Haematoxylin and eosin (H&E) remain the foundation of tissue diagnosis, yet many clinical questions, tumour-immune architecture, spatial heterogeneity, and predictors of therapy response, require molecular context that routine slides cannot provide. Spatial omics closes this gap by mapping RNA and proteins in situ while preserving morphology, and recent platforms are increasingly compatible with formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue, paving the way for its future potential use in routine pathology and retrospective cohorts. However, significant challenges related to cost, complexity,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphomannomutase deficiency (PMM2-CDG), the most common congenital disorder of glycosylation (CDG), is characterized by multisystem involvement and a lack of disease-modifying therapies. While previous transcriptomic studies have uncovered disrupted cellular pathways, the functional consequences of these alterations remain poorly understood. To further investigate PMM2-CDG pathophysiology, we integrated proteomic and metabolomic profiling of patient-derived fibroblasts with previously published transcriptomic data. Proteomic analysis was performed using Tandem Mass Tag-based mass spectrometr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A detailed analysis of how muscle fiber nuclei (myonuclei) respond to a hypertrophic stimulus could provide a critical step toward understanding compromised skeletal muscle plasticity with age. We used recombination-independent doxycycline-inducible myonucleus-specific fluorescent labelling, tissue RNA-sequencing, myonuclear DNA methylation analysis, multi-omic integration, and single myonucleus RNA-sequencing (smnRNA-seq) to define the molecular characteristics of adult (6-8 month) and aged (24 month) murine skeletal muscle after acute mechanical overload (MOV). In adult and aged MOV muscles,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periodontal diseases are polymicrobial infections driven by complex interactions between anaerobic pathogens and host immune responses within the periodontal pocket. Accurate detection and characterization of these pathogens are critical for early diagnosis, disease risk assessment, and effective therapeutic intervention. This review aims to critically evaluate conventional anaerobic culture and advanced molecular diagnostic techniques for the detection and characterization of periodontal pathogens, highlighting their respective advantages, limitations, and clinical relevance. A comprehensive
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endometriosis (EM) is a chronic inflammatory gynaecological disorder affecting approximately 10% of women of reproductive age. Early diagnosis remains challenging because definitive diagnosis still relies on invasive surgical confirmation. This study aimed to characterize systemic immune-metabolic alterations in EM and identify candidate peripheral blood biomarkers through integrated multi-omics profiling.
METHODS: Peripheral blood samples were collected from 88 participants, including 44 patients with EM T, 22 patients with benign ovarian cysts, and 22 healthy controls. Inflammat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic Kidney Disease of Unknown Etiology (CKDu) is an ongoing global health concern, particularly affecting agricultural communities in equatorial regions. Unlike traditional chronic kidney disease (CKD), CKDu occurs without common risk factors such as diabetes, hypertension, or kidney stones. Its etiology remains poorly understood, with environmental exposures, occupational hazards, and genetic susceptibility proposed as contributing factors. Omic technologies including genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, and exposomics offer promising avenues to elucidate CKDu pathogenesis
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multi-omics research is reshaping precision nephrology by linking genetic susceptibility, epigenetic regulation, transcriptional state, protein abundance, metabolic activity and spatial tissue context within integrated analytical frameworks.
METHODS: We critically reviewed recent technological advances and applications of multi-omics in kidney diseases, with particular attention to biomarker discovery and clinical translation, and discussed the challenges and future directions of multi-omics integration and its application in precision medicine.
RESULTS: Emerging approaches, incl
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rheumatoid arthritis (RA) is a highly heterogeneous chronic systemic inflammatory disease. Approximately 30-40% of patients exhibit an inadequate response to currently available biologic agents and Janus kinase inhibitors. In recent years, rapid advances in multi-omics technologies, including genomics, temporal transcriptomics, proteomics, metabolomics, microbiomics, epigenetics, and cytomics, have provided new opportunities to elucidate the molecular mechanisms of RA and advance precision medicine. Nevertheless, translating multi-omics integration into clinical practice remains challenging. K
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aging is a major risk factor for cardiovascular disease, yet the mechanisms driving age-related cardiac decline remain incompletely defined. Although traditional omics approaches have identified global signatures of inflammation and metabolic shifts, bulk analyses often mask cell-type-specific heterogeneity. Recent single-cell multi-omics innovations address this gap by enabling simultaneous profiling of gene expression and chromatin accessibility. These high-resolution analyses reveal that fibroblasts and macrophages exhibit particularly pronounced age-associated remodeling, marked by heighte
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute myocardial infarction (AMI) is a leading cause of death worldwide, characterised by systemic inflammation and metabolic disorders. Tetrahydropalmatine (THP) and berberine (BBR) are major alkaloids derived from Corydalis yanhusuo and Coptis chinensis, respectively, both of which have been shown to be cardioprotective; however, whether their mechanisms differ remains unclear. In this study, we systematically compared THP and BBR in treating AMI using integrated spatial metabolomics (AFADESI-MSI), untargeted metabolomics, lipidomics, and molecular biology. The results showed that both compo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tumor microenvironment (TME) is a structurally and functionally heterogeneous ecosystem in which extracellular matrix (ECM) remodeling, vascular-lymphatic dysfunction, hypoxia, acidosis, and spatially organized immunosuppressive networks jointly constrain nanoparticle accessibility, intratumoral distribution, and therapeutic efficacy. Conventional nanomedicine strategies based on passive accumulation, ligand-mediated targeting, and stimulus-responsive release have produced important advances, but they remain limited by empirical design principles that often overlook interpatient and intrat
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: A central goal in human gut microbiome research is to identify disease-associated functional shifts, an objective increasingly pursued through metagenomic and metabolomic assays. However, common differential abundance analyses of genes or metabolites often yield long and difficult-to-interpret feature lists. Aggregating features into predefined pathways can improve interpretability but relies on fixed pathway boundaries that may not reflect context-specific functional changes. Moreover, even when paired metagenomic-metabolomic data are available, they are often analyzed separately
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aflatoxin B1 (AFB1) is a pervasive feed contaminant that poses a silent threat to male reproductive health under chronic low‑dose exposure. In this study, a male quail model was established with graded doses of AFB1 (25, 50, and 75 μg/kg). Integrated database prediction, multi‑omics profiling, and molecular docking revealed that AFB1 potentially targets AKT1, BCL2, TP53, and BID, disrupts testicular sphingolipid and steroid metabolism, and triggers the intrinsic mitochondrial apoptotic pathway. In vivo experiments confirmed that AFB1 exposure reduced body weight, sperm viability, and serum rep
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathway enrichment analysis is essential for extracting biological insights from complex omics datasets, yet existing methods suffer from critical limitations: excessive false discoveries, arbitrary significance thresholds, poor handling of multi-omics data, and inability to model gene dependencies. We present JOANA (Joint continuous multi-Omics enrichment ANAlysis), a novel Bayesian framework for pathway analysis with three key contributions. First, JOANA enables high specificity through continuous probabilistic modeling of significance scores using Beta mixture distributions, eliminating arb
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aging-related molecular reprogramming profoundly influences melanoma progression and therapeutic sensitivity, yet underlying mechanisms remain poorly understood. We constructed a comprehensive multi-omics atlas integrating mutations, transcription, methylation, and copy number variations, utilizing the MOFA algorithm to uncover key age-driving factors. Among 20 factors, Factor6 exhibited significant negative age correlation and survival protection (HR = 0.95, P = 4.494e-05), defined as "RevitalAge Marker (RAM)". Integration of three single-cell RNA sequencing datasets revealed 4,796 RAM+ cells
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The rapid advancement of multi-omics strategies has profoundly facilitated the in-depth exploration of microbial physiological characteristics, accelerated the discovery of novel bioactive secondary metabolites, and promoted the mechanistic elucidation of their biological functions. As a dominant genus within the phylum Actinomycetota, Streptomyces is widely recognized for its remarkable capacity to synthesize a diverse spectrum of clinically applicable antibiotics. Candida haemulonii, an emerging opportunistic fungal pathogen, has emerged as a typical multidrug-resistant species
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Testis development and male fertility depend on androgens, yet the mechanisms underlying their regulation of adult human testicular function remain poorly defined due to ethical and technical constraints. To address this, we leverage androgen-deprived adult human testes as a spontaneous model and construct a comprehensive multi-omics atlas integrating single-nucleus RNA sequencing, single-cell ATAC-seq, and spatial transcriptomics. Our analyses highlight androgen-regulated transcription factors critical for Sertoli cell function and identify Neuregulin 2 (NRG2) as an androgen-dependent niche f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sjögren's syndrome (SS) is a systemic autoimmune disorder driven by interactions among genetic susceptibility, environmental factors, and alterations in mucosal microbial ecosystems. Emerging evidence from studies of the gut, oral cavity, and ocular surface indicates that microbial dysbiosis is closely associated with SS. Patients frequently exhibit reduced beneficial commensals and expansion of potentially pathogenic taxa, accompanied by epithelial barrier disruption, imbalance of T helper 17 and regulatory T cells, abnormal B-cell responses, and sustained activation of type I interferon sign
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although cellular senescence contributes to tissue dysfunction in inflammatory bowel disease (IBD), the heterogeneity of senescence at the single-cell resolution remains poorly defined. In this study, we systematically characterized the senescence landscape within the IBD microenvironment, with particular emphasis on fibroblast subpopulations and their systemic consequences. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) dataset was applied to profile senescence-associated feature heterogeneity. Fibroblasts were classified into high-senescence (HS-Fibro) and low-senescence (LS-Fibro) groups according
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dry Eye Disease (DED) is increasingly recognized as a complicated, multi-factorial disease involving oxidative damage, metabolic dysregulation and immune dysregulation on the ocular surface. New data emerging from proteomics, lipidomics, metabolomics and cytokine analysis suggest that the tear film is a multi-omic window into these pathological processes. The capacity to combine these layers of omics through machine learning and data from innovative biosensors enables us to transition away from subjective methods of symptom assessment to objective, precision diagnostics. This review provides a
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования