Scientific knowledge is intrinsically linked to available technologies and methods. This article will present two methods that allowed for the identification and verification of a drug resistance gene in the Apicomplexan parasite Toxoplasma gondii, the method of Quantitative Trait Locus (QTL) mapping using a Whole Genome Sequence (WGS) -based genetic map and the method of Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)/Cas9 -based gene editing. The approach of QTL mapping allows one to test if there is a correlation between a genomic region(s) and a phenotype. Two datasets a
СтатьяVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningitidis employs polysaccharides and outer membrane proteins to cope with human serum complement attack. To screen for factors influencing serum resistance, an assay was developed based on a colorimetric serum bactericidal assay. The screening used a genetically modified sequence type (ST)-41/44 clonal complex (cc) strain lacking LPS sialylation, polysaccharide capsule, the factor H binding protein (fHbp) and MutS, a protein of the DNA repair mechanism. After killing of >99.9% of the bacterial cells by serum treatment, the colorimetric assay was used to screen 1000 colonies, of w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Severe von Willebrand disease (VWD) type 3 is caused by large deletions, insertions, small truncating mutations, splice site mutations and missense mutations of the VWF gene, respectively. Large deletions have been regarded as being a rare cause of VWD type 3. Complete gene deletions have only been identified in Italian and German patients to date. However, their extent and breakpoints have not been determined yet.
OBJECTIVES: To identify the breakpoints of complete VWF deletions in patients with VWD type 3.
PATIENTS/METHODS: Five index patients with large deletions from two unre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Inhibitors of the ataxia-telangiectasia and Rad3-related (ATR) protein kinase, a critical component of the DNA damage repair response, have synergistic anticancer activity with platinum compounds in preclinical models. We therefore conducted a phase II study of the ATR inhibitor berzosertib + carboplatin versus docetaxel + carboplatin in metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC).
PATIENTS AND METHODS: Patients previously treated with at least one androgen receptor pathway inhibitor and taxane underwent mandatory biopsy and were randomized 1:1 to receive arm A (docetaxel
СтатьяКлиническое исследование II фазыРандомизированное исследованиеСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate cancer (PCa) is the second most common solid tumor in men, and its incidence is strongly dependent on age. With the aging global population, this poses a significant medical and sociodemographic issue. As treatment options for castration-resistant prostate cancer (CRPC) expand, the proportion of elderly patients with CRPC is expected to increase. Comprehensive genomic profiling (CGP) testing is becoming increasingly utilized for PCa; however, evidence on age-related outcomes or benefits is limited. This study aimed to evaluate the efficacy of CGP testing in advanced elderl
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: DNA damage repair genes are altered in 20-35% of metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC). Poly-ADP (Adénosine Diphosphate)-ribose polymerase inhibitors (PARPi) showed significant activity for these selected tumors, especially with homologous recombination repair (HRR) deficiency. These alterations could also predict platinum sensitivity. Although carboplatin was inconclusive in unselected mCRPC, the literature suggests an anti-tumoral activity in mCRPC with HHR gene alterations. We aimed to assess the efficacy of carboplatin monotherapy in mCRPC patients with HRR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atovaquone is an approved antimalarial drug which could sensitise tumours to radiation and may modulate tumour immune microenvironment. Here we evaluated the triple combination of radiation with atovaquone plus anti-PD-L1 in HNSCC syngeneic mouse tumour models. We observed significant tumour growth delay induced by the triple combination treatment with differential responses in three different mouse models. There was complete tumour eradication in 6 of 12 mice in the MOCL1 model but not in the other two murine models. The triple combination was associated with increased populations of CD8+-T G
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer is a heterogenous disease with various molecular subtypes. Among these, triple-negative breast cancer has the worst prognosis due to its high aggressiveness and limited availability of targeted therapies. In breast cancers, reduced expression of dipeptidyl peptidase 9 (DPP9) is associated with a poor patient prognosis. To model reduced DPP9 expression, we transplanted the human triple-negative breast cancer cell line MDA.MB.231 with an inducible genetic DPP9 deficiency in the mammary fat pad of immunocompromised mice. As expected, tumors with DPP9 deficiency showed an increased w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ovarian cancer metastasizes via peritoneal dissemination, requiring tumor cells to resist detachment-induced cell death (anoikis) in suspension and to reinitiate proliferation after seeding. Because disseminating ovarian cancer cells persist in malignant ascites enriched in extracellular S1 family serine proteases, we surveyed S1 protease gene expression across ovarian cancer cohorts to identify those most associated with poor outcomes. High expression of multiple family members was associated with poor survival, with HTRA3, TMPRSS12, and PRSS23 among the strongest hits. TMPRSS12 transcripts w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PROpel (phase 3 randomized [1:1], double-blind trial: NCT03732820) met its primary endpoint, showing statistically significantly improved investigator-assessed radiographic progression-free survival (rPFS) with olaparib plus abiraterone versus placebo plus abiraterone in biomarker-unselected first-line metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC; hazard ratio [HR], 0.66; 95% confidence interval [CI], 0.54-0.81; p < 0.0001). Median overall survival (OS) was 42.1 mo with olaparib plus abiraterone, a 7.4-mo improvement versus placebo plus abiraterone. We report efficacy in patients wit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rationale: Glioblastoma (GBM) is the most aggressive type of primary brain cancer and contains self-renewing GBM stem cells (GSCs) that contribute to tumor growth and therapeutic resistance. However, molecular determinants governing therapeutic resistance of GSCs are poorly understood. Methods: We performed genome-wide analysis of deubiquitylating enzymes (DUBs) in patient-derived GSCs and used gene-specific shRNAs to identify an important DUB gene contributing to GSC survival and radioresistance. Subsequently, we employed mass spectrometry and immunoprecipitation to show the interaction betwe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The SETD2 tumour suppressor encodes a histone methyltransferase that specifically trimethylates histone H3 on lysine 36 (H3K36me3), a key histone mark implicated in the maintenance of genomic integrity among other functions. We found that SETD2 protein deficiency, mirrored by H3K36me3 deficiency, is a nearly universal event in advanced-phase chronic myeloid leukemia (CML) patients. Similarly, K562 and KCL22 cell lines exhibited markedly reduced or undetectable SETD2/H3K36me3 levels, respectively. This resulted from altered SETD2 protein turnover rather than mutations or transcriptional downreg
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: BRCA1 and BRCA2 genes are well-established tumor suppressors, crucial for maintaining genomic stability through their roles in DNA repair. Pathogenic variants in BRCA1/2 genes are implicated in increased susceptibility to breast and ovarian cancers. However, variant interpretation remains challenging due to the large size of BRCA1/2 (>80 kb) and the broad spectrum of variant forms, particularly for rare or recently identified variants lacking adequate population, functional or segregation data.
CASE PRESENTATION: This report describes a case of high-grade serous ovarian carcinoma
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ataxia telangiectasia mutated (ATM) kinase plays a critical role in DNA double-strand break (DSB) repair. Ataxia telangiectasia (A-T) patients exhibit abnormalities in immunoglobulin isotype expression and class switch recombination (CSR). This study investigates the role of residual ATM kinase expression and activity in the severity of A-T disease.
METHODS: A-T patients with defined genetic diagnoses were classified based on CSR and based on the severity of their medical complications. Isolated peripheral blood mononuclear cells from any patient were evaluated before and after ex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: RAD51 recombinase (RAD51) is a highly conserved DNA repair protein and is indispensable for embryonic viability. As a result, the role of RAD51 in liver development and function is unknown. Our aim was to characterize the function of RAD51 in postnatal liver development.
APPROACH AND RESULTS: RAD51 is highly expressed during liver development and during regeneration following hepatectomy and hepatic injury, and is also elevated in chronic liver diseases. We generated a hepatocyte-specific Rad51 deletion mouse model using Alb -Cre ( Rad51 -conditional knockout (CKO)) and A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Individuals with cystic fibrosis (CF) are susceptible to chronic lung infections that lead to inflammation and irreversible lung damage. While most respiratory infections that occur in CF are caused by bacteria, some are dominated by fungi such as the slow-growing black yeast Exophiala dermatitidis. Here, we analyze isolates of E. dermatitidis cultured from two samples, collected from a single subject 2 years apart. One isolate genome was sequenced using long-read Nanopore technology as an in-population reference to use in comparative single nucleotide polymorphism and insertion-deletion varia
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Artemis is an exonuclease essential for V(D)J recombination and repair of DNA double-stranded breaks. Pathogenic variants in DCLRE1C encoding Artemis cause T-B-NK+ severe combined immunodeficiency (SCID), and patients with Artemis-deficient SCID (ART-SCID) require definitive therapy with allogeneic hematopoietic cell transplantation (HCT). Here we describe the clinical and genetic characteristics of patients with ART-SCID who were diagnosed in Japan from 2003 to 2022.
METHODS: Clinical data of ART-SCID patients who were diagnosed between 2003 and 2022 in Japan were collected from the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BCR-ABL1 gene fusion associated with additional DNA lesions involves the pathogenesis of chronic myelogenous leukemia (CML) from a chronic phase (CP) to a blast crisis of B lymphoid (CML-LBC) lineage and BCR-ABL1+ acute lymphoblastic leukemia (BCR-ABL1+ ALL). The recombination-activating gene RAG1 and RAG2 (collectively, RAG) proteins that assemble a diverse set of antigen receptor genes during lymphocyte development are abnormally expressed in CML-LBC and BCR-ABL1+ ALL. However, the direct involvement of dysregulated RAG in disease progression remains unclear. Here, we generate human wild-typ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer epidemiology, biomarkers & prevention : a publication of the American Association for Cancer Research, cosponsored by the American Society of Preventive Oncology2020eng
BACKGROUND: The link between modifiable breast cancer risk factors and tumor genomic alterations remains largely unexplored. We evaluated the association of prediagnostic body mass index (BMI), cigarette smoking, and alcohol consumption with somatic copy number variation (SCNV), total somatic mutation burden (TSMB), seven single base substitution (SBS) signatures (SBS1, SBS2, SBS3, SBS5, SBS13, SBS29, and SBS30), and nine driver mutations (CDH1, GATA3, KMT2C, MAP2K4, MAP3K1, NCOR1, PIK3CA, RUNX1, and TP53) in a subset of The Cancer Genome Atlas (TCGA).
METHODS: Clinical and genomic data were
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Platinum resistance is a major obstacle in the treatment of epithelial ovarian cancer (EOC). Activation of the AKT pathway promotes platinum resistance while inhibition of AKT sensitizes chemoresistant cells. Patients with BRCA mutant EOC, and thus a defect in the homologous recombination (HR) repair pathway, demonstrate greater clinical response to platinum and olaparib therapy than patients with BRCA wild-type EOC. MK-2206, an allosteric inhibitor of AKT phosphorylation, sensitizes a variety of cell types to various anticancer agents and is currently undergoing phase II trials as
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования