PURPOSE: The purpose of this study was to assess the variation in methods and to determine whether an External Quality Assessment Scheme (EQAS) for polymerase chain reaction (PCR) detection of Acanthamoeba keratitis is valuable for the diagnostic process.
METHODS: A multicenter EQAS was introduced, covering 16 diagnostic laboratories. Using Acanthamoeba castellanii ATCC strain 30010, 3 sets of samples were prepared, containing different amounts of DNA, cysts, or trophozoites. Samples were masked and sent to the participants with instructions for use and a questionnaire concerning the applied …
Многоцентровое исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Invasive aspergillosis (IA) by a triazole-resistant Aspergillus fumigatus is associated with high mortality. Real-time resistance detection will result in earlier initiation of appropriate therapy.
METHODS: In a prospective study, we evaluated the clinical value of the AsperGenius polymerase chain reaction (PCR) assay in hematology patients from 12 centers. This PCR assay detects the most frequent cyp51A mutations in A. fumigatus conferring azole resistance. Patients were included when a computed tomography scan showed a pulmonary infiltrate and bronchoalveolar fluid (BALf) sampli…
Многоцентровое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Cytomegalovirus (CMV) colitis is associated with negative outcomes in inflammatory bowel disease (IBD) and immunosuppres … There were similar proportions of positive CMV histology (IBD 5.9% and non-IBD 7.4%) and tissue CMV polymerase chain reaction (PCR) in the two groups (IBD 5.6% and non-IBD 5.0%), but within each group, results were discordant. Positive CMV histology was significantly associated with need for colectomy in the IBD group, while positive tissue CMV PCR was not. Positive CMV hi …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymerase chain reaction (PCR) is indispensable for diagnosing coronavirus disease 2019 (COVID-19) in autopsy cases. In this study, we performed comprehensive reverse transcription quantitative PCR (RT-qPCR) and rapid antigen tests for COVID-19 on forensic postmortem specimens, regardless of the antemortem symptoms and causes of death. Immediately before forensic external examination and autopsy, a wiping solution was collected from the nasopharynx with a dry swab, and rapid antigen testing and RT-qPCR were performed. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) was detected b…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cutaneous leishmaniasis (CL) is an important public health problem, most frequently seen in Şanlıurfa in Turkey. It is important to determine the species in regions where infection occurs with different Leishmania species, as in our province. In this study, it was aimed to genotype 136 samples with suspected Leishmania from Şanlıurfa using the Sybr Green-based ITS-1 real time polymerase chain reaction (Rt-PCR) method and then to compare them with ITS-1 PCR RFLP and direct microscopy methods. Wound fluid samples from patient lesions suspected of leishmaniasis were mounted on a slide, fixed, and…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The aim of this study was to determine the DNA and genotypes of Echinococcus granulosus in liver cyst hydatids isolated in humans.
MATERIAL AND METHODS: This study was conducted prospectively at the Department of General Surgery of the Cerrahpaşa School of Medicine, University of İstanbul-Cerrahpaşa, between January 2015 and June 2016 in 30 patients who were operated on for cystic Echinococcosis. E. granulosus DNA was analyzed using the Polymerase Chain Reaction (PCR) method in the cyst samples (protoscolex and/or germinative membrane) obtained during the operation, and genotype w…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pulmonary infections due to Aspergillus, Mucorales, and Nocardia have high morbidity and mortality, in part due to diagnostic challenges. Commercially available molecular assays on bronchoalveolar lavage fluid (BALF) may have increased sensitivity over currently available diagnostic options. Our aim was to characterize the diagnostic performance of assays for each of these pathogens in our patient population.
METHODS: The medical records of patients whose BALF was tested by polymerase chain reaction (PCR) for Aspergillus, Mucorales, and Nocardia between 2019 and 2021 were reviewed…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A probe-hybridization quantitative polymerase chain reaction assay specific for Cryptosporidium serpentis (qPCR) has been developed and shown to be extremely sensitive in the laboratory, but clinical sensitivity and specificity for this test are lacking. To approximate the sensitivity and specificity of the C. serpentis qPCR, the medical records from a captive snake colony were reviewed, and between November 2015 and June 2021, 63 eastern indigo snakes (Drymarchon couperi) were necropsied. Of these 63 snakes, 11 had qPCR performed on gastric biopsies collected at the time of necropsy, 8 had qP…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The pandemic of a novel coronavirus disease 2019 (COVID-19) caused by a severe acute respiratory coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in … ril and May 2021. We compared the results of the SmartAmp assay and real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (rRT-PCR) using a saliva sample from individuals suspected as having COVID-19.
RESULTS: Out of 70 samples tested, the SmartAmp assay had 50 (71%) positive and 20 (29%) negative results. Using rRT-PCR as a reference, the diagnostic accuracy displaye …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Periodontitis is a chronic destructive inflammatory disease of the oral cavity. The main causative agent is presence of biofilm formed due to different micro-organisms. Among different micro- organisms "red complex" bacteria is known to be the main causative agent in progression of periodontitis. Porphyromonas gingivalis out of the red the complex organism plays a major role in progression of periodontitis. P. gingivalisis present in both in healthy and diseased individuals. The difference in the strains will determine the virulence factor of the organism and also progression of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transplant recipients are at risk of pulmonary nocardiosis, a life-threatening opportunistic infection caused by Nocardia species. Given the limitations of conventional diagnostic techniques (i.e., microscopy and culture), a polymerase chain reaction (PCR)-based assay was developed to detect Nocardia spp. on clinical samples. While this test is increasingly being used by transplant physicians, its performance characteristics are not well documented. We evaluated the performance characteristics of this test on bronchoalveolar lavage (BAL) fluid samples from lung transplant recipient…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human adenovirus (HAdV) is increasingly recognized as a major cause of human respiratory tract viral infections. Its outbreaks and epidemics in various populations resulted in considerable morbidity and mortality. Therefore, a rapid and specific assay for HAdV in clinical samples is of crucial importance to diagnosing HAdV infections. The present study aimed to develop and evaluate a multiplex quantitative polymerase chain reaction (qPCR) assay for the rapid detection and accurate quantification of HAdV B, C and E. The lower limit of detection for this assay was two genomic copies per reaction…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Mannheimia haemolytica is a Gram-negative, non-motile, and non-spore-forming rod-shaped coccobacillus bacterium. On bloo … M. haemolytica from the lung tissues of sheep slaughtered in Shiraz abattoir through culturing and polymerase chain reaction (PCR) methods.
MATERIALS AND METHODS: In this study, a total of 2500 sheep's lungs were evaluated for finding pneumonic effects. Then, 161 infected pneumonic samples of lung tissues were investigated by culture and PCR methods.
RESULTS: After cult …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Tuberculoma and neurocysticercosis (NCC) often show similar clinical and neuroimaging features. Differential diagnosis of these 2 diseases is imperative, as tuberculoma is an active infection that requires immediate anti-tubercular therapy (ATT). CASE REPORT We present the case of a 17-year-old Indian girl with fever, severe headache, and right 6th cranial nerve palsy. Brain magnetic resonance imaging (MRI) showed multiple tiny ring-enhancing lesions in bilateral cerebral parenchyma with mild perilesional edema, which were initially thought to be NCC, but subsequently were diagnosed
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The US Centers for Disease Control and Prevention recommends the initial use of rapid antigen influenza diagnostic test (RIDT) for the detection of influenza A (H1N1-09). Nasopharyngeal samples were tested from 246 patients for H1N1-09 using target-enriched multiplex polymerase chain reaction (TEM-PCR), of which 163 were additionally tested via RIDT. RIDTs had a sensitivity of 18.7% compared with TEM-PCR as the reference standard. Patients with false-negative RIDTs were withheld from 111 days of oseltamivir and 65 days of isolation. Patients negative for H1N1 via TEM-PCR had antiviral therapy …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fusion transcripts detection is essential for subtyping and diagnosis of acute lymphoblastic leukemia (ALL). This enables institution of appropriate therapy and provides a parameter to monitor disease progression and response to therapy. This study endeared to detect and analyze various balanced translocations known in ALL by using a novel polymerase chain reaction (PCR) method. A pilot study was done in which 16 consecutive cases of ALL were analyzed and followed-up for a period of 1 year. Diagnosis of ALL was established after subjecting blood/bone marrow aspirate samples to morphological ex…
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background. Meningitis is a serious communicable disease with high morbidity and mortality rates. It is an endemic disease in Egypt caused m … ulture-negative CSF samples from suspected cases of bacterial meningitis were examined by real-time polymerase chain reaction (real-time PCR) for the presence of lytA, bexA, and ctrA genes specific for Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, and Neisseria meningitidis, respectively. Results. Positive real-time PCR results for Streptococcus pneumoniae were detecte …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Female genital schistosomiasis (FGS) is a tissue reaction to lodged ova of Schistosoma haematobium in the genital mucosa. Lesion … mous cell atypia (SCA) is also explored and discussed. Cytology results are compared to Schistosoma polymerase chain reaction (PCR) in vaginal lavage and urine and in urine microscopy.
MATERIALS AND METHODS: In a clinical study, 394 women aged between 16 and 23 years from rural high schools in KwaZulu-Natal, South Africa, underwent structured interviews and the following …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования