Colorectal cancer (CRC) is a prevalent malignant tumour, with its incidence and mortality rates consistently ranking among the highest and exhibiting an upward trend. Extensive screening and early diagnosis are crucial for managing CRC progression and improving patient prognosis. This study aims to construct a novel analytical framework for integrating the sequencing data from tumour tissue and peripheral blood. By integrating and analysing the multi-omics data and clinical data from tumour tissues and peripheral blood, we confirmed that the LTB4R gene is significantly upregulated not only in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 2 diabetes mellitus (T2DM), a chronic hyperglycemic disorder, adversely affects multiple organs, including the kidneys, retina, and cardiovascular system. Despite significant advancements, the understanding of early screening, diagnosis, prognosis, biomarkers, and the molecular pathways involved in T2DM and its complications remains limited. Metabolomics has emerged as a powerful tool for exploring complex metabolic networks, allowing rapid investigation of disease-specific metabolic processes and offering deeper insights into pathophysiological mechanisms. This review evaluates the appli
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Intrinsic capacity (IC) decline is inherently correlated with aging, yet distinguishing specific IC-related biomarkers from general physiological aging markers remains a significant challenge. We aimed to identify multi-omics signatures associated with IC decline after adjustment for relevant covariates and to explore the functional pathways potentially involved in IC decline.
METHODS: We analyzed 110 fecal (metagenomics) and 121 serum (untargeted metabolomics) samples from older adults at Beijing Hospital. Multivariable models were applied adjusting for age, sex, Charlson Comorbi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As a consequence of global industrial growth, microplastics (plastic fragments < 5 mm) have become ubiquitous environmental contaminants, prompting serious questions about their impact on human health. Beyond the established risks of ingestion, the inhalation of these airborne particles is now a primary focus, especially regarding potential effects on the neurological system. Emerging evidence from laboratory and animal models shows that inhaled microplastics can penetrate the brain. Once there, they can trigger a cascade of harmful effects, including neuroinflammation, oxidative stress, and d
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the advent of high-throughput techniques, multi-omics data and various clinical outcomes have been collected for a range of diseases. Multi-omics data play a crucial role in uncovering complex biological processes, yet simultaneous representation learning of such high-dimensional, heterogeneous multi-modality data along with clinical outcomes remains limited. To address this gap, we propose a supervised knowledge-guided Bayesian factor model for integrative analysis of multi-omics and clinical outcome data. The proposed method simultaneously extracts an informative low-dimensional represe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the influence of different grain fermentation substrates on the flavor development of sour meat. The results indicated that the fermentation substrate in the coix seed group, characterized by its high starch, protein, and fat content, created favorable conditions for the proliferation of Lactiplantibacillus. This promoted the accumulation of flavor compounds, including alcohols, aldehydes, and medium-chain fatty acids, which imparted distinctive grassy and fatty flavors to the product. Additionally, this substrate enhanced the product's sour profile while significantly
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative illness marked by cognitive impairment, synaptic dysfunction and neuronal death. Tau protein abnormalities and mitochondrial dysfunction are key features of its pathogenesis, and both are involved in driving disease development. Emerging evidence suggests that pathogenic tau not only destabilizes microtubules but also directly compromises mitochondrial dynamics, bioenergetics and quality control, ultimately aggravating neurodegeneration. However, the molecular processes by which tau disease causes mitochondrial failure are poorly know
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the context of increasing freshwater scarcity and the effects of climate change on aquatic environments, developing salt-tolerant fish strains has become a critical strategy for sustainable aquaculture. The limited availability of suitable species for saline-water aquaculture poses a significant challenge, severely impacting the development of the fishery economy. This study investigated the effects of 24 h exposure to freshwater, and seawater at salinities of 4, 9 ppt and 12 ppt, on juvenile grass carp (Ctenopharyngodon idella). Following these exposures, liver tissues were collected to as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic dysfunction-associated fatty liver disease (MASLD) is a highly prevalent liver condition with a complex etiology increasingly linked to air pollution. However, the molecular mechanisms through which air pollutants exacerbate MASLD remain poorly understood. In this study, we integrated computational toxicology, multi-omics analyses, and machine learning to identify critical molecular targets of hepatotoxicity-related air pollutants (HTRAPs). This integrated approach identified ozone (O3) and carbon monoxide (CO) as HTRAPs based on their hepatotoxic potential. Using integrative machine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid expansion of omics technologies has created new opportunities to understand inter-individual variations in metabolic responses to diet. Such advances are particularly relevant for Asian populations, which exhibit distinct metabolic characteristics, including increased visceral adiposity, reduced β-cell reserves, and heightened susceptibility to type 2 diabetes at lower BMI levels, compared to Western populations. This review synthesizes the current evidence on metabolomic and genomic biomarkers associated with metabolic health in Asians and outlines the mechanistic pathways through w
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Comparative studies of vertebrate appendages offer a powerful framework for uncovering shared components of an ancestral regeneration toolkit. Here, we employed a multi-omics comparative approach leveraging the regenerative capacity of the axolotl, zebrafish, and Polypterus senegalus, a fish capable of full fin regeneration. We identified conserved markers of proximal and distal blastema territories, shared activation of DNA damage repair, hif1a-mediated hypoxia response, and sequential activation of pro- and anti-inflammatory program. Apical epithelial ridge markers were expressed in both the
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a progressive neurodegenerative disorder with significant variability associated with substantial loss of dopaminergic neurons in the substantia nigra. Currently, there are limited opportunities for intervention. There is a lack of reliable biomarkers to identify patients with PD, which poses a challenge for clinicians. In this review, recent advances in PD biomarker research, including genomic, epigenomic, proteomic, and non-coding RNA, will be highlighted, with particular emphasis on integrating omics for precision medicine. In addition, the current understanding
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intensive aquaculture has significantly boosted aquatic product yields, but it often compromises sensory quality and remains constrained by reliance on unsustainable fishmeal. The Mulberry-dyke and Fish-pond system, used in China for millennia, suggests a circular approach, yet the underlying mechanism remains poorly understood. In this study, silkworm excrement (SE) from traditional sericulture (TSE) and modern insect factories (ISE) was evaluated as a functional aquafeed. Body weight, gut histology, and immunohistochemistry were employed to assess host health. Gut microbiome, electronic tong
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Total glucosides of paeony (TGP), primarily composed of monoterpene glycosides such as paeoniflorin and albiflorin, possess diverse pharmacological activities, including anti-inflammatory and neuroprotective effects. Traditional extraction from plants is limited by long growth cycles and low active content. This study employs an integrated metabolomics and transcriptomics strategy to systematically elucidate the molecular regulatory network underlying the biosynthesis of terpenoids by the Paeonia lactiflora leaf endophytic fungus Alternaria alstroemeriae PPL7 within a root co-fermentation syst
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Institutional research teams and core facilities routinely manage pre-publication omics datasets that span heterogeneous file types, nested project structures, and multiple downstream uses. Public repositories mainly support post-publication dissemination, while workflow systems and enterprise data platforms do not directly provide a lightweight governance and delivery layer for internal research assets.
RESULTS: We present MetaServe, an open-source governance and delivery layer for pre-publication research assets in institutional multi-omics settings. MetaServe registers and deli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transfusion medicine has practiced a form of precision medicine for decades through compatibility testing, infectious disease screening, component manufacturing, traceability, and hemovigilance. Yet blood is still often treated primarily as a commodity-collected, processed, stored, and transfused-rather than as a dynamic biological product rich in molecular information. This Perspective argues that the field is uniquely positioned to extend its long-standing precision framework into a more molecular, longitudinal, and predictive era. Omics approaches, especially genomics and repeated metabolom
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Algal blooms frequently trigger CO2 limitation, under which diatoms not only survive but dominate. However, the cellular metabolic adaptations underlying this ecological phenomenon remain poorly understood. This study systematically investigated the coordinated carbon-nitrogen metabolic response of the typical diatom Skeletonema costatum (S. costatum) to CO2 limitation (300 ppm, 100 ppm) via stable isotope and multi-omics analysis. CO2 limitation triggered the carbon concentrating mechanism (CCM) and attenuated nitrogen isotope fractionation, redirecting carbon flux towards amino acid biosynth
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Potentially toxic elements (PTEs) are persistent contaminants of terrestrial and aquatic ecosystems and heavy metals and metalloids represent a major environmental and health concern. Microbial bioremediation exploits the ability of bacteria, fungi, and microbial communities to modulate PTE fate through processes including biosorption, bioaccumulation, redox transformation, biomineralization, precipitation, chelation, and extracellular sequestration. This review examines the major advances of the last decade in the application of genomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics and thei
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolomics, the study of small molecules in biological systems, is a powerful tool for understanding biochemical pathways, discovering biomarkers, and elucidating disease mechanisms. This chapter provides a guide to performing metabolomics data analysis in R, focusing on enrichment analysis and network-based approaches. It covers essential steps in data processing, quality control (QC), differential expression analysis, integration with proteomics using multi-omics factor analysis (MOFA), and statistical network analysis, as well as enrichment analysis using prior knowledge. The methods outl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Postoperative nausea and vomiting (PONV) are still significant issues in the perioperative care that impact patient recovery and satisfaction, but the underlying molecular pathways that lead to personal predisposition are not comprehensively understood. In order to fill this gap we performed a multi-omics study incorporating bulk RNA sequencing, single cell transcriptomics, circRNA profiling, and alternative splicing evaluation and genotype expression colocalization analyses to detail regulatory networks of PONV. Analysis of differential expression showed inflammatory pathways and neurotransmi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.