands of IAV whole genomes. TreeSort uses the phylogeny of a selected IAV segment as a reference and finds the branches on the phylogeny where reassortment has occurred with high probability. The tool reports the particular gene segments that were involved in reassortment and how different they are from prior gene pairings. Using
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid evolution of SARS-CoV-2 during the pandemic was characterized by the fixation of a plethora of mutations, many of which enable the virus to evade host resistance, likely altering the virus' genome compositional structure (i.e., the arrangement of compositional domains of varying lengths and nucleotide frequencies within the genome). To explore this hypothesis, we summarize the evolutionary effects of these mutations by computing the Sequence Compositional Complexity (SCC) in random stratified datasets of fully sequenced genomes. Phylogenetic ridge regression of SCC against time revea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enzyme-directed evolution provides an environment-friendly method to optimize biocatalysis during the preparation of cardiac drugs. The study showed enzyme functionality and selectivity characteristics, such as cytochrome P450 monooxygenases and ketoreductases, transaminases, and hydrolases. The screening process revealed various variants of an enzyme that showed 7-fold elevated k_cat catalytic turnover capabilities, and k_cat/K_m proficiency was boosted to 12-fold. CYP450 (cytochrome P450) -F87A showed 97 % substrate conversion, and the enzyme KRED-M181T reached 99 % enantioselectivity. Enzym
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Saccharomyces cerevisiae is a widely used yeast for industrial production of ethanol. However, elevated ethanol, temperature, and osmotic stress adversely affect fermentation efficiency. In this study, adaptive laboratory evolution for S. cerevisiae CEN.PK 113-7D on higher concentrations of ethanol was performed. After 144 days, the maximum specific growth rate (µmax) increased from 0.0240 to 0.1150 h-1 for the strain evolved on 9% v/v ethanol, and from 0.0002 to 0.0530 h-1 for the strain evolved on 11% v/v ethanol, and the specific glucose uptake rate increased by 30%. The strain evolved on 1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rubisco is the main gateway through which inorganic carbon enters the biosphere, catalyzing the vast majority of carbon fixation on Earth. This pivotal enzyme has long been observed to be kinetically constrained. Yet, this impression is based on kinetic measurements heavily focused on eukaryotic rubiscos, a rather conserved group of low genetic diversity. Moreover, the fastest rubiscos that we know of so far were found among the sparsely sampled prokaryotes. Could there be yet faster rubiscos among the uncharted regions of rubisco's phylogenetic diversity? Here, we perform a characterization o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomes of giant viruses (phylum Nucleocytoviricota) have increasingly been found integrated into the genomes of diverse eukaryotes. Here, we report eight giant endogenous viral elements (GEVEs) in the genome of the microalgae Euglena gracilis. The GEVEs in E. gracilis bear signatures of genomic erosion, including invasion of transposable elements and duplications, suggesting that they are incapable of reactivation and virion production. Most of the GEVEs exhibit high average amino acid identity and cluster near each other in phylogenies of viral marker genes, suggesting that they are derived
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycosylated macrolactones (macrolides) often display broad and potent biological activities and are targets for drug development and discovery. The modular genetic organization of macrolide polyketide synthases (PKSs) and various polyketide tailoring enzymes has inspired the combinatorial biosynthesis of new-to-nature macrolides. However, most engineered PKS and macrolide biosynthetic pathways are ineffective and produce reduced or negligible product titers. Directed evolution could improve the activity of engineered PKSs and associated pathways but critically requires a high-throughput scree
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chemokine receptor variant CCR5delta32 is linked to HIV-1 resistance and other conditions. Its evolutionary history and allele frequency (10%-16%) in European populations have been extensively debated. We provide a detailed perspective of the evolutionary history of the deletion through time and space. We discovered that the CCR5delta32 allele arose on a pre-existing haplotype consisting of 84 variants. Using this information, we developed a haplotype-aware probabilistic model to screen 934 low-coverage ancient genomes and traced the origin of the CCR5delta32 deletion to at least 6,700 yea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The continuous evolution of SARS-CoV-2 has led to the emergence of several variants representing significant challenges for public health. Many studies highlight the relevance of phylogenetic inference or mutational pattern analysis to understand the evolutionary relatedness of viral variants and to estimate the potential effect of new mutations on viral transmission, virulence and antigenicity. Here we describe an evolutionary investigation approach combined with mutational analyses of SARS-CoV-2 Spike gene to annotate and potentially track important amino acid site variation of specific func
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Many viruses can cause persistent infection and/or viral shedding in immunocompromised hosts. This is a well-described occurrence not only with SARS-CoV-2 but for many other viruses as well. Understanding how viruses evolve and mutate in these patients and the global impact of this phenomenon is critical as the immunocompromised population expands.
CONTENT: In this review, we provide an overview of populations at risk for prolonged viral shedding, clinical manifestations of persistent viral infection, and methods of assessing viral evolution. We then review the literature on viral
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rabies, a neglected tropical zoonotic disease caused by the rabies virus (RABV), results in fatal encephalitis in both humans and animals. India, a high-burden country, accounts for nearly 30% of global rabies-related deaths. Robust surveillance combined with large-scale genomic sequencing of RABV is essential to monitor viral spread, evolution, and diversity, critical for developing targeted interventions. However, the lack of comprehensive whole genome data on Indian RABV isolates hampers detailed molecular epidemiological analysis. In this study, 630 RABV-positive samples from diverse hosts
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования