Catalase activity of the dual-function heme enzyme catalase-peroxidase (KatG) depends on several structural elements, including a unique adduct formed from covalently linked side chains of three conserved amino acids (Met-255, Tyr-229, and Trp-107, Mycobacterium tuberculosis KatG numbering) (MYW). Mutagenesis, electron paramagnetic resonance, and optical stopped-flow experiments, along with calculations using density functional theory (DFT) methods revealed the basis of the requirement for a radical on the MYW-adduct, for oxyferrous heme, and for conserved residues Arg-418 and Asp-137 in the r
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
New compounds containing a novel zinc-binding group (1-hydroxypiperazine-2,6-dione, HPD) have been identified as effective inhibitors of matrix metalloproteinases (MMPs), with activities in the nanomolar concentration range. That moiety seemed to bind the catalytic zinc ion of MMPs, revealing itself as a new potential substitute for the hydroxamate group in the next generation of metalloproteinase inhibitors. The X-ray crystal structure of 1b elucidated its 3D conformation and supramolecular packing in solid state. Theoretical procedures were used to investigate the binding mode of this class
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ground and excited electronic states in highly symmetric systems typically possess high degrees of spatial degeneracy as a consequence of point-group symmetry. However, many current quantum-chemical methods struggle to accurately describe the strong correlation effects inherently present in these states, thereby precluding the ability to obtain meaningful insights into the electronic structure of the underlying systems. Consequently, many of their important chemical and spectroscopic properties cannot be reliably computed and predicted. In this article, a new theoretical framework is described
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The theoretically predicted Chern insulators have highlighted the potential of easy-axis kagome ferromagnets to host the quantum anomalous Hall effect. Similar topological phases may also arise from in-plane ferromagnetism through the breaking of certain mirror symmetries in kagome materials. In this work, we show that the interplay between magnetism and mirror symmetries makes ferromagnetic kagome systems a versatile platform for realizing nontrivial topological phases, with the orientation of magnetic momentsm^(θ,ϕ)at lattice sites serving as a key tuning parameter. We construct a symmetry-a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structure of the aqueous electron, e-(aq), has been the focus of intense scrutiny from both theory and experiment. The temperature dependence of its g-factor, measured via electron paramagnetic resonance and shifted significantly from the free-electron value, has been suggested to be inconsistent with the conventional picture of an electron localized in a solvent void or "cavity". Here, we use ab initio molecular dynamics simulations and quantum chemistry calculations to compute the ensemble-averaged, isotropic g-factor for e-(aq) over the entire temperature range of liquid water. A temper
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Centrifugal distortion constants provide a key link between high-resolution rotational spectroscopy and quantum-chemical rovibrational calculations. Within Watson's Hamiltonian, the underlying structure is described in terms of tensorial objects, whereas fitted spectroscopic parameters become representation-dependent upon projection, complicating direct comparison between experiment and theory. Building on the tensorial formulation of centrifugal distortion, we show that standard quartic and sextic constants can be consistently described within a representation-independent linear tensor sector
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantum mechanical calculations are widely used to interpret experimental data in chemical and biochemical research, supported by user-friendly software and powerful computing resources. Their broad adoption, including by nonexperts, can lead to overinterpretation when calculations fail to achieve the required structural resolution. Chiroptical spectroscopy is a classic example: the absolute configuration (AC) assignment protocol relies entirely on density functional theory (DFT) calculations, so the reliability of the prediction is directly affected by the computational accuracy. We present a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite their huge technological interest, practical application of MXene nanomaterials is somehow hampered by their potential toxicity. In this regard, the present work showcases the design and implementation of a full in-silico methodology for the toxicological analysis of nanoparticles (NPs) of two MXenes within a human cell environment, employing cost-effective computational approaches to achieve a preliminary hazard estimation in the absence of experimental data. This study combines computational methodologies of very different nature, from Density Functional Theory (DFT) calculations for
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intravenous injection of engineered material dispersions into the bloodstream of laboratory animals has been a popular method for in vivo immunosuppression. It is also one of the primary approaches for delivering immunosuppressive and anti-inflammatory drugs within the early stages of donor cell/organ transplantation. Due to their systemic interaction with blood circulation and immune cells, the administration is reported to act effectively in suppressing host immune responses. Recent studies on immunomodulatory nanomaterials, including MXenes, have reported their potential for immunosuppressi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Supramolecular chemistry has traditionally focused on noncovalent interactions where p-block elements act as electron acceptors via σ-hole o … ature of these interactions is further characterized using the energy decomposition analysis (EDA), quantum theory of atoms in molecules (QTAIM), and natural bond orbital (NBO) analysis, confirming the significant charge transfer from the metal dz2 orbital to the triel acceptor. Additionally, a search of the Cambridge Structural Database (CSD) provides experimen …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aggregation-induced emission (AIE) has recently attracted considerable attention. Although phosphorescent transition-metal complexes exhibit significant potential as aggregation-induced emission luminogens (AIEgens), their exploration and utilization have remained limited, partly due to the insufficient understanding of the underlying mechanisms. Here, we report a new series of platinum(II) complexes, trans-bis(2-iminomethylpyrrolato)platinum derivatives (1a-d), which feature vaulted polymethylene chains of varying lengths (n = 9-12) that bridge over the metal atom. Notably, racemic complexes
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pharmaceutical residues in the environment and their transformation mechanism are important challenges in environmental pollution research. The present study investigated the transformation mechanisms and reaction kinetics of oxazepam, a representative of benzodiazepine pharmaceutical, with two typical water treatment oxidants including HOCl and ∙OH in aqueous solution through theoretical calculations and experimental verification. The results showed that oxazepam is a chiral molecule with two enantiomers in equal proportions. The reactions between oxazepam and HOCl can be classified into Cl-s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Along with the synthetic process optimization of 3-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazole-2-yl)sulfanyl]-1,2-benzothiazole 1,1-dioxide (MTSB), a selective copper chelator with potential interest in cancer chemotherapy, the unprecedented isolation of a novel compound, 3-(1,1-dioxidobenzo[d]isothiazol-3-yl)-5-methyl-1,3,4-thiadiazole-2(3H)-thione (BMTT), evidenced an unexpected reactivity of the starting 5-methyl-1,3,4-thiadiazole-2-thiol. To shed light into the reaction mechanisms, quantum chemical calculations were conducted at the M06-2X/def2-TZVPP/PCM(THF)//M06-2X/6-31++G(d,p) level of theory. The res
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of carbazolylpyridine (cp)-based 6/5/6 Pt(II) complexes featuring tetradentate ligands with nitrogen or oxygen atoms as bridging groups was designed and synthesized, and the bridging nitrogen atoms were derived from acridinyl (Ac), azaaceridine (AAc) and carbazole (Cz). Systematic experimental and theoretical studies reveal that the ligand structures have a significant effect on the electrochemical, photophysical and excited state properties of these complexes. Their oxidation processes mainly occur on the carbazole-Pt moieties, whereas the reduction processes typically occur on the e
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The kagome lattice is one of the most intriguing topics to study. It has a frustrated flat band touching a set of Dirac bands and can possess various promising properties, such as ferromagnetism, superconductivity, and a non-trivial topology. Covalent organic frameworks (COFs) are a rare type of inorganic material, however, they can provide a platform for generating certain required lattices. Based on first-principles density functional theory calculations, we show that a newly synthesized two-dimensional COF named COF-SH has novel enantiomorphic kagome bands, which include two sets of flat ba
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this computational study, density functional theory (DFT) and time-dependent DFT methods (TD-DFT) were employed to study the optical properties of six families of molecules with donor (D), bridge (B), and acceptor (A) fragments that have potential for use as fluorescent molecular probes for the early detection of Alzheimer's disease. After validating our computational method against experimental data, using X-ray and absorption data, the equilibrium geometries and wave functions of the ground and first singlet excited states were systematically studied. Our simulations demonstrate that the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In pursuit of enhancing the stability of the highly explosive and shock-sensitive compound XeO3, we performed quantum chemical calculations to investigate its possible complexation with electron-rich crown ethers, including 9-crown-3, 12-crown-4, 15-crown-5, 18-crown-6, and 21-crown-7, as well as their thio analogues. Furthermore, we expanded our study to other noble gas trioxides (NgO3), namely, KrO3 and ArO3. The basis set superposition error (BSSE) corrected interaction energies for these adducts range from -13.0 kcal/mol to -48.2 kcal/mol, which is notably high for σ-hole-mediated noncoval
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Cu-O-Cu core exhibits methane-to-methanol conversion, mirroring the reactivity of the copper-containing enzyme pMMO. Herein, we computat … nversion, we employed distortion-interaction analysis, orbital analysis, spin density analysis, and quantum theory of atoms in molecules analysis. Orbital analysis reveals that all four adducts follow a hydrogen atom transfer mechanism for C-H activation. Further, spin density analysis reveals that a higher spin density on the bridging oxygen leads to a lower C- …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The atmospheric and aqueous ozonolysis of metazachlor (MTZ) is investigated using high-level quantum chemical and kinetic calculations (M06-2X/6-311 + + G(3df,3pd)//M06-2X/6-31 + G(d,p) level of theory). The ozone (O3)-initiated degradation pathways of MTZ under three different mechanisms, namely cycloaddition, oxygen-addition, and single electron transfer (SET), are explored in the temperature range of 283-333 K and 1 atm pressure. As a result, the cycloaddition reaction at the C16C18 double bond of the benzene ring of MTZ is found to be the most dominant channel in the atmosphere with the s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study presents a detailed density functional theory (DFT) investigation into the mechanism and energetics of C-H activations catalyzed by bioinspired Fe(IV)O complexes, particularly in the presence of N-hydroxy mediators. The findings show that these mediators significantly enhance the reactivity of the iron-oxo complex. The study examines three substrates with varying bond dissociation energies─ethylbenzene, cyclohexane, and cyclohexadiene─alongside the [Fe(IV)O(N4Py)]2+ complex. Mediators N-hydroxyphthalimide (NHPI) and N-hydroxyquinolinimide (NHQI) were chosen for their strong oxidativ
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования