Rising global temperatures threaten male fertility, yet the molecular mechanisms by which heat stress disrupts spermatogenesis remain incompletely understood. We employed an integrative multi-omics approach incorporating transcriptomics, proteomics, and metabolomics to examine the impact of sub-lethal HS (Heat stress) on the testes and spermatozoa of male mice. Our results demonstrated that HS significantly diminished sperm motility and compromised the architecture of seminiferous tubules. Multi-omics integration demonstrated a synchronized downregulation of pathways regulating glycolysis, fla
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic neuroendocrine neoplasms (PanNENs) constitute a heterogeneous group of tumors distinguished by substantial variability in morphology, immunophenotype, molecular characteristics, and clinical behavior. In recent years, the advent of multiple omics-based methodologies has significantly enhanced our understanding of these neoplasms. Integrating histology and genomics with survival analyses has clarified that the fundamental distinction within this disease spectrum lies between well-differentiated neuroendocrine tumors (NETs) and poorly differentiated neuroendocrine carcinomas (NECs). F
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The transition to precision medicine (PM) is revolutionizing healthcare by enabling diagnostics and treatments tailored to individual molecular and genetic profiles, with omics sciences at its core. In Tunisia, growing interest is seen through initiatives such as Personalized Medicine in North Africa (PerMediNA).
METHODS: This study assesses Tunisia's readiness for PM by mapping publicly available omics datasets and related publications using Tunisian human data. A structured search across PubMed and major repositories covered studies published between 2010 and 2023 involving high-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pediatric enuresis is a common developmental disorder involving involuntary nocturnal voiding. This review synthesizes current evidence on its neurodevelopmental, renal, circadian, and genetic underpinnings. Traditional classification into monosymptomatic and non-monosymptomatic forms guides treatment but does not fully capture underlying biological heterogeneity. Genome-wide association studies have identified risk loci on chromosomes 6 and 13, implicating pathways in neuronal signaling, circadian regulation, and renal water handling, though these represent associations rather than proven cau
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epilepsy is a complex central nervous system disease with a high incidence and a significant social health burden. Although there are many antiepileptic drugs, about 30% of patients are insensitive to existing drug treatments, and it is urgently required to identify reliable molecular markers and therapeutic targets. Traditional research has focused on a single omics level, and it is difficult to establish a complete connection from genetic variation to changes in cell function. In this study, a multi-level analysis framework integrating transcriptome, proteome, Mendelian randomization, and si
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Atopic dermatitis (AD) and allergic asthma (AA) frequently co-occur and are a core component of the "atopic march." However, the shared molecular mechanisms linking these conditions, as well as the core comorbid genes with diagnostic value, remain poorly understood.
METHODS: This study integrated differential expression analysis and weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) of bulk RNA sequencing data from AD and AA to identify comorbidity-associated genes. Diagnostic models were built using 8 feature selection algorithms and 175 machine-learning combinations, and then
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Sarcoidosis is a heterogeneous granulomatous disease with highly variable clinical trajectories, yet no validated biomarkers exist to distinguish progressive sarcoidosis (P-sarcoidosis) from non-progressive disease (NP-sarcoidosis). This lack of tractable biomarkers limits early risk stratification and impedes therapeutic decision-making. Preliminary data from our group suggest that P-sarcoidosis and NP-sarcoidosis may be differentiated by blood-derived and peripheral blood mononuclear cell (PBMC)-derived molecular signatures, as well as ex vivo granuloma biogenesis in response t
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Anorexia nervosa (AN) is frequently accompanied by metabolic disturbances and immune dysregulation, yet its peripheral molecular mechanisms and therapeutic targets remain poorly understood. This study integrates multi-omics analyses with experimental validation to investigate causal relationships between circulating metabolites and immune features in AN.
METHODS: Two-sample Mendelian randomization (MR) analyses based on two independent cohorts were conducted to screen metabolism- and immune-related factors associated with AN. Differential expression analysis combined with machine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Moyamoya disease (MMD) features progressive intracranial artery stenosis and collateralization. Growing evidence implicates a dysregulated gut–brain axis in cerebrovascular pathology. We aimed to identify MMD-associated gut microbes and delineate the molecular mechanisms linking intestinal signals to vascular inflammation in MMD. RESULTS: We profiled fecal microbiota using full-length 16S rRNA sequencing from 24 MMD patients and 20 matched controls, prioritizing taxa with LEfSe, LASSO, and random forest algorithms. A species-level diagnostic model showed robust discrimination in ou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Improving meat quality while maintaining growth efficiency remains a major challenge in poultry production. However, the molecular mechanisms underlying breed-specific meat quality variation remain unclear. This study aimed to investigate how breed-specific growth patterns influence meat quality and elucidate metabolic and transcriptional mechanisms involved.
METHODS: Pectoralis major meat quality traits and multi-omics profiles were characterized in three genetically distinct chicken breeds-the fast-growing Small White-Feathered chicken (XBJ), the slow-growing Huiyang Bearded chi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Viral-associated pulmonary aspergillosis (VAPA) is a severe complication of viral pneumonia (VP) that is associated with pronounced inflammatory amplification, immune dysregulation, and increased mortality. However, systemic metabolic and immune response patterns accompanying VAPA remain incompletely understood.
METHODS: Plasma samples were obtained from 35 patients with viral pneumonia (VP group) and 20 with viral-associated pulmonary aspergillosis (VAPA group). An integrated multi-omics strategy combining data-independent acquisition (DIA)-based proteomics and untargeted metabol
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mandarin fish, as an obligate piscivore, is highly dependent on live bait, which restricts its intensive aquaculture. Although domestication has enabled it to partially accept formulated diets, the tissue-specific molecular adaptation mechanisms of its digestive tract to artificial feed remain unclear. In this study, we conducted an integrated analysis of mandarin fish fed with live bait or artificial diet for three weeks, combining growth performance evaluation, gastric histology, and paired transcriptomic and metabolomic analyses of the stomach and pyloric ceca. AD feeding significantly
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study used multi-omics technologies to analyze aroma formation during Congou black tea fermentation. Volatile compounds were analyzed by headspace solid phase microextraction coupled with gas chromatography mass spectrometry using two columns of different polarity. Fermentation increased total volatile normalized peak area fivefold, with alcohols, aldehydes, and acids increasing over sevenfold. 29 differential metabolites were screened, including amino acid derived phenylacetaldehyde, phenylethanol, and 2-methylbutanal; fatty acid derived (E,E)-2,4-heptadienal, hexanal, and 1-hexanol; and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Jiaoke is a traditional fermented dairy product from Inner Mongolia, China, and its characteristic flavor and quality attributes are shaped by region-specific microbial communities. In this study, shotgun metagenomic sequencing combined with untargeted metabolomics was used to systematically characterize Jiaoke samples collected from three distinct ecological production regions: Hulun Buir (HLB), Xilingol (XLG), and Bayan Nur (BYN). The results demonstrated pronounced regional specificity in both microbial composition and metabolite profiles across the three regions. BYN samples were dominated
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: This review investigates how advances in breath testing (BT), small bowel (SB) culture, metagenomics, metatranscriptomics, transcriptomics and proteomics are reshaping the definition and diagnosis of small intestinal bacterial overgrowth (SIBO). It also discusses whether SIBO should be redefined as part of a larger group of microbial overgrowth syndromes.
RECENT FINDINGS: Recent studies identify distinct hydrogen-, methane-, and hydrogen sulfide-associated overgrowth phenotypes, termed SIBO, intestinal methanogen overgrowth (IMO), and intestinal sulfide overproduction (ISO)
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ascaris roundworms impair human and swine health. While treatments using anthelmintic drugs are generally effective in eliminating worms, their effects on the gut microenvironment remain poorly understood. Here we applied integrated multi-omics to characterize infection- and treatment-associated alterations in the pig-Ascaris system. In vitro anaerobic cultures were conducted as supportive validation of selected observations. Ascaris suum infection altered microbial composition and dysregulated 182 serum and fecal metabolites, including histamine and p-cresol sulfate. Compared with time-matche
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ovarian cancer (OV) is a highly lethal gynecological malignancy with limited effective biomarkers for prognosis and precision immunotherapy. B and T lymphocyte attenuator (BTLA) is an immune checkpoint molecule involved in tumor immune regulation, but its role in OV remains unclear.
METHODS: Transcriptomic data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) were analyzed to evaluate BTLA expression and its potential clinical relevance in OV. Exploratory multivariable Cox regression analysis was performed to examine the association between BTLA expression and patient prognosis. Functional cha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The number and size of multi-omics datasets with paired measurements of the host and microbiome is rapidly increasing with the advance of sequencing technologies. As it becomes routine to generate these datasets, computational methods to aid in their interpretation become increasingly important. Here, we present a framework for integration of microbiome multi-omics data: Latent Interacting Variable Effects (LIVE) modeling. LIVE integrates multi-omics data using single-omic latent variables (LV) organized in a structured meta-model to determine the combinations of features most pred
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal cord injury (SCI) initiates a cascade of complex secondary damage processes, prominently involving programmed cell death (PCD). Although apoptosis and necroptosis have been extensively characterized, the role of oncosis in SCI remains inadequately understood. In this study, we examined the expression dynamics and cellular localization of oncosis-related genes (ORGs) following SCI. We conducted an analysis of bulk RNA-seq data to identify differentially expressed ORGs at five distinct time points post-injury. Six candidate genes (Trp53, Casp3, Jun, Tmem123, Chmp6, Map2) were identified b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Despite the increasing body of evidence that autophagy implicate in intrahepatic cholestasis of pregnancy (ICP), we are still far from a mechanistic understanding of the autophagy in ICP pathogenesis.
METHODS: In this study, we performed untargeted lipidomics, scRNA-seq, and RNA-seq data to systematically demonstrate the lipid alterations, cells and gene expression closely related to autophagy in placenta. These results were also verified by tissue, cell, and animal experiments.
RESULTS: We confirmed that autophagy played a pivotal role in ICP, autophagy-related lipids includin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.