We describe two unrelated patients with mental retardation and normal karyotypes found to have relatively large homozygous deletions (>150 kb) of different regions detected by array comparative genomic hybridization (aCGH). Patient 1 showed a 157-214 kb deletion at 8q24.2, containing BAC clone RP11-17M8. This patient was born to phenotypically normal parents and has microcephaly, distinctive craniofacial features, brachymetacarpia, brachymetatarsia and severe mental retardation. This BAC clone is listed as a copy number variant on the Database of Genomic Variants (http://projects.tcag.ca/varia…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite aggressive salvage regimens, approximately half of all children who suffer a Wilms' tumour recurrence will die of their disease. Although there are increasing data on molecular genetic prognostic factors present in the tumour at diagnosis, there is little information regarding the molecular events that occur with Wilms' tumour progression and relapse. In the present study, microarray-based comparative genomic hybridization (aCGH) analysis has been carried out on 58 Wilms' tumour samples, which included 38 untreated primary and 20 recurrent tumours. A higher degree of copy number change…
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long-term exposure to inorganic arsenic from drinking water has been documented to induce cancers and vascular diseases in a dose-response r … n arsenic-induced and non-arsenic-induced TCCs. The frequency of chromosomal imbalances analyzed by comparative genomic hybridization and the frequency of loss of heterozygosity were significantly higher in arsenic-induced TCC than non-arsenic-induced TCC at specific sites. Biomarkers of susceptibility to arsenic-induced health hazards included genetic polymorphisms of enzymes inv …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The etiology of Hodgkin lymphoma (HL) is poorly understood, and studies of the genetics of this disease have been hampered by the scarcity of the Hodgkin and Reed-Sternberg (HRS) cells within tumors. To determine whether recurrent genomic imbalances are a feature of HL, CD30-positive HRS cells were laser-microdissected from 20 classical Hodgkin lymphomas (cHLs) and four HL-derived cells lines and subjected to analyses by comparative genomic hybridization. In primary tumors, the most frequently involved chromosomal gains were 17q (70%), 2p (40%), 12q (40%), 17p (40%), 22q (35%), 9p (30%), 14q (…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
15q24.1 microdeletion syndrome is a recently described condition often resulting from non-allelic homologous recombination (NAHR). Typical clinical features include pre and post-natal growth retardation, facial dysmorphism, developmental delay and intellectual disability. Nonspecific urogenital, skeletal, and digit abnormalities may be present, although other congenital malformations are less frequent. Consequently, only one case was reported prenatally, complicating the genotype-phenotype correlation and the genetic counseling. We identified prenatally a second case, presenting with cerebral
Клинический случайСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Onychomatricoma (OM), an uncommon benign fibroepithelial neoplasm of the nail unit, is sometimes diagnostically challenging for clinic … (n = 5). The epithelial component of the tumours expressed immunopositivity for LEF-1. Using array comparative genomic hybridization (aCGH), we demonstrated that all OM, including its variants that were tested (n = 8), harboured a few copy number alterations with losses of whole or part of chromosome 13 including the RB1 gene (n = 8) and chromosome 16 (n = 6).
CONCLUSION: We rep …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An obligate anaerobic, Gram-negative, rod-shaped and non-spore-forming bacterium, designated as strain GYB001T, was isolated from the blood of a patient with a sigmoid colon perforation. Taxonomic characterization of the novel isolate was performed using a polyphasic approach. A phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene and whole genome sequences revealed that GYB001T represented a member of the genus Parabacteroides, in the family Tannerellaceae. The closest species, based on 16S rRNA sequence, was Parabacteroides gordonii DSM 23371T with 97.4 % similarity. Average nucleotide identity and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We present the first case of prenatally diagnosed isochromosome 4p with whole 4q arm translocating to chromosome 9p23 and review the literature.
CASE REPORT: A 26-year-old woman underwent amniocentesis at 25 weeks of gestation because of an abnormal ultrasound examination. Routine chromosome analysis on cultured amniocytes showed a karyotype of 46,XX, ?idic(4)(q11),der(9)t(4;9)(q11;p23). Single nucleotide polymorphism (SNP) array analysis on uncultured amniocytes detected two copy number variations (CNVs): arr [GRCh37] 4p16.3p11(68345-49089361) × 3; arr [GRCh37] 9p24.3p23(208454-10
Клинический случайСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary spastic paraplegias (HSP) are heterogeneous disorders, with more than 70 causative genes. Variants in SPAST are the most frequent genetic etiology and are responsible for spastic paraplegia type 4 (SPG4). Age at onset can vary, even between patients from the same family, and incomplete penetrance is described. Somatic mosaicism is extremely rare with only three patients reported in the literature. We report here SPAST mosaic variants in four unrelated patients. We confirm that mosaicism in SPAST is a very rare event with only four identified cases on more than 300 patients with a SP
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We present prenatal diagnosis of familial 2p15 microduplication associated with pulmonary artery stenosis, single umbilical arter … t foot postaxial polydactyly. Repeat amniocentesis was performed at 22 weeks of gestation and array comparative genomic hybridization (aCGH) analysis on the DNAs extracted from amniocytes revealed the result of arr 2p15 (61, 495, 220-62,885,679) × 3.0 [GRCh37 (hg19)] with a 1.391-Mb 2p15 duplication encompassing seven Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) genes of USP34, XPO1 …
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variants in Zinc Finger DHHC-Type Containing 9 (ZDHHC9) gene have been identified as the cause of X-linked intellectual disability (XLID) in a small number of families. There are a total of 11 reported pathogenic variants in ZDHHC9 in the literature. The majority of reported variants are familial point mutations. There is one report of XLID associated with a de novo mutation in ZDHHC9, and one family with intragenic deletion within ZDHHC9 detected by array CGH. Although initial reports of families with ZDHHC9 pathogenic variants suggested a nonsyndromic XLID, more recent reports sug
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosome copy number variants (CNVs; gains and losses of DNA sequences >1 kb) are wide-spread throughout the genome of healthy individuals. Laboratory studies show that a subset of CNVs are pathogenic, and not only can be responsible for the pathogenesis of major birth defects and cancer, but are also associated with neurodevelopmental disorders at birth. The characteristics of the pathogenic microdeletions and microduplications are important for both clinical implications and genetic counselling regarding test selection for prenatal screening and diagnosis. Unfortunately, our knowledge of t
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
By testing the susceptibility to DNA damaging agents of several Candida albicans mutant strains derived from the commonly used laboratory st … osity in this region in CAF2-1 or CAF4-2 resulted in MMS sensitivity. We identified 11 genes by SNP/comparative genomic hybridization containing only the a alleles in all the MMS-sensitive strains. Four candidate genes, SNF5, POL1, orf19.5854.1, and MBP1, were analyzed by generating hemizygous configurations in CAF2-1 and CAF4-2 for each allele of all four genes. Only hemizygous M …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In humans, narcolepsy is a sleep disorder that is characterized by sleepiness, cataplexy and rapid eye movement (REM) sleep abnormalities. Essential hypersomnia (EHS) is another type of sleep disorder that is characterized by excessive daytime sleepiness without cataplexy. A human leukocyte antigen (HLA) class II allele, HLA-DQB1*06:02, is a major genetic factor for narcolepsy. Almost all narcoleptic patients are carriers of this HLA allele, while 30-50% of EHS patients and 12% of all healthy individuals in Japan carry this allele. The pathogenesis of narcolepsy and EHS is thought to be partia
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent evidence suggests that lobular carcinoma in situ (LCIS) can be a clonal precursor of invasive breast cancers of both the ductal and lobular phenotypes. We sought to confirm these findings with an extensive study of fresh frozen breast specimens from women undergoing mastectomy.
METHODS: Patients with a history of LCIS presenting for therapeutic mastectomy were identified prospectively. Frozen tissue blocks were collected, screened for lesions of interest, and subjected to microdissection and DNA extraction. Copy number profiling, whole-exome sequencing, or both were perform
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deletions or intragenic mutations involving the MEF2C gene on chromosome 5q14.3 have generally been associated with a relatively uniform phenotype characterized by severe developmental delay, absent speech, stereotypies, absent or limited gait abilities, lack of a typical facial gestalt and scarcity of major malformations. We report on a patient of Cypriot descent with a de novo, approximately 147 kb in size, partial MEF2C deletion removing exons 1 to 3. He had a history of severe intellectual disability with absent speech, poor eye contact, hand stereotypies and a wide-based gait. A broad-bas
Клинический случайСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report on the natural history of a female with dominant omodysplasia, a rare osteochondrodysplasia with short stature, rhizomelia of the extremities (upper extremities more affected), and short first metacarpals. The proband had normal molecular analysis of the glypican 6 gene (GPC6), which was recently reported as a candidate for autosomal recessive omodysplasia. The findings in this patient were compared to other known and suspected cases of autosomal dominant omodysplasia. Mild rhizomelic shortening of the lower extremities has not been previously reported.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter summarizes the current knowledge on gene copy number changes found in lung tumors, and their application in the diagnosis, prognostication, and prediction of response to chemotherapy. Examples of the identification of specific "driver" oncogenes within amplified DNA segments are described. A model of how array-CGH could be integrated clinically into the routine workup of lung cancers in clinical laboratory is proposed.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pure distal monosomy of the long arm of chromosome 10 is a rare cytogenetic abnormality. The location and size of the deletions described in this region are variable. Nevertheless, the patients share characteristic facial appearance, variable cognitive impairment and neurobehavioral manifestations. A Minimal Critical Region corresponding to a 600 kb Smallest Region of deletion Overlap (SRO) has been proposed. In this report, we describe four patients with a distal 10q26 deletion, who displayed attention-deficit/hyperactivity disorders (ADHD). One of them had a marked behavioral profile and rel
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Usher Syndrome is the leading cause of inherited deaf-blindness. It is divided into three subtypes, of which the most common is Usher type 2, and the USH2A gene accounts for 75-80% of cases. Despite recent sequencing strategies, in our cohort a significant proportion of individuals with Usher type 2 have just one heterozygous disease-causing mutation in USH2A, or no convincing disease-causing mutations across nine Usher genes. The purpose of this study was to improve the molecular diagnosis in these families by screening USH2A for duplications, heterozygous deletions and a common p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования