OBJECTIVES: Several direct-acting agents against the hepatitis C virus (HCV) NS3 protease and NS5b polymerase have been developed in recent years to improve treatment of this viral infection. Of these, simeprevir is currently recommended for HCV genotype 1 and 4 infections, but genotypic assessment for the presence of 80K is required prior to simeprevir administration due to the reduced susceptibility of genotype 1 viruses carrying that polymorphism. Because the prevalence of 80K at baseline in genotype 1 viruses varies between reports, we wanted to assess its worldwide prevalence.
METHODS: O
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Chronic hepatitis C virus (HCV) infection is one of the leading causes of liver failure and liver cancer, affecting around 3% of the world's population. The extreme sequence variability of the virus resulting from error-prone replication has thwarted the discovery of a universal prophylactic vaccine. It is known that vigorous and multispecific cellular immune responses, involving both helper CD4(+) and cytotoxic CD8(+) T cells, are associated with the spontaneous clearance of acute HCV infection. Escape mutations in viral epitopes can, however, abrogate protective T-cell responses,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Germ cell number during ovarian organogenesis is regulated through programmed cell death. We investigated the expression of germ-cell-specific VASA protein, apoptosis-related proteins BAX and BCL-2 and DNA fragmentation in developing human ovaries from gestation week 12 to term.
METHODS: Human fetal ovaries from 13 women undergoing spontaneous abortion were fixed, paraffin-embedded and processed for immunohistochemistry to analyse temporal and cellular localization of VASA, BCL-2 and BAX, and to detect apoptosis by TUNEL assay.
RESULTS: VASA showed a differential pattern of expre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: ADAR1 (adenosine deaminase acting on RNA 1) catalyzes the conversion of adenosine to inosine in double stranded RNAs (dsRNAs), which is critical to prevent autoinflammatory responses mediated by activation of the type I IFN (interferon) signaling. We define the role of ADAR1-dependent RNA editing in IFNβ activation in pulmonary arterial smooth muscle cells (PASMCs) from idiopathic pulmonary arterial hypertension (IPAH), a devastating disease leading to right heart failure and death.
METHODS: RNA editing levels were analyzed in PASMCs from IPAH patients versus healthy controls. A c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CSA and CSB proteins are key players in transcription-coupled nucleotide excision repair (TC-NER) pathway that removes UV-induced DNA lesions from the transcribed strands of expressed genes. Additionally, CS proteins play relevant but still elusive roles in other cellular pathways whose alteration may explain neurodegeneration and progeroid features in Cockayne syndrome (CS). Here we identify a CS-containing chromatin-associated protein complex that modulates rRNA transcription. Besides RNA polymerase I (RNAP1) and specific ribosomal proteins (RPs), the complex includes ferrochelatase (FECH),
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrial cancer remains the most common gynecological malignancy in the United States. While the loss of the tumor suppressor, PTEN (phosphatase and tensin homolog), is well studied in endometrial cancer, recent studies suggest that DICER1, the endoribonuclease responsible for miRNA genesis, also plays a significant role in endometrial adenocarcinoma. Conditional uterine deletion of Dicer1 and Pten in mice resulted in poorly differentiated endometrial adenocarcinomas, which expressed Napsin A and HNF1B (hepatocyte nuclear factor 1 homeobox B), markers of clear-cell adenocarcinoma. Adenocarc
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory signaling is required for hematopoietic stem and progenitor cell (HSPC) development. Here, we studied the involvement of RIG-I-like receptors (RLRs) in HSPC formation. Rig-I or Mda5 deficiency impaired, while Lgp2 deficiency enhanced, HSPC emergence in zebrafish embryos. Rig-I or Mda5 deficiency reduced HSPC numbers by inhibiting inflammatory signals that were in turn enhanced in Lgp2 deficient embryos. Simultaneous reduction of Lgp2 and either Rig-I or Mda5 rescued inflammatory signals and HSPC numbers. Modulating the expression of the signaling mediator Traf6 in RLR deficient em
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alu sequences are the most abundant short interspersed repeated elements in the human genome. Here we show that in a cell culture model of colorectal cancer (CRC) progression, we observe accumulation of Alu RNA that is associated with reduced DICER1 levels. Alu RNA induces epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) by acting as a molecular sponge of miR-566. Moreover, Alu RNA accumulates as consequence of DICER1 deficit in colorectal, ovarian, renal and breast cancer cell lines. Interestingly, Alu RNA knockdown prevents DICER1 depletion-induced EMT despite global microRNA (miRNA) downregulatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the fact that alveolar macrophages play an important role in smoking-related disease, little is known about what regulates their pathophysiologic phenotype. Evaluating smoker macrophages, we found significant down-regulation of multiple microRNAs (miRNAs). This work investigates the hypothesis that cigarette smoke alters mature miRNA expression in lung macrophages by inhibiting processing of primary miRNA transcripts. Studies on smoker alveolar macrophages showed a defect in miRNA maturation. Studies on the miRNA biogenesis machinery led us to focus on the cytosolic RNA endonuclease, D
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ocular neovascularization is a vision-threatening complication of ischemic retinopathy that develops in various ocular disorders, such as retinopathy of prematurity (ROP) and diabetic retinopathy. Both Ang-2 and VEGF are implicated in this pathogenesis. However, their inter-regulation still remains elusive. Competitive endogenous RNAs (ceRNAs) are messenger RNA (mRNA) molecules that affect each other expression through the competition for the shared miRNA. Herein, we assessed whether the expression of Ang-2 and VEGF is interdependent through the sequestration of common miRNAs. Bioinformatics p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Dysregulation of microRNA (miRNA) metabolism has been observed in a variety of human cancers, but the expression patterns of the enzymes responsible for generating miRNAs remain largely unexplored. In this study, we investigated the expression profiles of the two most important enzymes of the miRNA machinery, Drosha and Dicer, which were closely correlated with nasopharyngeal carcinoma (NPC) and patient survival.
METHODS: Dicer and Drosha mRNA levels were detected by quantitative real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (qRT-PCR) using 24 NPC tissues, 7 normal nasoph
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human primordial germ cell-like cells (hPGCLCs) can be specified from human-induced pluripotent stem cells (hiPSCs), offering a valuable model for human germ cell development. However, further maturation steps of hPGCLCs rely on mouse feeders, or co-culture with mouse gonadal somatic cells. Exposure of hPGCLCs to human cellular niche has not been attempted. Here, we co-cultured female hPGCLCs in two distinct niche compartments. In reconstituted fetal ovary (rOv) culture, human fetal germ cells proliferated and initiated meiosis, while hPGCLCs upregulated gonadal germ cell markers such as DDX4.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DDX41 mutations are associated with myeloid neoplasms, including myelodysplastic syndrome (MDS) and acute myeloid leukemia (AML), and missense mutant R525H is seen in 67% of patients; however, its molecular pathogenesis is unknown. Using DDX41 knockout (KO) cells, we found that these cells were sensitive to bleomycin, camptothecin, and UV. DDX41 deficiency led to increased genomic instability, indicated by elevated DNA double-strand breaks (DSBs) and comet tails. We found that R-loop formation increased in DDX41-KO cells. DDX41 wild-type (WT) protein resolved DNA:RNA hybrid of R-loops in vitro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The coexistence of BRAFV600E and telomerase reverse transcriptase (TERT) promoter alterations has been reported to cooperatively upregulate TERT expression and is well recognized as a biomarker for aggressive thyroid cancer. However, the mechanism underlying their synergistic effect remains elusive.
METHODS: TERT-interacting proteins were identified via immunoprecipitation (IP) and mass spectrometry and validated by Co-IP. DDX21 expression was detected in 60 paired thyroid cancer and adjacent normal tissues, and the function of DDX21 in thyroid cancer was explored in vitro and in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Small cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic type (SCCOHT) is a rare, aggressive cancer affecting young women driven by inactivating mutations in SMARCA4, a key SWI/SNF chromatin remodeling gene. To uncover its druggable vulnerabilities, we performed a compound screen and found that SCCOHT cells and tumors were sensitive to PARP inhibitors. Paradoxically, SCCOHT displayed BRCA-deficient traits despite retaining wild-type BRCA1 expression. Elevated R-loop in SCCOHT sequestered BRCA1, limiting its availability for DNA damage repair. Proximity-dependent biotin identification revea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aimed to investigate the prevalence and cytological features of Dicer 1, Ribonuclease III (DICER)-mutant fine-needle aspiration (FNA) specimens in thyroid nodules classified as Bethesda II, III, and IV categories. The authors also sought to explore the relationship between DICER1 and BRAFV600E mutations in Bethesda III thyroid nodules.
METHODS: The authors collected a series of consecutive FNA cases diagnosed as Bethesda category II, III, and IV from a medical center over the course of 1 year. DICER1 exons 24 and 25 and TERT promoter mutations were detected by Sanger se
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleotide-bound crystal structures of SARS-CoV-2 NSP13 in ADP- and ATP-bound states were resolved to 1.8 and 1.9 Å, respectively. The ADP-bound model captures a state immediately following ATP hydrolysis, with both ADP and orthophosphate still present in the active site. Further comparative analysis revealed that crystal packing influences NSP13 by stabilizing the nucleotide-binding site, underscoring the importance of accounting for these effects in structure-based drug design targeting NSP13.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flaviviruses are the causative agents of viral hemorrhagic fever (VHF) globally and have demonstrated the capacity to result in fatal outcomes if not managed effectively. Among different types of flaviviruses, dengue (DENV) and Japanese encephalitis (JEV) viruses are the most common in tropical and subtropical countries. While vaccines have been developed and licensed for both DENV and JEV, effective treatment options remain sparse. Hence, there is a pressing need to develop small molecules that can target machineries crucial for virus replication and remain conserved across different flavivir
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DICER1 mutations, though infrequent, are encountered on preoperative molecular testing of indeterminate adult and pediatric thyroid fine-needle aspiration (FNA) specimens. Yet, published cytomorphologic features of DICER1-altered thyroid lesions are limited. Cytomorphological features of DICER1-altered thyroid lesions were examined in a multipractice FNA cohort with clinical, radiological, and histologic data.
METHODS: The cohort comprised 18 DICER1-altered thyroid FNAs, with 14 having slides available and eight having corresponding surgical resections. Smears, ThinPrep, and forma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A small subset of testicular sex cord-stromal tumors, designated as Sertoli-stromal cell tumors (SSCTs), comprises a mixture of Sertoli, spindle, and/or Leydig cells. The clinicopathologic features of these tumors have not been studied in any detail, and their molecular features are unknown. We, therefore, assessed the morphologic and genomic features of 14 SSCTs, including 1 tumor with features similar to the ovarian Sertoli-Leydig cell tumor (SLCT) with retiform tubules. The median age of the patients was 24 years (range, 10-55 years), and the median tumor size was 2.3 cm (range, 0.7-4.7 cm)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.