Coeliac disease (CD) is a chronic autoimmune disease that is characterized by malabsorption in sensitive individuals. CD is triggered by the ingestion of grains containing gluten. CD is concomitant with several other disorders, including dermatitis herpetiformis, selective IgA deficiency, thyroid disorders, diabetes mellitus, various connective tissue disorders, inflammatory bowel disease, and rheumatoid arthritis. The advent of high throughput technologies has provided a massive wealth of data which are processed in various omics scale fields. These approaches have revolutionized the medical
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The population of cancer survivors with prior cancer is rapidly growing. Whether a prior cancer diagnosis interferes with outcome is unknown. We conducted a pan-cancer analysis to determine the impact of prior cancer history for patients newly diagnosed with cancer. We identified 20 types of primary solid tumors between 2004 and 2008 in the Surveillance, Epidemiology, and End Results database. Demographic and clinicopathologic variables were compared by χ2 test and t-test as appropriate. The propensity score-adjusted Kaplan-Meier method and Cox proportional hazards models were used to evaluate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The two disorders of cornification associated with mutations in genes coding for intracellular calcium pumps are Darier disease (DD) and Hailey-Hailey disease (HHD). DD is caused by mutations in the ATP2A2 gene, whereas the ATP2C1 gene is associated with HHD. Both are inherited as autosomal-dominant traits. DD is mainly defined by warty papules in seborrheic and flexural areas, whereas the major symptoms of HHD are vesicles and erosions in flexural skin. Both phenotypes are highly variable. In 12%-40% of DD patients and 12%-55% of HHD patients, no mutations in ATP2A2 or ATP2C1 are found. We pr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advances in fluorescence in situ hybridization (FISH) make it feasible to detect multiple copy-number changes in hundreds of cells of solid tumors. Studies using FISH, sequencing, and other technologies have revealed substantial intra-tumor heterogeneity. The evolution of subclones in tumors may be modeled by phylogenies. Tumors often harbor aneuploid or polyploid cell populations. Using a FISH probe to estimate changes in ploidy can guide the creation of trees that model changes in ploidy and individual gene copy-number variations. We present FISHtrees 3.0, which implements a ploidy-based tre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Numerous genes including Irf6 have been revealed to contribute to cleft lip with or without cleft palate (CL/P). In this study, we performed a systematic bioinformatics analysis of Irf6-related gene regulatory network involved in palate and lip development by using GeneDecks, DAVID, STRING, and GeneMANIA database. Our results showed that many CL/P candidate genes have relation with Irf6, and 9 of these genes, including Msx1, Pvrl1, Pax9, Jag2, Irf6, Tgfb3, Rara, Gli2, and Tgfb2, were enriched into the CL/P gene group. Some of these 9 genes also were commonly involved in different signaling pat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The mosquito species Aedes aegypti is the primary vector of many arboviral diseases, including dengue and yellow fevers, that are responsible for a large worldwide health burden. The biological rhythms of mosquitoes regulate many of the physiological processes and behaviors that influence the transmission of these diseases. For insight into the molecular basis of biological rhythms, diel and circadian gene expression profiling has been carried out for many species. To bring these resources to Aedes aegypti researchers, we used microarray technology to carry out a genome wide assess
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Success rates for genomic analyses of highly heterogeneous disorders can be greatly improved if a large cohort of patient data is assembled to enhance collective capabilities for accurate sequence variant annotation, analysis, and interpretation. Indeed, molecular diagnostics requires the establishment of robust data resources to enable data sharing that informs accurate understanding of genes, variants, and phenotypes. The "Mitochondrial Disease Sequence Data Resource (MSeqDR) Consortium" is a grass-roots effort facilitated by the United Mitochondrial Disease Foundation to identify and priori
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pathogenetic mechanism of Alzheimer's disease (AD) is still unknown; however, genetic variants play a critical role in the pathogenesis of AD. It has been reported that single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the sortilin-related receptor with A-type repeats (SORL1, also called LR11 or sorLA) are associated with late-onset AD in Caucasian populations. Subsequently, other researchers have attempted to validate this finding in different ethnic populations. However, these findings have produced both negative and positive results. To derive a more precise estimation of whether SORL1 variants
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the research, few advances in the etiopathogenesis on essential tremor (ET) have been made to date. The high frequency of positive family history of ET and the observed high concordance rates in monozygotic compared with dizygotic twins support a major role of genetic factors in the development of ET. In addition, a possible role of environmental factors has been suggested in the etiology of ET (at least in non-familial forms). Although several gene variants in the LINGO1 gene may increase the risk of ET, to date no causative mutated genes have been identified. In this review, we summa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pleiotropy is a common phenomenon in the genetics of cancers, which is rarely systematically evaluated. A novel idea for identifying shared gene functional modules using biclustering was proposed in this paper to explore the common molecular mechanisms among cancers and the relationships between different types of cancers. Gene expression datasets for 20 cancers were obtained. And genes differentially expressing in at least two types of cancers were selected using both moderated t-statistic and fold change to construct a 10417 × 20 matrix (gene-cancer matrix). 22 gene clusters shared by cancer
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study was to investigate the distribution of mutations in the Cytochrome P450 1B1 gene (CYP1B1) in patients with primary congenital glaucoma (PCG) among different populations. All identifiable original studies on CYP1B1 gene mutations of patients with PCG were reviewed. Finally, DNA mutations within the CYP1B1 gene were identified in 542 patients with PCG according to 52 scientific articles and 147 distinct mutations were found. The 3987G>A (G61E) missense mutation is a founder mutation in Middle Eastern population, responsible for 45.52% of CYP1B1 mutations. In Gypsies,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biclustering, which performs simultaneous clustering of rows (e.g., genes) and columns (e.g., conditions), has been shown to be important for analyzing microarray data. To find biclusters, there have been many methods proposed. Most of these methods can find only clusters with coregulated patterns, which means that the expression levels of genes in a found cluster rise and fall simultaneously. However, for real microarray data, there exist negative-correlated patterns, which means that the tendencies of expression levels of some genes may be completely inverse to those of the other genes under
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Bacillus cereus group of bacteria includes species that can cause food-poisoning or spoilage, such as B. cereus, as well as Bacillus anthracis, the cause of anthrax. In the present report we have conducted a multi-datatype analysis using tools from the HyperCAT database (http://mlstoslo.uio.no/) that we recently developed, combining data from multilocus sequence typing (Tourasse et al., 2010), amplified fragment length polymorphism, and multilocus enzyme electrophoresis typing techniques. We provide a comprehensive snapshot of the B. cereus group population, incorporating 2213 isolates inc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Albinism ocular type 1 (OA1) is an X-linked type of albinism that mainly effects pigment production in the eye, resulting in hypopigmentation of the retina, nystagmus, strabismus, foveal hypoplasia, abnormal crossing of the optic fibers, and reduced visual acuity. The OA1 gene is located on chromosome Xp22.32 and the coding sequence is divided into nine exons. The protein is an integral transmembrane protein that has weak similarities to G protein-coupled receptors. A total of 25 missense, two nonsense, nine frameshift, and five splicing mutations have been reported in the OA1 gene associated
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Type 2 diabetes (T2D) is a heterogeneous disease for which (1) disease-causing pathways are incompletely understood and (2) subclassification may improve patient management. Unlike other biomarkers, germline genetic markers do not change with disease progression or treatment. In this paper, we test whether a germline genetic approach informed by physiology can be used to deconstruct T2D heterogeneity. First, we aimed to categorize genetic loci into groups representing likely disease mechanistic pathways. Second, we asked whether the novel clusters of genetic loci we identified have
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Niemann-Pick type C (NPC) disease is a rare inherited disease, with progressive neurodegeneration as the main symptom. It is a lysosomal storage disorder caused by mutations in NPC1 or NPC2 genes, leading to a lysosomal cholesterol trafficking impairment. Disease indicators are the clinical suspicion and biomarker levels. However, a genetic study is mandatory for the diagnosis, which is complicated due to the different variants with unknown significance. The aim of this work was to identify the variants responsible for NPC in our pediatric population. Twenty-two samples from non-related infant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) is a ubiquitous human herpesvirus associated with various malignancies and autoimmune diseases. MiRNAs play crucial roles in viral-host interactions by regulating gene expression post-transcriptionally. Understanding the regulatory networks between EBV-encoded miRNAs and human miRNAs is essential for elucidating viral pathogenesis and identifying therapeutic targets. We reported the EBV-HSA miRNA Regulatory Database (EBV-HSA-RegDB, https://lbcd.ufpa.br/ebvhsa or https://lbcd.ia.br/ebvhsa ), an integrated bioinformatics resource that combines comparative sequence analy
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study identified potential autophagy-related genes (ARGs) in atherosclerosis using bioinformatics strategies, aiming to explore novel therapeutic targets for the clinical management of atherosclerosis.
METHODS: Four gene expression datasets associated with atherosclerosis (GSE100927, GSE43292, GSE28829, and GSE20129) were retrieved from the GEO database of the NCBI and subjected to comprehensive analysis. A list of ARGs was compiled by accessing the HADb. AR-DEGs were screened using the "limma" package in R software. Thereafter, six core genes were identified through the combi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis, a life-threatening dysregulated host response to infection, involves complex cytokine signaling. Comprehensive bioinformatics analysis of cytokine activity, associated pathways, and immune alterations in sepsis is warranted. Using the sepsis dataset GSE26378 from GEO, we analyzed differential cytokine pathway activity with ssGSEA and identified differentially expressed genes (DEGs). Cytokine-related genes (CRGs) were extracted and overlapped with DEGs. Protein-Protein Interaction (PPI) network analysis and functional enrichment were performed on differentially expressed CRGs. Cytokine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.