Global regulators (GRs) are key transcription factors that orchestrate the expression of multiple genes, playing essential roles in stress responses, virulence, secondary metabolism, and antibiotic resistance-traits that make them powerful tools for synthetic biology applications. However, conventional approaches often fail to detect remote homologs and novel GR types, limiting our understanding of their regulatory diversity and evolutionary dynamics across prokaryotes. Here, we present a large-scale, protein language model-driven framework to systematically chart the global regulatory landsca
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbial pathogens use proteases for their infections, such as digestion of proteins for nutrients and activation of their virulence factors. As an obligate intracellular parasite, Toxoplasma gondii must invade host cells to establish its intracellular propagation. To facilitate invasion, the parasites secrete invasion effectors from microneme and rhoptry, two unique organelles in apicomplexans. Previous work has shown that some micronemal invasion effectors experience a series of proteolytic cleavages within the parasite's secretion pathway for maturation, such as the aspartyl protease (TgAS
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methanogenic archaea have long been implicated in microbially influenced corrosion (MIC) of oil and gas infrastructure, yet a first understanding of the underlying molecular mechanisms has only recently emerged. We surveyed pipeline-associated microbiomes from geographically distinct oil field facilities and found methanogens to account for 0.2 to 9.3% of the 16S rRNA gene sequencing reads. Neither the type nor the abundance of the detected methanogens was correlated with the perceived severity of MIC in these pipelines. Using fluids from one pipeline, MIC was reproduced in the laboratory, bot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periodontal disease (PD) and coronary artery disease (CAD) are two highly prevalent chronic systemic disorders with overlapping population risk profiles. Accumulating observational, cellular, and genetic studies have suggested potential positive correlations between PD severity, periodontal pathogen load, and CAD incidence, coronary lesion severity, and major adverse cardiac events, whereas Mendelian randomization analyses may not support a direct causal link between the two illnesses. Several synergistic pathogenic pathways may mediate their association: periodontal pathogens may translocate
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Once hailed as the cornerstone of modern medicine, antibiotics are now facing a critical reckoning as resistance outpaces innovation. The relentless rise of multidrug-resistant (MDR) pathogens, particularly the notorious ESKAPE group, has rendered many conventional antibiotics increasingly ineffective, transforming once-manageable infections into formidable clinical challenges. In response, researchers are pursuing diverse and inventive strategies to rejuvenate the antibiotic pipeline. Pharmacognostic exploration continues to uncover rare molecular scaffolds from nature's reservoirs, which are
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AMR) in environmental systems represents an emerging One Health challenge, with anaerobic digesters potentially serving as reservoirs of resistance-associated genetic features. This study analysed four publicly available anaerobic digester shotgun metagenomic datasets (M2, M3, M12 and M17) retrieved from the NCBI Sequence Read Archive to characterise microbial functions, resistance-associated annotations and antibiotic target loci. The datasets were generated using Illumina HiSeq 2000 sequencing and analysed through quality assessment, assembly, functional annotation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Casimicrobium huifangae SJ-1 is one of the 28 core microbial groups in the activated sludge of municipal wastewater treatment plants. It exhibits strong environmental adaptability and interactions with other microbes. To develop a genetic manipulation system for this strain, we tested several broad-host-range plasmids, and pBBR1MCS-2 was successfully transformed into strain SJ-1. However, only the plasmid extracted from the transformant could be retransformed into strain SJ-1, suggesting strong host defense systems. We investigated the genome-wide DNA methylation and obtained a DNA methylation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Piperazic acid (Piz)-containing compounds are a distinctive class of microbial metabolites characterized by a unique N-N bond and diverse bioactivities, rendering them as promising scaffolds for drug discovery. Herein, we utilized an integrated discovery strategy combining PCR-based genetic screening, genome mining and MS/MS-based molecular networking to target Piz-containing metabolites from an actinomycetes library. This effort led to the isolation of nine new Piz-containing linear pseudopeptides, saccharothriotides A-I (1-9), along with the known compound Sch 382583 (10), from a desert-deri
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic autoimmune disease characterized by persistent synovial inflammation, cartilage degradation, and bone erosion, ultimately leading to joint deformities and functional impairment. Affecting approximately 1% of the global population, RA imposes a significant burden on healthcare systems and patient quality of life. The disease pathogenesis involves a complex interplay between genetic predisposition, environmental triggers, and dysregulated immune responses. While genome-wide association studies (GWAS) have identified multiple susceptibility loci, genetic fac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Colorectal cancer is among the deadliest malignancies globally. The modern therapies do not lead to ideal outcomes due mostly to drug resistance and recurrence. Previously, we treated cancer patients by ameliorating the gut microbiome and achieved curative effects. We hypothesize that anticancer bacteria might be ubiquitous in the gut but suppressed under certain conditions, pointing to a possibility that an ameliorated gut ecology may help regain the abundance or functions of the hypothetical anticancer bacteria. Here, we show our successful isolation and polyphasic characterizati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Engineered live biotherapeutic products (eLBPs) are genetically modified microorganisms being explored as a novel treatment modality for gastrointestinal (GI) diseases. The therapeutic potential is driven by their ability to selectively interact with host tissues while maintaining inherent probiotic properties that promote gut health. A key limitation of orally administered eLBPs is their poor competitive fitness against resident gut microbes, which often leads to rapid passage through the GI tract and reduced therapeutic efficacy. This challenge can be addressed by engineering eLBPs to extend
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is a leading cause of cancer mortality, and pathogenic gut bacteria contribute to its pathogenesis. This review explains how gut microbiota dysbiosis drives hepatocarcinogenesis through inflammation, metabolic dysregulation, and immune modulation. Pathogens like Fusobacterium nucleatum, Helicobacter pylori, Clostridium spp., Enterococcus faecalis , and Escherichia coli disrupt intestinal barrier integrity, alter bile acid metabolism, and induce DNA damage. These interactions activate oncogenic pathways and suppress apoptosis, thereby creating a tumor-permissive e
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marine ecosystems are increasingly exposed to petroleum pollutants and plastic waste, highlighting the importance of better understanding the microbial taxa that mediate hydrocarbon degradation. Here, we describe the genetic and metabolic toolbox of Alcanivoracaceae bacteria strains; Alcanivorax jadensis IL1, a candidate new species - Alcanivorax davidoviea IL2, and Alloalcanivorax venustensis A6, isolated from a petroleum-contaminated Eastern Mediterranean Sea marina. The three strains showed high metabolic capacities to utilize crude oil, linear and branched alkanes, but not mono- and polyar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Streptococcus mutans is central to plaque-induced oral diseases due to its robust biofilm-forming ability. Understanding the genetic and regulatory basis of this process is critical for developing targeted anti-virulence strategies that preserve the balance of the oral microbiome. This systematic review aims to gather and evaluate existing evidence on the virulence genes associated with Streptococcus mutans biofilm formation.
METHODS: A comprehensive search of PubMed, Scopus, and Web of Science was conducted in accordance with PRISMA guidelines. Studies investigating the genetic
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atractylodes lancea, a traditional Chinese medicinal herb, is divided into two chemotypes based on the production of volatile bioactive compounds: the geo-authentic Maoshan chemotype (MSA, rich in atractylon and atractylodin) and the non-authentic Hubei chemotype (HBA, dominated by hinesol and β-eudesmol). However, the mechanisms underlying the differentiation of these chemotypes remain poorly understood. By sequencing analysis of wild and cultivated A. lancea samples from multiple provinces in China, we revealed that the genetic divergence into Maoshan-Dabie Mountains group (MA) and Qinling-T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The shikimate pathway is a crucial metabolic route for the biosynthesis of numerous valuable chemicals. In this study, we engineered the shikimate pathway in plants via expression of microbial enzymes to produce the two important antioxidants gallate and arbutin. The engineered pathways utilize the aromatics protocatechuate and 4-hydroxybenzoate as metabolic intermediates. Through transient expression in Nicotiana benthamiana leaves, we first identified biosynthetic routes for the production of gallate from either chorismate or 3-dehydroshikimate. Gallate production was then achieved in Arabid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rosacea is a chronic, inflammatory dermatosis driven by a complex interplay of genetic, environmental and lifestyle factors, collectively known as the exposome. This review explores how intrinsic contributors such as genetic susceptibility, immune dysregulation, microbiome alterations, hormonal influences and psychosocial stress intersect with extrinsic triggers like ultraviolet radiation (UVR), air pollution, dietary factors, and climate variability to shape rosacea pathogenesis. Recent advances in single-cell transcriptomics have identified fibroblasts as key components of inflammatory and v
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori (H. pylori) is a spiral-shaped, gram-negative, flagellated bacteria that causes gastritis symptoms. This bacterium, particularly in individuals with a genetic predisposition, has been implicated in the pathogenesis of several autoimmune diseases (AD) through complex mechanisms involving the interaction of cellular and humoral immune responses. This review article tells you about the link between H. pylori infection and several types of AD, including systemic lupus erythematosus (SLE), autoimmune pancreatitis (AIP), rheumatoid arthritis (RA), Sjögren syndrome (SjS), psoriasi
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Множественный склероз (MS) представляет собой сложное иммунное расстройство, на которое влияют генетические, экологические и микробные факторы. Последние исследования были сосредоточены на роли кишечной микробиоты в MS, однако ограниченные исследования были посвящены изучению грибковой микробиоты (mycobiota) в этом контексте. МЕТОДЫ: В этом исследовании мы описали кишечную микобиоту отдельных лиц с MS из страны Басков, выделив конкретные грибковые такси, связанные с факторами риска MS, клинической строгостью и рационом питания.РЕЗУЛЬТАТЫ: Наши результаты показали более высокое разнообразие гри
СтатьяПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Retinitis pigmentosa (RP) is a genetic blinding disease with over 80 causative genes. Disease progression varies between patients with similar genetic backgrounds. We assessed the association between environment, gut microbiota, and retinal degeneration in the RP rat model Royal College of Surgeons (RCS). The rats were born and raised for two generations under specific pathogen-free (SPF, n = 69) or non-SPF conditions (n = 48). At the age of four weeks, SPF rats had significantly shorter dark-adapted a-wave and dark and light-adapted b-wave implicit times by electroretinogram (p = 0.014, p = 9
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования