The escalating severity of global microplastic pollution has triggered significant public health concerns. Polyethylene terephthalate (PET), a ubiquitous plastic constituent, extensively permeates aquatic systems, food chains, and daily living environments. However, its potential long-term health impacts, particularly its association with Non-alcoholic Fatty Liver Disease (NAFLD), remain poorly understood. In this study, we adopted an integrative network toxicology approach combined with multi-omics data and machine learning to systematically elucidate the mechanistic relationship between expo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mesenchymal stem/stromal cells (MSCs) are promising candidates in regenerative medicine, but their effectiveness is significantly influenced by the surrounding metabolic and nutritional conditions. Increasing evidence suggests that lipids act not only as energy sources but also as regulators of MSC fate. This review explores how lipid metabolism influences the balance among stemness, immunomodulation, and differentiation into adipogenic or osteogenic lineages. It does so through mechanisms such as fatty acid uptake, β-oxidation, de novo lipogenesis, and membrane remodeling, all orchestrated by
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology2026eng
Extrahepatic cholangiocarcinoma (eCCA), comprising perihilar and distal cholangiocarcinoma, remains a major diagnostic challenge in the setting of an indeterminate biliary stricture. Definitive diagnosis still relies on histopathological examination of endobiliary samples. However, the diagnostic sensitivity of biopsy and brush cytology remains limited, at approximately 50% despite high specificity. This limitation has driven the development of novel omics-based assays aimed at improving diagnostic accuracy using solid tissue sampling, as well as liquid biopsies derived from blood, bile, or ur
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adult acute lymphoblastic leukemia (ALL) is a highly heterogeneous hematologic malignancy where treatment response and relapse risk do not exclusively rely on the identification of genetic lesions but also on dynamic biological states sustained by specific transcriptional and epigenetic programs. Although the integrated application of multi-omics approaches has significantly expanded our knowledge of oncogenic dependencies, cellular plasticity, and mechanisms of therapeutic resistance, its systematic translation into the clinical practice of adult ALL is yet to become a reality. The aim of thi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As the innate immune barrier, macrophages play an important role in coronavirus infection pneumonia and post-infection regeneration.
OBJECTIVE: Deeper understanding of macrophages can provide additional insights into treatment of coronavirus pneumonia.
METHOD: Single-cell transcriptomic dataset of coronavirus pneumonia (GSE171524) was acquired from GEO database and then underwent hdWGCNA analysis for identified macrophage-associated shared module and differentially expressed genes (DEGs). Next, we also performed Lasso framework in coronavirus pneumonia patient bulk dataset (GSE20
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vaccination is one of the greatest triumphs in human history. Traditionally, vaccines were designed to stimulate antibody responses that block infection, but this overlooks the immune system's complex and multifaceted defence mechanisms. Here we review the current state of the field of systems vaccinology, which has transformed vaccine research by using vaccines as controlled probes of the human immune system and by applying multi-omics and computational approaches to reveal the nature of human immunity. These approaches have identified molecular signatures that predict the magnitude and durab
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advances in spatial multi-omics technologies have opened new avenues for characterizing tissue architecture and function in situ, by simultaneously providing multimodal and complementary information-such as spatially resolved transcriptomic, epigenomic, and proteomic features. Current computational approaches face substantial challenges, such as effective integration of multi-omics molecular information with spatial information and corresponding high-resolution histology images. To address this challenge, we proposed SpaMOAL (Spatially Multi-Omics graph contrAstive Learning), a graph-ba
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heavy metal contamination is a major environmental constraint that negatively affects plant growth, metabolism, and agricultural productivity. Excess metals such as cadmium, lead, and copper disturb cellular functions mainly by inducing oxidative stress, disrupting nutrient balance, and causing toxicity at multiple levels of organization. To cope with these stresses, plants activate complex defense systems, among which melatonin (MT) (N-acetyl-5-methoxytryptamine) has recently emerged as a key regulatory molecule. This review highlights MT's central role in coordinating plant responses to heav
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrated analysis of multi-omics datasets holds great promise for uncovering complex biological processes. However, the large dimensionality of omics data poses significant interpretability and multiple testing challenges. Simultaneous enrichment analysis (SEA) was introduced to address these issues in single-omics analysis, providing an in-built multiple testing correction and enabling simultaneous feature set testing. In this article, we introduce OCEAN, an extension of SEA to multi-omics data. OCEAN is a flexible approach to analyze potentially all possible two-way feature sets from any p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Host-microbiota co-evolution maintains homeostasis via metabolic, immune, and neuroendocrine pathways. Diverse culture media and host cell models are widely used in microbiota research, but how these variables shape host transcriptional responses remains unclear. This study combined metabolomic, transcriptomic, and functional analyses to investigate how microbial culture medium and host cell type influence responses to a gut-derived Staphylococcus hominis isolate.
METHODS: S. hominis was cultured for 96 h in Brain Heart Infusion (BHI) or Gifu Anaerobic Medium (GAM). Culture s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
White-nose syndrome, caused by Pseudogymnoascus destructans (Pd), is a major fungal disease threatening hibernating bats. Cave soils can serve as environmental reservoirs for Pd, yet the microbial and biochemical mechanisms underlying naturally low Pd burdens in some cave environments remain poorly understood. Here, we integrated soil microbiome profiling, metagenomics, metabolomics, multi-omics network analysis, and in vitro validation to investigate the ecological and functional basis of differential Pd loads in hibernating bat caves in Northeast China. The three caves shared cold, humid, an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neoadjuvant chemotherapy (NAC) is a critical therapeutic strategy for locally advanced breast cancer; however, its clinical utility is constrained by tumor heterogeneity and a lack of reliable predictive biomarkers. Integrating single-omics, multimodal, and multi-omics technologies provides comprehensive insights into the tumor biology, while artificial intelligence (AI) facilitates the efficient integration and interpretation of these high-dimensional data.
MAIN BODY: Based on a comprehensive literature search, we review and synthesize existing literature on the progress of AI-dr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleic Acid Therapeutics (NATs), including Antisense oligonucleotides (ASOs), small interfering RNAs (siRNAs), and messenger RNAs (mRNAs), are a rapidly developing class of therapeutics capable of specifically regulating previously considered undruggable and inaccessible genes and pathways for modification by small molecules and antibodies. Despite promising results, the utilization of NATs in clinical practice is complicated by the potential off-target effects, such as activation of the immune response and organ-specific toxicity, which cannot be effectively predicted based solely on primary
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nicorandil, a vasodilator, exhibits potential in improving myocardial blood supply, but its protective mechanism against myocardial ischemia-reperfusion (I/R) injury remains unclear. This study aims to explore the cardioprotective effects of nicorandil on myocardial I/R injury and elucidate its molecular mechanisms, providing a theoretical basis for clinical treatment.
METHODS: Myocardial I/R injury models were established using SPF-grade male Sprague-Dawley (SD) rats, randomly divided into control, I/R, and I/R+Nicorandil groups (n = 6 per group). The I/R+Nicorandil group, nicora
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lentinula edodes is renowned for its unique aroma, which is characterized by various volatile sulfur-containing flavor metabolites (SCFMs). Cysteine and methionine could enhance the SCFMs biosynthesis in L. edodes; however, the underlying metabolic pathways remain unclear. To bridge this gap, integrated proteomic and metabolomic analysis were performed to decipher pathways through which cysteine and methionine regulate SCFM biosynthesis. Results showed that exogenous cysteine and methionine supplementation significantly increased the content of lenthionine, the key aroma compound of shiitake m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study examined the succession of metabolites and microorganisms during the fermentation of Gastrodia elata Blume (GE) and their interrelationships. A total of 739 volatile compounds (VCs) were identified, with four recognized as key VCs: dimethyl disulfide, dimethyl trisulfide, 2-nonenal, and damascenone. The dominant bacteria in the prime fermentation liquid (PFL) and secondary fermentation liquid (SFL) stages exhibited dynamic changes influenced by total acid, total polyphenols, total flavonoids, and pH, with Limosilactobacillus and Acetobacter emerging as the predominant bacteria, resp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding pathological processes is crucial for the diagnosis, prediction and prognostication of kidney diseases. Although progress has been made in non-invasive diagnostic approaches, many pathological processes and diseases mainly manifest in the kidney tissue, necessitating comprehensive analyses of kidney samples. Cellular and molecular analyses of the kidney, including single-cell omics approaches, have identified novel disease mechanisms. However, these non-spatial methods lack information on cellular localization and tissue organization, which is crucial for understanding cell-cell
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marine-derived Streptomyces are among the most prolific producers of structurally diverse and biologically active natural products. Adaptation to unique marine environments, including deep-sea sediments, hydrothermal vents, mangrove ecosystems, marine invertebrates, and hypersaline habitats, has promoted the evolution of specialized biosynthetic systems capable of generating a broad spectrum of secondary metabolites. These metabolites include polyketides, non-ribosomal peptides (NRPs), ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs), terpenoids, alkaloids, and hybrid
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lipid metabolism and fatty acid-derived volatiles (FADVs) are crucial in black tea aroma formation. Herein, dynamic variations of 458 lipids and 59 volatiles during black tea fermentation were investigated by multi-omics using UHPLC-Q-Exactive/MS and GC-MS. 120 lipids and 27 FADVs were predominantly altered during fermentation. Glycerophospholipids and glycoglycerolipids harboring 18:2 and 18:3 fatty acyls were highlighted as potential aromatic precursors. Model experiments using linoleic acid revealed firstly that both non-enzyme auto-oxidation and enzyme oxidation participated in FADVs forma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic lupus erythematosus (SLE) is a clinically and biologically heterogeneous autoimmune disease in which patients with similar or disparate clinical phenotypes can exhibit distinct molecular drivers. This heterogeneity limits the utility of traditional, largely linear, analytic approaches and contributes to variations in diagnosis, prognosis, and therapeutic outcome. Artificial intelligence (AI), including machine learning (ML) and deep learning (DL), offers a complementary framework for extracting nonlinear patterns from complex biomedical datasets and for translating high dimensional mo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.