BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA) is a common chronic systemic autoimmune disease. Accumulating evidence reveals that lactate plays a vital role in progression of RA. This study aimed to identify lactate-related genes (LRGs) associated with RA and investigate their potential pathological correlation with immune-infiltrating cells and their potential as diagnostic markers in RA.
METHODS: We downloaded four RA-related datasets containing 51 RA and 36 healthy synovium samples from the Gene Expression Omnibus (GEO) database and extracted the expression profiles of lactate-related genes to ide
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: While the global burden of inflammatory bowel diseases (IBD) is increasing, the identification of novel therapeutic targets and biomarkers is of significant importance. In particular, blood transcriptomes provide a non-invasive source for biomarker discovery. Therefore, this study aimed to identify potential blood markers for IBD.
METHODS: By employing an integrated transcriptomics approach, four datasets obtained from blood specimens of patients with IBD were analyzed (GSE119600, GSE94648, GSE86434, and GSE71730). After determining differentially expressed genes (DEGs) in IBD,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Periodontitis is a prevalent multifactorial, oral infectious disease and is considered a high-risk factor for pancreatic cancer. Nevertheless, there is limited understanding of the underlying epigenetic mechanisms governing this relationship. The aim of this study was to identify dysregulated miRNAs associated with periodontitis and pancreatic cancer, along with their related genes, signaling pathways, and compounds.
MATERIALS AND METHODS: miRNA expression datasets for tissues affected by periodontitis and pancreatic cancer were obtained from the Gene Expression Omnibus databa
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammation and immune dysregulation play critical roles in Kawasaki disease (KD) pathogenesis, yet specific biomarkers and immune signatures remain elusive. This study aims to identify key biomarkers and characterize immune cell infiltration scores in KD using bioinformatic approaches. The GSE73461 dataset, downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database, includes 78 KD patients and 55 normal controls collected by Imperial College London from 2015 to 2023, and was analyzed to identify differentially expressed genes (DEGs). Gene ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Gen
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Adrenocortical carcinoma (ACC) arises from the adrenal cortex. This cancer is characterized by a very low incidence, poor prognosis and high mortality rate. Because early detection is extremely difficult and no effective treatment has been established, the five-year survival rate is very low. Therefore, there is an urgent need to identify biomarkers and therapeutic target molecules that can serve as early detection and prognostic factors. Stathmin 1 is a ubiquitously expressed 19 kDa cytosolic phosphoprotein, which induces microtubule depolymerization and regulates microtubule-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oxidative stress was one of key factors driving the septic development by the uncontrolled accumulation of free radicals, thus oxidative stress-related biomarkers provide a novel diagnostic option. This study focused on screening oxidative stress-related genes and validating their diagnostic utility.
METHODS: We obtained microarray datasets (GSE65682, GSE95233, GSE131761, and GSE33118) from the NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) database and assigned them to the training, test, and validation cohorts. In the training cohort, differential expression genes (DEGs) were screened and i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Preeclampsia (PE) is a common hypertensive disease in women with pregnancy. With the development of bioinformatics, WGCNA was used to explore specific biomarkers to provide therapy targets efficiently. All samples were obtained from gene expression omnibus (GEO), then we used a package named "WGCNA" to construct a scale-free co-expression network and modules related to PE. Next, the search tool for the retrieval of interacting genes database (STRING) was adopted to structure the protein-protein interaction (PPI) of genes in the hub module. Furthermore, the MCODE plug-in was applied to discern
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Collagen type XVII alpha 1 chain (COL17A1) is a protein in the collagen family crucial for maintaining the integrity of skin and epithelial tissues. It is also vital for enamel formation and plays a significant role in the differentiation of ameloblasts. Many studies have indicated that single nucleotide variants (SNVs) can disrupt normal splicing process of the pre-mRNA by altering various splicing regulatory signals. This study aimed to explore the potential impact of SNVs in COL17A1 geneon splicing events, with the ultimate aim of improving the prediction of disease prognosis. Here, we anal
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies have found that there is tertiary lymphoid structure (TLS) in IgA nephropathy (IgAN), and the existence of TLS has an impact on renal function, creatinine, and proteinuria in patients. We aim to explore the potential molecular mechanisms and therapeutic targets of TLS in IgA nephropathy by bioinformatics methods, hoping to provide treatment methods. The datasets GSE226840, GSE237120, and GSE116626 from the Gene Expression Omnibus (GEO) database were employed to investigate the potential therapeutic targets of TLS in IgAN. The R was used to obtain the differentially expressed genes (DEG
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetes mellitus (DM) is a chronic metabolic disorder that poses significant challenges to public health. Among its various complications, diabetic nephropathy (DN) emerges as a critical microvascular complication associated with high mortality rates. Despite the development of diverse therapeutic strategies targeting metabolic improvement, hemodynamic regulation, and fibrosis mitigation, the precise mechanisms responsible for glomerular injury in DN are not yet fully elucidated. To explore these mechanisms, public DN datasets (GSE30528, GSE104948, and GSE96804) were obtained from the GEO dat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study of gene anomalies linked to thyroid cancer is gaining more and more attention, and these molecular indicators can offer scholarly support for thyroid cancer diagnosis, therapy selection, and prognosis. Genotype-tissue expression pan-cancer data and The Cancer Genome Atlas (TCGA) were used to investigate the expression of GZMK, TREM2, and OR4D10. In order to assess the relationship between GZMK, TREM2, and OR4D10 expression and patient outcome, TCGA clinical survival data were used. We used the clusterProfiler R software tool to conduct enrichment analysis of GZMK, TREM2, and OR4D10.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Polycystic ovary syndrome (PCOS) is one of the most significant cardiovascular risk factors, playing vital roles in various cardiovascular diseases such as atherosclerosis (AS). This study attempted to explore key biomarkers for predicting AS in patients with PCOS and to investigate the role of immune cell infiltration in this process.
METHODS: We downloaded the expression matrix of AS (GSE100927, GSE28829) and PCOS (GSE54248) from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Differential expression analysis and weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) were used to ident
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Keratoconus is corneal disease in which the progression of conical dilation of cornea leads to reduced visual acuity and even corneal perforation. However, the etiology mechanism of keratoconus is still unclear. This study aims to identify the signature genes related to cell death in keratoconus and examine the function of these genes. A dataset of keratoconus from the GEO database was analysed to identify the differentially expressed genes (DEGs). A total of 3558 DEGs were screened from GSE151631. The results of Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis sh
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: More and more studies have found that polycystic ovary syndrome (PCOS) is significantly associated with recurrent spontaneous abortion (RSA), but the specific mechanism is not yet clear.
METHODS: Based on the GEO database, we downloaded the PCOS (GSE10946, GSE6798 and GSE137684) and RSA (GSE165004, GSE26787 and GSE22490) datasets and performed differential analysis, weighted gene co-expression network (WGCNA), functional enrichment, and machine learning, respectively, on the datasets of the two diseases, Nomogram and integrated bioinformatics analysis such as immune infiltration an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prior studies have suggested a potential relationship between osteoporosis and sarcopenia, both of which can present symptoms of compromised mobility. Additionally, fractures among the elderly are often considered a common outcome of both conditions. There is a strong correlation between fractures in the elderly population, decreased muscle mass, weakened muscle strength, heightened risk of falls, and diminished bone density. This study aimed to pinpoint crucial diagnostic candidate genes for osteoporosis patients with concomitant sarcopenia.
METHODS: Two osteoporosis datasets and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Systemic lupus erythematosus (SLE) is a multi-organ chronic autoimmune disease. Inflammatory bowel disease (IBD) is a common chronic inflammatory disease of the gastrointestinal tract. Previous studies have shown that SLE and IBD share common pathogenic pathways and genetic susceptibility, but the specific pathogenic mechanisms remain unclear.
METHODS: The datasets of SLE and IBD were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO). Differentially expressed genes (DEGs) were identified using the Limma package. Weighted gene coexpression network analysis (WGCNA) was used to deter
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several studies reveal that allergic rhinitis (AR) is a significant risk factor of systemic lupus erythematosus (SLE). However, studies investigating the common pathogenesis linking AR and SLE are lacking. Our study aims to search for the shared biomarkers and mechanisms that may provide new therapeutic targets for preventing AR from developing SLE. GSE50223 for AR and GSE103760 for SLE were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database to screen differentially expressed genes (DEGs). The Gene Ontology (GO) analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrich
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study is to explore the potential mechanism of action of Total glucosides of paeony (TGP) in the treatment of autoimmune thyroiditis (AIT). The study utilized literature mining to obtain the active ingredients of TGP. Databases such as Super-PRED, similarity ensemble approach, and Swiss Target Prediction were utilized to predict the targets of the active ingredients. DisGeNET, Dangbank, GeneCards, online mendelian inheritance in man, and Pharmgkb databases were used to obtain the targets related to AIT. The Venn Online tool was used to screen the intersecting genes betwee
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AR) is a major global threat to public health. Understanding the population dynamics of AR is critical to restrain and control this issue. However, no study has provided a global picture of the whole resistome of Acinetobacter baumannii, a very important nosocomial pathogen. Here we analyse 1450+ genomes (covering >40 countries and >4 decades) to infer the global population dynamics of the resistome of this species. We show that gene flow and horizontal transfer have driven the dissemination of AR genes in A. baumannii. We found considerable variation in AR gene conte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Few small-scale studies have reported a genetic and familial predisposition in Hashimoto's thyroiditis (HT), however, quantified familial risk estimates from population-level data are unavailable. We aimed to estimate the incidence and familial risk of HT among first-degree relatives (FDR) according to age, sex, and family relationships. Methods: We conducted a population-based study in the general population of Korea from 2002 to 2017. Using the nationwide health insurance database, which has full population coverage and family relationship information, a cohort of 22 million indi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования