Identification of driver mutations in human diseases is often limited by cohort size and availability of appropriate statistical models. We propose a framework for the systematic discovery of genetic alterations that are causal determinants of disease, by prioritizing genes upstream of functional disease drivers, within regulatory networks inferred de novo from experimental data. We tested this framework by identifying the genetic determinants of the mesenchymal subtype of glioblastoma. Our analysis uncovered KLHL9 deletions as upstream activators of two previously established master regulator
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genetic variation in the β-2 adrenergic receptor gene (ADRB2) has been implicated in asthma severity and control with conflicting results. Epigenetic variation in the ADRB2 may play an important role in asthma phenotype.
OBJECTIVE: We aimed to evaluate whether DNA methylation of ADRB2 is associated with asthma phenotypes in inner-city school-aged children.
METHODS: Multiple CpG sites in the promoter region of ADRB2 gene were analysed in 177 children enrolled in the School Inner-City Asthma Study. Blood- or saliva-derived DNA was measured by bisulphite-polymerase chain reaction py
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spontaneously hypertensive rat (SHR) lines differ in their susceptibility to hypertensive end-organ disease and may provide an informative model of genetic risk of disease. Lines derived from the original SHR-B and SHR-C clades are highly resistant to hypertensive end-organ disease, whereas lines derived from the SHR-A clade were selected for stroke susceptibility and experience hypertensive renal disease.
METHOD: Here we characterize the temporal development of progressive renal injury in SHR-A3 animals consuming 0.3% sodium in the diet and drinking water. SHR-A3 rats demonstrate
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rat strains differ dramatically in their susceptibility to mammary carcinogenesis. On the assumption that susceptibility genes are conserved across mammalian species and hence inform human carcinogenesis, numerous investigators have used genetic linkage studies in rats to identify genes responsible for differential susceptibility to carcinogenesis. Using a genetic backcross between the resistant Copenhagen (Cop) and susceptible Fischer 344 (F344) strains, we mapped a novel mammary carcinoma susceptibility (Mcs30) locus to the centromeric region on chromosome 12 (LOD score of ∼8.6 at the D12Rat
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vitiligo has been found to be associated with different HLA antigens in different ethnic groups. In our previous genome-wide association study (GWAS), we identified independent association signal of rs9468925 (P = 2.21 × 10(-33), OR = 0.74) within HLA-C-HLA-B region.
OBJECTIVES: To explore the association between rs9468925 polymorphism within MHC and the clinical features of generalized vitiligo.
METHODS: The study, using 5566 cases and 6462 controls from previous GWA study investigated the single and combined (GA + GG) genotypic distribution of rs9468925 in subsets of vitiligo p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IgA deficiency (IgAD) and common variable immunodeficiency (CVID) often co-occur in families, associating with chronic inflammatory diseases such as celiac disease (CD). ICOS (inducible co-stimulator) and CTLA4 (cytotoxic T-lymphocyte-associated protein-4) may be important in both disorders, as ICOS is necessary for Ig class-switching and CTLA4 negatively regulates T-cell activation. Linkage and association of CD with CTLA4-ICOS is well documented, we thus aimed to further pinpoint CD susceptibility by haplotype-tagging analysis. We genotyped 663 CD families from Finland and Hungary, 575 addit
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kit ligand (KITLG) is the ligand for the type III receptor tyrosine kinase KIT. Studies of the KIT/KITLG pathway in a number of mammalian species have shown that it is important for the development of stem cell populations in haematopoietic tissues, germ cells in reproductive organs and the embryonic migrating melanoblasts that give rise to melanocytes. Consequently, mutations in the pathway may result in a range of defects including anaemia, sterility and de-pigmentation. The cDNA sequence of the porcine KITLG gene has been reported previously, and is an attractive candidate locus for moderat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Evidence of the linkage of chromosome 2p to bone mineral density (BMD) has previously been reported in multiple populations. However, the identification of the BMD quantitative trait loci (QTL) gene at chromosome 2p remains a challenge. We performed a gene-wide and tag single nucleotide polymorphism (SNP)-based association study of four positional and functional candidate genes (CALM2, CYP1B1, QPCT, and POMC) in a sample of 1,243 cases and matched controls. Thirteen HapMap tag SNPs were selected and genotyped by using the high-throughput Sequenom genotyping platform. Binary logistic regression…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Obsessive-compulsive disorder (OCD) and hoarding disorder often co-occur but differ in onset, course, symptoms, and treatment response. This study compared diagnosis-based OCD genetic liability with hoarding-symptom liability, rather than direct expression differences between diagnosed patient groups.
METHODS: Large-scale OCD and hoarding genome-wide association study (GWAS) summary statistics were integrated with brain expression quantitative trait loci (eQTL) reference panels using a transcriptome-wide association approach. Gene-set enrichment was assessed across s…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human organoids recapitulate the cell type diversity and function of their primary organs holding tremendous potentials for basic and translational research. Advances in single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) technology and genome-wide association study (GWAS) have accelerated the biological and therapeutic interpretation of trait-relevant cell types or states. Here, we constructed a computational framework to integrate atlas-level organoid scRNA-seq data, GWAS summary statistics, expression quantitative trait loci, and gene-drug interaction data for distinguishing critical cell populations an…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND PURPOSE: The aim of this study was to identify quantitative trait loci (QTL) for carotid intima-media thickness (CIMT) a risk factor for stroke and cardiovascular disease.
METHODS: Probands were selected from Caribbean Hispanic subjects of the population-based Northern Manhattan Study. CIMT was measured by high-resolution B-mode ultrasound and expressed as the mean (IMTx) and mean of the maximum (IMTm). Variance components methodology was used to detect linkage using SOLAR and calculate locus-specific heritability. Ordered-subset Analysis was done based on history of hypertensi…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Methamphetamine (METH) is a central nervous psychostimulant and one of the most frequently used illicit drugs. Numerous genetic … were examined by single marker- and haplotype-based methods using PLINK. The effects of expression quantitative trait loci (eQTLs) on targeted gene expressions were investigated using the Genotype-Tissue Expression (GTEx) database.
RESULTS: The SNP rs14251 was identified as a significant association signal (χ2 = 9.84, P = 0.0017). An increased risk of METH dependence w …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoarthritis (OA) affects more than 500 million people worldwide, yet disease-modifying therapies remain unavailable. Genome-wide associat … cal mechanisms and precision medicine. We discuss how integrating GWAS with fine-mapping, molecular quantitative trait loci (QTLs), chromatin interaction maps, single-cell and spatial omics, proteomics and metabolomics links non-coding signals to effector genes, regulatory programs and disease-relevant cell states. These genes converge on biological modules involving dev …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
European archives of oto-rhino-laryngology : official journal of the European Federation of Oto-Rhino-Laryngological Societies (EUFOS) : affiliated with the German Society for Oto-Rhino-Laryngology - Head and Neck Surgery2026eng
PURPOSE: This study aimed to systematically identify and annotate oropharyngeal cancer (OPC) genetic risk, construct OPC risk prediction mod … analysis identified 160 nominate OPC-associated candidate druggable genes using expression/protein quantitative trait loci as instrumental variables. Drugs targeting these genes, such as Daunorubicin, Gefitinib, and Ibrutinib had been approved as anti-cancer agents.
CONCLUSION: These results advanced our understanding of the genetic architecture of OPC and provided ins …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome evolution in eukaryotes is predominantly driven by the dynamics of repetitive sequences, which vary widely in both copy number and sequence composition. Rates of repeat evolution differ between and within species and are likely modulated by both genetics and environment. To uncover factors shaping the rate of genome content evolution, we analyzed 1043 resequenced Arabidopsis thaliana genomes using a novel K-mer-based approach to characterize genome content variation and identify hypervariable regions underlying differences in repeat abundance. We next treated repeat abundance as a quant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Childhood adversity (CA) is a major risk factor for diverse psychiatric and physical disorders and is thought to interact with genetic variation to influence disease vulnerability via gene-environment interplay (G×E). DNA methylation (DNAm) may mediate these effects, particularly within the immune system, which is implicated in the long-term health consequences of CA. We mapped the epigenetic embedding of CA in immune cells by testing for contextual methylation quantitative trait loci (contmeQTLs) in peripheral blood using data from 3,471 adolescents and adults across six cohorts, followed by …
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early-onset conduct problems (CP) are a key predictor of adult criminality and poor mental health. While previous studies suggest that both … ntified sites correlated with prenatal exposures, and none were linked to known genetic methylation quantitative trait loci. Findings contribute to a better understanding of epigenetic patterns associated with early-onset CP.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Collagen-induced arthritis (CIA) is a useful model for dissecting the genetic patterns underlying susceptibility to rheumatoid arthritis (RA) and related chronic/inflammatory autoimmune diseases. CIA exhibits three phenotypes characteristic of autoimmune disease pathogenesis: abnormal levels of immune reactivity to self antigens; chronic inflammation of target organs expressing that specific autoantigen; activation and direct participation of invading mononuclear cells and resident tissue fibroblasts in organ damage. Over 25 different quantitative trait loci (QTL) regulating arthritis severity…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bloodstream malaria parasites require Ca++ for their development, but the sites and mechanisms of Ca++ utilization are not well understood. We hypothesized that there may be differences in Ca++ uptake or utilization by genetically distinct lines of P. falciparum. These differences, if identified, may provide insights into molecular mechanisms.
RESULTS: Dose response studies with the Ca++ chelator EGTA (ethylene glycol-bis(β-aminoethyl ether)-N,N,N',N'-tetraacetic acid) revealed stable differences in Ca++ requirement for six geographically divergent parasite lines used in previous
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Depriving one eye of visual experience during a sensitive period of development results in a shift in ocular dominance (OD) in the primary visual cortex (V1). To assess the heritability of this form of cortical plasticity and identify the responsible gene loci, we studied the influence of monocular deprivation on OD in a large number of recombinant inbred mouse strains derived from mixed C57BL/6J and DBA/2J backgrounds (BXD). The strength of imaged intrinsic signal responses in V1 to visual stimuli was strongly heritable as were various elements of OD plasticity. This has important implication
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования