Vanillin (4-hydroxy-3-methoxybenzaldehyde) is an economically important flavor compound that can be made in bacterial cell factories, but toxicity is a major problem for cells producing this aromatic aldehyde. Using (i) a global proteomic analysis supported by multiple physiological experiments, mutant analyses, and inferred transcription factor modeling and (ii) adaptive laboratory evolution (ALE) of vanillin tolerance combined with genome-wide analysis of the underlying mutations, mechanisms of vanillin toxicity in Escherichia coli have been elucidated. We identified 147 proteins that exhibi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus epidermidis is a leading cause of nosocomial infections, majorly resistant to beta-lactam antibiotics, and may transfer several mobile genetic elements among the members of its own species, as well as to Staphylococcus aureus; however, a genetic exchange from S. aureus to S. epidermidis remains controversial. We recently identified two pathogenic clinical strains of S. epidermidis that produce a staphylococcal enterotoxin C3-like (SEC) similar to that by S. aureus pathogenicity islands. This study aimed to determine the genetic environment of the SEC-coding sequence and to ident
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resistance of human pathogens like Leishmania to drugs is a growing concern where the multidrug-resistant phenotype renders chemotherapy ineffective. The acquired resistance of Leishmania to antimony has promoted intense research on the mechanisms involved but the question has not been resolved yet. In this study we have explored host-pathogen- drug interactions leading to identification of pharmacological determinants of host macrophages that resist the sodium antimony gluconate (SAG) mediated intracellular parasite killing. mRNA profiling of mammalian host stage amastigotes of sodium antimon
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disclaimer: These ACMG Standards and Guidelines are developed primarily as an educational resource for clinical laboratory geneticists to help them provide quality clinical laboratory genetic services. Adherence to these Standards and Guidelines is voluntary and does not necessarily assure a successful medical outcome. These Standards and Guidelines should not be considered inclusive of all proper procedures and tests or exclusive of other procedures and tests that are reasonably directed to obtaining the same results. In determining the propriety of any specific procedure or test, the clinica
СтатьяКлинические рекомендацииПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-Hodgkin lymphomas include a biologically and clinically heterogeneous group of cancers distinguished by genetics, histology, and treatment outcomes. New discoveries regarding the genomic alterations and epidemiological exposures associated with these lymphomas have enhanced our understanding of factors that contribute to lymphomagenesis for specific subtypes. We explore the impact of normal B-cell biology engineered for recognizing a wide variety of antigens on the development of specific lymphoma subtypes, review lymphoma genetics, and examine the epidemiology of B-cell NHLs including rec
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of medical genetics. Part B, Neuropsychiatric genetics : the official publication of the International Society of Psychiatric Genetics2016eng
Gamma-amino butyric acid (GABA) and glutamate are the major inhibitory and excitatory neurotransmitters in the mammalian central nervous system, respectively, and have been associated with suicidal behavior and major depressive disorder (MDD). We examined the relationship between genotype, brain transcriptome, and MDD/suicide for 24 genes involved in GABAergic and glutamatergic signaling. In part 1 of the study, 119 candidate SNPs in 24 genes (4 transporters, 4 enzymes, and 16 receptors) were tested for associations with MDD and suicidal behavior in 276 live participants (86 nonfatal suicide a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ankylosing spondylitis (AS) is a highly heritable disease for which there is a great unmet need for improved therapies. Genetics research has identified several major pathways involved in the disease, from which treatments have either now entered clinical practice or are in development. In particular, therapies targeting the IL-23 pathway were repositioned for use in AS following the discovery of multiple genes in the pathway as determinants of AS risk. Discovery of the association of aminopeptidase genes with AS, and subsequently with psoriasis, inflammatory bowel disease and other conditions
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mucoid (MTB313) and nonmucoid (MTB314) strains of group A streptococcus emm type 1 were simultaneously isolated from a single patient suffering from streptococcal meningitis. Whole-genome sequencing revealed that MTB313 carried a nucleotide substitution within rocA, which generated an amber termination codon.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genome sequence analysis of a clinical Vibrio cholerae VC35 strain from an outbreak case in Malaysia indicates multiple genes involved in host adaptation and a novel Na(+)-driven multidrug efflux pump-coding gene in the genome of Vibrio cholerae with the highest similarity to VMA_001754 of Vibrio mimicus VMA223.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The inaugural issue of Circulation: Cardiovascular Genetics arrives at a remarkable time in the history of genetic research and cardiovascul … enetic technologies has transformed in a few short years the conduct of cardiovascular genetics and genomics research from a primary focus on mendelian disorders to a current emphasis on genome-wide association studies (GWAS; Figure1). In this review, we describe the rationale for the current emphasis on large-scale genomic studies, summarize the evolving …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) is a poorly understood and uniformly fatal malignancy of antibody-secreting plasma cells. Although several key molecular events in disease initiation or progression have been confirmed (eg, 14q32 translocations) or implicated (eg, chromosome 13 deletion), a unifying mechanism of myelomagenesis has eluded investigators. Furthermore, although MM is generally indistinguishable morphologically, it exhibits a tremendous degree of variability clinically with some patients surviving only months and others many years, suggesting that MM is composed of distinct clinical entities.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prevalence of different H. pylori genotypes in various geographical regions indicates region-specific adaptations during the course of e … es, including their phylogenetic status. We believe that these genome sequences and the comparative genomics emanating thereupon will help us to clearly understand the ancestry and biology of the Indian H. pylori genotypes, and this will be helpful in solving the so-called Indian enigma, by which high infection rates do not corroborate the minuscule number …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The sleepy cod (Oxyeleotris lineolata Steindachner 1867) is a valuable freshwater teleost with male-biased growth dimorphism, making sex control breeding vital for aquaculture. We generated a high-quality chromosome-level genome assembly (⁓985.07 Mb) using PacBio HiFi and Hi-C sequencing, with 99.31% sequences anchored to 23 chromosomes (contig N50: 14.73 Mb; scaffold N50: 42.32 Mb). BUSCO assessment showed 98.1% completeness, with 25,933 protein-coding genes and 42.21% repetitive elements annotated. Phylogenetic analysis indicated closest affinity to Gobiidae (Boleophthalmus pectinirostris, P
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
How genomic changes translate into organismal novelties is often confounded by the multi-layered nature of genome architecture and the long evolutionary timescales over which molecular changes can accumulate. Coleoid cephalopods (squid, cuttlefish, and octopus) provide a unique system to study these processes due to a large-scale chromosomal rearrangement in the coleoid ancestor that gave rise to highly modified karyotypes, followed by lineage-specific repeat expansions, fusions, and translocations. How these events have shaped gene regulatory patterns underlying the evolution of coleoid innov
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SUMMARYThe concept of the pangenome has emerged as the approach of choice for targeted comparative genomics across groups of organisms, from strain or population levels within a species to broader taxonomic or phenotypic categories. Pangenome analyses employ diverse procedures that inevitably introduce reproducibility challenges. Nevertheless, they have already yielded important insights into the structure, function, and evolution of archaeal, bacterial, and eukaryotic genomes across space, time, biogeography, and phylogeny. There is a wide range of applications from vaccine design to syntheti…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To characterize the genomic features of the extracellular polysaccharide-overproducing strain Schizophyllum commune SC-N, genome assembly and functional annotation were performed using a hybrid sequencing strategy combining Nanopore long reads and Illumina short reads, followed by comparative genomic analyses with S. commune H4-8 and representative basidiomycetes. The SC-N genome was 45.62 Mb in size, with a GC content of 55.45% and a contig N50 of 3.71 Mb. A total of 13,832 protein-coding genes were predicted, and the BUSCO completeness score reached 95.12%. In independent fermentation experi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Gymnosperm mitochondrial genomes exhibit substantial variation in size and structure, yet the evolutionary dynamics of Cycadales remain insufficiently explored beyond the genus Cycas.
METHODS: We assembled the complete mitochondrial genome of Zamia integrifolia using Oxford Nanopore long-read and MGI short-read sequencing. Genome assembly, polishing, and annotation were performed through an integrated bioinformatics pipeline. Repetitive elements and mitochondrial plastid DNA transfers (MTPTs) were characterized. Whole-genome synteny and structural rearrangements were analyzed. P
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Familial hypercholesterolaemia (FH) is an inherited disease of high LDL cholesterol (LDL-C) caused by defects in LDLR, APOB, APOE, and PCSK9 genes. A pathogenic variant cannot be found in ∼60% of clinical FH patients. Using whole genome sequencing (WGS), we examined genetic determinants of FH.
METHODS AND RESULTS: Whole genome sequencing data generated by the 100 000 Genomes Project (100KGP) included 536 FH patients diagnosed using the FH Simon-Broome criteria. Rare variants in known FH genes were analysed. Genome-wide association study between 443 FH variant-negative unrelated FH cases
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Klebsiella pneumoniae has emerged as a major opportunistic pathogen, with rising antimicrobial resistance representing a critical public health concern. This study investigated the genomic characteristics, transmission dynamics, and evolutionary relationships of CRKP isolates from Gansu Province, China, to inform regional prevention strategies.
METHODS: Thirty CRKP isolates collected from two tertiary hospitals (2023-2025) were tested for susceptibility to 15 antibiotics and subjected to whole-genome sequencing. Genome assembly and annotation employed standard pipelines, followe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A growing body of work has highlighted advantages of long-read genome sequencing (LR-GS) over short-read genome sequencing (SR-GS) with regards to the detection and interpretation of pathogenic variants. However, the incremental diagnostic yield of LR-GS over SR-GS for patients with suspected Mendelian conditions has not been systematically characterized.
METHODS: We performed LR-GS on 144 cases that previously had undergone SR-GS through the Pediatric Mendelian Genomics Research Center at the University of California, Irvine (PMGRC-UCI, a founding center of the GREGoR Consortium)…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.