The immune system mediates the complex interaction between pathogenic microorganisms and their hosts. Despite its significance, the evolutionary mechanisms underlying immune system complexity in primates remain largely elusive. In this study, we investigated the evolution of the primate immune system by generating the first comprehensive catalog of immune-related genes through extensive phylogenomic sampling. Our analyses uncovered substantial genetic diversity in the evolution of the primate immune system, in the form of modules that vary in their sequences and functional capabilities. We ide
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The microtubule-associated protein tau, encoded by the MAPT gene, serves as a major component of the neuronal cytoskeleton, facilitating the assembly, stabilization, and spatial organization of microtubules. Much of the work on tau has focused on the low-molecular-weight (LMW) isoforms abundantly expressed in the central nervous system (CNS) and their pathological aggregation in tauopathies. However, a different variant known as "Big tau", present in the peripheral nervous system (PNS) and selective CNS regions has distinct structural and functional properties and offers a unique perspective o
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Nucleotide-binding leucine-rich repeat (NLR) proteins are major intracellular immune receptors involved in effector-triggered immunity. However, the evolutionary diversity and genomic organization of NLR repertoires remain incompletely characterized in Solanaceae crops and their wild relatives. This study aimed to investigate the pan-NLRome landscape and evolutionary patterns of tomato and related species. Methods: A comparative pan-NLRome analysis was performed across five angiosperms, including cultivated tomato (Solanum lycopersicum) and four related species (Solanum
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DUF4465 family (DUF, domain of unknown function) contains more than 1000 members distributed across eight bacterial clades with species from diverse microenvironments including various gut microbiomes, hydrothermal vents, and soil. In the gut commensal Bacteroides thetaiotaomicron (B. theta), DUF4465 containing proteins act as high-affinity B12-binding proteins that scavenge this cofactor to ensure bacterial survival. Such B12 capture is essential for bacteria that have lost the ability to synthesize B12 de novo. This raises the question of whether B12-binding is ubiquitous across this fam
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
New genes and gene functions are key drivers of evolutionary innovation. Venomous animals, such as cone snails, provide striking examples of gene innovation, yet the mechanisms by which toxins arise remain poorly understood. Using the Conus textile genome, we uncover how neuropeptide genes were recruited into the venom and neofunctionalized as doppelgänger toxins. We identify over 20 independent recruitment events that evolved dynamically across the Conus lineage. Rather than arising from ohnologs of a whole-genome duplication event ∼200 mya, these toxins evolved through diverse mechanisms, in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Horizontal gene transfer (HGT) can accelerate plant adaptation, but the evolutionary fate of newly acquired nuclear genes is often unclear. Here, we analyzed a papain-like cysteine peptidase horizontally transferred from Panicoideae to wild Hordeum (Poaceae). Using chromosome-level assemblies of 21 diploid Hordeum species, we assessed presence/absence, copy-number variation, coding diversity, selection, predicted protein functionality, and expression. To infer donor relationships, we screened 77 Panicoideae accessions (48 species, 20 genera) by polymerase chain reaction and sequenced positive
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolution of plant defensive specialized metabolites often involves repurposing existing primary metabolic pathways for novel roles. However, the relative contribution of changes in protein function versus gene regulation and localization in driving such divergency remains less well understood. Here, we investigate the evolutionary origin of long-branched-chain acylsugars-a class of insecticidal metabolites found in wild tomatoes but absent from their domesticated counterpart. We show that this chemical divergency is enabled by a single enzyme, an acyl-CoA synthetase (SpBACS1), that was re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbial bioconversions are shaped by environmental perturbations and the adaptation of resident microbiomes. Prokaryotes coexist with bacteriophages, yet their coevolutionary trajectories remain underexplored. Here, we investigate the effects of a cultivation vessel leak on an anaerobic consortium performing carbon dioxide reduction. Using time-series shotgun metagenomic sequencing, we reconstruct microbial and viral genomes to track community shifts. We further apply single-nucleotide variant profiling and CRISPR array analysis to monitor viral microdiversity and host defense mechanisms. Af
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Haemosporida is a diverse order of vector-borne apicomplexan parasites infecting terrestrial vertebrates worldwide, including humans, but the evolutionary relationships among its genera remain unresolved. The phylogenetic placement of two bat-restricted genera, Nycteria and Polychromophilus, both of which lack erythrocytic schizogony, has varied across studies depending on taxon sampling and marker choice.
METHODS: To address this problem, an expanded dataset of near-complete mitochondrial (mtDNA) genomes together with nine nuclear loci were analyzed.
RESULTS: Phylogenetic analys
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While sex determination has been extensively studied in animals, the origin and early evolution of sex chromosomes in plants remain poorly understood. Magnolia kwangsiensis, an early-diverging dioecious flowering plant, provides a unique opportunity to investigate sex chromosome evolution at early stages. Here we generated phased chromosome-level genome assemblies for male and female M. kwangsiensis individuals (~2.4-2.5 Gb of 19 chromosomes) and uncovered a nascent XY sex chromosome system. The sex-determining region (SDR) is located on chromosome 4 and spans ~10.4 Mb on the X chromosome and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the most extensively studied segregation distorters is the t haplotype in house mice (Mus musculus), which can have transmission rates as high as 99 in heterozygous males. Numerous t-haplotype variants exist that induce male sterility or cause embryonic lethality when homozygous. Lethal t variants are thought to have evolved through the accumulation of lethal mutations on a sterile background, but theoretical work indicates that this process is plausible only under substantial inbreeding and reproductive compensation. Here, we use a spatially explicit and stochastic individual-based mod
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gorillas have a polygynous social system in which the highest-ranking male has almost exclusive access to females and sires most of the offspring in the troop. Such behavior results in a dramatic reduction of sperm competition, which is ultimately associated with numerous traits that cause low efficacy of gorilla spermatogenesis. However, the molecular basis behind the remarkable erosion of the gorilla male reproductive system remains unknown. Here, we explored the genetic implications of the polygynous social system in gorillas by testing for altered selection intensity across 13,310 ortholog
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many RNA viruses exhibit error-prone replication. Continuous generation of erroneous copies accelerates evolution. Avian leukosis virus subgroup J (ALV-J), an avian oncogenic virus, is a classical model virus for studying retroviruses. ALV-J's high mutation rates drive continuous evolution of its envelope and pathogenicity, posing significant challenges to the poultry industry. Here we employed deep mutational scanning to systematically assess envelope-wide mutation effects on ALV-J replication, integrating high-throughput sequencing with mutant libraries to identify critical envelope residues
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study of genetic diversity has a rich history, as it serves as the foundation upon which evolutionary processes act. Numerous methods have been developed to quantify genetic variation within and among populations. While some methods focus solely on allele frequencies, others assess branching patterns within phylogenetic clades without considering genetic distances. Here we introduce the Proportional Diversity Likelihood Ratio Statistic (PLR), a novel method that integrates genetic distances with phylogenetic tree structure to provide a comprehensive measure of genetic diversity. This metho
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genomic surveillance is central to tracking SARS-CoV-2 evolution, variant replacement, and transmission dynamics. In Senegal, the Institut Pasteur de Dakar generated one of the largest national longitudinal SARS-CoV-2 genomic datasets, offering a unique view of viral spread from the first pandemic wave to the post-Omicron period.
AIMS: This study aimed to reconstruct SARS-CoV-2 evolution and dissemination in Senegal from March 2020 to September 2024, assess variant and Omicron sublineage dynamics, infer introduction and interregional spread patterns, and describe the national muta
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how bacteria rapidly adapt to recently introduced antibiotics increasingly demands experimental models that move beyond classical evolution systems. We developed a microbial evolution hanging-droplet system (MEHS) that uses gravity-driven flow to sustain continuous exponential growth, doubling daily reproduction rate. Using this MEHS, Klebsiella pneumoniae rapidly adapted to fluctuating cefiderocol (CFDC) exposure. However, resistant clones comprised only a minor fraction of the evolved populations. Many mutations overlapped with variants previously observed in clinical practice,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nearly all known cases of antimicrobial resistance have been linked to agents that directly target microbes. This paradigm overlooks other drivers of microbial evolution and resistance. Here, we report compelling evidence of resistance-associated mutations in Pneumocystis jirovecii, a high-priority fungal pathogen designated by WHO as having unknown resistance. These mutations emerged under selective pressure from mycophenolic acid (MPA), a widely used immunosuppressant not used for Pneumocystis pneumonia (PCP) treatment. A potent inhibitor of inosine monophosphate dehydrogenase (IMPDH), MPA h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Given that some DNA viruses have been found to exhibit virus-host co-evolution and establish lifelong infection, mammals with unique evolutionary histories in island ecosystems likely host exceptionally diverse viruses. Madagascar is inhabited by endemic non-human primate and rodent lineages interacting with expansive populations of introduced non-native rodents across the island. Using a viral metagenomic workflow on 189 oral swabs of lemurs and rodents in southeastern Madagascar, we characterized genomic sequences of DNA viruses in the families Adenoviridae, Circoviridae, Orthoherpesviridae,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pyrrhulina australis Eigenmann & Kennedy, 1903, is widely distributed across the main hydrographic basins of South America. The taxonomic integrity of this species is nevertheless challenged by the lack of clear diagnostic characters, its marked geographic variation and the morphological overlap with its congeners. In this context, the present study investigated the genetic diversity of the P. australis group (P. australis, Pyrrhulina marilynae and Pyrrhulina vittata), using sequences of the mitochondrial Cytochrome Oxidase I gene to delimit evolutionary lineages and provide insights into biog
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ancient pathogen DNA from animals elucidates the origin and evolution of infectious diseases.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования