Nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) serves as a critical cofactor in redox reactions and metabolic transformations catalyzed by NAD-dependent enzymes and is essential for bacterial survival and virulence. The biosynthesis of NAD+ in the cariogenic pathogen Streptococcus Sobrinus (S. sobrinus), a pivotal participant in oral cavities of children and adolescents with a history of caries, has yet to be explored. Bioinformatics, genetics, and biochemical techniques were used to identify NAD+ biosynthesis pathways and corresponding regulator in S. Sobrinus. S. sobrinus lacks de novo NAD+ synthe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa is a model organism for studying social behaviors in bacteria, such as the exploitation of exoprotease by social cheaters. The current paradigm holds that continuous culture of exoprotease-producing individuals with protein as the sole carbon source selects for exoprotease non-producers mutants with an impaired quorum-sensing regulator, LasR, which controls exoprotease expression. However, recent studies reveal that some isolates lacking functional LasR still produce exoproteases under the control of another regulator, RhlR. Here, we extended this study to two clinical s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus aureus is a Gram-positive pathogen that causes life-threatening infections. Its cell envelope contains anionic polymers called teichoic acids that are required for cell viability. Teichoic acids come in two forms and are made by different biosynthetic pathways. One form, lipoteichoic acid (LTA), is anchored in the cell membrane; the other form, wall teichoic acid (WTA), is covalently linked to the peptidoglycan cell wall. Although the LTA and WTA biosynthetic pathways have been characterized, regulation of teichoic acid production is not well understood. Here, we identified SpbR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The antibiotic resistance of pathogenic bacteria is currently one of the major problems in medicine, and finding novel antibacterial agents is one of the most difficult tasks in the field of biomedical sciences. Studies on such tasks can be successful only if genetic and molecular mechanisms leading to antibiotic resistance/sensitivity are understood. Previous reports indicated that the bacterial protein Hfq, discovered as an RNA chaperone but subsequently demonstrated to play also other functions in cells, is involved in the mechanisms of the response of bacterial cells to antibiotics. Recent
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitric oxide (NO) and the greenhouse gas (GHG) nitrous oxide (N2O) contribute significantly to climate change. In rhizobia, the denitrifying enzyme c-type nitric oxide reductase (cNor), encoded by norCBQD genes, is crucial for maintaining a delicate balance of NO and N2O levels. In the soybean endosymbiont Bradyrhizobium diazoefficiens, maximal expression of norCBQD genes in response to NO is controlled by NnrR, which belongs to a distinct clade of the CRP/FNR family of bacterial transcription factors. This protein participates in the FixLJ-FixK2-NnrR regulatory cascade that induces denitrific
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Dental caries is a globally chronic disease, with Streptococcus mutans (S. mutans) identified as a principal cariogenic pathogen due to its multifaceted virulence attributes. Understanding the molecular regulation of S. mutans cariogenic virulence is critical for advancing targeted prevention and therapeutic strategies. The objective of this study is to map the research trajectory and future trends in molecular regulation of S. mutans cariogenic virulence.
METHODS & METHODS: This study conducted a comprehensive bibliometric and scientometric analysis of 470 publications from 1994 to 202
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The pathogenic bacterium Chlamydia reproduces via two specialized forms inside a eukaryotic host cell. The dividing form called the reticulate body (RB) must convert at late times into the infectious elementary body (EB) for spread to new host cells. Late genes are a temporal class of chlamydial genes believed to be responsible for RB-to-EB conversion, but late gene regulation is incompletely understood. In this study, we used chromatin immunoprecipitation (ChIP) to investigate two alternative sigma factors, σ28 and σ54, that alter the promoter specificity of Chlamydia trachomatis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis are tenacious pathogens that cause toxic shock syndrome. Accessory gene regulator (Agr) of Staphylococcus sp. controls the expression of multiple genes that encode virulence properties. Evolutionary covariance of accessory gene regulators of selected strains of two Staphylococcus sp. was entrenched through multiple sequence alignment, relative synonymous codon usage, codon adaptation index and compositional analysis. Artificial intelligence and machine learning based AlphaFold and TrRosetta were used to determine the tertiary str
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To efficiently and accurately understand, detect, and treat sepsis, we require a deep understanding of how its underlying biological systems work. Conventional methods struggle to provide a detailed view of both the functional and regulatory elements orchestrating a system-wide response to pathogenic infection. Our approach was to use a streamlined process: First, we used multi-omics integration to create a functional-omics signature at the single molecule level, employing sparse Partial Least Squares Discriminant Analysis (sPLSDA). Then, we turned to genome Natural Language Processing (genome
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas is an adaptive immune system that protects prokaryotes from the invasion of foreign genetic elements. The components and immunity mechanisms of CRISPR-Cas have been extensively studied, but the regulation of this system in Staphylococci remains unclear. Here, it is shown that the cell-cell communication, known as quorum sensing (QS), inhibits the expression and activity of the type III-A CRISPR-Cas system in S. aureus. The QS regulator, AgrA, directly binds to the promoters of two transcriptional regulators encoding the genes sarA and arcR to inhibit their expression. However, both
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular chaperones are critical for protein homeostasis. In bacteria, chaperone trigger factor (TF) folds proteins co-translationally, and chaperone DnaK requires a J-domain cochaperone and nucleotide exchange factor GrpE to fold proteins largely post-translationally. However, when the pathogen Salmonella enterica serovar Typhimurium faces the infection-relevant condition of cytoplasmic Mg2+ starvation, DnaK reduces protein synthesis independently. This raises the possibility that bacteria differentially express chaperones and cochaperones. We now report that S. Typhimurium responds to cytop
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Typhi (S. Typhi) is the etiological agent of typhoid fever in humans. The genomic organization of this bacterium shows the presence of 41 LysR-Type transcriptional regulators (LTTRs). Remarkably, 23 of these LTTRs have orthologous proteins in different bacterial species where they have been characterized. However, the remaining 18 LTTRs are annotated as hypothetical proteins and their role is not described yet. In this work we report the role of these 18 proteins. We show that these transcriptional factors contain the two domains characteristic of the LTTR family. F
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Seemingly simple bacteria mount intricate adaptive responses when exposed to physical stress or nutrient limitation, and the activation of these responses is governed by complex signal transduction networks. Upon entry into the stationary growth phase, the soil bacterium Bacillus subtilis may develop natural competence, form biofilms or stress-resistant cells, or ultimately trigger a cellular differentiation program leading to spore formation. Master regulators, such as Spo0A, ComK, SinR, and SigB, constantly monitor the bacterium's environment and then determine appropriate adapti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sulfur, a critical element for bacterial growth, is not directly utilized by bifidobacteria, rendering the sulfur-containing amino acid biosynthesis pathway, particularly for cysteine and methionine, poorly understood. This research identifies six genes involved in this pathway through re-annotation of the Bifidobacterium longum DJO10A genome. These genes play crucial roles in bioconversion processes essential for cysteine utilization, highlighting its significance in sulfur metabolism. Our study uncovers a novel regulatory mechanism of these pathways under varying cysteine concentrations. We
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycerol utilization as a carbohydrate source by Borreliella burgdorferi, the Lyme disease spirochete, is critical for its successful colonization and persistence in the tick vector. The expression of the glpFKD (glp) operon, which encodes proteins for glycerol uptake/utilization, must be tightly regulated during the enzootic cycle of B. burgdorferi. Previous studies have established that the second messenger cyclic di-GMP (c-di-GMP) is required for the activation of glp expression, while an alternative sigma factor RpoS acts as a negative regulator for glp expression. In the present study, we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The causative agent of Legionnaires' disease, Legionella pneumophila, is an environmental bacterium, that replicates in macrophages, parasitizes amoeba, and forms biofilms. L. pneumophila employs the Legionella quorum sensing (Lqs) system and the transcription factor LvbR to control various bacterial traits, including virulence and biofilm architecture. LvbR negatively regulates the nitric oxide (NO) receptor Hnox1, linking quorum sensing to NO signaling. Here, we assessed the response of L. pneumophila to NO and investigated bacterial receptors underlying this process. Chemical NO
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is the bacterium responsible for causing Tuberculosis (TB) and understanding its mechanisms of virulence, persistence, and pathogenesis is a global research priority. Attenuated strains of Mtb are valuable tools for investigating the genes and proteins involved in these processes. In this study, we identified an Mtb mutant, H37Rv-S, which exhibits a shorter mycelium, smoother colony, slower growth, and reduced antibiotics resistance compared to the wild-type strain H37Rv. Genomic sequencing revealed 34 mutation events in the coding regions of H37Rv-S, affecting
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ECF (extracytoplasmic function) σ factors, members of the σ70-family, are the largest class of alternative σ factors which are stimulated in the presence of specific signals and direct RNA polymerase to transcribe a defined subset of genes. Thanks to them, bacterial pathogens can effectively reprogram their gene expression and, consequently, survive in the host and establish infection in a relatively short time. The number of ECF σ factors encoded within bacterial genomes is different depending on a given species and it reflects the likelihood that these bacteria will encounter harsh environme
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several bacterial pathogens, including Salmonella enterica, can cause persistent infections in humans by mechanisms that are poorly understood. By comparing genomes of isolates longitudinally collected from 256 prolonged salmonellosis patients, we identified repeated mutations in global regulators, including the barA/sirA two-component regulatory system, across multiple patients and Salmonella serovars. Comparative RNA-seq analysis revealed that distinct mutations in barA/sirA led to diminished expression of Salmonella pathogenicity islands 1 and 4 genes, which are required for Salmonella inva
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gamma-proteobacteria is a class of gram-negative opportunistic pathogens existing in the intestinal flora, often leading to diarrhea and intestinal infectious diseases, and plays an important role in maintaining intestinal homeostasis. Type III secretion system (T3SS), an important virulence system, is closely related to the adhesion and invasion and pathogenicity to host cells. Therefore, anti-virulence agents targeting T3SS are important strategies for controlling pathogenic infections. In this study, the anti-Salmonella T3SS active compounds neochebulagic acid (1), ellagic acid (2) and urol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования