There is an urgent need to improve the diagnostic capacity of cutaneous leishmaniasis (CL) in rural health centers to improve the management of the disease in patients from remote regions where the infection is endemic. Microscopy of Giemsa-stained lesion smears is the standard-of-care diagnostic test in virtually all health centers, but its sensitivity is suboptimal (50-70%) and prone to false negative results. We evaluated the performance of a low-cost DNA extraction buffer (LAB) using a portable miniPCR™ equipment coupled with an inexpensive fluorescence viewer to detect Leishmania DNA with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurate differentiation between Pneumocystis jirovecii (Pj) infection and colonization is crucial for effective treatment.
METHODS: From September 2016 to June 2022, 89 immunocompromised patients with unexplained lung infiltrates and clinical suspicion of Pj pneumonia were enrolled at Peking University People's Hospital. Bronchoalveolar lavage fluid (BALF) of these patients were detected by quantitative PCR (qPCR) and droplet digital PCR (ddPCR).
RESULTS: The performance of ddPCR was superior to qPCR in detecting Pj infection. Area under the curve was 0.97 (95 %CI: 0.94-1) for d
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trichinellosis is caused by Trichinella spiralis, a meat-borne zoonotic disease transmitted to humans through the consumption of infected undercooked or raw meat. Surveillance using safe and precise diagnostic tools to diagnose T. spiralis in sheep is needed to assess the incidence and probability of transmission from sheep to humans. In this study, we developed a real-time PCR assay to detect T. spiralis DNA in ovine muscle samples that can be used as an alternative surveillance tool to ensure food safety using newly designed primers. The assay is specific for the Scfld4 gene of Trichinella (
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to assess the ability of a real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) with multiple targets to detect SARS-CoV-2 and its variants in a single test. Nasopharyngeal specimens were collected from patients in Granada, Spain, between January 2021 and December 2022. Five allele-specific RT-PCR kits were used sequentially, with each kit designed to detect a predominant variant at the time. When the Alpha variant was dominant, the kit included the HV69/70 deletion, E and N genes. When Delta replaced Alpha, the kit incorporated the L452R mutation in addition to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine cytomegalovirus (PCMV), a porcine roseolovirus (PRV) that is closely related to human herpesviruses 6 and 7, is commonly found in co … spectively, were found to be PCMV/PRV positive, while 36% and 60%, respectively, tested positive by real-time polymerase chain reaction (PCR). These data indicate that the virus is common in German and Italian wild boars and that the Western blot assay detected a PCMV/PRV infection more often than did real-time PCR. The data also indicate that pigs raised for xenotransplantation sho …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytomegalovirus infection can cause increased mortality and morbidity in renal transplant recipient. The purpose of the present study was to observe the clinical profiles and outcomes of Cytomegalovirus positive renal transplant patients in early post-transplant period. This prospective cohort study was conducted in the Department of Nephrology at Bangabandhu Sheikh Mujib Medical University (BSMMU), Dhaka, Bangladesh from September 2016 to August 2017. Adult patients who had undergone renal transplantation were selected as study population. CMV serology (CMV IgM and CMV IgG) of both donor and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia-related bacteria of the Chlamydiales order have recently been described as emerging pathogens that cause pneumonia and abortion in animals and humans. We investigated the presence of Chlamydiales using real-time polymerase chain reaction (PCR) by targeting the 16S rRNA gene of a broad range of Chlamydiales in 827 fecal samples from pet birds kept in individual homes in Japan. Of the 827 samples, 493 (59.6%) tested positive for the Chlamydiales 16S rRNA gene in the real-time PCR assay. We determined the nucleic acid sequences of PCR products from 17 Chlamydiales strains. A homology se…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Livedoid vasculopathy (LV) manifests as ulcers and atrophic white scars on the lower extremities. The main known etiopathogenesis is hypercoagulability with thrombus formation, followed by inflammation. Thrombophilia, collagen and myeloproliferative diseases may induce LV, but the idiopathic (primary) form predominates. Bartonella spp. may cause intra-endothelial infection and skin manifestations caused by these bacteria may be diverse, including leukocytoclastic vasculitis and ulcers.
OBJECTIVE: The aim of this study was to investigate the presence of bacteremia by Bartonella spp
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RT-qPCR dissects transcription-based processes but requires reference genes (RGs) for data normalization. This study prospected RGs for mouse macrophages (pMØ) and spleen infected with Listeria monocytogenes. The pMØ were infected in vitro with L. monocytogenes or vehicle for 4 h. Mice were injected with L. monocytogenes (or vehicle) and euthanized 24 h post-injection. The RGs came from a multispecies primer set, from the literature or designed here. The RG ranking relied on GeNorm, NormFinder, BestKeeper, Delta-CT and RefFinder. B2m-H3f3a-Ppia were the most stable RGs for pMØ, albeit RG index
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Amoebic liver abscess (ALA) is commonly seen in tropical countries and diagnosis of ALA relies mainly on non-specific serological and imaging techniques as well as PCR from pus.
OBJECTIVE: This study evaluated the potential of using cell free DNA (cfDNA) from serum and urine for diagnosing ALA.
METHODS: We prospectively evaluated quantitative PCR (qPCR) for detection of cf DNA in serum and urine sample in all liver abscess patients. The samples were collected from patients reporting to emergency ward of Postgraduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, India w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: In this study, we focused on five microRNAs (miRNAs) that have been reported to regulate phosphatase and tensin homolog deleted on chromosome 10 (PTEN) gene expression, namely miR-182, miR-183, miR-200a, miR-200b, and miR-205, and examined their relationships with PTEN protein expression in endometrial cancer tissues.
METHODS: By utilizing paraffin-embedded blocks of normal endometrium (NE) and endometrial carcinoma (EC) tissue (40 cases each), we measured the expression of miRNAs by real-time PCR. Conversely, we examined PTEN protein expression by immunohistochemistry and computer
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymerase chain reaction (PCR) is indispensable for diagnosing coronavirus disease 2019 (COVID-19) in autopsy cases. In this study, we performed comprehensive reverse transcription quantitative PCR (RT-qPCR) and rapid antigen tests for COVID-19 on forensic postmortem specimens, regardless of the antemortem symptoms and causes of death. Immediately before forensic external examination and autopsy, a wiping solution was collected from the nasopharynx with a dry swab, and rapid antigen testing and RT-qPCR were performed. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) was detected b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A more rapid and less complicated test to diagnose pertussis is required in clinical settings. We need to detect Bordetella pertussis, which … nducted in 11 medical institutions, involving 195 cases with suspected pertussis. Compared with the real-time polymerase chain reaction (rPCR), the sensitivity and specificity of the ICkit were 86.4% (19/22) and 97.1% (168/173), respectively. The ICkit detected the antigen in both children and adults. Furthermore, the ICkit detected the antigen until the 25th day from the onset of c …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pneumococcal carriage has often been studied from a serotype perspective; however, little is known about the strain-specific carriage and inter-strain interactions. Here, we examined the strain-level carriage and co-colonization dynamics of Streptococcus pneumoniae in a Swiss birth cohort by PacBio single-molecule real-time (SMRT) sequencing of the plyNCR marker.
METHODS: A total of 872 nasal swab (NS) samples were included from 47 healthy infants during the first year of life. Pneumococcal carriage was determined based on the quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR…
СтатьяVideo-Audio MediaПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular diagnostic approaches are increasingly included in the diagnostic workup and even in the primary diagnosis of malaria in non-endemic settings, where it is difficult to maintain skillful microscopic malaria detection due to the rarity of the disease. Pathogen-specific nucleic acid amplification, however, bears the risk of overlooking other pathogens associated with febrile illness in returnees from the tropics. Here, we assessed the discriminatory potential of metagenomic sequencing for the identification of different Plasmodium species with various parasitemia in EDTA blood of malari
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Current recommendations for diagnosis of Dirofilaria immitis infection in dogs rely on the detection of antigen produced largely by adult females coupled with the visualization of microfilariae (mf) in the circulation via a microfilaria detection test (MFDT). It is hypothesized that qPCR assays used in parallel with antigen detection tests will perform better in detecting mf than modified Knott's test (MK), when combined with antigen detection. This study compares probe-based qPCR and MK techniques for mf detection used in parallel with the DiroCHEK® antigen test to screen for hear
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: American cutaneous leishmaniasis is a commonly neglected, vector-borne tropical parasitic disease that is a major public health … equines, and caprines) for the detection of L. braziliensis using molecular tests (conventional and real-time polymerase chain reaction [PCR and qPCR]). For immunological detection, blood samples from 115 dogs were assessed using enzyme-linked immunosorbent assay.
RESULTS: Real-time quantitative PCR showed positive results for blood and conjunctival samples in all investigated spec …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bartonella quintana is a re-emerging louse-borne pathogen. Horizontal transmission from the body louse vector (Pediculus humanus humanus) to a human host occurs through contact with infectious louse feces containing a high concentration of the bacteria. However, questions have remained about whether vertical transmission from infected vectors to their progeny, which could significantly influence the dynamics of transmission to humans, occurs in body lice. To address this subject, we performed a series of controlled laboratory experiments that examined the presence of B. quintana on the surface
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The globally concerning outbreak of monkeypox virus (MPXV) in non-endemic countries in 2022 warranted an increased capacity of diagnostic clinical testing. In this study, we detail the Johns Hopkins analytical validation of a qualitative orthopoxvirus real-time PCR and characterize its analytical performance for MPXV testing. We also describe our first month of MPXV clinical laboratory diagnosis, including assay utilization and positivity.
METHODS: The analytical performance of a previously characterized orthopoxvirus assay that targets the DNA polymerase gene of non-variola ortho
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In spring of 2022, an outbreak of monkeypox (mpox) spread worldwide. Here, we describe performance characteristics of monkeypox virus (MPXV)-specific and pan-orthopoxvirus qPCR assays for clinical use.
METHODS: We validated probe-based qPCR assays targeting MPXV-specific loci F3L and G2R (genes MPXVgp052/OPG065 and MPXVgp002 and gp190/OPG002, respectively) and a pan-orthopoxvirus assay targeting the E9L locus (MPXVgp057/OPG071). Clinical samples and synthetic controls were extracted using the Roche MP96 or Promega Maxwell 48 instrument. qPCR was performed on the AB7500 thermocycle
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования