Clonality testing using BIOMED-2-based multiplex PCR is widely applied in routine diagnostics, but its interpretation can be complicated by clonal-like peaks arising from non-neoplastic immune responses. In this study, we retrospectively analyzed routine diagnostic cases examined by IGH and TCRB multiplex PCR and assessed both the number of rearranged regions and peak patterns in B-cell lymphoma (N = 291), T-cell lymphoma (N = 48), Classic Hodgkin lymphoma (N = 31), reactive lymphoid hyperplasia (N = 28), and carcinoma (N = 41). The most clinically relevant finding was the frequent detection o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Identification of a clonal proliferation of lymphocytes is central to the diagnosis of lymphoma compared with a reactive lymphoproliferation. We propose a novel diagnostic technique based on restriction fragment length polymorphism (RFLP) of amplified polymerase chain reaction (PCR) products of the T-cell receptor -gamma (TCR-gamma) gene rearrangement to rapidly identify monoclonality in T-cell lymphomas and improve diagnosis of malignancy.
MATERIALS AND METHODS: DNA from peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of 10 healthy volunteers and 7 T-cell lymphoma patients were isolat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
WNT signaling pathway regulates several processes involved in the homeostasis of normal cells. Its dysregulation is associated with pathological outcomes like cancer. We previously demonstrated that downregulation of WNT7A correlates with higher proliferation rates in acute lymphoblastic leukemia. However, the regulation of this gene in pathological and normal conditions remains unexplored. In this work, we aimed to analyze the transcriptional regulation of WNT7A in leukemic cells and in normal T lymphocytes after a proliferative stimulus. WNT7A expression was measured in blood cells and in T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: There are no disease-modifying therapies for the treatment of eosinophilic oesophagitis (EoE), which is driven by non-IgE-mediated allergic inflammation. A recent clinical trial of milk epicutaneous immunotherapy (EPIT) has shown initial promise, with 47% of treated EoE patients tolerating milk without recurrence of disease. Mechanisms of EPIT in EoE have not been studied in humans. Here, we identify transcriptional changes in the peripheral CD4+ T-cell compartment during active EoE and following EPIT.
METHODS: RNA isolation, sequencing and integrative data analysis were performed
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatic inflammatory response is a risk factor for liver cancer initiation and progression. Interleukin (IL)-35 is the newest member of the IL-12 cytokine family, and has been reported to play an essential role in the immunosuppressive liver microenvironment. Herein we focus on the expression profiles of IL-35 in hepatocellular carcinoma (HCC) and effects on local immune status. HCC transcriptome array data were downloaded from Gene Expression Omnibus (GEO). Analysis was performed by BRB-Array Tools and Ingenuity Pathway Analysis (IPA) software. Serum IL-35 level was detected by AimPlet bead-b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Discerning the pathologic significance of cutaneous T-cell infiltrates can pose a diagnostic challenge for dermatopathologists. Reactive conditions such as drug-associated lymphomatoid hypersensitivity and lymphomatoid lupus erythematosus can demonstrate lymphoid atypia and a phenotype resembling cutaneous T-cell lymphoma (CTCL). Further, lymphoid dyscrasias such as pityriasis lichenoides chronica, large plaque parapsoriasis, and atypical pigmentary purpura confuse the picture because they not only mimic CTCL but also represent prelymphomatous states with inherent malignant potential. Although
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report 3 cases of primary hepatic peripheral T-cell lymphoma (PTCL). All patients were men, 50 to 57 years of age, who sought care because of systemic symptoms including fever, fatigue, and weight loss. Physical examination revealed hepatomegaly in 2 patients, associated with jaundice in 1. Two patients had abnormal serum liver enzyme levels and coagulation profiles. Imaging studies demonstrated marked hepatomegaly without focal lesions in 1 patient and multiple discrete tumor masses in 2 patients. Tumor infiltrates in biopsy specimens were heterogeneous with a large cell component in 2 cas
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Guillain-Barré syndrome (GBS) is a acute immune-mediated peripheral neuropathy with scarce incidence, yet its molecular mechanisms remain incompletely elucidated. This study aims to systematically identify key hub genes and signaling pathways in GBS to uncover novel insights into its immunopathology and potential therapeutic targets. METHODS: The transcriptomic dataset GSE31014, comprising peripheral blood leukocytes from 7 GBS patients and 7 healthy controls, was analyzed. Differentially expressed genes (DEGs) were identified using the Limma package. Functional enrichment was asse
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The molecular basis of the immunomodulatory properties of 1alpha,25-dihydroxyvitamin D3 (1alpha,25(OH)2D3) remains elusive. We demonstrate here that 1alpha,25(OH)2D3-mediated suppressive effects on the inducible expression of cytokine genes in human T cells may, in part, be due to diminished activity of the transcription factor NFAT. The vitamin D3 receptor (VDR) and its heterodimeric partner retinoid X receptor alpha (RXR alpha) specifically bound to the distal NFAT site in the human IL-2 promoter, and this binding was abolished by mutating unique regions in the NFAT oligonucleotide. In vitro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The distinction between certain benign cutaneous lymphocytic infiltrates and cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) can be a challenging problem in clinical practice. An imperfect but useful tool in this circumstance is the analysis of T-cell clonality or monoclonality by assessing T-cell receptor (TCR) gene rearrangements. "Monoclonality" describes the origin of a specific human malignant tumor from one single cell from which the entire tumor is derived. The term is used to describe the early steps in tumorigenesis; in later stages of tumor growth and progression, monoclonal tumor cells may acquire
КомментарийСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the significance of detecting TCR gene clonal rearrangement in the diagnosis of mycosis fungoides (MF) and to optimize the primers used for detecting the TCR gene clonal rearrangement with PCR in paraffin embedded tissues of MF.
METHODS: Nineteen cases of MF were enrolled into the study. A panel of 10 antibodies were used for immunophenotypic analysis and polymerase chain reaction for TCR-γ and TCR-β gene rearrangement detection in this study.
RESULTS: TCR gene clonal rearrangements were detected in all 19 cases, in which 84.2% cases (16/19) had TCR-γ gene clonal re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Current diagnostics are inadequate to meet the challenges presented by co-infection with Mycobacterium tuberculosis (Mtb) and HIV, the leading cause of death for HIV-infected individuals. Improved characterization of Mtb/HIV coinfection as a distinct disease state may lead to better identification and treatment of affected individuals.
METHODS: Four previously-published TB and HIV co-infection related datasets were used to train and validate multinomial machine learning classifiers that simultaneously predict TB and HIV status. Classifier predictive performance was measured using
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aspergillus fumigatus is a ubiquitous mold that can cause severe infections in immunocompromised patients, typically manifesting as invasive pulmonary aspergillosis (IPA). Adaptive and innate immune cells that respond to A. fumigatus are present in the endogenous repertoire of patients with IPA but are infrequent and cannot be consistently isolated and expanded for adoptive immunotherapy. Therefore, we gene-engineered A. fumigatus-specific chimeric antigen receptor (Af-CAR) T cells and demonstrate their ability to confer antifungal reactivity in preclinical models in vitro and in vivo. We gene
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nasal polyps (NP) are associated with inflamed mucosa of unknown etiology. The role of T cells in nasal polyposis is unclear. Invariant natural killer T cells (iNKT) can promote Th2 responses and have been implicated in some types of asthma. As there are shared inflammatory pathways involved in asthma and NPs, we evaluated the frequency of iNKT in 17 patients with NPs, but without asthma. A median of 6% polyp cells were T lymphocytes, of which iNKT were 0 to 2.38% (mean 0.674%). In the matched group (n = 10), iNKT in NPs was significantly higher than PBMCs (1.057% vs 0.155%, P < 0.05). Relativ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunoreactivity to intra- and extracellular antigens is regulated mainly by two different types of T-helper cells, namely TH1 (producing mainly IFN-gamma and Il-2) and TH2 (producing IL-4, -5, -10). Both types cross-regulate each other. TH1 mechanisms seem to be involved principally in organ-specific autoaggressive disorders, while TH2 response is an expression of allergic conditions characterized by eosinophilic reactions and increased IgE levels. There are only a few reports dealing with cytokine profiles in patients with primary biliary cirrhosis (PBC). From studies analyzing the cytokine
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fibrosis development in patients with metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) is a key indicator of disease progression and clinical outcome. Bulk and single-cell transcriptomics on human tissue have advanced understanding of fibrosis progression, but interstudy heterogeneity and limited sample size hinder the identification of consistent and targetable fibrogenic mechanisms.
METHODS: To identify conserved fibrogenic mechanisms, we performed a comprehensive meta-analysis of hepatic transcriptomic data with fibrosis stage characterized from ~1000 patients w
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The peculiar features of T-cell large granular lymphocytic leukemia (T-LGLL) are its association with autoimmune disorders (particularly with rheumatoid arthritis (RA)) and a broad spectrum of B-cell lymphoproliferative disorders. However, association of T-LGLL with mantle cell lymphoma (MCL) is extremely rare. Here, we describe a case of an 80-year-old man admitted with suspected Felty's syndrome. The blood count showed white blood cells at 2.2×109/L, with 3% neutrophils, 88% lymphocytes, and at 0.66×109/L LGLs. The spleen had been removed 43 months prior to the admission due to suspected B-c
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunotherapy through adoptive cell therapy (ACT) has become an effective cancer treatment method, using genetically modified immune cells or immune cells grown outside the body. The ACT methods use chimeric antigen receptor T (CAR-T) cells, with proven results for blood cancers, while tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) and T-cell receptor (TCR)-engineered T cells serve as effective methods to fight against solid tumors and intracellular antigens. The current medical field uses natural killer (NK) cell-based therapies because of their natural ability to destroy cells, their lower incidence
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orai1 is the pore subunit of Ca(2+) release-activated Ca(2+) (CRAC) channels that stimulate downstream signaling pathways crucial for T cell activation. CRAC channels are an attractive therapeutic target for alleviation of autoimmune diseases. Using high-throughput chemical library screening targeting Orai1, we identified a novel class of small molecules that inhibit CRAC channel activity. One of these molecules, compound 5D, inhibited CRAC channel activity by blocking ion permeation. When included during differentiation, Th17 cells showed higher sensitivity to compound 5D than Th1 and Th2 cel
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The purpose of this study was to analyze the data of patients with T-cell large granular lymphocyte (T-LGL) lymphocytosis associated with inflammatory arthropathy or with no arthritis symptoms.
METHODS: Clinical, serological as well as histopathological, immunohistochemical, and flow cytometric evaluations of blood/bone marrow of 21 patients with T-LGL lymphocytosis were performed. The bone marrow samples were also investigated for T-cell receptor (TCR) and immunoglobulin (IG) gene rearrangements by polymerase chain reaction with heteroduplex analysis.
RESULTS: Neutropenia was
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.