Myocardial infarction (MI) triggers a reparative response involving fibroblast proliferation and differentiation driving extracellular matrix modulation necessary to form a stabilizing scar. Recently, it was shown that a genetic variant of the base excision repair enzyme NEIL3 was associated with increased risk of MI in humans. Here, we report elevated myocardial NEIL3 expression in heart failure patients and marked myocardial upregulation of Neil3 after MI in mice, especially in a fibroblast-enriched cell fraction. Neil3-/- mice show increased mortality after MI caused by myocardial rupture.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation dynamics influence brain function and are altered in neurological disorders. 5-hydroxymethylcytosine (5-hmC), a DNA base that is derived from 5-methylcytosine, accounts for ∼40% of modified cytosine in the brain and has been implicated in DNA methylation-related plasticity. We mapped 5-hmC genome-wide in mouse hippocampus and cerebellum at three different ages, which allowed us to assess its stability and dynamic regulation during postnatal neurodevelopment through adulthood. We found developmentally programmed acquisition of 5-hmC in neuronal cells. Epigenomic localization of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetics, and in particular imprinted genes, have a critical role in the development and function of the placenta, which in turn has a central role in the regulation of fetal growth and development. A unique characteristic of imprinted genes is their expression from only one allele, maternal or paternal and dependent on parent of origin. This unique expression pattern may have arisen as a mechanism to control the flow of nutrients from the mother to the fetus, with maternally expressed imprinted genes reducing the flow of resources and paternally expressed genes increasing resources to the
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epithelial surfaces of the mammalian alimentary tract are characterised by very high rates of cell proliferation and DNA synthesis, and in humans they are highly susceptible to cancer. The role of somatic mutations as drivers of carcinogenesis in the alimentary tract is well established, but the importance of gene silencing by epigenetic mechanisms is increasingly recognised. Methylation of CpG islands is an important component of the epigenetic code that regulates gene expression during development and normal cellular differentiation, and a number of genes are well known to become abnorma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Over the past 5 to 7 million years, humans and chimpanzees have diverged in brain size, structure, and cognition despite high conservation of protein-coding genes. However, retroviral infections within host genomes have introduced numerous species-specific regulatory elements. Chimpanzees harbor lineage-specific PTERV1 endogenous retroviruses that are absent in humans, but their role in brain evolution has remained unclear. We performed an epigenomic analysis of PTERV1 insertions in chimpanzee neural organoids and found they are heavily DNA methylated, forming over 150 species-specific heteroc
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid expansion of high-throughput technologies and multi-omics profiling has transformed cancer research by enabling systematic characterization of genomic, transcriptomic, epigenomic, proteomic, immunological, and pharmacological features of tumors. These diverse molecular alterations contribute to tumor initiation, progression, heterogeneity, treatment response, and resistance, creating a need for computational resources capable of integrating and interpreting complex cancer datasets. Consequently, numerous bioinformatics resources have been developed to organize, analyze, and interpret
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic reprogramming within the tumor microenvironment (TME) is a pivotal driver of CD8+ T cell dysfunction in cancer. Tumor cells outcompete T cells for essential nutrients, including glucose and amino acids, while accumulating immunosuppressive metabolites such as lactate and 2-hydroxyglutarate. Beyond direct functional impairment, emerging research reveals that these metabolic alterations orchestrate CD8+ T cell transcriptional programs by remodeling their epigenome-via histone modifications, DNA methylation, and non-coding RNA networks-thereby dictating their differentiation, cytotoxic
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human genome contains hundreds of thousands of short open reading frames (sORFs), yet their translational products, hereafter referred to as sORF-encoded microproteins (also historically termed micropeptides), have long remained overlooked in conventional genome annotation. Increasing evidence demonstrates that these molecules play critical regulatory roles in human physiology and disease. This narrative review summarizes current knowledge regarding the classification, discovery, translational regulation, and biological significance of sORF-encoded microproteins. Their expression is tightl
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three-dimensional (3D) genome conformation is central to gene expression regulation, yet our understanding of its contribution to rapid transcriptional responses, signal integration, and memory in immune cells is limited. Here, we study the molecular regulation of the inflammatory response in primary macrophages using integrated transcriptomic, epigenomic, and chromosome conformation data, including base pair-resolution Micro Capture-C. We demonstrate that interleukin-4 (IL-4) primes the inflammatory response in macrophages by stably rewiring 3D genome conformation, juxtaposing endotoxin-, int
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meningiomas have traditionally been classified and treated according to histopathological grade and extent of resection. However, recent advances in molecular biology have revealed that histology alone does not fully explain the clinical behavior of these tumors. The 2021 World Health Organization classification introduced molecular criteria for meningioma grading, including CDKN2A/B homozygous deletion and TERT promoter mutation as defining features of grade 3 disease. In parallel, large-scale multi-omics studies integrating genomic, epigenomic, and transcriptomic data have established biolog
СтатьяОбзорАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spatial resolution of omics analyses is fundamental to understanding tissue biology1-3. The capacity to spatially profile DNA methylation, which is a canonical epigenetic mark extensively implicated in transcriptional regulation4,5, is lacking. Here we introduce a method for whole-genome spatial co-profiling of DNA methylation and the transcriptome of the same tissue section at near single-cell resolution. Applying this technology to mouse embryogenesis and the postnatal mouse brain resulted in rich DNA-RNA bimodal tissue maps. These maps revealed the spatial context of known methylation b
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic mechanisms act as mediators of genetic and environmental influences. In Alzheimer's disease, blood-based DNA methylation signatures are increasingly being explored as minimally invasive peripheral biomarkers. We previously reported associations between blood DNA methylation in the CHI3L1 gene (encoding YKL-40) and cerebrospinal fluid (CSF) levels of YKL-40, a marker of neuroinflammation. These findings have now been replicated in an independent study (Kaleck et al. 2025), reinforcing their robustness and biological relevance. We also reported associations between DNA methylation and
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin D deficiency is widespread. It increases the risk of several diseases. Therefore, researchers have long studied the factors that influence vitamin D levels in the body. These include its metabolism, catabolism, transport and binding of vitamin D to the receptor VDR. Currently, an increasing number of studies are focusing on genetic factors. Variations in vitamin D levels, including vitamin D deficiency, are under substantial genetic control. There is a reciprocity between the vitamin D system and epigenetic mechanisms. Vitamin D metabolism, on the one hand, is regulated by epigenetic m
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent decades have described parallel neuropathological mechanisms increasing the risk for developing late-onset Alzheimer's dementia (LOAD) in type 2 diabetes mellitus (T2DM); however, still little is known of the role of diabetic encephalopathy and brain atrophy in LOAD. The aim of this systematic review is to provide a comprehensive view on diabetic encephalopathy/cerebral atrophy, taking into account neuroimaging data, neuropathology, metabolic and endocrine mechanisms, amyloid formation, brain perfusion impairments, neuroimmunology, and inflammasome activation. Key switches were identifi
СтатьяСистематический обзорМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virtually all individuals aged 65 or older develop at least early pathology of Alzheimer's disease (AD), yet most lack disease-causing mutations in APP, PSEN, or MAPT, and many do not carry the APOE4 risk allele. This raises questions about AD development in the general population. Although transcriptional dysregulation has not traditionally been a hallmark of AD, recent studies reveal significant epigenomic changes in late-onset AD (LOAD) patients. We show that altered expression of the LOAD biomarker phosphoglycerate dehydrogenase (PHGDH) modulates AD pathology in mice and human brain organo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our knowledge of testis development and function mainly comes from research using mammalian model organisms, primarily the mouse. However, there are integral differences between men and other mammalian species regarding cellular composition and expression profiles during fetal and post-natal testis development and in the mature testis. Therefore, to specifically learn more about human testis development and function, there is a need to use human testis tissue for research. Human testicular tissues that have been donated for research have allowed extensive molecular and cytological assessments,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, male reproductive health has attracted extensive attention, with the adverse effects of circadian disruption on male fertility gradually gaining recognition. However, the mechanism by which circadian disruption leads to damage to male reproductive system remains unclear. In this review, we first summarized the dual regulatory roles of circadian clock genes on the male reproductive system: (1) circadian regulation of testosterone synthesis via the hypothalamic-pituitary-testicular (HPT) and hypothalamic-pituitary-adrenal (HPA) axes; (2) non-circadian regulation of spermatogenesis. Nex
СтатьяОбзорАннотация на английскомПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrations in the regulatory genome play a pivotal role in population-level disease predisposition. Annotation of the regulatory regions using appropriate primary tissues - instead of cell lines affected by selection and other confounding factors - could shed new light into mechanisms underlying common conditions. We test this approach in uterine leiomyomas, highly prevalent benign neoplasms of the myometrium, by creating 15-state chromatin annotations for myometrium and uterine leiomyomas. Integration with RNA-seq, ATAC-seq, HiChIP and methylation data enables us to compare the epigenomes of
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An epigenomic approach was used to study the impact of maternal pregestational body mass index (BMI) on the placenta and umbilical cord methylomes and their potential effect on the offspring's metabolic phenotype. DNA methylome was assessed in 24 paired placenta and umbilical cord samples. The differentially methylated CpGs associated with maternal pregestational BMI were identified and the metabolic pathways and the potentially related diseases affected by their annotated genes were determined. Two top differentially methylated CpGs were studied in 90 additional samples and the relationship w
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Posttraumatic stress disorder (PTSD) is characterized by exposure to traumatic events and involves symptom domains such as intrusive thoughts, avoidant behaviors, negative mood, and cognitive dysfunction. The disorder can be chronic and debilitating, and the heterogenous nature and varied presentation of PTSD has afforded difficulty in determining efficacious treatment. The ability to identify biomarkers for PTSD risk, prognosis, or for the purposes of treatment, would be highly valuable. There is evidence for peripheral biomarkers related to the hypothalamic-pituitary-adrenal axis, the immune
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования