INTRODUCTION: Triple-Negative Breast Cancer (TNBC) is an aggressive variant of breast cancer, which has a high degree of molecular heterogen … immunotherapy outcomes in TNBC. The results of genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, epigenomics, and single-cell multi-omics research were summarized, and advances made in humanized mouse models (including PBMC-, HSC-, and PDXbased models) were presented. In addition, new computational techniques, such as machine learning, deep learning, and n …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiometabolic diseases, encompassing obesity, insulin resistance, type 2 diabetes (T2D), metabolic dysfunction-associated steatotic liver … , inter-individual heterogeneity, and differential response to interventions. Multiomics (genomics, epigenomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, lipidomics, microbiomics, and extracellular vesicle/exosome cargo profiling) expands the biomarker landscape but introduces translational barriers: high dimensionality, cohort heterogeneity, limited causal …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in isocitrate dehydrogenase 1 or 2 (IDH1/2) define a major subgroup of adult-type diffuse gliomas and induce accumulation of D-2-h … demonstrate complete epigenetic reversal. Emerging applications, including single-cell and spatial epigenomics, tumour microenvironment deconvolution and CSF methylation profiling, remain investigational. Overall, DNA methylation profiling is most valuable when used as integrated diagnostic and risk-stratification evidence within the complete histological, g …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: BCG is recommended as intravesical immunotherapy to reduce the risk of tumor recurrence in patients with non-muscle invasive bla … 0.40 to 1.01)) for respiratory infections in BCG-treated versus non-BCG-treated NMIBC patients. An epigenomics approach combining chromatin immuno precipitation-sequencing and RNA-sequencing with in vitro trained immunity experiments identified enhanced inflammasome activity in BCG-treated individuals. Finally, germline variation in genes that affect trained …
Наблюдательное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two distinct genetically defined entities of ependymoma arising in the supratentorial compartment are characterized by the presence of either a C11orf95-RELA or a YAP-MAMLD1 fusion, respectively. There is growing evidence that supratentorial ependymomas without these genetic features exist. In this study, we report on 18 pediatric non-RELA/non-YAP supratentorial ependymomas that were systematically characterized by means of their histology, immunophenotype, genetics, and epigenomics. Comprehensive molecular analyses included high-resolution copy number analysis, methylation profiling, analysis…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rat oxycodone and cocaine biobanks contain samples that vary by genotypes (by using genetically diverse genotyped HS rats), phenotypes ( … ed to facilitate diverse downstream applications such as proteomics, metabolomics, transcriptomics, epigenomics, microbiomics, neuroanatomy, biomarker discovery, and other cellular and molecular approaches. To date, >20,000 samples have been collected from over 1000 unique animals and made available free of charge to non-profit institutions through https://ww …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Alcoholism is a multifactorial, genetically influenced disorder. It is a major health and social issue, a highly frequent disease and … environment interactions, is still unknown. Technological progress and advances in transcriptomics, epigenomics and proteomics are expected to enhance our knowledge of the genetic susceptibility to alcoholism.
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin remodeling is prominent in cancers, yet it remains obscure how chromatin dynamics underlies stepwise tumorigenesis and informs anti-cancer therapeutics. By decoding a large-scale chromatin accessibility atlas of 650 multistage samples from 439 patients, we delineate epigenetic switches spanning multistep gastric tumorigenesis. A cancer-resembling epigenetic priming state in intestinal metaplasia licenses subsequent tumor initiation. In advanced malignancies, inter-tumoral diversity stratifies three epigenomic subtypes. The proliferative and mesenchymal-inflammatory subtypes are sensi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early postnatal life is important for reproductive development, but the effects of early-life nutrition on female reproductive capacity remain largely unknown. Here, we investigated whether neonatal ketone body deficiency affects adult oocyte quality using a lactational malnutrition model and Hmgcs2-deficient mice. We found that impaired neonatal ketogenesis caused long-lasting impairments in female reproductive function, including reduced ovarian reserve, decreased oocyte developmental competence, altered hormone levels, and impaired embryo development. Neonatal β-hydroxybutyrate (β-HB) suppl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variants in MSL2, a core component of the histone-modifying MSL complex, are associated with neurodevelopmental disorders (NDDs) and white matter abnormalities; however, their mechanisms of pathogenicity remain unknown. In this study, we identified three patients with NDD carrying MSL2 variants, all of whom exhibited white matter abnormalities. Using conditional knockout mice, we demonstrated that oligodendrocyte lineage-specific deletion of Msl2 disrupts oligodendrocyte precursor cell proliferation, maturation, and myelination in a cell-autonomous manner, leading to autism-like beh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trigonelline, a coffee-derived alkaloid with antioxidant and mitochondrial effects, has been proposed as a candidate modulator of aging, but its specific role in ovarian aging remains unclear. In this study, we applied an integrated in silico strategy combining network pharmacology, protein-protein interaction analyses, molecular docking, 100-ns molecular dynamics simulations, and single-cell transcriptomic data to identify potential trigonelline targets relevant to ovarian aging. Among 57 predicted targets, five (MMP9, JAK2, PARP1, HDAC1, and CYP3A4) emerged as core candidates spanning extrac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is a genomically diverse disease, and molecular classification is essential for understanding its biology and improving patient care. Here, integrative analyses of 529 HCC samples across genomic, transcriptomic, epigenomic, and proteomic layers identify nine robust molecular subtypes, validated in 807 external cases. Three common subtypes are defined by alterations in CTNNB1ex3/APC (25%), TP53 (21%), and AXIN1/IRF2 (11%), while four rare subtypes involve TP53+CTNNB1ex3 (6%), BAP1 (6%), CCNA2/E1 (6%), and HNF1A (1%). Two additional immune-related subtypes, UHot (1
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lineage plasticity develops as tumor cells overcome terminal differentiation barriers, adapt to environmental stressors, and acquire metastatic, therapy-resistant phenotypes. These phenotypic transitions are driven by nonmutational epigenetic mechanisms, including dynamic shifts in chromatin accessibility, histone modifications, DNA methylation, and noncoding RNA activity beyond genetic alterations. While epithelial-mesenchymal plasticity (EMP) remains a foundational model, cancer-cell plasticity extends into a broader pan-plasticity spectrum encompassing dedifferentiation, transdifferentiatio
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zygotic genome activation (ZGA) marks the initial transcription event in embryogenesis, yet the cis-regulatory mechanism remains unclear. Here, utilizing massively parallel reporter assays, we functionally dissect enhancers across mouse genome in DUX-induced 2C-like cells (2CLCs). Through integrated analysis with epigenomic and transcriptomic data from 2CLCs and 2C embryos, active enhancers in totipotent cells are depicted. Among them, a notable proportion of promoters exhibit enhancer activities, showing elevated active chromatin features and correlating with enhanced gene expression during Z
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular function depends on the spatial organization of cells and biomolecules within the tissue microenvironment. Advances in spatial omics have enabled profiling of molecular features such as transcriptome, proteome and epigenome, and there has been rapid progress of imaging-based approaches to study spatial three-dimensional (3D) genome organization. Here we present Spatial-ATAC-Hi-C, a microfluidic‑based platform for genome-wide, spatially resolved joint-profiling of 3D genome organization and chromatin accessibility on tissue slides. Applied to mouse and human brains, Spatial-ATAC-Hi-C r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hybridization-led integration of the D-genome into domesticated tetraploid wheat gave rise to allohexaploid wheat, the most cultivated wheat globally grown across diverse environmental conditions. However, the regulatory mechanisms by which this genomic integration confers increased environmental adaptability in allohexaploid remains largely unexplored. Here, we investigated the change of transcriptome, chromatin interactome and metabolome in three independent polyploidization events. Our findings reveal that polyploidization triggers the activation of defense-related genes through a compr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell lines are indispensable tools in prostate cancer research yet their suitability as models for distance metastasis remains incompletely characterized. Here, we conduct a systematic evaluation study using large-scale public multi-omics data. We reveal substantial genomic differences between cell lines and metastatic patient samples, and meanwhile pinpoint cell lines which more closely resemble metastatic prostate cancer. Notably, hypermutation significantly influences the tumor microenvironment, underscoring the importance of considering mutational burden in model selection. Surprisingly, t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNAs (lncRNAs) have emerged as critical regulators of the cancer epitranscriptome, orchestrating post-transcriptional gene regulation through dynamic interactions with RNA-modifying enzymes and RNA-binding proteins. Acting as molecular guides, scaffolds, decoys, and organizational hubs, lncRNAs regulate the deposition, removal, and interpretation of epitranscriptomic marks, including N6-methyladenosine (m6A), 5-methylcytosine, pseudouridine, and adenosine-to-inosine editing. Through these interactions, lncRNAs influence RNA stability, splicing, translation, localization, and de
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell multiomic technology makes it possible to profile both the transcriptome and epigenome within individual cells. The detection of rare cell states from such data is crucial for exploring novel disease biomarkers with clinical potential. However, existing methods typically focus on the gene and peak counts while ignoring the underlying genomic sequence at accessible sites. Here, we propose ComicGTN, an innovative computational framework that integrates single-cell multiomic data with DNA sequence information via enhanced graph transformer networks to accurately identify rare cell clu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deep learning, as a pivotal branch of machine learning, has demonstrated remarkable potential in advancing crop science by effectively integrating genomics and phenomics. This review systematically outlines the application of diverse deep learning architectures-such as convolutional neural networks, recurrent neural networks, and transformers-across key crop genomic tasks, including gene expression prediction, alternative splicing analysis, cis-regulatory element identification, epigenomic profiling, and genome-based trait prediction. In phenomics, these models facilitate high-throughput extra
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования