Plants host diverse microbial communities across spatially distinct foliar niches. For hemibiotrophic pathogens, the epiphytic leaf surface and the apoplast impose contrasting physiological constraints that shape infection strategies. We investigated how these environments program the transcriptional responses of a tomato pathogen, Xanthomonas perforans (Xp), and how virulence, metabolism, and regulation are coordinated across space and time during disease progression. By selectively enriching and profiling the transcriptome of a pathogen from the leaf surface and apoplast, we uncovered pronou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Streptococcus pneumoniae is a major colonizer of the human nasopharynx, where inter- and intra-strain competition plays a critical role in shaping population structure and influencing vaccine outcomes. Bacteriocins are key mediators of intra-species competition, yet many of their functions and regulatory mechanisms remain poorly understood. Here, we identify and characterize streptolancidin D, a previously uncharacterized bacteriocin encoded by the sldA-T locus, and demonstrate its contribution to pneumococcal competition. Using isogenic streptolancidin-producing and non-producing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) poses a significant health risk, with Stx1 and Stx2 as key virulence factors associated with hemolytic uremic syndrome (HUS). Current STEC treatment relies on supportive care, avoiding antimicrobial therapy. This study evaluates the antibacterial activity of three cecropin peptides and their effect on the expression of the stx2 gene in STEC. Employing microdilution assays and RT-qPCR, all three cecropins demonstrated antibacterial efficacy, displaying MIC and MBC values of 12.5 µg/mL, and decreased gene expression levels following treatment. Notabl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patchouli alcohol, a natural tricyclic sesquiterpene isolated from Pogostemon cablin, exhibits promising antimicrobial properties, yet its activity against Streptococcus mutans (S. mutans), a major cariogenic bacterium associated with dental caries, has not been characterized. This study determined the minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration (MBC) of patchouli alcohol against S. mutans to be 40 and 80 μg/mL, respectively. A series of phenotypic assays showed that patchouli alcohol delayed bacterial growth and culture acidification, reduced extracellular po
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Within-host environments are complex and multidimensional, making it challenging to link the evolutionary responses of colonizing pathogens to causal selective drivers. Loss of quorum sensing (QS) via mutation of the master regulator, lasR, is a common adaptation of Pseudomonas aeruginosa during chronic infections. Here, we use experimental evolution in host-mimicking media to show that loss of QS is constrained by environmental factors associated with host inflammation. Specifically, environments combining oxidative stress and abundant free amino acids limited loss of QS, whereas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa is a primary driver of morbidity and mortality in cystic fibrosis (CF) patients. Throughout the course of infection, P. aeruginosa undergoes significant evolution and adaptation to the dynamic environment of the CF respiratory tract, leading to the emergence of diverse phenotypes. Among the variants that arise during this process are mutations in the regulatory gene lasR. While clinical significance of LasR deficiency is well recognized, current evidence does not fully elucidate the metabolic changes associated with the absence of this master regulator. To address this,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zinc (Zn2+) is essential for all bacteria, but excessive Zn2+ levels are toxic. Bacteria maintain zinc homeostasis through regulators, such as Zur, AdcR, and ZntR. Riemerella anatipestifer is a significant Flavobacteriales pathogen causing acute serositis in ducks and other birds. In this study, we identified a homolog of ZntR, a regulator for zinc homeostasis, and demonstrated its contribution to the pathogenicity of R. anatipestifer. Deletion of zntR makes the bacteria hypersensitive to excess Zn2+ but not to other metals like manganese (Mn2+), copper (Cu2+), cobalt (Co2+), and nickel (Ni2+)
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes (Lm) is a gram-positive pathogen that is widespread throughout the environment and known for its ability to infect mammalian hosts following the ingestion of contaminated food. Lm uses a variety of mechanisms to survive challenging conditions experienced both during life in the outside environment and inside of the infected host. We recently described a novel two-component signaling system known as PieRS that regulates the secretion of the chaperone PrsA2, which is essential for bacterial virulence, as well as its related homolog PrsA1 and a variety of gene products of u
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella is a foodborne pathogen that enters the host's body through contaminated food and water, leading to gastroenteritis and systemic diseases. It is a significant veterinary and human pathogen capable of infecting both humans and animals, with substantial impacts on public health, human well-being, and the economic development of the livestock and poultry farming industry. Small non-coding RNAs (sRNAs), typically 50-500 nucleotides (nt) in length, have been identified in various bacteria, including Escherichia coli, Brucella, Pseudomonas aeruginosa, and Salmonella. These sRNAs play cruc
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium abscessus (Mab) is an opportunistic pathogen afflicting individuals with underlying lung disease such as Cystic Fibrosis (CF) or immunodeficiencies. Current treatment strategies for Mab infections are limited by its inherent antibiotic resistance and limited drug access to Mab in its in vivo niches resulting in poor cure rates of 30-50%. Mab's ability to survive within macrophages, granulomas and the mucus laden airways of the CF lung requires adaptation via transcriptional remodeling to counteract stresses like hypoxia, increased levels of nitrate, nitrite, and reactive nitrogen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Limiting the availability of transition metals at infection sites serves as a critical defense mechanism employed by the innate immune system to combat microbial infections. Pseudomonas aeruginosa exhibits a remarkable ability to thrive in zinc-deficient environments, facilitated by intricate cellular responses governed by numerous genes regulated by the zinc-responsive transcription factor Zur. Many of these genes have unknown functions, including those within the predicted PA2911-PA2914 and PA4063-PA4066 operons. A structural bioinformatics investigation revealed that PA2911-PA29
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The multifunctional proteins of class 2 CRISPR systems such as Cas9, have been employed to activate cryptic biosynthetic gene clusters (BGCs) in Streptomyces, which represent a large and hidden reservoir of natural products. However, such approaches are not applicable to most Streptomyces strains with reasons to be comprehended. Inspired by the prevalence of the class 1 subtype especially the type I-E CRISPR system in Streptomyces, here we report the development of the type I-E CRISPR system into a series of transcriptional regulation tools. We further demonstrate the effectiveness of such act
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Streptococcus pneumoniae is a common member of the nasopharynx commensal microflora and the leading etiological agent of bacterial pneumonia in young children and aging adults. SPD_0739, a highly expressed lipoprotein, is the predicted substrate-binding component of an ABC transporter linked to the uptake of nucleosides and heme by independent studies (named PnrA or Spbhp-37, respectively). Here, we demonstrate that SPD_0739 binds heme in vitro and contributes to the bacterial binding to hemoglobin. A ∆spd_0739 strain exhibited growth attenuation that was relieved by the inactivati
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lyme disease, the leading vector-borne disease in the United States and Europe, develops after infection with Borrelia burgdorferi sensu lato bacteria. Transmission of the spirochete from the tick vector to a vertebrate host requires global changes in gene expression that are controlled, in part, by the Rrp2/RpoN/RpoS alternative sigma factor cascade. Transcriptional studies defining the B. burgdorferi RpoS regulon have suggested that RpoS activates the transcription of paralogous family 52 (PFam52) genes. In strain B31, PFam52 genes (bbi42, bbk53, and bbq03) encode a set of conserved hypothet
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ability of bacteria to sense and respond to mechanical forces has important implications for pathogens during infection, as they experience wide fluid shear fluctuations in the host. However, little is known about how mechanical forces encountered in the infected host drive microbial pathogenesis. Herein, we combined mathematical modeling with hydrodynamic bacterial culture to profile transcriptomic and pathogenesis-related phenotypes of multidrug resistant S. Typhimurium (ST313 D23580) under different fluid shear conditions relevant to its transition from the intestinal tract to the blood
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Outer membrane vesicle (OMV)-delivered Pseudomonas quinolone signal (PQS) plays a critical role in cell-cell communication in Pseudomonas aeruginosa. However, the functions and mechanisms of membrane-enclosed PQS in interspecies communication in microbial communities are not clear. Here, we demonstrate that PQS delivered by both OMVs from P. aeruginosa and liposome reduces the competitiveness of Burkholderia cenocepacia, which usually shares the same niche in the lungs of cystic fibrosis patients, by interfering with quorum sensing (QS) in B. cenocepacia through the LysR-type regulator ShvR. I
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SigS is the sole extracytoplasmic function sigma factor in Staphylococcus aureus and is necessary for virulence, immune evasion, and adaptation to toxic chemicals and environmental stressors. Despite the contribution of SigS to a myriad of critical phenotypes, the downstream effectors of SigS-dependent pathogenesis, immune evasion, and stress adaptation remain elusive. To address this knowledge gap, we analyzed the S. aureus transcriptome following transient overexpression of SigS. We identified a bicistronic transcript, upregulated 1,000-fold, containing two midsized genes, each containing si
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously demonstrated that MgrA, SarA, SarR, SarS, SarZ, and Rot bind at least three of the four promoters associated with genes encoding primary extracellular proteases in Staphylococcus aureus (Aur, ScpA, SspA/SspB, SplA-F). We also showed that mutation of sarA results in a greater increase in protease production, and decrease in biofilm formation, than mutation of the loci encoding any of these other proteins. However, these conclusions were based on in vitro studies. Thus, the goal of the experiments reported here was to determine the relative impact of the regulatory loci encoding th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The alternative sigma factor RpoS plays a central role in the critical host-adaptive response of the Lyme disease spirochete, Borrelia burgdorferi. We previously identified bbd18 as a negative regulator of RpoS but could not inactivate bbd18 in wild-type spirochetes. In the current study we employed an inducible bbd18 gene to demonstrate the essential nature of BBD18 for viability of wild-type spirochetes in vitro and at a unique point in vivo. Transcriptomic analyses of BBD18-depleted cells demonstrated global induction of RpoS-dependent genes prior to lysis, with the absolute requirement for
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The seventh pandemic of the diarrheal cholera disease, which began in 1960, is caused by the Gram-negative bacterium Vibrio cholerae. Its environmental persistence provoking recurring sudden outbreaks is enabled by V. cholerae's rapid adaption to changing environments involving sensory proteins like ToxR and ToxS. Located at the inner membrane, ToxR and ToxS react to environmental stimuli like bile acid, thereby inducing survival strategies for example bile resistance and virulence regulation. The presented crystal structure of the sensory domains of ToxR and ToxS in combination with multiple
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования